100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_2141 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_2141  phosphonoacetaldehyde hydrolase  100 
 
 
267 aa  537  9.999999999999999e-153  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2117  phosphonoacetaldehyde hydrolase  93.63 
 
 
267 aa  503  9.999999999999999e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2989  phosphonoacetaldehyde hydrolase  47.35 
 
 
270 aa  257  1e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.446751  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0966  phosphonoacetaldehyde hydrolase  46.97 
 
 
283 aa  253  3e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.12889 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3836  phosphonoacetaldehyde hydrolase  45.08 
 
 
277 aa  236  3e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000103872 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0473  phosphonoacetaldehyde hydrolase  49.07 
 
 
269 aa  231  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0479  phosphonoacetaldehyde hydrolase  49.07 
 
 
269 aa  230  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.34346  normal  0.293244 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0534  phosphonoacetaldehyde hydrolase  49.07 
 
 
269 aa  230  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.746184  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0492  phosphonoacetaldehyde hydrolase  49.07 
 
 
269 aa  230  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0471  phosphonoacetaldehyde hydrolase  49.07 
 
 
269 aa  230  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0548  phosphonoacetaldehyde hydrolase  44.74 
 
 
271 aa  226  3e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000564985  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0814  phosphonoacetaldehyde hydrolase  44.36 
 
 
271 aa  226  4e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.180019  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0514  phosphonoacetaldehyde hydrolase  42.42 
 
 
280 aa  223  2e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0295748 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000769  phosphonoacetaldehyde hydrolase  43.61 
 
 
284 aa  223  3e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3261  phosphonoacetaldehyde hydrolase  41.35 
 
 
275 aa  222  4e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.258798  normal  0.0791037 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2749  phosphonoacetaldehyde hydrolase  41.73 
 
 
295 aa  223  4e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1731  phosphonoacetaldehyde hydrolase  40.53 
 
 
277 aa  222  4.9999999999999996e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.464888  normal  0.0777557 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1340  phosphonoacetaldehyde hydrolase  42.02 
 
 
264 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04874  phosphonoacetaldehyde hydrolase  43.98 
 
 
271 aa  221  9.999999999999999e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1215  phosphonoacetaldehyde hydrolase  42.02 
 
 
264 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1239  phosphonoacetaldehyde hydrolase  42.02 
 
 
264 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1217  phosphonoacetaldehyde hydrolase  42.02 
 
 
264 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1377  phosphonoacetaldehyde hydrolase  41.63 
 
 
264 aa  218  5e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1439  phosphonoacetaldehyde hydrolase  41.63 
 
 
267 aa  218  6e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4608  phosphonoacetaldehyde hydrolase  42.26 
 
 
292 aa  218  7e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.363137  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4474  phosphonoacetaldehyde hydrolase  42.26 
 
 
292 aa  218  7e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.139325 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1414  phosphonoacetaldehyde hydrolase  41.63 
 
 
264 aa  218  1e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2896  phosphonoacetaldehyde hydrolase  39.02 
 
 
277 aa  217  1e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0103695 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3967  phosphonoacetaldehyde hydrolase  40.47 
 
 
264 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1051  phosphonoacetaldehyde hydrolase  40.86 
 
 
264 aa  215  5.9999999999999996e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1240  phosphonoacetaldehyde hydrolase  40.08 
 
 
264 aa  214  9e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3530  phosphonoacetaldehyde hydrolase  40.38 
 
 
275 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.359748  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2208  phosphonoacetaldehyde hydrolase  40.38 
 
 
275 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.136428  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2412  phosphonoacetaldehyde hydrolase  42.26 
 
 
281 aa  214  1.9999999999999998e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3462  phosphonoacetaldehyde hydrolase  40.38 
 
 
275 aa  212  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.985191  normal  0.890252 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3684  phosphonoacetaldehyde hydrolase  40.38 
 
 
275 aa  211  7e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1480  phosphonoacetaldehyde hydrolase  40.47 
 
 
264 aa  211  7e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1833  phosphonoacetaldehyde hydrolase  39.62 
 
 
275 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47280  phosphonoacetaldehyde hydrolase  40.53 
 
 
275 aa  209  4e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3421  phosphonoacetaldehyde hydrolase  39.55 
 
 
274 aa  208  9e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4080  phosphonoacetaldehyde hydrolase  40.15 
 
 
275 aa  207  1e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3627  phosphonoacetaldehyde hydrolase  39.02 
 
 
269 aa  199  3.9999999999999996e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2313  phosphonoacetaldehyde hydrolase  40.32 
 
 
257 aa  189  5e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.546562  normal  0.912396 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3095  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.81 
 
 
234 aa  79.3  0.00000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0156733  normal  0.965778 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27890  hypothetical protein  33.03 
 
 
247 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2354  hypothetical protein  33.94 
 
 
247 aa  69.3  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1925  phosphatase/phosphohexomutase-like protein  23.02 
 
