103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0548 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009456  VC0395_0548  phosphonoacetaldehyde hydrolase  100 
 
 
271 aa  555  1e-157  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000564985  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04874  phosphonoacetaldehyde hydrolase  78.97 
 
 
271 aa  454  1e-127  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000769  phosphonoacetaldehyde hydrolase  78.23 
 
 
284 aa  450  1.0000000000000001e-126  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0814  phosphonoacetaldehyde hydrolase  76.75 
 
 
271 aa  444  1.0000000000000001e-124  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.180019  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2749  phosphonoacetaldehyde hydrolase  69.89 
 
 
295 aa  402  1e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0479  phosphonoacetaldehyde hydrolase  65.79 
 
 
269 aa  343  2e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.34346  normal  0.293244 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0534  phosphonoacetaldehyde hydrolase  65.79 
 
 
269 aa  343  2e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.746184  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0492  phosphonoacetaldehyde hydrolase  65.79 
 
 
269 aa  343  2e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0471  phosphonoacetaldehyde hydrolase  65.41 
 
 
269 aa  340  1e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0473  phosphonoacetaldehyde hydrolase  65.41 
 
 
269 aa  340  1e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3684  phosphonoacetaldehyde hydrolase  55.72 
 
 
275 aa  307  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2412  phosphonoacetaldehyde hydrolase  56.34 
 
 
281 aa  299  3e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3261  phosphonoacetaldehyde hydrolase  55.26 
 
 
275 aa  297  1e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.258798  normal  0.0791037 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2208  phosphonoacetaldehyde hydrolase  54.61 
 
 
275 aa  297  2e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.136428  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3530  phosphonoacetaldehyde hydrolase  54.61 
 
 
275 aa  297  2e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.359748  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1833  phosphonoacetaldehyde hydrolase  54.89 
 
 
275 aa  295  5e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3462  phosphonoacetaldehyde hydrolase  54.89 
 
 
275 aa  295  7e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.985191  normal  0.890252 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47280  phosphonoacetaldehyde hydrolase  53.51 
 
 
275 aa  288  8e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4080  phosphonoacetaldehyde hydrolase  53.51 
 
 
275 aa  288  8e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4474  phosphonoacetaldehyde hydrolase  52.63 
 
 
292 aa  272  4.0000000000000004e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.139325 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4608  phosphonoacetaldehyde hydrolase  52.63 
 
 
292 aa  272  4.0000000000000004e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.363137  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0966  phosphonoacetaldehyde hydrolase  45.69 
 
 
283 aa  228  1e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.12889 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2141  phosphonoacetaldehyde hydrolase  44.74 
 
 
267 aa  226  3e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2117  phosphonoacetaldehyde hydrolase  45.11 
 
 
267 aa  225  6e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1414  phosphonoacetaldehyde hydrolase  41.6 
 
 
264 aa  218  7e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1217  phosphonoacetaldehyde hydrolase  41.6 
 
 
264 aa  218  7.999999999999999e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1239  phosphonoacetaldehyde hydrolase  41.6 
 
 
264 aa  217  1e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1215  phosphonoacetaldehyde hydrolase  41.6 
 
 
264 aa  217  1e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1340  phosphonoacetaldehyde hydrolase  41.6 
 
 
264 aa  217  1e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1377  phosphonoacetaldehyde hydrolase  41.22 
 
 
264 aa  216  2e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3967  phosphonoacetaldehyde hydrolase  41.22 
 
 
264 aa  214  9e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1439  phosphonoacetaldehyde hydrolase  41.22 
 
 
267 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3421  phosphonoacetaldehyde hydrolase  35.63 
 
 
274 aa  214  9.999999999999999e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1051  phosphonoacetaldehyde hydrolase  41.31 
 
 
264 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2896  phosphonoacetaldehyde hydrolase  40.52 
 
 
277 aa  213  2.9999999999999995e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0103695 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0514  phosphonoacetaldehyde hydrolase  39.41 
 
 
280 aa  211  7e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0295748 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1731  phosphonoacetaldehyde hydrolase  39.7 
 
 
277 aa  209  3e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.464888  normal  0.0777557 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3836  phosphonoacetaldehyde hydrolase  42.86 
 
 
277 aa  209  4e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000103872 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1240  phosphonoacetaldehyde hydrolase  40.46 
 
 
264 aa  208  6e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3627  phosphonoacetaldehyde hydrolase  40.22 
 
 
269 aa  206  5e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2989  phosphonoacetaldehyde hydrolase  43.73 
 
 
270 aa  205  7e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.446751  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1480  phosphonoacetaldehyde hydrolase  39.77 
 
 
264 aa  204  9e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2313  phosphonoacetaldehyde hydrolase  35.29 
 
 
257 aa  177  2e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.546562  normal  0.912396 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3095  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.79 
 
 
234 aa  77.4  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0156733  normal  0.965778 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1909  hypothetical protein  26.44 
 
