192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_3261 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010322  PputGB1_3261  phosphonoacetaldehyde hydrolase  100 
 
 
275 aa  567  1e-161  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.258798  normal  0.0791037 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47280  phosphonoacetaldehyde hydrolase  86.45 
 
 
275 aa  494  1e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4080  phosphonoacetaldehyde hydrolase  84.98 
 
 
275 aa  489  1e-137  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3684  phosphonoacetaldehyde hydrolase  79.56 
 
 
275 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1833  phosphonoacetaldehyde hydrolase  80.29 
 
 
275 aa  458  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2208  phosphonoacetaldehyde hydrolase  79.56 
 
 
275 aa  456  1e-127  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.136428  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3462  phosphonoacetaldehyde hydrolase  79.2 
 
 
275 aa  454  1e-127  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.985191  normal  0.890252 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3530  phosphonoacetaldehyde hydrolase  79.56 
 
 
275 aa  456  1e-127  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.359748  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4474  phosphonoacetaldehyde hydrolase  68.89 
 
 
292 aa  384  1e-105  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.139325 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4608  phosphonoacetaldehyde hydrolase  68.89 
 
 
292 aa  384  1e-105  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.363137  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000769  phosphonoacetaldehyde hydrolase  56.02 
 
 
284 aa  306  2.0000000000000002e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04874  phosphonoacetaldehyde hydrolase  54.51 
 
 
271 aa  298  9e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0548  phosphonoacetaldehyde hydrolase  55.26 
 
 
271 aa  297  1e-79  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000564985  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2749  phosphonoacetaldehyde hydrolase  50.55 
 
 
295 aa  286  2e-76  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0492  phosphonoacetaldehyde hydrolase  54.85 
 
 
269 aa  285  8e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0479  phosphonoacetaldehyde hydrolase  54.85 
 
 
269 aa  285  8e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.34346  normal  0.293244 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0534  phosphonoacetaldehyde hydrolase  54.85 
 
 
269 aa  285  8e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.746184  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0471  phosphonoacetaldehyde hydrolase  54.85 
 
 
269 aa  282  4.0000000000000003e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0473  phosphonoacetaldehyde hydrolase  54.48 
 
 
269 aa  282  5.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0814  phosphonoacetaldehyde hydrolase  50.74 
 
 
271 aa  280  1e-74  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.180019  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2412  phosphonoacetaldehyde hydrolase  52.83 
 
 
281 aa  270  2e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2896  phosphonoacetaldehyde hydrolase  42.8 
 
 
277 aa  236  4e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0103695 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2141  phosphonoacetaldehyde hydrolase  41.35 
 
 
267 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2117  phosphonoacetaldehyde hydrolase  41.73 
 
 
267 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0514  phosphonoacetaldehyde hydrolase  41.67 
 
 
280 aa  216  2.9999999999999998e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0295748 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0966  phosphonoacetaldehyde hydrolase  40.15 
 
 
283 aa  215  7e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.12889 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1377  phosphonoacetaldehyde hydrolase  39.15 
 
 
264 aa  211  1e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1731  phosphonoacetaldehyde hydrolase  39.26 
 
 
277 aa  210  2e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.464888  normal  0.0777557 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3836  phosphonoacetaldehyde hydrolase  39.77 
 
 
277 aa  206  3e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000103872 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3967  phosphonoacetaldehyde hydrolase  37.98 
 
 
264 aa  206  4e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1051  phosphonoacetaldehyde hydrolase  39.15 
 
 
264 aa  205  6e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1414  phosphonoacetaldehyde hydrolase  38.37 
 
 
264 aa  204  2e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1439  phosphonoacetaldehyde hydrolase  37.98 
 
 
267 aa  202  3e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1239  phosphonoacetaldehyde hydrolase  38.37 
 
 
264 aa  203  3e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1215  phosphonoacetaldehyde hydrolase  38.37 
 
 
264 aa  203  3e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1217  phosphonoacetaldehyde hydrolase  38.37 
 
 
264 aa  203  3e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1340  phosphonoacetaldehyde hydrolase  38.37 
 
 
264 aa  203  3e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3421  phosphonoacetaldehyde hydrolase  34.98 
 
 
274 aa  198  7.999999999999999e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1240  phosphonoacetaldehyde hydrolase  36.43 
 
 
264 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1480  phosphonoacetaldehyde hydrolase  37.6 
 
 
264 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2989  phosphonoacetaldehyde hydrolase  39.62 
 
 
270 aa  195  9e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.446751  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3627  phosphonoacetaldehyde hydrolase  39.39 
 
 
269 aa  194  2e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2313  phosphonoacetaldehyde hydrolase  36.9 
 
 
257 aa  178  9e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.546562  normal  0.912396 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2114  hypothetical protein  30.99 
 
 
196 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.367695  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3095  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.02 
 
 
234 aa  75.1  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0156733  normal  0.965778 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1909  hypothetical protein  29.24 
 
 
202 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.363123  hitchhiker  0.00151684 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1717  2-deoxyglucose-6-phosphatase  28.85 
 
 
223 aa  67.4  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.886251 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1912  2-deoxyglucose-6-phosphatase  28 
 
 
223 aa  66.6  0.0000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0120822  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3851  hypothetical protein  29.24 
 
