138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3836 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3836  phosphonoacetaldehyde hydrolase  100 
 
 
277 aa  563  1.0000000000000001e-159  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000103872 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0966  phosphonoacetaldehyde hydrolase  74.73 
 
 
283 aa  426  1e-118  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.12889 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1051  phosphonoacetaldehyde hydrolase  50 
 
 
264 aa  270  2e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1439  phosphonoacetaldehyde hydrolase  50.19 
 
 
267 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1731  phosphonoacetaldehyde hydrolase  47.76 
 
 
277 aa  267  1e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.464888  normal  0.0777557 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1217  phosphonoacetaldehyde hydrolase  49.03 
 
 
264 aa  265  5e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1239  phosphonoacetaldehyde hydrolase  49.03 
 
 
264 aa  265  5.999999999999999e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1215  phosphonoacetaldehyde hydrolase  49.03 
 
 
264 aa  265  5.999999999999999e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1340  phosphonoacetaldehyde hydrolase  49.03 
 
 
264 aa  265  5.999999999999999e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3967  phosphonoacetaldehyde hydrolase  50.77 
 
 
264 aa  265  7e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1377  phosphonoacetaldehyde hydrolase  50.38 
 
 
264 aa  265  8.999999999999999e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1414  phosphonoacetaldehyde hydrolase  49.62 
 
 
264 aa  263  3e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1240  phosphonoacetaldehyde hydrolase  48.08 
 
 
264 aa  262  4e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1480  phosphonoacetaldehyde hydrolase  49.03 
 
 
264 aa  260  2e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0514  phosphonoacetaldehyde hydrolase  44.81 
 
 
280 aa  248  7e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0295748 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2896  phosphonoacetaldehyde hydrolase  43.66 
 
 
277 aa  242  3.9999999999999997e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0103695 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3627  phosphonoacetaldehyde hydrolase  43.56 
 
 
269 aa  238  5.999999999999999e-62  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2141  phosphonoacetaldehyde hydrolase  45.08 
 
 
267 aa  236  3e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3421  phosphonoacetaldehyde hydrolase  40.15 
 
 
274 aa  231  1e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2117  phosphonoacetaldehyde hydrolase  44.32 
 
 
267 aa  230  2e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2989  phosphonoacetaldehyde hydrolase  42.32 
 
 
270 aa  213  2.9999999999999995e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.446751  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2749  phosphonoacetaldehyde hydrolase  41.73 
 
 
295 aa  212  4.9999999999999996e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0548  phosphonoacetaldehyde hydrolase  42.86 
 
 
271 aa  209  4e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000564985  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2313  phosphonoacetaldehyde hydrolase  43.31 
 
 
257 aa  207  2e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.546562  normal  0.912396 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3261  phosphonoacetaldehyde hydrolase  39.77 
 
 
275 aa  206  3e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.258798  normal  0.0791037 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000769  phosphonoacetaldehyde hydrolase  40.98 
 
 
284 aa  206  4e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04874  phosphonoacetaldehyde hydrolase  41.35 
 
 
271 aa  205  6e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47280  phosphonoacetaldehyde hydrolase  40.84 
 
 
275 aa  204  1e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0479  phosphonoacetaldehyde hydrolase  43.23 
 
 
269 aa  204  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.34346  normal  0.293244 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0534  phosphonoacetaldehyde hydrolase  43.23 
 
 
269 aa  204  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.746184  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0492  phosphonoacetaldehyde hydrolase  43.23 
 
 
269 aa  204  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0471  phosphonoacetaldehyde hydrolase  43.23 
 
 
269 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0814  phosphonoacetaldehyde hydrolase  40.23 
 
 
271 aa  202  4e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.180019  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0473  phosphonoacetaldehyde hydrolase  42.86 
 
 
269 aa  202  6e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3684  phosphonoacetaldehyde hydrolase  39.31 
 
 
275 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4080  phosphonoacetaldehyde hydrolase  39.69 
 
 
275 aa  199  5e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4608  phosphonoacetaldehyde hydrolase  39.69 
 
 
292 aa  198  7.999999999999999e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.363137  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2412  phosphonoacetaldehyde hydrolase  41.06 
 
 
281 aa  198  7.999999999999999e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4474  phosphonoacetaldehyde hydrolase  39.69 
 
 
292 aa  198  7.999999999999999e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.139325 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3462  phosphonoacetaldehyde hydrolase  38.72 
 
 
275 aa  195  8.000000000000001e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.985191  normal  0.890252 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2208  phosphonoacetaldehyde hydrolase  38.35 
 
 
275 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.136428  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3530  phosphonoacetaldehyde hydrolase  38.35 
 
 
275 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.359748  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1833  phosphonoacetaldehyde hydrolase  39.55 
 
 
275 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3095  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  33.05 
 
 
234 aa  82.4  0.000000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0156733  normal  0.965778 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2102  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  30.27 
 
 
233 aa  74.3  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3851  hypothetical protein  30.6 
 
 
206 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.911623 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2114  hypothetical protein  30 
 
