More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_3103 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_3103  HAD family hydrolase  100 
 
 
562 aa  1157    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3516  phosphoglycolate phosphatase  32.23 
 
 
229 aa  79.7  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2206  HAD family hydrolase  33.64 
 
 
227 aa  78.6  0.0000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0834963  normal  0.088242 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2878  phosphoglycolate phosphatase  30.41 
 
 
226 aa  77.4  0.0000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2363  phosphoglycolate phosphatase  30 
 
 
227 aa  76.3  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.496506  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3798  phosphoglycolate phosphatase  29.5 
 
 
253 aa  75.9  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0419361 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0027  HAD-superfamily hydrolase  27.45 
 
 
238 aa  76.3  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1987  HAD family hydrolase  29.41 
 
 
215 aa  74.7  0.000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0143235  normal  0.0109237 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3482  phosphoglycolate phosphatase  31.55 
 
 
226 aa  73.9  0.000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.824519  normal  0.190106 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1985  phosphoglycolate phosphatase  26.12 
 
 
223 aa  72.4  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.554471  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1492  HAD family hydrolase  30.88 
 
 
217 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.210059  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0925  phosphoglycolate phosphatase  30.62 
 
 
224 aa  72  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2324  phosphoglycolate phosphatase  37.21 
 
 
223 aa  71.2  0.00000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.289687  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2111  phosphoglycolate phosphatase  29.38 
 
 
228 aa  70.5  0.00000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0525  HAD family hydrolase  35.14 
 
 
209 aa  70.5  0.00000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00124351  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0265  phosphoglycolate phosphatase  27.75 
 
 
227 aa  69.7  0.0000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0934  HAD family hydrolase  28.57 
 
 
214 aa  69.7  0.0000000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1410  phosphoglycolate phosphatase  27.17 
 
 
225 aa  70.1  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14840  HAD-superfamily hydrolase  26.99 
 
 
220 aa  68.9  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.770171  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0673  HAD family hydrolase  26.17 
 
 
211 aa  69.3  0.0000000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0071  phosphatase-like protein  25.74 
 
 
246 aa  69.3  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1595  HAD family hydrolase  27.6 
 
 
219 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00389314  normal  0.0112895 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1709  HAD family hydrolase  27.82 
 
 
238 aa  68.2  0.0000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000621435  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3679  phosphoglycolate phosphatase  26.59 
 
 
252 aa  68.2  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.966867  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1752  HAD family hydrolase  28.28 
 
 
238 aa  68.2  0.0000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000718269  normal  0.2896 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1514  phosphoglycolate phosphatase  30.1 
 
 
243 aa  68.2  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00414525  decreased coverage  0.0000736152 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0343  phosphoglycolate phosphatase  28 
 
 
233 aa  67.8  0.0000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4610  phosphoglycolate phosphatase  28.5 
 
 
272 aa  67.4  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1621  HAD family hydrolase  29.25 
 
 
231 aa  67.4  0.0000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0638141  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0567  phosphoglycolate phosphatase  27.57 
 
 
266 aa  67  0.0000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00378  phosphoglycolate phosphatase  30.66 
 
 
250 aa  67  0.0000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.590108  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03237  phosphoglycolate phosphatase  27.78 
 
 
252 aa  66.6  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0328  phosphoglycolate phosphatase  27.78 
 
 
252 aa  66.6  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0261  phosphoglycolate phosphatase  28.24 
 
 
226 aa  66.6  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02338  putative phosphoglycolate phosphatase, contains a phosphatase-like domain  29.44 
 
 
234 aa  66.2  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0463297  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03189  hypothetical protein  27.78 
 
 
252 aa  66.6  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3762  phosphoglycolate phosphatase  27.78 
 
 
252 aa  66.6  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.40481  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0057  phosphoglycolate phosphatase  25.58 
 
 
232 aa  66.2  0.000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.049028  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3752  HAD family hydrolase  28.7 
 
 
237 aa  66.6  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3581  phosphoglycolate phosphatase  27.78 
 
 
252 aa  65.9  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.284383  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3850  phosphoglycolate phosphatase  26.19 
 
 
252 aa  65.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0328  phosphoglycolate phosphatase  27.78 
 
 
252 aa  65.9  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.372389  normal  0.201922 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0447  phosphoglycolate phosphatase  25.97 
 
 
272 aa  65.9  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.558752 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2112  HAD family hydrolase  41.05 
 
 
239 aa  65.5  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3661  phosphoglycolate phosphatase  27.78 
 
 
252 aa  65.9  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.29844  normal  0.025681 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3854  phosphoglycolate phosphatase  27.31 
 
 
252 aa  65.9  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00525883  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4689  phosphoglycolate phosphatase  27.78 
 
 
252 aa  65.9  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.663349  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07930  phosphoglycolate phosphatase  26.42 
 
 
272 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00282972 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3754  phosphoglycolate phosphatase  26.19 
 
 
252 aa  65.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2449  HAD family hydrolase  26.07 
 