 
206 aa  65.9  0.0000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.911623 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2205  2-deoxyglucose-6-phosphatase  26.79 
 
 
221 aa  64.7  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.100097  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01696  predicted hydrolase  26.96 
 
 
222 aa  63.5  0.000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1915  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.96 
 
 
222 aa  63.5  0.000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.752357  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01684  hypothetical protein  26.96 
 
 
222 aa  63.5  0.000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1464  2-deoxyglucose-6-phosphatase  26.96 
 
 
222 aa  63.9  0.000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1905  2-deoxyglucose-6-phosphatase  26.96 
 
 
222 aa  63.5  0.000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.798501  normal  0.727123 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1972  2-deoxyglucose-6-phosphatase  26.96 
 
 
222 aa  63.9  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2445  2-deoxyglucose-6-phosphatase  26.96 
 
 
222 aa  63.9  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1808  2-deoxyglucose-6-phosphatase  26.96 
 
 
222 aa  63.5  0.000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.305682  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1947  2-deoxyglucose-6-phosphatase  26.96 
 
 
222 aa  63.9  0.000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.504113  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1849  2-deoxyglucose-6-phosphatase  26.02 
 
 
222 aa  62.8  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0029739  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1436  2-deoxyglucose-6-phosphatase  26.02 
 
 
222 aa  62.8  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.905236  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2022  2-deoxyglucose-6-phosphatase  26.02 
 
 
222 aa  62.8  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1451  2-deoxyglucose-6-phosphatase  26.02 
 
 
222 aa  62.8  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.913842  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1419  2-deoxyglucose-6-phosphatase  26.19 
 
 
222 aa  62.4  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.744627  hitchhiker  0.00259415 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2632  HAD family hydrolase  31.22 
 
 
233 aa  61.6  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.503423  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0431  2-deoxyglucose-6-phosphatase  29 
 
 
217 aa  61.2  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3315  HAD family hydrolase  29.27 
 
 
242 aa  61.2  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.354727 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3410  2-deoxyglucose-6-phosphatase  27.23 
 
 
217 aa  60.5  0.00000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0110715  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1808  2-deoxyglucose-6-phosphatase  27.5 
 
 
221 aa  60.1  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.417032  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1697  2-deoxyglucose-6-phosphatase  27.5 
 
 
221 aa  60.1  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3772  2-deoxyglucose-6-phosphatase  24.14 
 
 
218 aa  59.7  0.00000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3425  2-deoxyglucose-6-phosphatase  29.55 
 
 
223 aa  59.3  0.00000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000919178  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2007  HAD family hydrolase  29.41 
 
 
233 aa  59.3  0.00000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0418734 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3307  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  30.52 
 
 
735 aa  58.9  0.00000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.081208  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2787  phosphoglycolate phosphatase  31.34 
 
 
221 aa  58.5  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00496025  hitchhiker  0.0014162 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3402  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  27.24 
 
 
244 aa  58.2  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0865244 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0027  HAD-superfamily hydrolase  27.33 
 
 
238 aa  57.4  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1319  HAD family hydrolase  29.06 
 
 
223 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3547  phosphoglycolate phosphatase  30.54 
 
 
238 aa  56.6  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2125  2-deoxyglucose-6-phosphatase  25.12 
 
 
221 aa  56.2  0.0000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0177126  hitchhiker  0.00144451 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3574  phosphoglycolate phosphatase  27.4 
 
 
242 aa  54.3  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.952116  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3555  phosphoglycolate phosphatase  27.4 
 
 
245 aa  53.9  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.221388  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3582  phosphoglycolate phosphatase  27.4 
 
 
245 aa  53.9  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2701  phosphoglycolate phosphatase  24.79 
 
 
230 aa  53.1  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.364651  normal  0.0856305 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27890  hypothetical protein  28.18 
 
 
247 aa  52.8  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0534  phosphoglycolate phosphatase  26.92 
 
 
242 aa  52.4  0.000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0250125  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2581  phosphoglycolate phosphatase  32.84 
 
 
221 aa  52.4  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2091  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  28.77 
 
 
233 aa  52.4  0.000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2743  HAD family hydrolase  27.18 
 
 
227 aa  52.8  0.000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.994994  normal  0.0511558 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0643  phosphoglycolate phosphatase  26.92 
 
 
242 aa  52.4  0.000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0939  phosphoglycolate phosphatase  26.92 
 
 
242 aa  52.4  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1909  phosphoglycolate phosphatase  26.92 
 
 
242 aa  52.4  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1798  phosphoglycolate phosphatase  32.58 
 
 
221 aa  52.4  0.000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0263592  unclonable  0.00000282508 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0710  phosphoglycolate phosphatase  32.58 
 
 
218 aa  52.4  0.000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.113573  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0436  2-deoxyglucose-6-phosphatase  25.73 
 
 
218 aa  52.4  0.000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000024214  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0053  hydrolase  28.31 
 
 
229 aa  52  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.205751 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2690  HAD family hydrolase  29.91 
 
 
221 aa  52  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.365385  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0071  phosphatase-like protein  26.32 
 
 
246 aa  51.6  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7385  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA  27.15 
 
 
248 aa  51.2  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1925  phosphatase/phosphohexomutase-like protein  27.72 
 
 
239 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.27121 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>