53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_1909 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007005  Psyr_1909  hypothetical protein  100 
 
 
202 aa  403  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.363123  hitchhiker  0.00151684 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2114  hypothetical protein  86.67 
 
 
196 aa  342  2e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.367695  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3851  hypothetical protein  63.59 
 
 
206 aa  251  6e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.911623 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1925  phosphatase/phosphohexomutase-like protein  48.94 
 
 
239 aa  205  4e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.27121 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27890  hypothetical protein  49 
 
 
247 aa  204  7e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3580  hypothetical protein  56.48 
 
 
187 aa  202  4e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.091933  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2162  hypothetical protein  55.96 
 
 
187 aa  200  9e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.085842  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2354  hypothetical protein  48.78 
 
 
247 aa  197  7e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1703  hypothetical protein  54.92 
 
 
187 aa  197  7.999999999999999e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00235983 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1679  hypothetical protein  55.67 
 
 
187 aa  192  3e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0473  phosphonoacetaldehyde hydrolase  35.48 
 
 
269 aa  75.5  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0492  phosphonoacetaldehyde hydrolase  35.48 
 
 
269 aa  74.7  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0534  phosphonoacetaldehyde hydrolase  35.48 
 
 
269 aa  74.7  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.746184  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0479  phosphonoacetaldehyde hydrolase  35.48 
 
 
269 aa  74.7  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.34346  normal  0.293244 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0471  phosphonoacetaldehyde hydrolase  35.48 
 
 
269 aa  74.3  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000769  phosphonoacetaldehyde hydrolase  25.99 
 
 
284 aa  72  0.000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3261  phosphonoacetaldehyde hydrolase  29.24 
 
 
275 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.258798  normal  0.0791037 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04874  phosphonoacetaldehyde hydrolase  25.57 
 
 
271 aa  69.7  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3836  phosphonoacetaldehyde hydrolase  35.71 
 
 
277 aa  66.6  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000103872 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3627  phosphonoacetaldehyde hydrolase  34.82 
 
 
269 aa  66.6  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2749  phosphonoacetaldehyde hydrolase  29.82 
 
 
295 aa  66.2  0.0000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0966  phosphonoacetaldehyde hydrolase  33.04 
 
 
283 aa  66.6  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.12889 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47280  phosphonoacetaldehyde hydrolase  28.65 
 
 
275 aa  65.9  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3421  phosphonoacetaldehyde hydrolase  27.12 
 
 
274 aa  65.1  0.0000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0548  phosphonoacetaldehyde hydrolase  26.44 
 
 
271 aa  64.3  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000564985  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3684  phosphonoacetaldehyde hydrolase  30.23 
 
 
275 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2141  phosphonoacetaldehyde hydrolase  31.53 
 
 
267 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3462  phosphonoacetaldehyde hydrolase  29.24 
 
 
275 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.985191  normal  0.890252 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2896  phosphonoacetaldehyde hydrolase  25.28 
 
 
277 aa  63.2  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0103695 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4080  phosphonoacetaldehyde hydrolase  27.49 
 
 
275 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4608  phosphonoacetaldehyde hydrolase  27.22 
 
 
292 aa  63.2  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.363137  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4474  phosphonoacetaldehyde hydrolase  27.22 
 
 
292 aa  63.2  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.139325 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0814  phosphonoacetaldehyde hydrolase  26.14 
 
 
271 aa  62.8  0.000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.180019  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1833  phosphonoacetaldehyde hydrolase  28.4 
 
 
275 aa  62.4  0.000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2117  phosphonoacetaldehyde hydrolase  30.63 
 
 
267 aa  62  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1731  phosphonoacetaldehyde hydrolase  27.65 
 
 
277 aa  61.6  0.000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.464888  normal  0.0777557 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2208  phosphonoacetaldehyde hydrolase  28.07 
 
 
275 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.136428  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3530  phosphonoacetaldehyde hydrolase  28.07 
 
 
275 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.359748  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1414  phosphonoacetaldehyde hydrolase  25.49 
 
 
264 aa  58.5  0.00000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2989  phosphonoacetaldehyde hydrolase  31.97 
 
 
270 aa  58.2  0.00000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.446751  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1340  phosphonoacetaldehyde hydrolase  25.49 
 
 
264 aa  57.4  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1217  phosphonoacetaldehyde hydrolase  25.49 
 
 
264 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1215  phosphonoacetaldehyde hydrolase  25.49 
 
 
264 aa  57.4  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1239  phosphonoacetaldehyde hydrolase  25.49 
 
 
264 aa  57.4  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3967  phosphonoacetaldehyde hydrolase  22.88 
 
 
264 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1439  phosphonoacetaldehyde hydrolase  24.18 
 
 
267 aa  55.5  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1377  phosphonoacetaldehyde hydrolase  22.88 
 
 
264 aa  55.1  0.0000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0514  phosphonoacetaldehyde hydrolase  27.87 
 
 
280 aa  55.1  0.0000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0295748 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2412  phosphonoacetaldehyde hydrolase  32.43 
 
 
281 aa  51.2  0.000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2313  phosphonoacetaldehyde hydrolase  30.61 
 
 
257 aa  50.8  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.546562  normal  0.912396 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1240  phosphonoacetaldehyde hydrolase  22.22 
 
 
264 aa  50.1  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1051  phosphonoacetaldehyde hydrolase  22.88 
 
 
264 aa  48.9  0.00005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1480  phosphonoacetaldehyde hydrolase  21.57 
 
 
264 aa  45.4  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>