127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_1833 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_1833  phosphonoacetaldehyde hydrolase  100 
 
 		 275 aa  568  1e-161  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2208  phosphonoacetaldehyde hydrolase  98.18 
 
 		 275 aa  560  1e-158  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.136428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3530  phosphonoacetaldehyde hydrolase  98.18 
 
 		 275 aa  560  1e-158  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.359748  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3462  phosphonoacetaldehyde hydrolase  96.73 
 
 		 275 aa  554  1e-157  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.985191  normal  0.890252 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3684  phosphonoacetaldehyde hydrolase  87.96 
 
 		 275 aa  510  1e-144  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47280  phosphonoacetaldehyde hydrolase  82.42 
 
 		 275 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4080  phosphonoacetaldehyde hydrolase  81.32 
 
 		 275 aa  461  1e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3261  phosphonoacetaldehyde hydrolase  80.29 
 
 		 275 aa  458  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.258798  normal  0.0791037 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4608  phosphonoacetaldehyde hydrolase  69.85 
 
 		 292 aa  395  1e-109  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.363137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4474  phosphonoacetaldehyde hydrolase  69.85 
 
 		 292 aa  395  1e-109  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.139325 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000769  phosphonoacetaldehyde hydrolase  56.57 
 
 		 284 aa  313  1.9999999999999998e-84  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04874  phosphonoacetaldehyde hydrolase  55.22 
 
 		 271 aa  303  3.0000000000000004e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0548  phosphonoacetaldehyde hydrolase  54.89 
 
 		 271 aa  295  5e-79  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000564985  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2749  phosphonoacetaldehyde hydrolase  51.88 
 
 		 295 aa  289  3e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0471  phosphonoacetaldehyde hydrolase  53.73 
 
 		 269 aa  282  4.0000000000000003e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0479  phosphonoacetaldehyde hydrolase  53.36 
 
 		 269 aa  280  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.34346  normal  0.293244 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0534  phosphonoacetaldehyde hydrolase  53.36 
 
 		 269 aa  280  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.746184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0492  phosphonoacetaldehyde hydrolase  53.36 
 
 		 269 aa  280  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0814  phosphonoacetaldehyde hydrolase  51.88 
 
 		 271 aa  279  4e-74  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.180019  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0473  phosphonoacetaldehyde hydrolase  52.99 
 
 		 269 aa  277  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2412  phosphonoacetaldehyde hydrolase  52.81 
 
 		 281 aa  268  5e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2896  phosphonoacetaldehyde hydrolase  41.85 
 
 		 277 aa  228  6e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0103695 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2141  phosphonoacetaldehyde hydrolase  39.62 
 
 		 267 aa  211  1e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2117  phosphonoacetaldehyde hydrolase  40 
 
 		 267 aa  208  7e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1731  phosphonoacetaldehyde hydrolase  39.48 
 
 		 277 aa  204  2e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.464888  normal  0.0777557 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3421  phosphonoacetaldehyde hydrolase  37.31 
 
 		 274 aa  204  2e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1051  phosphonoacetaldehyde hydrolase  38.76 
 
 		 264 aa  204  2e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3967  phosphonoacetaldehyde hydrolase  37.21 
 
 		 264 aa  203  3e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1377  phosphonoacetaldehyde hydrolase  37.21 
 
 		 264 aa  202  4e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0966  phosphonoacetaldehyde hydrolase  38.52 
 
 		 283 aa  199  3e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.12889 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1414  phosphonoacetaldehyde hydrolase  36.82 
 
 		 264 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1217  phosphonoacetaldehyde hydrolase  36.82 
 
 		 264 aa  199  5e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1239  phosphonoacetaldehyde hydrolase  36.82 
 
 		 264 aa  198  7.999999999999999e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1215  phosphonoacetaldehyde hydrolase  36.82 
 
 		 264 aa  198  7.999999999999999e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1340  phosphonoacetaldehyde hydrolase  36.82 
 
 		 264 aa  198  7.999999999999999e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1439  phosphonoacetaldehyde hydrolase  37.21 
 
 		 267 aa  198  9e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0514  phosphonoacetaldehyde hydrolase  38.52 
 
 		 280 aa  196  4.0000000000000005e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0295748 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1240  phosphonoacetaldehyde hydrolase  36.05 
 
 		 264 aa  194  1e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3836  phosphonoacetaldehyde hydrolase  39.55 
 
 		 277 aa  191  1e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000103872 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3627  phosphonoacetaldehyde hydrolase  37.88 
 
 		 269 aa  191  1e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1480  phosphonoacetaldehyde hydrolase  36.43 
 
 		 264 aa  188  7e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2989  phosphonoacetaldehyde hydrolase  39.78 
 
 		 270 aa  178  8e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.446751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2313  phosphonoacetaldehyde hydrolase  36.51 
 
 		 257 aa  174  1.9999999999999998e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.546562  normal  0.912396 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2114  hypothetical protein  28.99 
 
 		 196 aa  66.2  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.367695  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3095  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.55 
 
 		 234 aa  65.5  0.0000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0156733  normal  0.965778 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3851  hypothetical protein  27.75 
 
 		 206 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.911623 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0027  HAD-superfamily hydrolase  29.87 
 
