110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1731 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_1731  phosphonoacetaldehyde hydrolase  100 
 
 
277 aa  568  1e-161  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.464888  normal  0.0777557 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2896  phosphonoacetaldehyde hydrolase  54.15 
 
 
277 aa  328  5.0000000000000004e-89  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0103695 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0514  phosphonoacetaldehyde hydrolase  51.99 
 
 
280 aa  291  6e-78  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0295748 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0966  phosphonoacetaldehyde hydrolase  51.28 
 
 
283 aa  281  9e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.12889 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1051  phosphonoacetaldehyde hydrolase  49.61 
 
 
264 aa  277  2e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3967  phosphonoacetaldehyde hydrolase  48.44 
 
 
264 aa  274  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1240  phosphonoacetaldehyde hydrolase  50 
 
 
264 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1239  phosphonoacetaldehyde hydrolase  49.22 
 
 
264 aa  272  5.000000000000001e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1215  phosphonoacetaldehyde hydrolase  49.22 
 
 
264 aa  272  5.000000000000001e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1217  phosphonoacetaldehyde hydrolase  49.22 
 
 
264 aa  272  5.000000000000001e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1340  phosphonoacetaldehyde hydrolase  49.22 
 
 
264 aa  272  5.000000000000001e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1439  phosphonoacetaldehyde hydrolase  49.61 
 
 
267 aa  271  6e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1480  phosphonoacetaldehyde hydrolase  49.22 
 
 
264 aa  269  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1414  phosphonoacetaldehyde hydrolase  48.83 
 
 
264 aa  269  4e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3836  phosphonoacetaldehyde hydrolase  47.76 
 
 
277 aa  267  1e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000103872 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1377  phosphonoacetaldehyde hydrolase  48.05 
 
 
264 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2313  phosphonoacetaldehyde hydrolase  44.66 
 
 
257 aa  223  3e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.546562  normal  0.912396 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2141  phosphonoacetaldehyde hydrolase  40.53 
 
 
267 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3627  phosphonoacetaldehyde hydrolase  39.02 
 
 
269 aa  221  8e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2117  phosphonoacetaldehyde hydrolase  40.91 
 
 
267 aa  221  9e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47280  phosphonoacetaldehyde hydrolase  41.67 
 
 
275 aa  219  5e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000769  phosphonoacetaldehyde hydrolase  39.71 
 
 
284 aa  216  2.9999999999999998e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4080  phosphonoacetaldehyde hydrolase  40.91 
 
 
275 aa  216  5e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04874  phosphonoacetaldehyde hydrolase  39.7 
 
 
271 aa  213  2.9999999999999995e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0479  phosphonoacetaldehyde hydrolase  42.75 
 
 
269 aa  213  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.34346  normal  0.293244 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0534  phosphonoacetaldehyde hydrolase  42.75 
 
 
269 aa  213  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.746184  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0492  phosphonoacetaldehyde hydrolase  42.75 
 
 
269 aa  213  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0471  phosphonoacetaldehyde hydrolase  42.75 
 
 
269 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3684  phosphonoacetaldehyde hydrolase  41.11 
 
 
275 aa  210  2e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3261  phosphonoacetaldehyde hydrolase  39.26 
 
 
275 aa  210  2e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.258798  normal  0.0791037 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0548  phosphonoacetaldehyde hydrolase  39.7 
 
 
271 aa  209  3e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000564985  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0473  phosphonoacetaldehyde hydrolase  42.38 
 
 
269 aa  210  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3421  phosphonoacetaldehyde hydrolase  37.5 
 
 
274 aa  208  9e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2749  phosphonoacetaldehyde hydrolase  37.92 
 
 
295 aa  206  5e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3462  phosphonoacetaldehyde hydrolase  38.75 
 
 
275 aa  204  1e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.985191  normal  0.890252 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2208  phosphonoacetaldehyde hydrolase  39.11 
 
 
275 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.136428  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3530  phosphonoacetaldehyde hydrolase  39.11 
 
 
275 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.359748  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1833  phosphonoacetaldehyde hydrolase  39.48 
 
 
275 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0814  phosphonoacetaldehyde hydrolase  38.2 
 
 
271 aa  201  9.999999999999999e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.180019  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2989  phosphonoacetaldehyde hydrolase  38.2 
 
 
270 aa  199  3.9999999999999996e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.446751  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4474  phosphonoacetaldehyde hydrolase  37.23 
 
 
292 aa  198  6e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.139325 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4608  phosphonoacetaldehyde hydrolase  37.23 
 
 
292 aa  198  6e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.363137  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2412  phosphonoacetaldehyde hydrolase  38.2 
 
 
281 aa  189  5e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3095  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.91 
 
 
234 aa  80.1  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0156733  normal  0.965778 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2114  hypothetical protein  30.23 
 
 
196 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.367695  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1301  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  31.97 
 
 
228 aa  66.2  0.0000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.782591  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3817  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.04 
 
