More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2007 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2007  HAD family hydrolase  100 
 
 		 233 aa  451  1.0000000000000001e-126  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0418734 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2632  HAD family hydrolase  94.42 
 
 		 233 aa  423  1e-117  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.503423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1319  HAD family hydrolase  60.18 
 
 		 223 aa  223  2e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1301  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  55.41 
 
 		 228 aa  218  7e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.782591  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3817  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  60.89 
 
 		 227 aa  218  7.999999999999999e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0325282  hitchhiker  0.00357212 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0053  hydrolase  54.39 
 
 		 229 aa  216  2e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.205751 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0027  HAD-superfamily hydrolase  48.47 
 
 		 238 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2582  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 1  50.46 
 
 		 224 aa  195  4.0000000000000005e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0909618 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0071  phosphatase-like protein  46.93 
 
 		 246 aa  195  4.0000000000000005e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0714  hydrolase  51.13 
 
 		 255 aa  190  2e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3186  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  54.75 
 
 		 231 aa  183  2.0000000000000003e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.234606  normal  0.0137169 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03670  predicted phosphatase  42.01 
 
 		 244 aa  139  3e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0282294  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2102  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  40.5 
 
 		 233 aa  122  5e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3095  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  33.48 
 
 		 234 aa  116  3e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0156733  normal  0.965778 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3402  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  34.75 
 
 		 244 aa  107  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0865244 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4840  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.28 
 
 		 220 aa  94  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0176298  hitchhiker  0.0000825577 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1480  phosphonoacetaldehyde hydrolase  32.23 
 
 		 264 aa  82.8  0.000000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1377  phosphonoacetaldehyde hydrolase  29.61 
 
 		 264 aa  79  0.00000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2412  phosphonoacetaldehyde hydrolase  28.51 
 
 		 281 aa  77.8  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1051  phosphonoacetaldehyde hydrolase  30.56 
 
 		 264 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1240  phosphonoacetaldehyde hydrolase  28.02 
 
 		 264 aa  77  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1439  phosphonoacetaldehyde hydrolase  26.98 
 
 		 267 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1414  phosphonoacetaldehyde hydrolase  26.98 
 
 		 264 aa  76.3  0.0000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1239  phosphonoacetaldehyde hydrolase  26.98 
 
 		 264 aa  75.5  0.0000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1215  phosphonoacetaldehyde hydrolase  26.98 
 
 		 264 aa  75.5  0.0000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1217  phosphonoacetaldehyde hydrolase  26.98 
 
 		 264 aa  75.5  0.0000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1340  phosphonoacetaldehyde hydrolase  26.98 
 
 		 264 aa  75.5  0.0000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3967  phosphonoacetaldehyde hydrolase  30.33 
 
 		 264 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0356  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.77 
 
 		 233 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2313  phosphonoacetaldehyde hydrolase  30.43 
 
 		 257 aa  68.6  0.00000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.546562  normal  0.912396 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3421  phosphonoacetaldehyde hydrolase  25.96 
 
 		 274 aa  67.4  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0323  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.41 
 
 		 233 aa  65.9  0.0000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0341719 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0280  HAD family hydrolase  29.41 
 
 		 233 aa  65.5  0.0000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02338  putative phosphoglycolate phosphatase, contains a phosphatase-like domain  29.22 
 
 		 234 aa  63.9  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0463297  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1483  HAD family hydrolase  28.83 
 
 		 224 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0762089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0514  phosphonoacetaldehyde hydrolase  26.25 
 
 		 280 aa  63.2  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0295748 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3684  phosphonoacetaldehyde hydrolase  26.6 
 
 		 275 aa  62.4  0.000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4417  HAD family hydrolase  30.66 
 
 		 232 aa  62.4  0.000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.155896  normal  0.156136 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1114  HAD family hydrolase  28.71 
 
 		 218 aa  62.4  0.000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.35546  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0854  HAD family hydrolase  33.49 
 
 		 221 aa  62  0.000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.249022  decreased coverage  0.000200034 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47280  phosphonoacetaldehyde hydrolase  30.23 
 
 		 275 aa  62.4  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4762  HAD family hydrolase  30.36 
 
 		 242 aa  62  0.000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.698376  hitchhiker  0.00269567 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0590  HAD family hydrolase  29.22 
 
 		 219 aa  62  0.000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0419315 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2746  HAD family hydrolase  29.03 
 
 		 240 aa  62  0.000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.906764  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4921  nucleotidase  32.28 
 
 		 225 aa  62  0.000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0815818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2776  HAD family hydrolase  29.03 
 
 		 240 aa  62  0.000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.223588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2790  HAD family hydrolase  29.03 
 
