More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4840 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4840  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  100 
 
 		 220 aa  454  1e-127  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0176298  hitchhiker  0.0000825577 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3095  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  36.07 
 
 		 234 aa  137  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0156733  normal  0.965778 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2102  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  34.8 
 
 		 233 aa  117  9.999999999999999e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3402  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  32.33 
 
 		 244 aa  110  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0865244 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2632  HAD family hydrolase  29.28 
 
 		 233 aa  96.3  3e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.503423  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0714  hydrolase  30.04 
 
 		 255 aa  94.7  1e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2007  HAD family hydrolase  29.28 
 
 		 233 aa  94  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0418734 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2582  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 1  29.33 
 
 		 224 aa  92  6e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0909618 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0053  hydrolase  28 
 
 		 229 aa  92  7e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.205751 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1319  HAD family hydrolase  28.14 
 
 		 223 aa  89.4  5e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1301  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  28 
 
 		 228 aa  84.7  9e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.782591  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3817  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.15 
 
 		 227 aa  83.6  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0325282  hitchhiker  0.00357212 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0027  HAD-superfamily hydrolase  25.22 
 
 		 238 aa  81.3  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03670  predicted phosphatase  32.09 
 
 		 244 aa  74.7  0.000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0282294  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0071  phosphatase-like protein  22.37 
 
 		 246 aa  70.1  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0966  phosphonoacetaldehyde hydrolase  27.82 
 
 		 283 aa  69.7  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.12889 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0356  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.39 
 
 		 233 aa  69.3  0.00000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3186  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  29.68 
 
 		 231 aa  69.3  0.00000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.234606  normal  0.0137169 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3836  phosphonoacetaldehyde hydrolase  27.85 
 
 		 277 aa  67  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000103872 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2141  phosphonoacetaldehyde hydrolase  24.31 
 
 		 267 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2117  phosphonoacetaldehyde hydrolase  25 
 
 		 267 aa  65.1  0.0000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0280  HAD family hydrolase  26.34 
 
 		 233 aa  65.1  0.0000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2989  phosphonoacetaldehyde hydrolase  28.16 
 
 		 270 aa  63.9  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.446751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0323  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.34 
 
 		 233 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0341719 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0142  HAD family hydrolase  23.08 
 
 		 235 aa  62.4  0.000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3627  phosphonoacetaldehyde hydrolase  28.02 
 
 		 269 aa  62.4  0.000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0525  HAD family hydrolase  25.68 
 
 		 209 aa  62  0.000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00124351  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2449  HAD family hydrolase  25.23 
 
 		 217 aa  61.2  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0190416  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2641  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  22.33 
 
 		 222 aa  61.2  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2310  HAD family hydrolase  24.88 
 
 		 221 aa  61.2  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.523408  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3288  HAD family hydrolase  22.33 
 
 		 222 aa  60.8  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4786  HAD family hydrolase  24.19 
 
 		 225 aa  61.6  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.480444 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3967  phosphonoacetaldehyde hydrolase  27.05 
 
 		 264 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0258  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  24.77 
 
 		 220 aa  60.5  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14840  HAD-superfamily hydrolase  24.43 
 
 		 220 aa  60.8  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.770171  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1240  phosphonoacetaldehyde hydrolase  26.75 
 
 		 264 aa  60.5  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1439  phosphonoacetaldehyde hydrolase  27.05 
 
 		 267 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1377  phosphonoacetaldehyde hydrolase  26.79 
 
 		 264 aa  59.7  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5280  HAD family hydrolase  24.65 
 
 		 228 aa  59.3  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.94241  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2100  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.57 
 
 		 215 aa  59.3  0.00000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1239  phosphonoacetaldehyde hydrolase  33.66 
 
 		 264 aa  59.3  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1215  phosphonoacetaldehyde hydrolase  33.66 
 
 		 264 aa  59.3  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1217  phosphonoacetaldehyde hydrolase  33.66 
 
 		 264 aa  59.3  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1340  phosphonoacetaldehyde hydrolase  33.66 
 
 		 264 aa  59.3  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1414  phosphonoacetaldehyde hydrolase  33.66 
 
 		 264 aa  59.3  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1313  HAD family hydrolase  24.67 
 
 		 232 aa  58.9  0.00000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.95229 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7122  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.4 
 
 		 219 aa  58.9  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4474  phosphonoacetaldehyde hydrolase  28.35 
 
 		 292 aa  58.5  0.00000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.139325 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4608  phosphonoacetaldehyde hydrolase  28.35 
 
 		 292 aa  58.5  0.00000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.363137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0548  phosphonoacetaldehyde hydrolase  27.38 
 