 
196 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.367695  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4840  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.85 
 
 
220 aa  67  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0176298  hitchhiker  0.0000825577 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1909  hypothetical protein  35.71 
 
 
202 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.363123  hitchhiker  0.00151684 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0053  hydrolase  33.33 
 
 
229 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.205751 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2354  hypothetical protein  33.03 
 
 
247 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27890  hypothetical protein  32.11 
 
 
247 aa  62.8  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1925  phosphatase/phosphohexomutase-like protein  31.19 
 
 
239 aa  62.8  0.000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.27121 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0071  phosphatase-like protein  29.01 
 
 
246 aa  60.8  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0027  HAD-superfamily hydrolase  29.11 
 
 
238 aa  60.1  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3580  hypothetical protein  26.59 
 
 
187 aa  59.3  0.00000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.091933  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2162  hypothetical protein  31.19 
 
 
187 aa  59.3  0.00000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.085842  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3402  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  28.64 
 
 
244 aa  58.9  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0865244 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3186  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  35.29 
 
 
231 aa  58.5  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.234606  normal  0.0137169 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1319  HAD family hydrolase  35.78 
 
 
223 aa  57  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1703  hypothetical protein  27.52 
 
 
187 aa  56.2  0.0000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00235983 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3817  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.29 
 
 
227 aa  54.7  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0325282  hitchhiker  0.00357212 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2632  HAD family hydrolase  32.56 
 
 
233 aa  53.1  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.503423  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14830  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  31.25 
 
 
219 aa  53.1  0.000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.187107 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2007  HAD family hydrolase  28.21 
 
 
233 aa  53.1  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0418734 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1679  hypothetical protein  28.44 
 
 
187 aa  52.8  0.000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1399  phosphoglycolate phosphatase  28.4 
 
 
225 aa  52.4  0.000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3134  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25.6 
 
 
219 aa  52.4  0.000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.833655  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2461  phosphoglycolate phosphatase  27.81 
 
 
225 aa  50.8  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.768725 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1356  HAD family hydrolase  23.65 
 
 
221 aa  51.2  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.14421  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1089  phosphoglycolate phosphatase  27.27 
 
 
227 aa  51.2  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.396739  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1614  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25.76 
 
 
224 aa  51.2  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0147527  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2582  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 1  31.13 
 
 
224 aa  50.1  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0909618 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25590  putative hydrolase  30.3 
 
 
230 aa  49.3  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.080664  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2007  HAD family hydrolase  24.62 
 
 
222 aa  48.5  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0714  hydrolase  33.03 
 
 
255 aa  48.5  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1301  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  33.64 
 
 
228 aa  48.5  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.782591  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03670  predicted phosphatase  29.49 
 
 
244 aa  47.8  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0282294  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0945  putative 2-phosphoglycolate phosphatase  26.7 
 
 
226 aa  47.4  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0525  HAD family hydrolase  26.96 
 
 
209 aa  47.8  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00124351  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4075  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.36 
 
 
230 aa  47  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.280264  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01216  Glycerol-3-phosphate phosphatasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UVC6]  24.62 
 
 
236 aa  46.6  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00109898  normal  0.137881 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2065  HAD-superfamily hydrolase  38.61 
 
 
216 aa  46.2  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.803499  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1575  phosphoglycolate phosphatase  26.2 
 
 
229 aa  46.6  0.0005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.099799  unclonable  0.000000163733 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0767  phosphoglycolate phosphatase  25 
 
 
229 aa  46.2  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.54601  hitchhiker  0.00790762 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2083  phosphoglycolate phosphatase  25.63 
 
 
226 aa  46.2  0.0006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.609164  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15750  phosphoglycolate phosphatase  26.24 
 
 
223 aa  46.2  0.0007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3547  phosphoglycolate phosphatase  27.07 
 
 
238 aa  45.8  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2701  phosphoglycolate phosphatase  27.88 
 
 
230 aa  46.2  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.364651  normal  0.0856305 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3193  phosphoglycolate phosphatase  24.16 
 
 
250 aa  45.8  0.0008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0838  phosphoglycolate phosphatase  25.35 
 
 
228 aa  45.8  0.0009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.681144  normal  0.099255 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1712  HAD family hydrolase  27.62 
 
 
239 aa  45.4  0.0009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000827821  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2943  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.57 
 
 
218 aa  45.1  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.86932  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5246  pyrophosphatase PpaX  28.97 
 
 
216 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2232  pyrophosphatase PpaX  37.11 
 
 
214 aa  45.1  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23210  phosphoglycolate phosphatase  27.75 
 
 
226 aa  45.4  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0343323  hitchhiker  0.00416895 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3103  HAD family hydrolase  25.11 
 
 
562 aa  45.1  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1715  HAD family hydrolase  39.68 
 
 
195 aa  44.7  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.101498 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1844  phosphoglycolate phosphatase  42.86 
 
 
223 aa  45.1  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0203973  normal  0.771348 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3122  HAD family hydrolase  24.05 
 
 
214 aa  45.4  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>