 
217 aa  66.2  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0190416  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2565  HAD family hydrolase  28.68 
 
 
244 aa  65.5  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000244874  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1575  HAD family hydrolase  28.12 
 
 
238 aa  65.9  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000310395  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2697  phosphoglycolate phosphatase  29.86 
 
 
240 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02162  phosphoglycolate phosphatase  27.53 
 
 
225 aa  66.2  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3681  phosphoglycolate phosphatase  26.19 
 
 
252 aa  65.5  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.123155  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3788  phosphoglycolate phosphatase  26.19 
 
 
252 aa  65.1  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2034  HAD family hydrolase  26.69 
 
 
216 aa  65.1  0.000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.645104  normal  0.0672621 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2124  phosphoglycolate phosphatase  29.08 
 
 
230 aa  64.7  0.000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.305125  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2493  phosphoglycolate phosphatase  26.27 
 
 
225 aa  64.7  0.000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2192  phosphoglycolate phosphatase  28.57 
 
 
217 aa  64.7  0.000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0416  phosphoglycolate phosphatase  25.97 
 
 
272 aa  64.3  0.000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2655  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.41 
 
 
239 aa  64.3  0.000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.019501  hitchhiker  0.000128755 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0752  phosphoglycolate phosphatase  26.02 
 
 
272 aa  64.7  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0450  phosphoglycolate phosphatase  25.97 
 
 
272 aa  64.3  0.000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.416285 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3998  phosphoglycolate phosphatase  25.6 
 
 
226 aa  64.3  0.000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.739792  normal  0.543367 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1697  HAD family hydrolase  31.88 
 
 
231 aa  64.3  0.000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0993915 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1824  HAD family hydrolase  31.18 
 
 
222 aa  63.9  0.000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0332  HAD family hydrolase  25.78 
 
 
210 aa  63.9  0.000000007  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3878  phosphoglycolate phosphatase  29.03 
 
 
234 aa  63.9  0.000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4527  phosphoglycolate phosphatase  24.88 
 
 
216 aa  63.9  0.000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1712  HAD family hydrolase  25.77 
 
 
239 aa  63.5  0.000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000827821  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2083  phosphoglycolate phosphatase  34.53 
 
 
226 aa  63.9  0.000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.609164  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25590  putative hydrolase  27.83 
 
 
230 aa  63.5  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.080664  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1319  HAD family hydrolase  30.34 
 
 
223 aa  62.8  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2403  HAD family hydrolase  26.95 
 
 
248 aa  63.2  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000854479  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2473  HAD family hydrolase  25.4 
 
 
248 aa  63.2  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000591891  hitchhiker  0.00615598 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0927  HAD family hydrolase  28.3 
 
 
210 aa  62.4  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2187  putative hydrolase  30.28 
 
 
230 aa  62.8  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0143931  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0956  phosphoglycolate phosphatase  39.18 
 
 
222 aa  62.4  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1630  phosphoglycolate phosphatase  29.83 
 
 
224 aa  62.8  0.00000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0714  hydrolase  28.89 
 
 
255 aa  62.4  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2446  phosphoglycolate phosphatase  26.57 
 
 
225 aa  62.8  0.00000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0176  phosphoglycolate phosphatase  28.76 
 
 
224 aa  62.4  0.00000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.790253  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3193  phosphoglycolate phosphatase  31.48 
 
 
250 aa  62  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2632  HAD family hydrolase  27.67 
 
 
216 aa  62  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.861911  hitchhiker  0.000131082 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3036  phosphoglycolate phosphatase  28.37 
 
 
224 aa  61.6  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0038441  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3622  2-phosphoglycolate phosphatase  26.29 
 
 
254 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2007  HAD family hydrolase  30 
 
 
233 aa  62  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0418734 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1575  phosphoglycolate phosphatase  28.38 
 
 
229 aa  62  0.00000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.099799  unclonable  0.000000163733 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3168  pyrophosphatase PpaX  25.9 
 
 
222 aa  61.6  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1355  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30 
 
 
228 aa  61.6  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.873579  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4498  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  25.94 
 
 
223 aa  62  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.511661  normal  0.0143777 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0535  phosphoglycolate phosphatase  28.64 
 
 
254 aa  62  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2570  phosphoglycolate phosphatase  28.64 
 
 
254 aa  62  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2251  phosphoglycolate phosphatase  28.31 
 
 
229 aa  62  0.00000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2880  phosphoglycolate phosphatase  29.61 
 
 
246 aa  61.6  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.587243  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0507  phosphoglycolate phosphatase  28.64 
 
 
254 aa  61.6  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.263743  normal  0.890695 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5010  pyrophosphatase PpaX  30.19 
 
 
216 aa  61.6  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2110  phosphoglycolate phosphatase  24.41 
 
 
225 aa  61.6  0.00000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.782136  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5390  pyrophosphatase PpaX  30.19 
 
 
216 aa  61.6  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>