99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A2117 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A2117  phosphonoacetaldehyde hydrolase  100 
 
 
267 aa  536  1e-151  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2141  phosphonoacetaldehyde hydrolase  93.63 
 
 
267 aa  503  9.999999999999999e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2989  phosphonoacetaldehyde hydrolase  46.97 
 
 
270 aa  255  6e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.446751  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0966  phosphonoacetaldehyde hydrolase  46.21 
 
 
283 aa  244  9.999999999999999e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.12889 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0473  phosphonoacetaldehyde hydrolase  49.44 
 
 
269 aa  231  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0479  phosphonoacetaldehyde hydrolase  49.44 
 
 
269 aa  230  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.34346  normal  0.293244 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0534  phosphonoacetaldehyde hydrolase  49.44 
 
 
269 aa  230  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.746184  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0492  phosphonoacetaldehyde hydrolase  49.44 
 
 
269 aa  230  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3836  phosphonoacetaldehyde hydrolase  44.32 
 
 
277 aa  230  2e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000103872 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0471  phosphonoacetaldehyde hydrolase  49.44 
 
 
269 aa  230  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0514  phosphonoacetaldehyde hydrolase  42.8 
 
 
280 aa  225  6e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0295748 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0548  phosphonoacetaldehyde hydrolase  45.11 
 
 
271 aa  225  6e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000564985  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0814  phosphonoacetaldehyde hydrolase  44.36 
 
 
271 aa  222  4e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.180019  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2896  phosphonoacetaldehyde hydrolase  40.15 
 
 
277 aa  223  4e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0103695 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1731  phosphonoacetaldehyde hydrolase  40.91 
 
 
277 aa  221  8e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.464888  normal  0.0777557 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3261  phosphonoacetaldehyde hydrolase  41.73 
 
 
275 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.258798  normal  0.0791037 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4608  phosphonoacetaldehyde hydrolase  43.4 
 
 
292 aa  218  6e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.363137  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4474  phosphonoacetaldehyde hydrolase  43.4 
 
 
292 aa  218  6e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.139325 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000769  phosphonoacetaldehyde hydrolase  43.23 
 
 
284 aa  217  1e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2749  phosphonoacetaldehyde hydrolase  41.35 
 
 
295 aa  216  2.9999999999999998e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04874  phosphonoacetaldehyde hydrolase  43.61 
 
 
271 aa  216  4e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1340  phosphonoacetaldehyde hydrolase  41.25 
 
 
264 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1215  phosphonoacetaldehyde hydrolase  41.25 
 
 
264 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1239  phosphonoacetaldehyde hydrolase  41.25 
 
 
264 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1217  phosphonoacetaldehyde hydrolase  41.25 
 
 
264 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2412  phosphonoacetaldehyde hydrolase  43.02 
 
 
281 aa  214  1.9999999999999998e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47280  phosphonoacetaldehyde hydrolase  41.67 
 
 
275 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1439  phosphonoacetaldehyde hydrolase  40.86 
 
 
267 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1377  phosphonoacetaldehyde hydrolase  40.86 
 
 
264 aa  212  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2208  phosphonoacetaldehyde hydrolase  40.75 
 
 
275 aa  211  7e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.136428  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3530  phosphonoacetaldehyde hydrolase  40.75 
 
 
275 aa  211  7e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.359748  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1480  phosphonoacetaldehyde hydrolase  40.08 
 
 
264 aa  211  1e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1414  phosphonoacetaldehyde hydrolase  40.86 
 
 
264 aa  211  1e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3684  phosphonoacetaldehyde hydrolase  40.75 
 
 
275 aa  211  1e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4080  phosphonoacetaldehyde hydrolase  41.29 
 
 
275 aa  211  1e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3967  phosphonoacetaldehyde hydrolase  39.69 
 
 
264 aa  209  3e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1833  phosphonoacetaldehyde hydrolase  40 
 
 
275 aa  208  6e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3462  phosphonoacetaldehyde hydrolase  40.38 
 
 
275 aa  208  7e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.985191  normal  0.890252 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1240  phosphonoacetaldehyde hydrolase  39.3 
 
 
264 aa  207  1e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1051  phosphonoacetaldehyde hydrolase  40.08 
 
 
264 aa  207  1e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3421  phosphonoacetaldehyde hydrolase  38.4 
 
 
274 aa  207  1e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3627  phosphonoacetaldehyde hydrolase  38.64 
 
 
269 aa  192  7e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2313  phosphonoacetaldehyde hydrolase  40.73 
 
 
257 aa  190  2.9999999999999997e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.546562  normal  0.912396 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3095  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.85 
 
 
234 aa  72.4  0.000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0156733  normal  0.965778 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2354  hypothetical protein  33.04 
 
 
247 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27890  hypothetical protein  32.11 
 
