54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2114 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2114  hypothetical protein  100 
 
 		 196 aa  394  1e-109  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.367695  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1909  hypothetical protein  86.67 
 
 		 202 aa  342  2e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.363123  hitchhiker  0.00151684 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3851  hypothetical protein  62.05 
 
 		 206 aa  246  1e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.911623 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1925  phosphatase/phosphohexomutase-like protein  47.93 
 
 		 239 aa  203  1e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.27121 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2162  hypothetical protein  54.4 
 
 		 187 aa  199  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.085842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3580  hypothetical protein  54.4 
 
 		 187 aa  199  3e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.091933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27890  hypothetical protein  47.54 
 
 		 247 aa  194  6e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1703  hypothetical protein  52.33 
 
 		 187 aa  193  2e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235983 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1679  hypothetical protein  53.61 
 
 		 187 aa  188  4e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2354  hypothetical protein  47.3 
 
 		 247 aa  185  3e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0473  phosphonoacetaldehyde hydrolase  31.74 
 
 		 269 aa  79  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0492  phosphonoacetaldehyde hydrolase  31.74 
 
 		 269 aa  77.8  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0534  phosphonoacetaldehyde hydrolase  31.74 
 
 		 269 aa  77.8  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.746184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0479  phosphonoacetaldehyde hydrolase  31.74 
 
 		 269 aa  77.8  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.34346  normal  0.293244 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0471  phosphonoacetaldehyde hydrolase  31.74 
 
 		 269 aa  77.4  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3261  phosphonoacetaldehyde hydrolase  30.99 
 
 		 275 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.258798  normal  0.0791037 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000769  phosphonoacetaldehyde hydrolase  28.07 
 
 		 284 aa  75.9  0.0000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04874  phosphonoacetaldehyde hydrolase  28.07 
 
 		 271 aa  74.7  0.0000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47280  phosphonoacetaldehyde hydrolase  29.24 
 
 		 275 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3462  phosphonoacetaldehyde hydrolase  29.59 
 
 		 275 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.985191  normal  0.890252 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4080  phosphonoacetaldehyde hydrolase  28.07 
 
 		 275 aa  68.9  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2896  phosphonoacetaldehyde hydrolase  28.65 
 
 		 277 aa  68.2  0.00000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0103695 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3836  phosphonoacetaldehyde hydrolase  30 
 
 		 277 aa  67.4  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000103872 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0966  phosphonoacetaldehyde hydrolase  27.91 
 
 		 283 aa  67.4  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.12889 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2749  phosphonoacetaldehyde hydrolase  26.9 
 
 		 295 aa  67.8  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1731  phosphonoacetaldehyde hydrolase  30.23 
 
 		 277 aa  67.8  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.464888  normal  0.0777557 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0814  phosphonoacetaldehyde hydrolase  29.31 
 
 		 271 aa  67.8  0.0000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.180019  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3530  phosphonoacetaldehyde hydrolase  28.4 
 
 		 275 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.359748  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4608  phosphonoacetaldehyde hydrolase  27.22 
 
 		 292 aa  66.2  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.363137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4474  phosphonoacetaldehyde hydrolase  27.22 
 
 		 292 aa  66.2  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.139325 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2208  phosphonoacetaldehyde hydrolase  28.4 
 
 		 275 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.136428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1833  phosphonoacetaldehyde hydrolase  28.99 
 
 		 275 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2141  phosphonoacetaldehyde hydrolase  31.53 
 
 		 267 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3627  phosphonoacetaldehyde hydrolase  33.93 
 
 		 269 aa  65.1  0.0000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2989  phosphonoacetaldehyde hydrolase  30.36 
 
 		 270 aa  64.3  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.446751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3684  phosphonoacetaldehyde hydrolase  27.06 
 
 		 275 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0548  phosphonoacetaldehyde hydrolase  26.32 
 
 		 271 aa  63.2  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000564985  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2117  phosphonoacetaldehyde hydrolase  26.47 
 
 		 267 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3421  phosphonoacetaldehyde hydrolase  27.1 
 
 		 274 aa  60.5  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0514  phosphonoacetaldehyde hydrolase  27.65 
 
 		 280 aa  59.3  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0295748 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1414  phosphonoacetaldehyde hydrolase  23.53 
 
 		 264 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1217  phosphonoacetaldehyde hydrolase  23.53 
 
 		 264 aa  55.5  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1340  phosphonoacetaldehyde hydrolase  23.53 
 
 		 264 aa  55.5  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1215  phosphonoacetaldehyde hydrolase  23.53 
 
 		 264 aa  55.5  0.0000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1239  phosphonoacetaldehyde hydrolase  23.53 
 
 		 264 aa  55.5  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3967  phosphonoacetaldehyde hydrolase  20.75 
 
 		 264 aa  55.1  0.0000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1051  phosphonoacetaldehyde hydrolase  22.64 
 
 		 264 aa  54.7  0.0000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1377  phosphonoacetaldehyde hydrolase  21.57 
 
 		 264 aa  54.7  0.0000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2412  phosphonoacetaldehyde hydrolase  32.12 
 
 		 281 aa  54.7  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1439  phosphonoacetaldehyde hydrolase  22.22 
 
 		 267 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2313  phosphonoacetaldehyde hydrolase  28.57 
 
 		 257 aa  50.4  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.546562  normal  0.912396 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1240  phosphonoacetaldehyde hydrolase  20.92 
 
 		 264 aa  49.3  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1480  phosphonoacetaldehyde hydrolase  20.26 
 
 		 264 aa  45.4  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20940  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  28.43 
 
 		 273 aa  41.2  0.009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.650807 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>