More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2311 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2311  HAD superfamily (subfamily IA) hydrolase, TIGR01548  100 
 
 		 246 aa  503  1e-141  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1886  HAD superfamily hydrolase  36.15 
 
 		 263 aa  138  1e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32916  predicted protein  35.86 
 
 		 252 aa  124  1e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2346  HAD family hydrolase  35.18 
 
 		 261 aa  120  1.9999999999999998e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.470846 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1448  HAD family hydrolase  33.2 
 
 		 263 aa  119  6e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0334777 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3452  HAD family hydrolase  32.41 
 
 		 271 aa  113  3e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.23904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0466  HAD superfamily (subfamily IA) hydrolase, TIGR01548  32.68 
 
 		 280 aa  106  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0844788  normal  0.0854988 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17301  putative imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  28.41 
 
 		 262 aa  99.4  4e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1555  HAD superfamily (subfamily IA) hydrolase, TIGR01548  29.28 
 
 		 324 aa  99  7e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17181  putative imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  27.76 
 
 		 262 aa  98.6  8e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1618  putative imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  27.65 
 
 		 262 aa  95.9  5e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0335  HAD superfamily (subfamily IA) hydrolase, TIGR01548  29.25 
 
 		 287 aa  95.1  9e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0232711 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0531  HAD family hydrolase  27.52 
 
 		 266 aa  93.6  2e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.498343  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2174  HAD family hydrolase  32.49 
 
 		 232 aa  92.8  4e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.21673  normal  0.110893 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_12741  putative imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  27.52 
 
 		 266 aa  90.9  2e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.281535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17051  putative imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  27.34 
 
 		 267 aa  89.7  4e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.426884  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0501  HAD family hydrolase  31.74 
 
 		 226 aa  84  0.000000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0968917  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04971  putative imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  29.32 
 
 		 247 aa  83.6  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15601  putative imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  28.46 
 
 		 262 aa  82  0.000000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2007  HAD family hydrolase  30.73 
 
 		 222 aa  80.1  0.00000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3499  HAD superfamily (subfamily IA) hydrolase, TIGR01548  29.03 
 
 		 293 aa  77  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0734  HAD family hydrolase  32.2 
 
 		 241 aa  73.9  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.879574  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1346  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  25.47 
 
 		 255 aa  74.3  0.000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0927  HAD family hydrolase  26.53 
 
 		 210 aa  74.3  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0305  HAD superfamily (subfamily IA) hydrolase, TIGR01548  56.14 
 
 		 293 aa  74.3  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.741763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4954  pyrophosphatase PpaX  26.5 
 
 		 215 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0718  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.31 
 
 		 221 aa  73.2  0.000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.00000286264  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2479  phosphoglycolate phosphatase  30.46 
 
 		 228 aa  72.4  0.000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0669626  normal  0.547058 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3168  pyrophosphatase PpaX  27.64 
 
 		 222 aa  70.9  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1352  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  21.03 
 
 		 251 aa  68.9  0.00000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000681054  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0431  3-amino-5-hydroxybenoic acid synthesis related  29.06 
 
 		 263 aa  68.9  0.00000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2984  pyrophosphatase PpaX  27.59 
 
 		 215 aa  68.6  0.00000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.417941  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0122  haloacid dehalogenase-like hydrolase  26.86 
 
 		 236 aa  67.8  0.0000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.817509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2449  HAD family hydrolase  30.21 
 
 		 217 aa  67.8  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0190416  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4258  phosphoglycolate phosphatase  27.67 
 
 		 235 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0125483 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0131  HAD family hydrolase  26.86 
 
 		 236 aa  67  0.0000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0293  phosphoglycolate phosphatase  26.7 
 
 		 227 aa  65.9  0.0000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02162  phosphoglycolate phosphatase  25.7 
 
 		 225 aa  65.9  0.0000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3691  phosphoglycolate phosphatase  26.7 
 
 		 227 aa  65.5  0.0000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0019  phosphatase  24.26 
 
 		 208 aa  65.5  0.0000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.379676 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3361  phosphoglycolate phosphatase  27.62 
 
 		 227 aa  65.5  0.0000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5010  pyrophosphatase PpaX  25 
 
 		 216 aa  65.5  0.0000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4839  pyrophosphatase PpaX  25 
 
 		 216 aa  65.5  0.0000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4854  pyrophosphatase PpaX  25 
 
 		 216 aa  65.5  0.0000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5390  pyrophosphatase PpaX  25 
 
 		 216 aa  65.5  0.0000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5677  pyrophosphatase PpaX  25.5 
 
 		 216 aa  65.5  0.0000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5280  pyrophosphatase PpaX  25 
 
 		 216 aa  65.5  0.0000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3887  phosphoglycolate phosphatase  26.7 
 
 		 227 aa  65.5  0.0000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.379252 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5265  pyrophosphatase PpaX  26.96 
 