 
202 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.363123  hitchhiker  0.00151684 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2114  hypothetical protein  26.32 
 
 
196 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.367695  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3851  hypothetical protein  27.49 
 
 
206 aa  62.4  0.000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.911623 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3402  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  26.83 
 
 
244 aa  61.2  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0865244 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2582  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 1  28.04 
 
 
224 aa  60.5  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0909618 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2007  HAD family hydrolase  27.07 
 
 
233 aa  59.3  0.00000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0418734 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4840  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.38 
 
 
220 aa  58.5  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0176298  hitchhiker  0.0000825577 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2102  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  28.1 
 
 
233 aa  58.5  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1925  phosphatase/phosphohexomutase-like protein  24.82 
 
 
239 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.27121 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1356  HAD family hydrolase  31.3 
 
 
221 aa  57.8  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.14421  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2632  HAD family hydrolase  27.4 
 
 
233 aa  58.2  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.503423  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2743  HAD family hydrolase  27.41 
 
 
227 aa  57.4  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.994994  normal  0.0511558 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0071  phosphatase-like protein  23.9 
 
 
246 aa  54.7  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1679  hypothetical protein  31.19 
 
 
187 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0027  HAD-superfamily hydrolase  27.39 
 
 
238 aa  53.5  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2354  hypothetical protein  32.31 
 
 
247 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27890  hypothetical protein  30.28 
 
 
247 aa  52.8  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3315  HAD family hydrolase  27.16 
 
 
242 aa  52.8  0.000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.354727 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2245  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.72 
 
 
247 aa  52.8  0.000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.56873  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3772  2-deoxyglucose-6-phosphatase  22.44 
 
 
218 aa  51.6  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2162  hypothetical protein  31.19 
 
 
187 aa  49.7  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.085842  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3580  hypothetical protein  31.19 
 
 
187 aa  49.7  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.091933  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4498  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  23.38 
 
 
223 aa  49.7  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.511661  normal  0.0143777 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0053  hydrolase  26.58 
 
 
229 aa  48.9  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.205751 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1752  HAD family hydrolase  25.73 
 
 
232 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7385  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA  25 
 
 
248 aa  48.1  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2091  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  33.33 
 
 
233 aa  47.8  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1319  HAD family hydrolase  27.22 
 
 
223 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1703  hypothetical protein  30.28 
 
 
187 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00235983 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1479  phosphoglycolate phosphatase  22.75 
 
 
231 aa  47  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.781791  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3425  2-deoxyglucose-6-phosphatase  24.51 
 
 
223 aa  47.4  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000919178  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0381  2-deoxyglucose-6-phosphatase  23.67 
 
 
221 aa  46.6  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0071153  normal  0.324571 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3307  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  33.04 
 
 
735 aa  46.6  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.081208  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0520  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.73 
 
 
217 aa  46.2  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000391  2-deoxyglucose-6-phosphate hydrolase YniC  22.61 
 
 
218 aa  46.2  0.0006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0106831  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5088  beta-phosphoglucomutase  24.46 
 
 
219 aa  45.8  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00016924  normal  0.408522 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0431  2-deoxyglucose-6-phosphatase  23.3 
 
 
217 aa  45.4  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2742  HAD family hydrolase  27.45 
 
 
218 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1301  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  25.95 
 
 
228 aa  44.7  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.782591  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0271  hypothetical protein  24.87 
 
 
229 aa  44.3  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.586518  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1220  phosphoglycolate phosphatase  21.95 
 
 
225 aa  44.3  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3410  2-deoxyglucose-6-phosphatase  21.74 
 
 
217 aa  44.3  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0110715  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0437  2-deoxyglucose-6-phosphatase  19.9 
 
 
221 aa  43.9  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000647119  hitchhiker  0.00000756317 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3346  HAD family hydrolase  25.36 
 
 
221 aa  44.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.363754  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0766  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  24.56 
 
 
222 aa  44.7  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3817  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  24.62 
 
 
227 aa  44.3  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0325282  hitchhiker  0.00357212 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0714  hydrolase  28.57 
 
 
255 aa  43.9  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0436  haloacid dehalogenase/epoxide hydrolase family protein  23.33 
 
 
226 aa  43.9  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0783  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  24.89 
 
 
222 aa  43.9  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4494  HAD family hydrolase  26.21 
 
 
217 aa  43.5  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.901613 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4954  pyrophosphatase PpaX  21.79 
 
 
215 aa  43.5  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03670  predicted phosphatase  26.85 
 
 
244 aa  43.5  0.004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0282294  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4133  6-phosphogluconate phosphatase  25 
 
 
221 aa  43.1  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0258255  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1566  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.28 
 
 
263 aa  43.1  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0545  HAD-superfamily hydrolase  23.27 
 
 
246 aa  42.7  0.006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4240  6-phosphogluconate phosphatase  25 
 
 
221 aa  42.7  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0636361  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>