More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2102 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2102  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  100 
 
 		 233 aa  448  1e-125  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2007  HAD family hydrolase  40.5 
 
 		 233 aa  122  5e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0418734 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4840  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  34.8 
 
 		 220 aa  117  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0176298  hitchhiker  0.0000825577 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2632  HAD family hydrolase  39.48 
 
 		 233 aa  115  6e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.503423  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3817  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  39.91 
 
 		 227 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0325282  hitchhiker  0.00357212 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0053  hydrolase  40.95 
 
 		 229 aa  108  7.000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.205751 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2582  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 1  37.29 
 
 		 224 aa  107  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0909618 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3095  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.19 
 
 		 234 aa  106  3e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0156733  normal  0.965778 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1319  HAD family hydrolase  38.26 
 
 		 223 aa  102  4e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3402  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  33.05 
 
 		 244 aa  101  8e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0865244 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3186  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  37.45 
 
 		 231 aa  91.3  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.234606  normal  0.0137169 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0027  HAD-superfamily hydrolase  32.91 
 
 		 238 aa  85.9  5e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0071  phosphatase-like protein  31.76 
 
 		 246 aa  84.7  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1239  phosphonoacetaldehyde hydrolase  32.57 
 
 		 264 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1215  phosphonoacetaldehyde hydrolase  32.57 
 
 		 264 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1217  phosphonoacetaldehyde hydrolase  32.57 
 
 		 264 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1340  phosphonoacetaldehyde hydrolase  32.57 
 
 		 264 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1301  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  36.24 
 
 		 228 aa  84  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.782591  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1414  phosphonoacetaldehyde hydrolase  32.57 
 
 		 264 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1439  phosphonoacetaldehyde hydrolase  32.11 
 
 		 267 aa  82.4  0.000000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0966  phosphonoacetaldehyde hydrolase  31.06 
 
 		 283 aa  82  0.000000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.12889 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3967  phosphonoacetaldehyde hydrolase  31.65 
 
 		 264 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0714  hydrolase  31.6 
 
 		 255 aa  81.6  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1377  phosphonoacetaldehyde hydrolase  29.17 
 
 		 264 aa  79.7  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1240  phosphonoacetaldehyde hydrolase  29.03 
 
 		 264 aa  77  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03670  predicted phosphatase  41.3 
 
 		 244 aa  75.1  0.0000000000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0282294  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3836  phosphonoacetaldehyde hydrolase  30.27 
 
 		 277 aa  74.3  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000103872 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1051  phosphonoacetaldehyde hydrolase  26.87 
 
 		 264 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1480  phosphonoacetaldehyde hydrolase  29.49 
 
 		 264 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1483  HAD family hydrolase  30.38 
 
 		 224 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0762089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3658  HAD family hydrolase  30.04 
 
 		 219 aa  72.8  0.000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3627  phosphonoacetaldehyde hydrolase  28.09 
 
 		 269 aa  71.6  0.000000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2313  phosphonoacetaldehyde hydrolase  29.28 
 
 		 257 aa  70.9  0.00000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.546562  normal  0.912396 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3807  HAD family hydrolase  29.96 
 
 		 224 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.118188  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0460  phosphoglycolate phosphatase  30.7 
 
 		 229 aa  68.9  0.00000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0934432  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1907  HAD superfamily hydrolase  29.54 
 
 		 224 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000027861 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0514  phosphonoacetaldehyde hydrolase  28.25 
 
 		 280 aa  66.2  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0295748 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1722  HAD family hydrolase  30.37 
 
 		 228 aa  65.9  0.0000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0343  phosphoglycolate phosphatase  27.88 
 
 		 233 aa  65.1  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0265  phosphoglycolate phosphatase  28.63 
 
 		 232 aa  63.2  0.000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.210779  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3084  HAD family hydrolase  29.44 
 
 		 219 aa  63.2  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2141  phosphonoacetaldehyde hydrolase  28.12 
 
 		 267 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3959  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.48 
 
 		 229 aa  62  0.000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0218  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  23.53 
 
 		 206 aa  60.5  0.00000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3878  phosphoglycolate phosphatase  27.23 
 
 		 234 aa  60.5  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0590  HAD family hydrolase  28.45 
 
 		 219 aa  60.5  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0419315 
 
 
-
 
NC_004310  BR1002  HAD superfamily hydrolase  30.4 
 
 		 221 aa  60.1  0.00000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4762  HAD family hydrolase  29.78 
 
 		 242 aa  60.1  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.698376  hitchhiker  0.00269567 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0968  HAD superfamily hydrolase  30.4 
 
 		 221 aa  60.1  0.00000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1731  phosphonoacetaldehyde hydrolase  27.13 
 
 		 277 aa  60.1  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.464888  normal  0.0777557 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2896  phosphonoacetaldehyde hydrolase  26.79 
 