 		 216 aa  65.5  0.0000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1957  phosphoglycolate phosphatase  29.18 
 
 		 223 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4194  phosphoglycolate phosphatase  25.73 
 
 		 225 aa  63.9  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10830  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  25.94 
 
 		 296 aa  63.9  0.000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2760  putative phosphoglycolate phosphatase  29.23 
 
 		 221 aa  64.3  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0219607 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2908  phosphoglycolate phosphatase  26.73 
 
 		 242 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5322  pyrophosphatase PpaX  24.5 
 
 		 216 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3996  phosphoglycolate phosphatase  25.73 
 
 		 225 aa  63.5  0.000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2112  HAD family hydrolase  28.64 
 
 		 239 aa  63.5  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2363  phosphoglycolate phosphatase  27.12 
 
 		 227 aa  63.5  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.496506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4106  phosphoglycolate phosphatase  25.73 
 
 		 225 aa  63.5  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5246  pyrophosphatase PpaX  25 
 
 		 216 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23210  phosphoglycolate phosphatase  28.76 
 
 		 226 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0343323  hitchhiker  0.00416895 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3122  HAD family hydrolase  25.86 
 
 		 214 aa  63.5  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2310  HAD family hydrolase  30 
 
 		 221 aa  63.2  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.523408  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0254  phosphoglycolate phosphatase  26.21 
 
 		 227 aa  63.2  0.000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0382  phosphoglycolate phosphatase  27.05 
 
 		 229 aa  63.2  0.000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1002  HAD superfamily hydrolase  27.87 
 
 		 221 aa  62.8  0.000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4076  phosphoglycolate phosphatase  25.24 
 
 		 225 aa  62.8  0.000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0968  HAD superfamily hydrolase  27.87 
 
 		 221 aa  62.8  0.000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4527  phosphoglycolate phosphatase  25.73 
 
 		 216 aa  62.8  0.000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3704  pyrophosphatase PpaX  26.56 
 
 		 212 aa  62.4  0.000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3699  phosphoglycolate phosphatase  26.21 
 
 		 226 aa  62.8  0.000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3516  phosphoglycolate phosphatase  29.63 
 
 		 229 aa  62.4  0.000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5953  phosphoglycolate phosphatase  29.9 
 
 		 257 aa  62  0.000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0174691 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2097  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  24.12 
 
 		 221 aa  61.6  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.284323  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00378  phosphoglycolate phosphatase  26.21 
 
 		 250 aa  61.2  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.590108  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0267  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.19 
 
 		 220 aa  61.2  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.583067  normal  0.103324 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0937  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.23 
 
 		 219 aa  60.8  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.171636 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0447  phosphoglycolate phosphatase  26.76 
 
 		 272 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.558752 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3582  phosphoglycolate phosphatase  27.18 
 
 		 245 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0643  phosphoglycolate phosphatase  27.18 
 
 		 242 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0534  phosphoglycolate phosphatase  27.18 
 
 		 242 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0250125  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2937  phosphoglycolate phosphatase  26.47 
 
 		 218 aa  60.1  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3574  phosphoglycolate phosphatase  27.18 
 
 		 242 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.952116  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3555  phosphoglycolate phosphatase  27.18 
 
 		 245 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.221388  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2102  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  26.45 
 
 		 233 aa  60.5  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1630  phosphoglycolate phosphatase  28.28 
 
 		 224 aa  60.1  0.00000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1909  phosphoglycolate phosphatase  27.18 
 
 		 242 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0939  phosphoglycolate phosphatase  27.18 
 
 		 242 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1257  AHBA synthesis associated protein  28.12 
 
 		 228 aa  59.7  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0136935  hitchhiker  0.0000231922 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2255  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.17 
 
 		 209 aa  59.7  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00490459 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0320  HAD family hydrolase  28.02 
 
 		 241 aa  59.3  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.288784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1233  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  31.75 
 
 		 375 aa  59.3  0.00000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00126511  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1758  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.62 
 
 		 234 aa  59.3  0.00000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0639278  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2229  phosphoglycolate phosphatase  26.64 
 
 		 227 aa  59.3  0.00000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.40738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2711  HAD family hydrolase  26.27 
 
 		 230 aa  58.9  0.00000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2880  phosphoglycolate phosphatase  27.19 
 
 		 246 aa  58.9  0.00000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.587243  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4023  phosphoglycolate phosphatase  28.12 
 
 		 227 aa  58.5  0.00000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0581  putative phosphoglycolate phosphatase protein  27.05 
 
 		 233 aa  58.5  0.00000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3482  phosphoglycolate phosphatase  27.92 
 
 		 226 aa  58.5  0.00000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.824519  normal  0.190106 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0743  phosphoglycolate phosphatase  25 
 
 		 225 aa  58.5  0.00000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>