44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_3580 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_3580  hypothetical protein  100 
 
 		 187 aa  374  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.091933  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2162  hypothetical protein  99.47 
 
 		 187 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.085842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1703  hypothetical protein  90.37 
 
 		 187 aa  344  4e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235983 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1679  hypothetical protein  83.42 
 
 		 187 aa  316  2e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3851  hypothetical protein  57.65 
 
 		 206 aa  211  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.911623 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1909  hypothetical protein  56.48 
 
 		 202 aa  202  3e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.363123  hitchhiker  0.00151684 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2114  hypothetical protein  54.4 
 
 		 196 aa  199  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.367695  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1925  phosphatase/phosphohexomutase-like protein  55.28 
 
 		 239 aa  164  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.27121 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27890  hypothetical protein  54.43 
 
 		 247 aa  154  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2354  hypothetical protein  55.62 
 
 		 247 aa  153  2e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0473  phosphonoacetaldehyde hydrolase  30.29 
 
 		 269 aa  67.4  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0471  phosphonoacetaldehyde hydrolase  31.95 
 
 		 269 aa  67.4  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0492  phosphonoacetaldehyde hydrolase  30.29 
 
 		 269 aa  66.6  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0534  phosphonoacetaldehyde hydrolase  30.29 
 
 		 269 aa  66.6  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.746184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0479  phosphonoacetaldehyde hydrolase  30.29 
 
 		 269 aa  66.6  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.34346  normal  0.293244 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0966  phosphonoacetaldehyde hydrolase  26.59 
 
 		 283 aa  59.7  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.12889 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3836  phosphonoacetaldehyde hydrolase  26.59 
 
 		 277 aa  59.3  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000103872 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3627  phosphonoacetaldehyde hydrolase  30.95 
 
 		 269 aa  58.9  0.00000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2749  phosphonoacetaldehyde hydrolase  30.28 
 
 		 295 aa  57.4  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000769  phosphonoacetaldehyde hydrolase  32.11 
 
 		 284 aa  57.4  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04874  phosphonoacetaldehyde hydrolase  29.36 
 
 		 271 aa  54.7  0.0000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2141  phosphonoacetaldehyde hydrolase  29.36 
 
 		 267 aa  54.3  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3421  phosphonoacetaldehyde hydrolase  25.23 
 
 		 274 aa  53.1  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2117  phosphonoacetaldehyde hydrolase  28.44 
 
 		 267 aa  53.1  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0814  phosphonoacetaldehyde hydrolase  30.28 
 
 		 271 aa  51.2  0.000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.180019  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0548  phosphonoacetaldehyde hydrolase  31.19 
 
 		 271 aa  49.7  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000564985  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3462  phosphonoacetaldehyde hydrolase  31.21 
 
 		 275 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.985191  normal  0.890252 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1833  phosphonoacetaldehyde hydrolase  30.64 
 
 		 275 aa  48.1  0.00008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2208  phosphonoacetaldehyde hydrolase  30.64 
 
 		 275 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.136428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3530  phosphonoacetaldehyde hydrolase  30.64 
 
 		 275 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.359748  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2989  phosphonoacetaldehyde hydrolase  29.07 
 
 		 270 aa  45.4  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.446751  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1439  phosphonoacetaldehyde hydrolase  23.78 
 
 		 267 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3967  phosphonoacetaldehyde hydrolase  24.55 
 
 		 264 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1731  phosphonoacetaldehyde hydrolase  25.69 
 
 		 277 aa  43.1  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.464888  normal  0.0777557 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2896  phosphonoacetaldehyde hydrolase  25 
 
 		 277 aa  43.5  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0103695 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1340  phosphonoacetaldehyde hydrolase  23.17 
 
 		 264 aa  42.7  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1217  phosphonoacetaldehyde hydrolase  23.17 
 
 		 264 aa  42.7  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1215  phosphonoacetaldehyde hydrolase  23.17 
 
 		 264 aa  42.7  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1239  phosphonoacetaldehyde hydrolase  23.17 
 
 		 264 aa  42.7  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47280  phosphonoacetaldehyde hydrolase  28.07 
 
 		 275 aa  42.7  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2313  phosphonoacetaldehyde hydrolase  25.16 
 
 		 257 aa  42.4  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.546562  normal  0.912396 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3261  phosphonoacetaldehyde hydrolase  26.01 
 
 		 275 aa  42  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.258798  normal  0.0791037 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1377  phosphonoacetaldehyde hydrolase  23.17 
 
 		 264 aa  42  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1240  phosphonoacetaldehyde hydrolase  22.75 
 
 		 264 aa  41.2  0.009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>