96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2896 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_2896  phosphonoacetaldehyde hydrolase  100 
 
 
277 aa  561  1.0000000000000001e-159  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0103695 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1731  phosphonoacetaldehyde hydrolase  54.15 
 
 
277 aa  328  5.0000000000000004e-89  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.464888  normal  0.0777557 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0514  phosphonoacetaldehyde hydrolase  50.9 
 
 
280 aa  303  2.0000000000000002e-81  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0295748 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1051  phosphonoacetaldehyde hydrolase  47.45 
 
 
264 aa  271  8.000000000000001e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1377  phosphonoacetaldehyde hydrolase  46.67 
 
 
264 aa  271  9e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3967  phosphonoacetaldehyde hydrolase  46.67 
 
 
264 aa  270  2e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1240  phosphonoacetaldehyde hydrolase  47.24 
 
 
264 aa  270  2e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0966  phosphonoacetaldehyde hydrolase  47.25 
 
 
283 aa  268  8.999999999999999e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.12889 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1414  phosphonoacetaldehyde hydrolase  46.27 
 
 
264 aa  265  5.999999999999999e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1217  phosphonoacetaldehyde hydrolase  46.27 
 
 
264 aa  264  1e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1239  phosphonoacetaldehyde hydrolase  46.27 
 
 
264 aa  263  2e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1340  phosphonoacetaldehyde hydrolase  46.27 
 
 
264 aa  263  2e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1215  phosphonoacetaldehyde hydrolase  46.27 
 
 
264 aa  263  2e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1439  phosphonoacetaldehyde hydrolase  46.27 
 
 
267 aa  262  4e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1480  phosphonoacetaldehyde hydrolase  44.71 
 
 
264 aa  256  4e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47280  phosphonoacetaldehyde hydrolase  44.65 
 
 
275 aa  247  1e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4080  phosphonoacetaldehyde hydrolase  45.02 
 
 
275 aa  245  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3836  phosphonoacetaldehyde hydrolase  43.66 
 
 
277 aa  242  3.9999999999999997e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000103872 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3261  phosphonoacetaldehyde hydrolase  42.8 
 
 
275 aa  236  4e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.258798  normal  0.0791037 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3684  phosphonoacetaldehyde hydrolase  43.33 
 
 
275 aa  230  2e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1833  phosphonoacetaldehyde hydrolase  41.85 
 
 
275 aa  228  6e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3530  phosphonoacetaldehyde hydrolase  41.85 
 
 
275 aa  228  8e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.359748  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2208  phosphonoacetaldehyde hydrolase  41.85 
 
 
275 aa  228  8e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.136428  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3462  phosphonoacetaldehyde hydrolase  41.48 
 
 
275 aa  228  9e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.985191  normal  0.890252 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3627  phosphonoacetaldehyde hydrolase  40.15 
 
 
269 aa  223  3e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2117  phosphonoacetaldehyde hydrolase  40.15 
 
 
267 aa  223  4e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2989  phosphonoacetaldehyde hydrolase  42.42 
 
 
270 aa  218  7e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.446751  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4474  phosphonoacetaldehyde hydrolase  41.24 
 
 
292 aa  218  7.999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.139325 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4608  phosphonoacetaldehyde hydrolase  41.24 
 
 
292 aa  218  7.999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.363137  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000769  phosphonoacetaldehyde hydrolase  41.26 
 
 
284 aa  218  1e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2141  phosphonoacetaldehyde hydrolase  39.02 
 
 
267 aa  217  1e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04874  phosphonoacetaldehyde hydrolase  40.52 
 
 
271 aa  215  7e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0548  phosphonoacetaldehyde hydrolase  40.52 
 
 
271 aa  213  2.9999999999999995e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000564985  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0814  phosphonoacetaldehyde hydrolase  40.45 
 
 
271 aa  209  3e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.180019  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0471  phosphonoacetaldehyde hydrolase  43.23 
 
 
269 aa  209  4e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0479  phosphonoacetaldehyde hydrolase  42.48 
 
 
269 aa  206  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.34346  normal  0.293244 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0534  phosphonoacetaldehyde hydrolase  42.48 
 
 
269 aa  206  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.746184  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0492  phosphonoacetaldehyde hydrolase  42.48 
 
 
269 aa  206  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3421  phosphonoacetaldehyde hydrolase  35.8 
 
 
274 aa  206  5e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2313  phosphonoacetaldehyde hydrolase  41.18 
 
 
257 aa  204  1e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.546562  normal  0.912396 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0473  phosphonoacetaldehyde hydrolase  42.11 
 
 
269 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2412  phosphonoacetaldehyde hydrolase  39.1 
 
 
281 aa  201  8e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2749  phosphonoacetaldehyde hydrolase  38.29 
 