 
239 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.27121 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4840  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  24.31 
 
 
220 aa  67.4  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0176298  hitchhiker  0.0000825577 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2114  hypothetical protein  31.53 
 
 
196 aa  65.5  0.0000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.367695  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1909  hypothetical protein  31.53 
 
 
202 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.363123  hitchhiker  0.00151684 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3851  hypothetical protein  31.19 
 
 
206 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.911623 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2102  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  28.12 
 
 
233 aa  62.4  0.000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1679  hypothetical protein  27.52 
 
 
187 aa  55.5  0.0000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3580  hypothetical protein  29.36 
 
 
187 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.091933  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2162  hypothetical protein  29.36 
 
 
187 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.085842  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4525  phosphatase  24.66 
 
 
208 aa  52.4  0.000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1703  hypothetical protein  28.44 
 
 
187 aa  52  0.000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00235983 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2632  HAD family hydrolase  23.15 
 
 
216 aa  51.6  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.861911  hitchhiker  0.000131082 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2007  HAD family hydrolase  25 
 
 
233 aa  48.5  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0418734 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0027  HAD-superfamily hydrolase  23.3 
 
 
238 aa  47.4  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0436  haloacid dehalogenase/epoxide hydrolase family protein  24.74 
 
 
226 aa  47.8  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2240  HAD family hydrolase  26.89 
 
 
214 aa  47.4  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.279618  normal  0.937061 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4142  6-phosphogluconate phosphatase  22.45 
 
 
221 aa  47.4  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05938  hypothetical protein  23.22 
 
 
237 aa  47  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3402  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  24.48 
 
 
244 aa  46.6  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0865244 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1319  HAD family hydrolase  27.03 
 
 
223 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1483  HAD family hydrolase  24.88 
 
 
224 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0762089  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0053  hydrolase  23.08 
 
 
229 aa  46.6  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.205751 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1987  HAD family hydrolase  23.56 
 
 
215 aa  45.8  0.0006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0143235  normal  0.0109237 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2790  HAD family hydrolase  22.82 
 
 
223 aa  46.2  0.0006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0766  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.19 
 
 
222 aa  46.2  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1573  HAD family hydrolase  27.56 
 
 
222 aa  45.8  0.0007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.670571  normal  0.310253 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4762  HAD family hydrolase  22.48 
 
 
242 aa  45.8  0.0007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.698376  hitchhiker  0.00269567 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0071  phosphatase-like protein  24.05 
 
 
246 aa  45.8  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1907  HAD superfamily hydrolase  25.12 
 
 
224 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.00000027861 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4240  6-phosphogluconate phosphatase  21.94 
 
 
221 aa  44.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0636361  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3807  HAD family hydrolase  25 
 
 
224 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.118188  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2112  HAD family hydrolase  26.15 
 
 
239 aa  45.4  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4133  6-phosphogluconate phosphatase  21.94 
 
 
221 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0258255  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4814  HAD family hydrolase  27.89 
 
 
221 aa  44.3  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0787  HAD family sugar phosphatase  23.5 
 
 
234 aa  44.3  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00527191  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3475  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  24.15 
 
 
221 aa  44.3  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7122  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.4 
 
 
219 aa  44.3  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4082  6-phosphogluconate phosphatase  20.92 
 
 
221 aa  44.3  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.580327 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2632  HAD family hydrolase  25.58 
 
 
233 aa  43.9  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.503423  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0658  haloacid dehalogenase-like hydrolase  27.1 
 
 
222 aa  43.5  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.40238 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4183  6-phosphogluconate phosphatase  21.94 
 
 
221 aa  43.5  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.201399  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4061  6-phosphogluconate phosphatase  21.94 
 
 
221 aa  43.5  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2582  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 1  22.53 
 
 
224 aa  43.1  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0909618 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5146  6-phosphogluconate phosphatase  20.92 
 
 
221 aa  43.1  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.107109 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3315  HAD family hydrolase  27.27 
 
 
242 aa  43.1  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.354727 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1715  HAD family hydrolase  25.96 
 
 
195 aa  42.4  0.007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.101498 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3658  HAD family hydrolase  26.62 
 
 
219 aa  42.4  0.007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0770  putative phosphatase  24.02 
 
 
200 aa  42.4  0.008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.737749  normal  0.0504873 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0019  phosphatase  21.69 
 
 
208 aa  42.4  0.009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.379676 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03599  predicted hydrolase  20.41 
 
 
221 aa  42  0.01  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03543  hypothetical protein  20.41 
 
 
221 aa  42  0.01  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3929  6-phosphogluconate phosphatase  20.41 
 
 
221 aa  42  0.01  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4224  6-phosphogluconate phosphatase  20.41 
 
 
221 aa  42  0.01  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4279  6-phosphogluconate phosphatase  20.41 
 
 
221 aa  42  0.01  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>