 		 238 aa  62.4  0.000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1909  hypothetical protein  28.4 
 
 		 202 aa  62.4  0.000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.363123  hitchhiker  0.00151684 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2582  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 1  29.41 
 
 		 224 aa  61.6  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0909618 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1319  HAD family hydrolase  27.71 
 
 		 223 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2007  HAD family hydrolase  28.08 
 
 		 233 aa  61.2  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0418734 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2632  HAD family hydrolase  29.41 
 
 		 233 aa  61.2  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.503423  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0071  phosphatase-like protein  28.5 
 
 		 246 aa  59.3  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1925  phosphatase/phosphohexomutase-like protein  30.11 
 
 		 239 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.27121 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03670  predicted phosphatase  33.33 
 
 		 244 aa  56.6  0.0000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0282294  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2743  HAD family hydrolase  25.71 
 
 		 227 aa  55.1  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.994994  normal  0.0511558 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3307  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  28.71 
 
 		 735 aa  54.3  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.081208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1301  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  32.08 
 
 		 228 aa  53.9  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.782591  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3772  2-deoxyglucose-6-phosphatase  23.83 
 
 		 218 aa  53.9  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7385  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA  27.19 
 
 		 248 aa  53.9  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27890  hypothetical protein  36.13 
 
 		 247 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1717  2-deoxyglucose-6-phosphatase  29.37 
 
 		 223 aa  53.5  0.000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.886251 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3547  phosphoglycolate phosphatase  28.48 
 
 		 238 aa  53.5  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1912  2-deoxyglucose-6-phosphatase  24.75 
 
 		 223 aa  53.1  0.000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0120822  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2485  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.04 
 
 		 238 aa  52.4  0.000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000391  2-deoxyglucose-6-phosphate hydrolase YniC  27.5 
 
 		 218 aa  52.4  0.000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0106831  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3402  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  27.82 
 
 		 244 aa  51.6  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0865244 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2581  phosphoglycolate phosphatase  32.59 
 
 		 221 aa  51.2  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0714  hydrolase  33.65 
 
 		 255 aa  51.2  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0053  hydrolase  27.59 
 
 		 229 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.205751 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2354  hypothetical protein  36.75 
 
 		 247 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2790  HAD family hydrolase  24.51 
 
 		 223 aa  49.7  0.00005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3495  phosphoglycolate phosphatase  29.38 
 
 		 238 aa  50.1  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0294223  hitchhiker  0.0000911523 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2205  2-deoxyglucose-6-phosphatase  24.26 
 
 		 221 aa  49.3  0.00006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.100097  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1697  2-deoxyglucose-6-phosphatase  25.93 
 
 		 221 aa  49.7  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1808  2-deoxyglucose-6-phosphatase  25.93 
 
 		 221 aa  49.7  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.417032  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0462  2-phosphoglycolate phosphatase  29.38 
 
 		 238 aa  48.9  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0710  phosphoglycolate phosphatase  31.62 
 
 		 218 aa  48.9  0.00009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.113573  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0431  2-deoxyglucose-6-phosphatase  24.38 
 
 		 217 aa  48.5  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0905  HAD family hydrolase  27.67 
 
 		 204 aa  48.5  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.427836  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0723  HAD family hydrolase  24.26 
 
 		 240 aa  47.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.272248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3410  2-deoxyglucose-6-phosphatase  24.38 
 
 		 217 aa  48.1  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0110715  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2777  HAD family hydrolase  19.75 
 
 		 220 aa  47.4  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0810098  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3580  hypothetical protein  30.64 
 
 		 187 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.091933  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1436  2-deoxyglucose-6-phosphatase  23.96 
 
 		 222 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.905236  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1451  2-deoxyglucose-6-phosphatase  23.96 
 
 		 222 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.913842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1419  2-deoxyglucose-6-phosphatase  23.96 
 
 		 222 aa  47.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.744627  hitchhiker  0.00259415 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1849  2-deoxyglucose-6-phosphatase  23.96 
 
 		 222 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0029739  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2022  2-deoxyglucose-6-phosphatase  23.96 
 
 		 222 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2162  hypothetical protein  30.64 
 
 		 187 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.085842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0674  phosphatase  23.74 
 
 		 215 aa  47  0.0003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3243  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  23.76 
 
 		 237 aa  47.4  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0124526  normal  0.9958 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0897  hydrolase protein  32.35 
 
 		 229 aa  46.6  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00554563  normal  0.72661 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2125  2-deoxyglucose-6-phosphatase  25.49 
 
 		 221 aa  46.2  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0177126  hitchhiker  0.00144451 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1679  hypothetical protein  27.65 
 
 		 187 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2690  HAD family hydrolase  27.19 
 
 		 221 aa  45.8  0.0008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.365385  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14830  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  25.83 
 
 		 219 aa  45.4  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.187107 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0260  haloacid dehalogenase, IA family protein  22.76 
 
 		 217 aa  44.7  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1550  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25.58 
 
 		 249 aa  44.3  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.204001 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0767  phosphoglycolate phosphatase  32.33 
 
 		 229 aa  43.9  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.54601  hitchhiker  0.00790762 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>