292 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3817 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_3817  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  100 
 
 
227 aa  441  1e-123  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0325282  hitchhiker  0.00357212 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2007  HAD family hydrolase  60.89 
 
 
233 aa  228  7e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0418734 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1319  HAD family hydrolase  62.44 
 
 
223 aa  226  2e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2632  HAD family hydrolase  62.21 
 
 
233 aa  224  7e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.503423  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0053  hydrolase  56.82 
 
 
229 aa  218  8.999999999999998e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.205751 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3186  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  61.54 
 
 
231 aa  210  2e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.234606  normal  0.0137169 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1301  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  54.95 
 
 
228 aa  204  7e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.782591  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2582  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 1  53.18 
 
 
224 aa  201  9.999999999999999e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0909618 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0714  hydrolase  51.12 
 
 
255 aa  184  8e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0027  HAD-superfamily hydrolase  47.79 
 
 
238 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0071  phosphatase-like protein  46.02 
 
 
246 aa  175  4e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03670  predicted phosphatase  44.8 
 
 
244 aa  139  4.999999999999999e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0282294  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3095  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  35.81 
 
 
234 aa  124  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0156733  normal  0.965778 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2102  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  39.91 
 
 
233 aa  114  2.0000000000000002e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3402  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  31.93 
 
 
244 aa  98.2  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0865244 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4840  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.15 
 
 
220 aa  92.8  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0176298  hitchhiker  0.0000825577 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0854  HAD family hydrolase  35.27 
 
 
221 aa  75.9  0.0000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.249022  decreased coverage  0.000200034 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0966  phosphonoacetaldehyde hydrolase  29.76 
 
 
283 aa  74.7  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.12889 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2896  phosphonoacetaldehyde hydrolase  34.29 
 
 
277 aa  73.6  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0103695 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1731  phosphonoacetaldehyde hydrolase  30.04 
 
 
277 aa  71.2  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.464888  normal  0.0777557 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2313  phosphonoacetaldehyde hydrolase  31.78 
 
 
257 aa  68.6  0.00000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.546562  normal  0.912396 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3836  phosphonoacetaldehyde hydrolase  35.29 
 
 
277 aa  65.1  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000103872 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0072  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.03 
 
 
230 aa  64.3  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3421  phosphonoacetaldehyde hydrolase  22.54 
 
 
274 aa  61.6  0.000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2412  phosphonoacetaldehyde hydrolase  28.46 
 
 
281 aa  61.6  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0734  HAD family hydrolase  32.68 
 
 
241 aa  60.8  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.879574  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1330  HAD family hydrolase  40.74 
 
 
230 aa  60.8  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2658  haloacid dehalogenase-like hydrolase  31.96 
 
 
236 aa  59.7  0.00000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4417  HAD family hydrolase  30.88 
 
 
232 aa  58.5  0.00000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.155896  normal  0.156136 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2469  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.24 
 
 
224 aa  58.2  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.618161  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1051  phosphonoacetaldehyde hydrolase  28.91 
 
 
264 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2240  HAD family hydrolase  29.87 
 
 
214 aa  57  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.279618  normal  0.937061 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14840  HAD-superfamily hydrolase  29.49 
 
 
220 aa  56.6  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.770171  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0356  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.09 
 
 
233 aa  56.6  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2034  HAD family hydrolase  26.85 
 
 
216 aa  56.2  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.645104  normal  0.0672621 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4411  HAD family hydrolase  33.33 
 
 
224 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.981308  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1439  phosphonoacetaldehyde hydrolase  28.17 
 
 
267 aa  55.8  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1492  HAD family hydrolase  25.12 
 
 
217 aa  55.8  0.0000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.210059  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1239  phosphonoacetaldehyde hydrolase  28.17 
 
 
264 aa  55.8  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1215  phosphonoacetaldehyde hydrolase  28.17 
 
 
264 aa  55.8  0.0000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1414  phosphonoacetaldehyde hydrolase  28.17 
 
 
264 aa  55.8  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1217  phosphonoacetaldehyde hydrolase  28.17 
 
 
264 aa  55.8  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4915  nucleotidase  37.93 
 
 
225 aa  55.8  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.366204  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4812  nucleotidase  37.93 
 
 
225 aa  55.8  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.622374  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7037  HAD family hydrolase  33.33 
 
 
224 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.927677 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1340  phosphonoacetaldehyde hydrolase  28.17 
 
 
264 aa  55.8  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4973  nucleotidase  37.93 
 
 
225 aa  55.8  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.100904  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4880  nucleotidase  37.93 
 
 
225 aa  55.8  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00926428  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4967  nucleotidase  37.93 
 
 
225 aa  55.8  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.081412  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0479  phosphonoacetaldehyde hydrolase  28.68 
 
