52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_1925 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_1925  phosphatase/phosphohexomutase-like protein  100 
 
 		 239 aa  473  1e-133  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.27121 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27890  hypothetical protein  56.96 
 
 		 247 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2354  hypothetical protein  58.23 
 
 		 247 aa  230  2e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3851  hypothetical protein  49.17 
 
 		 206 aa  207  1e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.911623 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1909  hypothetical protein  48.94 
 
 		 202 aa  205  5e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.363123  hitchhiker  0.00151684 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2114  hypothetical protein  47.93 
 
 		 196 aa  203  2e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.367695  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1703  hypothetical protein  53.46 
 
 		 187 aa  168  8e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235983 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2162  hypothetical protein  55.28 
 
 		 187 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.085842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3580  hypothetical protein  55.28 
 
 		 187 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.091933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1679  hypothetical protein  50.57 
 
 		 187 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2141  phosphonoacetaldehyde hydrolase  23.02 
 
 		 267 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2117  phosphonoacetaldehyde hydrolase  23.4 
 
 		 267 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2749  phosphonoacetaldehyde hydrolase  22.26 
 
 		 295 aa  65.5  0.0000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0473  phosphonoacetaldehyde hydrolase  35.77 
 
 		 269 aa  63.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0966  phosphonoacetaldehyde hydrolase  33.03 
 
 		 283 aa  64.3  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.12889 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3836  phosphonoacetaldehyde hydrolase  31.19 
 
 		 277 aa  62.8  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000103872 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0492  phosphonoacetaldehyde hydrolase  35.77 
 
 		 269 aa  62.8  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0534  phosphonoacetaldehyde hydrolase  35.77 
 
 		 269 aa  62.8  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.746184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0479  phosphonoacetaldehyde hydrolase  35.77 
 
 		 269 aa  62.8  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.34346  normal  0.293244 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3421  phosphonoacetaldehyde hydrolase  25.23 
 
 		 274 aa  62  0.000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0471  phosphonoacetaldehyde hydrolase  34.82 
 
 		 269 aa  62  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000769  phosphonoacetaldehyde hydrolase  23.91 
 
 		 284 aa  61.6  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0814  phosphonoacetaldehyde hydrolase  23.99 
 
 		 271 aa  60.5  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.180019  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47280  phosphonoacetaldehyde hydrolase  30.11 
 
 		 275 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4080  phosphonoacetaldehyde hydrolase  30.11 
 
 		 275 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3462  phosphonoacetaldehyde hydrolase  30.68 
 
 		 275 aa  59.7  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.985191  normal  0.890252 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0548  phosphonoacetaldehyde hydrolase  24.82 
 
 		 271 aa  58.2  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000564985  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1833  phosphonoacetaldehyde hydrolase  30.11 
 
 		 275 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2896  phosphonoacetaldehyde hydrolase  27.78 
 
 		 277 aa  57  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0103695 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2208  phosphonoacetaldehyde hydrolase  29.55 
 
 		 275 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.136428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2989  phosphonoacetaldehyde hydrolase  23.79 
 
 		 270 aa  56.6  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.446751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3530  phosphonoacetaldehyde hydrolase  29.55 
 
 		 275 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.359748  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3627  phosphonoacetaldehyde hydrolase  26.61 
 
 		 269 aa  55.5  0.0000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3684  phosphonoacetaldehyde hydrolase  27.68 
 
 		 275 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04874  phosphonoacetaldehyde hydrolase  21.77 
 
 		 271 aa  53.5  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4474  phosphonoacetaldehyde hydrolase  27.19 
 
 		 292 aa  52.8  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.139325 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4608  phosphonoacetaldehyde hydrolase  27.19 
 
 		 292 aa  52.8  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.363137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1822  putative phosphatase  32.43 
 
 		 218 aa  52  0.000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1554  putative phosphatase  32.43 
 
 		 218 aa  52  0.000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1446  putative phosphatase  32.43 
 
 		 218 aa  52  0.000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3261  phosphonoacetaldehyde hydrolase  27.72 
 
 		 275 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.258798  normal  0.0791037 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1731  phosphonoacetaldehyde hydrolase  25.54 
 
 		 277 aa  49.7  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.464888  normal  0.0777557 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2777  putative phosphatase  30.27 
 
 		 224 aa  48.1  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.779945  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2313  phosphonoacetaldehyde hydrolase  28.87 
 
 		 257 aa  47.8  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.546562  normal  0.912396 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1388  putative phosphatase  30.27 
 
 		 218 aa  47  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00329661  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1487  putative phosphatase  29.73 
 
 		 224 aa  46.6  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.751605  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0514  phosphonoacetaldehyde hydrolase  24.77 
 
 		 280 aa  45.8  0.0005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0295748 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2556  putative phosphatase  33.33 
 
 		 218 aa  44.3  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4417  HAD family hydrolase  29.95 
 
 		 232 aa  43.5  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.155896  normal  0.156136 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1937  HAD family hydrolase  29.95 
 
 		 234 aa  42.4  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.67763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1377  phosphonoacetaldehyde hydrolase  23.36 
 
 		 264 aa  42  0.009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2586  putative phosphatase  30.81 
 
 		 216 aa  41.6  0.01  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.118565  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>