 		 240 aa  62  0.000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3103  HAD family hydrolase  30 
 
 		 562 aa  62  0.000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3683  nucleotidase  32.28 
 
 		 225 aa  62  0.000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.847444  hitchhiker  0.000163133 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1750  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.3 
 
 		 237 aa  61.2  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00428028  normal  0.0347073 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0431  3-amino-5-hydroxybenoic acid synthesis related  29.55 
 
 		 263 aa  61.6  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2100  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.83 
 
 		 215 aa  61.6  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1833  phosphonoacetaldehyde hydrolase  28.08 
 
 		 275 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04249  nucleotidase  32.3 
 
 		 225 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.306947  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3625  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.3 
 
 		 225 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.175354  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1907  HAD superfamily hydrolase  28.7 
 
 		 224 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000027861 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5886  nucleotidase  32.3 
 
 		 225 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.252509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2641  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.17 
 
 		 222 aa  60.8  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0966  phosphonoacetaldehyde hydrolase  27.38 
 
 		 283 aa  60.5  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.12889 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3807  HAD family hydrolase  28.57 
 
 		 224 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.118188  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6309  HAD family hydrolase  31.48 
 
 		 224 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.403057 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04215  hypothetical protein  32.3 
 
 		 225 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.375532  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1518  HAD family hydrolase  27.4 
 
 		 226 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0020263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3556  HAD family hydrolase  31.96 
 
 		 262 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3288  HAD family hydrolase  29.17 
 
 		 222 aa  60.8  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2083  phosphoglycolate phosphatase  31.25 
 
 		 226 aa  60.5  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.609164  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2208  phosphonoacetaldehyde hydrolase  28.08 
 
 		 275 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.136428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3530  phosphonoacetaldehyde hydrolase  28.08 
 
 		 275 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.359748  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7037  HAD family hydrolase  31.02 
 
 		 224 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.927677 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4080  phosphonoacetaldehyde hydrolase  30.56 
 
 		 275 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0647  HAD family hydrolase  29.49 
 
 		 221 aa  59.7  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.496334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3462  phosphonoacetaldehyde hydrolase  28.08 
 
 		 275 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.985191  normal  0.890252 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1284  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.17 
 
 		 227 aa  59.7  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.153215  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1760  HAD family hydrolase  29.02 
 
 		 260 aa  59.7  0.00000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.960773  normal  0.487326 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1317  HAD family hydrolase  31.48 
 
 		 224 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.716581  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3261  phosphonoacetaldehyde hydrolase  29.41 
 
 		 275 aa  59.3  0.00000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.258798  normal  0.0791037 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6512  HAD family hydrolase  31.48 
 
 		 224 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1937  HAD family hydrolase  31.19 
 
 		 234 aa  59.3  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.67763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6102  HAD family hydrolase  31.94 
 
 		 224 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.524869  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2989  phosphonoacetaldehyde hydrolase  30.4 
 
 		 270 aa  58.9  0.00000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.446751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0909  phosphoglycolate phosphatase  28.25 
 
 		 222 aa  58.9  0.00000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0548  phosphonoacetaldehyde hydrolase  27.07 
 
 		 271 aa  59.3  0.00000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000564985  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3959  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.38 
 
 		 229 aa  58.5  0.00000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6369  HAD family hydrolase  31.53 
 
 		 219 aa  58.5  0.00000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.23133  normal  0.167912 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4411  HAD family hydrolase  34.92 
 
 		 224 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.981308  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0072  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.9 
 
 		 230 aa  58.2  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5294  HAD family hydrolase  30.09 
 
 		 224 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.08015 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4472  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.31 
 
 		 223 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4503  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.08 
 
 		 224 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3289  AHBA synthesis associated protein  31.39 
 
 		 264 aa  58.2  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0220  HAD family hydrolase  29.95 
 
 		 238 aa  58.2  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.208784 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4360  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.31 
 
 		 223 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1175  HAD family hydrolase  27.98 
 
 		 222 aa  58.2  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.341694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0267  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.9 
 
 		 220 aa  57.4  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.583067  normal  0.103324 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4970  nucleotidase  33.33 
 
 		 225 aa  57  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000601052  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0740  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  26.79 
 
 		 212 aa  57.8  0.0000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.865984 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1595  HAD family hydrolase  26.91 
 
 		 219 aa  57  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00389314  normal  0.0112895 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4608  nucleotidase  33.33 
 
 		 225 aa  57  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000431721  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1257  AHBA synthesis associated protein  28.5 
 
 		 228 aa  57.4  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0136935  hitchhiker  0.0000231922 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0569  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  26.7 
 
 		 213 aa  57.4  0.0000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.895889  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>