 
295 aa  201  9.999999999999999e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3095  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.55 
 
 
234 aa  76.6  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0156733  normal  0.965778 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2114  hypothetical protein  28.65 
 
 
196 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.367695  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3817  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.29 
 
 
227 aa  65.9  0.0000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0325282  hitchhiker  0.00357212 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1909  hypothetical protein  25.28 
 
 
202 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.363123  hitchhiker  0.00151684 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3851  hypothetical protein  25.58 
 
 
206 aa  62  0.000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.911623 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3402  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  28.35 
 
 
244 aa  61.6  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0865244 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2102  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  26.79 
 
 
233 aa  60.1  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1301  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  34.58 
 
 
228 aa  60.1  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.782591  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1925  phosphatase/phosphohexomutase-like protein  27.78 
 
 
239 aa  57  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.27121 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2354  hypothetical protein  32 
 
 
247 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27890  hypothetical protein  31.86 
 
 
247 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0714  hydrolase  30.84 
 
 
255 aa  55.8  0.0000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1319  HAD family hydrolase  26.56 
 
 
223 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3186  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  27.91 
 
 
231 aa  54.3  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.234606  normal  0.0137169 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0027  HAD-superfamily hydrolase  29.15 
 
 
238 aa  53.9  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0284  2-deoxyglucose-6-phosphatase  24.66 
 
 
221 aa  53.9  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00458991 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0260  haloacid dehalogenase, IA family protein  24.63 
 
 
217 aa  53.9  0.000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0053  hydrolase  28.64 
 
 
229 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.205751 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2690  HAD family hydrolase  28.57 
 
 
221 aa  53.1  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.365385  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2582  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 1  23.74 
 
 
224 aa  53.1  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0909618 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4840  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  34.02 
 
 
220 aa  51.6  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0176298  hitchhiker  0.0000825577 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3134  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.11 
 
 
219 aa  51.6  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.833655  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0269  haloacid dehalogenase, IA family protein  24.14 
 
 
217 aa  51.2  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0537  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.43 
 
 
260 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2240  HAD family hydrolase  24.76 
 
 
214 aa  48.1  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.279618  normal  0.937061 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3084  HAD family hydrolase  28.43 
 
 
219 aa  47.8  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2632  HAD family hydrolase  28.57 
 
 
233 aa  48.1  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.503423  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2007  HAD family hydrolase  28.08 
 
 
233 aa  47.4  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0418734 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1257  AHBA synthesis associated protein  27.09 
 
 
228 aa  47  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0136935  hitchhiker  0.0000231922 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0071  phosphatase-like protein  27.72 
 
 
246 aa  46.6  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3122  HAD family hydrolase  24.31 
 
 
214 aa  46.2  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0397  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  22.82 
 
 
223 aa  45.8  0.0008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3073  HAD family hydrolase  29.2 
 
 
223 aa  45.8  0.0009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00582956  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1679  hypothetical protein  22.94 
 
 
187 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1595  HAD family hydrolase  25.94 
 
 
219 aa  44.3  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00389314  normal  0.0112895 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2496  phosphoglycolate phosphatase  27.41 
 
 
221 aa  43.9  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1356  HAD family hydrolase  30.48 
 
 
221 aa  43.5  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.14421  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2943  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.7 
 
 
218 aa  43.9  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.86932  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0734  HAD family hydrolase  27.27 
 
 
241 aa  43.9  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.879574  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3580  hypothetical protein  25 
 
 
187 aa  43.5  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.091933  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2162  hypothetical protein  25 
 
 
187 aa  43.5  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.085842  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1874  HAD family hydrolase  25.13 
 
 
216 aa  43.5  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.785736  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1483  HAD family hydrolase  23.38 
 
 
224 aa  43.5  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0762089  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3288  HAD family hydrolase  26.87 
 
 
222 aa  43.5  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2112  HAD family hydrolase  25.35 
 
 
239 aa  43.1  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2641  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.87 
 
 
222 aa  43.1  0.005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0349  HAD superfamily hydrolase  23.85 
 
 
250 aa  42.7  0.006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.123194 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03670  predicted phosphatase  25 
 
 
244 aa  42.7  0.007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0282294  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2581  phosphoglycolate phosphatase  28.15 
 
 
221 aa  42.4  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3991  HAD family hydrolase  26.91 
 
 
223 aa  42.4  0.009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0589691  normal  0.286342 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3012  phosphoglycolate phosphatase  27.19 
 
 
237 aa  42.4  0.009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0258131  normal  0.0275568 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1703  hypothetical protein  25.64 
 
 
187 aa  42  0.01  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00235983 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4786  HAD family hydrolase  25.48 
 
 
225 aa  42.4  0.01  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.480444 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>