 		 271 aa  58.5  0.00000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000564985  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2034  HAD family hydrolase  29.3 
 
 		 216 aa  58.5  0.00000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.645104  normal  0.0672621 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0178  HAD family hydrolase  24.15 
 
 		 230 aa  58.5  0.00000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000756614  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3421  phosphonoacetaldehyde hydrolase  23.64 
 
 		 274 aa  57.8  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5624  HAD family hydrolase  27.23 
 
 		 228 aa  58.2  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.147818  normal  0.407625 
 
 
-
 
NC_004310  BR1002  HAD superfamily hydrolase  25.23 
 
 		 221 aa  57.8  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0072  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  23.04 
 
 		 230 aa  57.8  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0968  HAD superfamily hydrolase  25.23 
 
 		 221 aa  57.8  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1545  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  24.42 
 
 		 213 aa  57.4  0.0000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0590  HAD family hydrolase  23.56 
 
 		 219 aa  57  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0419315 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1614  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  20.81 
 
 		 224 aa  57.4  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0147527  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1758  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.11 
 
 		 234 aa  57.4  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0639278  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0461  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.92 
 
 		 217 aa  57  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4762  HAD family hydrolase  24.2 
 
 		 242 aa  57  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.698376  hitchhiker  0.00269567 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1051  phosphonoacetaldehyde hydrolase  37.21 
 
 		 264 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0156  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  23.33 
 
 		 216 aa  57.4  0.0000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1595  HAD family hydrolase  22.97 
 
 		 219 aa  56.6  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00389314  normal  0.0112895 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2632  HAD family hydrolase  29.25 
 
 		 216 aa  56.2  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.861911  hitchhiker  0.000131082 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14830  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  23.21 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.187107 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1575  HAD family hydrolase  25.85 
 
 		 238 aa  55.8  0.0000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000310395  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0271  hypothetical protein  24.55 
 
 		 229 aa  55.8  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.586518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2502  HAD family hydrolase  29.6 
 
 		 200 aa  55.5  0.0000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.396303  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1064  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase  23.68 
 
 		 219 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.259823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1722  HAD family hydrolase  24.19 
 
 		 228 aa  55.5  0.0000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0416  phosphoglycolate phosphatase  21.46 
 
 		 272 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0976  HAD family hydrolase  24.57 
 
 		 225 aa  54.7  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0450  phosphoglycolate phosphatase  21.46 
 
 		 272 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.416285 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2251  phosphoglycolate phosphatase  23.53 
 
 		 229 aa  54.3  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19180  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.84 
 
 		 218 aa  54.3  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.143986  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6369  HAD family hydrolase  26.03 
 
 		 219 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.23133  normal  0.167912 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1752  HAD family hydrolase  24.68 
 
 		 238 aa  54.3  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000718269  normal  0.2896 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3084  HAD family hydrolase  25.81 
 
 		 219 aa  54.3  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1853  HAD-superfamily hydrolase  25 
 
 		 213 aa  54.7  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1562  putative hydrolase  21.72 
 
 		 218 aa  53.5  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.320439  normal  0.240105 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02338  putative phosphoglycolate phosphatase, contains a phosphatase-like domain  22.48 
 
 		 234 aa  53.5  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0463297  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0431  3-amino-5-hydroxybenoic acid synthesis related  28.68 
 
 		 263 aa  53.9  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2565  HAD family hydrolase  29.68 
 
 		 244 aa  53.9  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000244874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1712  HAD family hydrolase  24.27 
 
 		 239 aa  53.9  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000827821  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4527  phosphoglycolate phosphatase  29.84 
 
 		 216 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1621  HAD family hydrolase  22.42 
 
 		 231 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0638141  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0057  phosphoglycolate phosphatase  24.64 
 
 		 232 aa  53.5  0.000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.049028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0384  HAD family hydrolase  27.15 
 
 		 222 aa  53.1  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000045535  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0397  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  25.65 
 
 		 223 aa  53.1  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1480  phosphonoacetaldehyde hydrolase  31.68 
 
 		 264 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1957  phosphoglycolate phosphatase  25.58 
 
 		 223 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3704  pyrophosphatase PpaX  24.89 
 
 		 212 aa  52.8  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1709  HAD family hydrolase  25.52 
 
 		 238 aa  52.8  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000621435  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0514  phosphonoacetaldehyde hydrolase  23.47 
 
 		 280 aa  52.4  0.000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0295748 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0447  phosphoglycolate phosphatase  21.46 
 
 		 272 aa  52.4  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.558752 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4850  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.75 
 
 		 229 aa  52.8  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0298674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4626  HAD family hydrolase  23 
 
 		 213 aa  52.4  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.317625  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>