84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_04874 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_04874  phosphonoacetaldehyde hydrolase  100 
 
 		 271 aa  554  1e-157  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000769  phosphonoacetaldehyde hydrolase  93.36 
 
 		 284 aa  526  1e-148  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0814  phosphonoacetaldehyde hydrolase  82.29 
 
 		 271 aa  474  1e-133  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.180019  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0548  phosphonoacetaldehyde hydrolase  78.97 
 
 		 271 aa  454  1e-127  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000564985  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2749  phosphonoacetaldehyde hydrolase  73.33 
 
 		 295 aa  416  9.999999999999999e-116  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0471  phosphonoacetaldehyde hydrolase  63.53 
 
 		 269 aa  340  2e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0492  phosphonoacetaldehyde hydrolase  63.16 
 
 		 269 aa  338  5.9999999999999996e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0534  phosphonoacetaldehyde hydrolase  63.16 
 
 		 269 aa  338  5.9999999999999996e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.746184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0479  phosphonoacetaldehyde hydrolase  63.16 
 
 		 269 aa  338  5.9999999999999996e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.34346  normal  0.293244 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0473  phosphonoacetaldehyde hydrolase  62.78 
 
 		 269 aa  335  3.9999999999999995e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2208  phosphonoacetaldehyde hydrolase  55.35 
 
 		 275 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.136428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3684  phosphonoacetaldehyde hydrolase  54.98 
 
 		 275 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3530  phosphonoacetaldehyde hydrolase  55.35 
 
 		 275 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.359748  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3462  phosphonoacetaldehyde hydrolase  55.6 
 
 		 275 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.985191  normal  0.890252 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1833  phosphonoacetaldehyde hydrolase  55.22 
 
 		 275 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3261  phosphonoacetaldehyde hydrolase  54.51 
 
 		 275 aa  298  9e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.258798  normal  0.0791037 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47280  phosphonoacetaldehyde hydrolase  53.87 
 
 		 275 aa  286  2e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4080  phosphonoacetaldehyde hydrolase  53.14 
 
 		 275 aa  285  8e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4474  phosphonoacetaldehyde hydrolase  54.14 
 
 		 292 aa  284  1.0000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.139325 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4608  phosphonoacetaldehyde hydrolase  54.14 
 
 		 292 aa  284  1.0000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.363137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2412  phosphonoacetaldehyde hydrolase  51.87 
 
 		 281 aa  281  7.000000000000001e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1217  phosphonoacetaldehyde hydrolase  44.23 
 
 		 264 aa  224  1e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3967  phosphonoacetaldehyde hydrolase  43.46 
 
 		 264 aa  224  1e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1414  phosphonoacetaldehyde hydrolase  44.23 
 
 		 264 aa  224  1e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0966  phosphonoacetaldehyde hydrolase  43.82 
 
 		 283 aa  223  2e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.12889 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1215  phosphonoacetaldehyde hydrolase  44.23 
 
 		 264 aa  224  2e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1239  phosphonoacetaldehyde hydrolase  44.23 
 
 		 264 aa  224  2e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1051  phosphonoacetaldehyde hydrolase  42.86 
 
 		 264 aa  223  2e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1340  phosphonoacetaldehyde hydrolase  44.23 
 
 		 264 aa  224  2e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1377  phosphonoacetaldehyde hydrolase  43.08 
 
 		 264 aa  221  9e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2141  phosphonoacetaldehyde hydrolase  43.98 
 
 		 267 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1439  phosphonoacetaldehyde hydrolase  43.02 
 
 		 267 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1240  phosphonoacetaldehyde hydrolase  43.46 
 
 		 264 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2117  phosphonoacetaldehyde hydrolase  43.61 
 
 		 267 aa  216  4e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2896  phosphonoacetaldehyde hydrolase  40.52 
 
 		 277 aa  215  7e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0103695 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1731  phosphonoacetaldehyde hydrolase  39.7 
 
 		 277 aa  213  2.9999999999999995e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.464888  normal  0.0777557 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3421  phosphonoacetaldehyde hydrolase  37.08 
 
 		 274 aa  208  8e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3836  phosphonoacetaldehyde hydrolase  41.35 
 
 		 277 aa  205  6e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000103872 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1480  phosphonoacetaldehyde hydrolase  40.93 
 