 
269 aa  55.5  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.34346  normal  0.293244 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2880  phosphoglycolate phosphatase  32 
 
 
246 aa  55.5  0.0000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.587243  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0492  phosphonoacetaldehyde hydrolase  28.68 
 
 
269 aa  55.5  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0534  phosphonoacetaldehyde hydrolase  28.68 
 
 
269 aa  55.5  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.746184  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6309  HAD family hydrolase  33.33 
 
 
224 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.403057 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2438  HAD family hydrolase  29.58 
 
 
219 aa  54.3  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.625372  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34060  predicted phosphatase  32.35 
 
 
228 aa  54.3  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6102  HAD family hydrolase  33.99 
 
 
224 aa  54.7  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.524869  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5583  HAD family hydrolase  32.72 
 
 
224 aa  54.3  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1377  phosphonoacetaldehyde hydrolase  28.17 
 
 
264 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0280  HAD family hydrolase  29.22 
 
 
233 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1937  HAD family hydrolase  30.7 
 
 
234 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.67763  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0323  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.96 
 
 
233 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0341719 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3122  phosphoglycolate phosphatase  29.65 
 
 
248 aa  53.9  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.571446  normal  0.270174 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7122  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.08 
 
 
219 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4360  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  33.54 
 
 
223 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1483  HAD family hydrolase  28.11 
 
 
224 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0762089  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0569  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  25.35 
 
 
213 aa  53.9  0.000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.895889  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1317  HAD family hydrolase  33.33 
 
 
224 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.716581  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1240  phosphonoacetaldehyde hydrolase  26.64 
 
 
264 aa  53.5  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6512  HAD family hydrolase  33.33 
 
 
224 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1874  HAD family hydrolase  28.7 
 
 
216 aa  54.3  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.785736  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2291  HAD family hydrolase  30.13 
 
 
218 aa  53.1  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.265516  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4472  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.52 
 
 
223 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3103  HAD family hydrolase  30.34 
 
 
562 aa  53.1  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4762  HAD family hydrolase  31.9 
 
 
242 aa  52.8  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.698376  hitchhiker  0.00269567 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1778  HAD family hydrolase  28.51 
 
 
222 aa  52.4  0.000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0979226  decreased coverage  0.0000822361 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3967  phosphonoacetaldehyde hydrolase  28.24 
 
 
264 aa  52.4  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1002  HAD superfamily hydrolase  27.59 
 
 
221 aa  52.4  0.000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1518  HAD family hydrolase  28.9 
 
 
226 aa  52.4  0.000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0020263  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0548  phosphonoacetaldehyde hydrolase  24.62 
 
 
271 aa  52.4  0.000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000564985  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0968  HAD superfamily hydrolase  27.59 
 
 
221 aa  52.4  0.000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4921  nucleotidase  30.92 
 
 
225 aa  52  0.000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0815818  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2757  phosphoglycolate phosphatase  28.76 
 
 
243 aa  52  0.000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.411374  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6369  HAD family hydrolase  32.58 
 
 
219 aa  52  0.000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.23133  normal  0.167912 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3683  nucleotidase  30.92 
 
 
225 aa  52  0.000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.847444  hitchhiker  0.000163133 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2232  pyrophosphatase PpaX  24.74 
 
 
214 aa  52  0.000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1480  phosphonoacetaldehyde hydrolase  27.78 
 
 
264 aa  52  0.000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3084  HAD family hydrolase  25.91 
 
 
219 aa  52  0.000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0473  phosphonoacetaldehyde hydrolase  30.54 
 
 
269 aa  51.6  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0514  phosphonoacetaldehyde hydrolase  27.24 
 
 
280 aa  51.6  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0295748 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3991  HAD family hydrolase  30.52 
 
 
223 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0589691  normal  0.286342 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1621  HAD family hydrolase  28.57 
 
 
231 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0638141  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1783  D,D-heptose 1,7-bisphosphate phosphatase  29.65 
 
 
183 aa  51.6  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000391203  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2711  HAD family hydrolase  31.22 
 
 
230 aa  51.2  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0909  phosphoglycolate phosphatase  28.37 
 
 
222 aa  51.6  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3625  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.72 
 
 
225 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.175354  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5280  pyrophosphatase PpaX  26.01 
 
 
216 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2815  D,D-heptose 1,7-bisphosphate phosphatase  28.65 
 
 
183 aa  50.8  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000907424  normal  0.640137 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0471  phosphonoacetaldehyde hydrolase  29.94 
 
 
269 aa  50.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1383  D,D-heptose 1,7-bisphosphate phosphatase  28.02 
 
 
185 aa  50.4  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000311107  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>