 
227 aa  63.2  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0325282  hitchhiker  0.00357212 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1909  hypothetical protein  27.65 
 
 
202 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.363123  hitchhiker  0.00151684 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3851  hypothetical protein  26.18 
 
 
206 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.911623 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2102  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  27.13 
 
 
233 aa  60.1  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0053  hydrolase  26.82 
 
 
229 aa  56.6  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.205751 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2582  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 1  27.45 
 
 
224 aa  55.1  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0909618 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0714  hydrolase  30.77 
 
 
255 aa  54.7  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3084  HAD family hydrolase  30.84 
 
 
219 aa  54.3  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0027  HAD-superfamily hydrolase  27.91 
 
 
238 aa  53.9  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3402  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  26.91 
 
 
244 aa  52.8  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0865244 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2701  phosphoglycolate phosphatase  25.21 
 
 
230 aa  52.4  0.000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.364651  normal  0.0856305 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2112  HAD family hydrolase  27.19 
 
 
239 aa  52  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4840  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  33.33 
 
 
220 aa  51.2  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0176298  hitchhiker  0.0000825577 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1925  phosphatase/phosphohexomutase-like protein  25.54 
 
 
239 aa  49.7  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.27121 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1562  putative hydrolase  23.01 
 
 
218 aa  49.3  0.00006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.320439  normal  0.240105 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1907  HAD superfamily hydrolase  32.08 
 
 
224 aa  48.9  0.00008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.00000027861 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3807  HAD family hydrolase  32.08 
 
 
224 aa  48.9  0.00008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.118188  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27890  hypothetical protein  25.68 
 
 
247 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1319  HAD family hydrolase  26.92 
 
 
223 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1483  HAD family hydrolase  31.13 
 
 
224 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0762089  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3103  HAD family hydrolase  31.25 
 
 
562 aa  47.4  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1679  hypothetical protein  31.53 
 
 
187 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3012  phosphoglycolate phosphatase  24.24 
 
 
237 aa  46.6  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0258131  normal  0.0275568 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2007  HAD family hydrolase  27.36 
 
 
233 aa  46.2  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0418734 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2632  HAD family hydrolase  27.36 
 
 
233 aa  46.2  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.503423  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2240  HAD family hydrolase  28.93 
 
 
214 aa  45.8  0.0008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.279618  normal  0.937061 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2192  phosphoglycolate phosphatase  29.75 
 
 
217 aa  45.1  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0971  2-phosphoglycolate phosphatase  26.92 
 
 
237 aa  45.4  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.080581  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2354  hypothetical protein  29.13 
 
 
247 aa  45.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1703  hypothetical protein  25.69 
 
 
187 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00235983 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1518  HAD family hydrolase  33.66 
 
 
226 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0020263  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3186  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  31.46 
 
 
231 aa  45.1  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.234606  normal  0.0137169 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3168  pyrophosphatase PpaX  24.51 
 
 
222 aa  45.1  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4164  HAD family hydrolase  31.07 
 
 
193 aa  44.3  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0540485  normal  0.889807 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2232  pyrophosphatase PpaX  23.73 
 
 
214 aa  44.7  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25590  putative hydrolase  25.12 
 
 
230 aa  44.3  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.080664  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3122  HAD family hydrolase  25 
 
 
214 aa  44.3  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0071  phosphatase-like protein  26.92 
 
 
246 aa  44.3  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1380  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.8 
 
 
223 aa  44.3  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2581  phosphoglycolate phosphatase  29.23 
 
 
221 aa  43.9  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3658  HAD family hydrolase  24.64 
 
 
219 aa  43.9  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2438  HAD family hydrolase  24.62 
 
 
219 aa  43.9  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.625372  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1295  HAD-superfamily hydrolase  28.33 
 
 
224 aa  43.5  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.647127  normal  0.296731 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0647  HAD family hydrolase  24.89 
 
 
221 aa  43.9  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.496334  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0431  2-deoxyglucose-6-phosphatase  23.88 
 
 
217 aa  43.5  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2363  phosphoglycolate phosphatase  26.62 
 
 
227 aa  43.5  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.496506  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03670  predicted phosphatase  26.45 
 
 
244 aa  43.5  0.004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0282294  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2162  hypothetical protein  25.69 
 
 
187 aa  43.1  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.085842  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3580  hypothetical protein  25.69 
 
 
187 aa  43.1  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.091933  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0729  HAD family hydrolase  30.3 
 
 
225 aa  42.7  0.006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0260  haloacid dehalogenase, IA family protein  24.88 
 
 
217 aa  42.7  0.006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1987  HAD family hydrolase  25.87 
 
 
215 aa  42.7  0.006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0143235  normal  0.0109237 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3288  HAD family hydrolase  29.71 
 
 
222 aa  42.7  0.006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3992  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25.5 
 
 
218 aa  42.7  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.177922  normal  0.23268 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>