 		 264 aa  204  9e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2989  phosphonoacetaldehyde hydrolase  41.91 
 
 		 270 aa  201  8e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.446751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0514  phosphonoacetaldehyde hydrolase  38.29 
 
 		 280 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0295748 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3627  phosphonoacetaldehyde hydrolase  38.38 
 
 		 269 aa  194  1e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2313  phosphonoacetaldehyde hydrolase  33.99 
 
 		 257 aa  169  6e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.546562  normal  0.912396 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3095  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.52 
 
 		 234 aa  75.5  0.0000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0156733  normal  0.965778 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2114  hypothetical protein  28.07 
 
 		 196 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.367695  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3851  hypothetical protein  28.65 
 
 		 206 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.911623 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1909  hypothetical protein  25.57 
 
 		 202 aa  69.7  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.363123  hitchhiker  0.00151684 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1679  hypothetical protein  29.36 
 
 		 187 aa  59.3  0.00000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2354  hypothetical protein  28.35 
 
 		 247 aa  55.8  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27890  hypothetical protein  24.31 
 
 		 247 aa  55.5  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2162  hypothetical protein  29.36 
 
 		 187 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.085842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3580  hypothetical protein  29.36 
 
 		 187 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.091933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1925  phosphatase/phosphohexomutase-like protein  21.77 
 
 		 239 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.27121 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1703  hypothetical protein  28.44 
 
 		 187 aa  52.8  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235983 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3315  HAD family hydrolase  26.17 
 
 		 242 aa  51.6  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.354727 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4840  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.32 
 
 		 220 aa  51.2  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0176298  hitchhiker  0.0000825577 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0027  HAD-superfamily hydrolase  26.14 
 
 		 238 aa  50.4  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2582  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 1  26.15 
 
 		 224 aa  49.7  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0909618 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3402  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  24.2 
 
 		 244 aa  48.9  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0865244 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2701  phosphoglycolate phosphatase  23.94 
 
 		 230 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.364651  normal  0.0856305 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4142  6-phosphogluconate phosphatase  27.5 
 
 		 221 aa  48.1  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4240  6-phosphogluconate phosphatase  27.86 
 
 		 221 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0636361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0436  haloacid dehalogenase/epoxide hydrolase family protein  23.81 
 
 		 226 aa  48.1  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4077  6-phosphogluconate phosphatase  27.86 
 
 		 221 aa  47.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4133  6-phosphogluconate phosphatase  27.86 
 
 		 221 aa  47.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0258255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2846  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.47 
 
 		 226 aa  47  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.281035  normal  0.462582 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0071  phosphatase-like protein  23.9 
 
 		 246 aa  47.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2091  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  26.89 
 
 		 233 aa  47  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3772  2-deoxyglucose-6-phosphatase  24.27 
 
 		 218 aa  47  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2743  HAD family hydrolase  24.5 
 
 		 227 aa  46.6  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.994994  normal  0.0511558 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4061  6-phosphogluconate phosphatase  27.36 
 
 		 221 aa  46.2  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0053  hydrolase  27.73 
 
 		 229 aa  46.2  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.205751 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4183  6-phosphogluconate phosphatase  27.36 
 
 		 221 aa  46.2  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.201399  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4325  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.34 
 
 		 234 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1479  phosphoglycolate phosphatase  22.75 
 
 		 231 aa  44.7  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.781791  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2102  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  26.46 
 
 		 233 aa  45.1  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4082  6-phosphogluconate phosphatase  28 
 
 		 221 aa  44.3  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.580327 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1356  HAD family hydrolase  24.24 
 
 		 221 aa  43.5  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.14421  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2757  beta-phosphoglucomutase  25.12 
 
 		 216 aa  43.1  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.273253 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3134  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  23.56 
 
 		 219 aa  43.1  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.833655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1220  phosphoglycolate phosphatase  22.93 
 
 		 225 aa  43.1  0.005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5146  6-phosphogluconate phosphatase  27.5 
 
 		 221 aa  42.7  0.007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.107109 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1913  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.82 
 
 		 245 aa  42.4  0.009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000014808 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1752  HAD family hydrolase  25.45 
 
 		 232 aa  42.4  0.009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>