 
247 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1925  phosphatase/phosphohexomutase-like protein  23.4 
 
 
239 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.27121 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4840  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25 
 
 
220 aa  65.1  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0176298  hitchhiker  0.0000825577 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2114  hypothetical protein  26.47 
 
 
196 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.367695  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1909  hypothetical protein  30.63 
 
 
202 aa  62  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.363123  hitchhiker  0.00151684 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3851  hypothetical protein  30.28 
 
 
206 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.911623 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0436  haloacid dehalogenase/epoxide hydrolase family protein  25.74 
 
 
226 aa  55.1  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2102  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  27.73 
 
 
233 aa  54.7  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2162  hypothetical protein  28.44 
 
 
187 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.085842  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3580  hypothetical protein  28.44 
 
 
187 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.091933  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1679  hypothetical protein  26.61 
 
 
187 aa  52.8  0.000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1319  HAD family hydrolase  27.6 
 
 
223 aa  52.4  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1703  hypothetical protein  27.52 
 
 
187 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00235983 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2581  phosphoglycolate phosphatase  28.22 
 
 
221 aa  49.3  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0766  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.62 
 
 
222 aa  49.7  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0053  hydrolase  25.47 
 
 
229 aa  49.3  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.205751 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4762  HAD family hydrolase  22.48 
 
 
242 aa  48.9  0.00009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.698376  hitchhiker  0.00269567 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2240  HAD family hydrolase  24.06 
 
 
214 aa  48.5  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.279618  normal  0.937061 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2790  HAD family hydrolase  22.27 
 
 
223 aa  47.8  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1483  HAD family hydrolase  25.62 
 
 
224 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0762089  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1573  HAD family hydrolase  27.56 
 
 
222 aa  47.8  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.670571  normal  0.310253 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0770  putative phosphatase  24.51 
 
 
200 aa  47.4  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.737749  normal  0.0504873 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1301  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  28 
 
 
228 aa  48.1  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.782591  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1987  HAD family hydrolase  23.56 
 
 
215 aa  47.4  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0143235  normal  0.0109237 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4817  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25 
 
 
235 aa  47  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.821962  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0027  HAD-superfamily hydrolase  22.73 
 
 
238 aa  46.2  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2300  HAD family hydrolase  25.48 
 
 
215 aa  45.8  0.0007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000835779  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2112  HAD family hydrolase  25.48 
 
 
239 aa  45.8  0.0008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2157  beta-phosphoglucomutase  22.61 
 
 
585 aa  45.1  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14840  HAD-superfamily hydrolase  23.67 
 
 
220 aa  45.1  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.770171  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3402  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  24.44 
 
 
244 aa  45.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0865244 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05938  hypothetical protein  22.27 
 
 
237 aa  44.3  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3658  HAD family hydrolase  28 
 
 
219 aa  44.3  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2632  HAD family hydrolase  22.12 
 
 
216 aa  44.7  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.861911  hitchhiker  0.000131082 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0787  HAD family sugar phosphatase  24.28 
 
 
234 aa  44.3  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00527191  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1874  HAD family hydrolase  26.38 
 
 
216 aa  44.3  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.785736  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0658  haloacid dehalogenase-like hydrolase  28.04 
 
 
222 aa  44.3  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.40238 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2582  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 1  23.32 
 
 
224 aa  44.3  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0909618 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4525  phosphatase  24.04 
 
 
208 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0071  phosphatase-like protein  23.42 
 
 
246 aa  43.5  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2187  putative hydrolase  23.96 
 
 
230 aa  43.5  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0143931  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25590  putative hydrolase  23.41 
 
 
230 aa  43.9  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.080664  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0641  HAD family hydrolase  22.12 
 
 
220 aa  43.9  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.950078  normal  0.0427696 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3556  HAD family hydrolase  25.37 
 
 
262 aa  43.5  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1621  HAD family hydrolase  22.8 
 
 
231 aa  43.1  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0638141  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0783  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.56 
 
 
222 aa  42.7  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0714  hydrolase  25.66 
 
 
255 aa  42.7  0.006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0356  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  23.88 
 
 
233 aa  42.7  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2007  HAD family hydrolase  25 
 
 
233 aa  42.7  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0418734 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2255  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  23.11 
 
 
209 aa  42.4  0.008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00490459 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3807  HAD family hydrolase  24.52 
 
 
224 aa  42.4  0.008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.118188  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2438  HAD family hydrolase  23.92 
 
 
219 aa  42.4  0.009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.625372  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02338  putative phosphoglycolate phosphatase, contains a phosphatase-like domain  25.5 
 
 
234 aa  42  0.01  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0463297  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1907  HAD superfamily hydrolase  24.64 
 
 
224 aa  42  0.01  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.00000027861 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>