 		 277 aa  60.1  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0103695 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2412  phosphonoacetaldehyde hydrolase  29.43 
 
 		 281 aa  59.3  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1518  HAD family hydrolase  27.54 
 
 		 226 aa  59.3  0.00000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0020263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1985  phosphoglycolate phosphatase  25.63 
 
 		 223 aa  59.3  0.00000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.554471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4600  phosphoglycolate phosphatase  28.57 
 
 		 232 aa  58.9  0.00000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.383007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4055  phosphoglycolate phosphatase  26.34 
 
 		 234 aa  58.5  0.00000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0278697  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0548  phosphonoacetaldehyde hydrolase  28.1 
 
 		 271 aa  58.5  0.00000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000564985  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1175  HAD family hydrolase  28.83 
 
 		 222 aa  58.5  0.00000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.341694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4555  phosphoglycolate phosphatase  29.87 
 
 		 461 aa  58.2  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.82365  normal  0.133597 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5280  HAD family hydrolase  29.44 
 
 		 228 aa  58.2  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.94241  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2583  phosphoglycolate phosphatase  30.13 
 
 		 227 aa  57.8  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4164  HAD family hydrolase  29.3 
 
 		 193 aa  57  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0540485  normal  0.889807 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0431  3-amino-5-hydroxybenoic acid synthesis related  34.33 
 
 		 263 aa  57.4  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0927  HAD family hydrolase  24.11 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4839  AHBA synthesis associated protein  36.69 
 
 		 237 aa  55.8  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.098143  normal  0.0397379 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3218  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.71 
 
 		 234 aa  55.5  0.0000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2251  phosphoglycolate phosphatase  29.57 
 
 		 229 aa  55.8  0.0000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2083  phosphoglycolate phosphatase  29.65 
 
 		 226 aa  55.5  0.0000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.609164  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2060  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.46 
 
 		 225 aa  55.1  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.750609  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14840  HAD-superfamily hydrolase  29.65 
 
 		 220 aa  54.7  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.770171  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2117  phosphonoacetaldehyde hydrolase  27.73 
 
 		 267 aa  54.7  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1267  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.28 
 
 		 221 aa  53.5  0.000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.090781  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1780  HAD family hydrolase  26.46 
 
 		 225 aa  53.5  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.587654  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2310  HAD family hydrolase  34.56 
 
 		 221 aa  54.3  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.523408  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0230  phosphoglycolate phosphatase  27.27 
 
 		 232 aa  53.5  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.135549  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3684  phosphonoacetaldehyde hydrolase  27.72 
 
 		 275 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2190  HAD family hydrolase  35 
 
 		 234 aa  53.5  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3961  phosphoglycolate phosphatase  27.27 
 
 		 232 aa  53.5  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.512442  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3722  phosphoglycolate phosphatase  27.27 
 
 		 232 aa  53.5  0.000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0244843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4786  HAD family hydrolase  28.77 
 
 		 225 aa  53.5  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.480444 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2989  phosphonoacetaldehyde hydrolase  26.22 
 
 		 270 aa  53.1  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.446751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2776  HAD family hydrolase  25.46 
 
 		 240 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.223588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2746  HAD family hydrolase  25.46 
 
 		 240 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.906764  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2790  HAD family hydrolase  25.46 
 
 		 240 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3482  phosphoglycolate phosphatase  26.44 
 
 		 228 aa  52.8  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.875502  normal  0.981101 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1080  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  54.55 
 
 		 218 aa  52.8  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00830882  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2880  phosphoglycolate phosphatase  28.25 
 
 		 246 aa  52.4  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.587243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0569  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  31.52 
 
 		 213 aa  52.4  0.000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.895889  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3421  phosphonoacetaldehyde hydrolase  24.2 
 
 		 274 aa  52.4  0.000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0743  phosphoglycolate phosphatase  27.31 
 
 		 225 aa  52.4  0.000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4850  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.3 
 
 		 229 aa  52  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0298674  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2311  HAD superfamily (subfamily IA) hydrolase, TIGR01548  25.43 
 
 		 246 aa  52  0.000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2065  HAD-superfamily hydrolase  37.67 
 
 		 216 aa  52  0.000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.803499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3288  HAD family hydrolase  28.07 
 
 		 222 aa  52  0.000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2641  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.07 
 
 		 222 aa  51.6  0.000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0820  HAD family hydrolase  27.08 
 
 		 219 aa  51.2  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.362734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0592  HAD family hydrolase  27.93 
 
 		 227 aa  51.2  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4954  pyrophosphatase PpaX  28.57 
 
 		 215 aa  51.2  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0578  HAD family hydrolase  27.93 
 
 		 227 aa  51.2  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.297181  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2469  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.49 
 
 		 224 aa  51.2  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.618161  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>