160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_34060 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_34060  predicted phosphatase  100 
 
 
228 aa  446  1.0000000000000001e-124  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0479  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  65.02 
 
 
218 aa  261  4.999999999999999e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4734  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  56 
 
 
206 aa  197  9e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0147  ExsB family protein  50 
 
 
486 aa  172  3.9999999999999995e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00645126 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8096  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  52 
 
 
205 aa  153  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0817  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  46.67 
 
 
206 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4428  haloacid dehalogenase-like hydrolase  45.5 
 
 
213 aa  145  4.0000000000000006e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.283335 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3933  hydrolase  51.02 
 
 
472 aa  141  8e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.158663  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8903  phosphatase-like protein  46.15 
 
 
205 aa  138  7e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.272506  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6159  Haloacid dehalogenase domain-containing protein hydrolase  43.35 
 
 
202 aa  134  9e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4626  hydrolase  37.04 
 
 
207 aa  100  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.413109  normal  0.0153666 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3579  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  40.8 
 
 
241 aa  88.6  7e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0582871  normal  0.0546383 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1212  hypothetical protein  28.24 
 
 
219 aa  73.2  0.000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0173059  normal  0.0170431 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2442  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  32.64 
 
 
201 aa  70.9  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2643  HAD family hydrolase  32.86 
 
 
227 aa  69.3  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.735097  normal  0.197279 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3263  HAD family hydrolase  24.51 
 
 
216 aa  67.4  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2186  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  27.27 
 
 
221 aa  66.2  0.0000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2285  phosphatases  31.55 
 
 
221 aa  63.9  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.812545  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0914  hypothetical protein  27.7 
 
 
216 aa  63.5  0.000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1267  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.04 
 
 
221 aa  62.4  0.000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.090781  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0384  HAD family hydrolase  28.64 
 
 
222 aa  62  0.000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000045535  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4333  HAD family hydrolase  29.03 
 
 
218 aa  61.2  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3547  phosphoglycolate phosphatase  33.16 
 
 
238 aa  61.2  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2726  phosphoglycolate phosphatase  27.36 
 
 
223 aa  59.7  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.658118  hitchhiker  0.000458503 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0072  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.47 
 
 
230 aa  58.5  0.00000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2037  HAD family hydrolase  30.99 
 
 
225 aa  58.5  0.00000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00546936 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2045  HAD family hydrolase  22.83 
 
 
225 aa  57.8  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.143641  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0364  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  29.74 
 
 
229 aa  57.8  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.946559  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25590  putative hydrolase  29.81 
 
 
230 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.080664  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3382  HAD family hydrolase  31.58 
 
 
217 aa  57.4  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.424816 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2083  phosphoglycolate phosphatase  30.91 
 
 
226 aa  57.4  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.609164  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2187  putative hydrolase  30.62 
 
 
230 aa  57  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0143931  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0525  HAD family hydrolase  30.66 
 
 
209 aa  57  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00124351  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35600  predicted phosphatase  28.5 
 
 
220 aa  57  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1821  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  31.63 
 
 
238 aa  55.8  0.0000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000701178 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2493  phosphoglycolate phosphatase  25.66 
 
 
225 aa  54.3  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0387  conserved hypothetical protein, putative HAD superfamily hydrolase  25.45 
 
 
214 aa  54.7  0.000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.322414  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2445  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  28.18 
 
 
232 aa  55.1  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0477823 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2202  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  22.27 
 
 
221 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.958257  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2080  hydrolase  31.1 
 
 
231 aa  55.1  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.025582  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0391  phosphoglycolate phosphatase  26.78 
 
 
216 aa  54.3  0.000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1319  HAD family hydrolase  30.88 
 
 
223 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1222  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.98 
 
 
220 aa  53.1  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1937  HAD family hydrolase  32.71 
 
 
234 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.67763  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2110  phosphoglycolate phosphatase  25.33 
 
 
225 aa  52.8  0.000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.782136  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0740  hypothetical protein  27.72 
 
 
212 aa  52.8  0.000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.347846  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1483  HAD family hydrolase  28.85 
 
 
224 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0762089  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0590  HAD family hydrolase  28.7 
 
 
219 aa  52.4  0.000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0419315 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3123  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  22.33 
 
 
221 aa  52.4  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0025393 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3807  HAD family hydrolase  28.37 
 
 
224 aa  52.4  0.000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.118188  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0209  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  30.3 
 
 
235 aa  52.4  0.000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.415502  normal  0.0513274 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2250  HAD superfamily hydrolase  21.82 
 
 
221 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.17199  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1907  HAD superfamily hydrolase  28.37 
 
 
224 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.00000027861 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1650  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1 family protein  26.4 
 
 
213 aa  50.8  0.00002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2251  phosphoglycolate phosphatase  30.32 
 
 
229 aa  50.4  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2332  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  22.02 
 
 
221 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000150125  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2449  HAD family hydrolase  27.98 
 
 
217 aa  50.4  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0190416  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4411  HAD family hydrolase  28.38 
 
 
224 aa  50.4  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.981308  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3817  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.33 
 
 
227 aa  50.1  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0325282  hitchhiker  0.00357212 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3084  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.89 
 
 
218 aa  50.1  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6309  HAD family hydrolase  28.76 
 
 
224 aa  50.1  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.403057 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1317  HAD family hydrolase  28.76 
 
 
224 aa  49.7  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.716581  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2582  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 1  31.95 
 
 
224 aa  49.7  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0909618 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5294  HAD family hydrolase  29.6 
 
 
224 aa  49.7  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.08015 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6512  HAD family hydrolase  28.76 
 
 
224 aa  49.7  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1452  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  35.29 
 
 
231 aa  49.7  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.546355 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3203  hydrolase  26.07 
 
 
220 aa  49.7  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2363  phosphoglycolate phosphatase  29.58 
 
 
227 aa  49.7  0.00004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.496506  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7037  HAD family hydrolase  28.32 
 
 
224 aa  49.3  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.927677 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1470  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1 family protein  25.89 
 
 
213 aa  49.3  0.00005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000674726  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0025  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase family protein  32.39 
 
 
219 aa  49.3  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.412211  normal  0.132054 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1600  pyrophosphatase PpaX  24.39 
 
 
217 aa  49.3  0.00005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000092205  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1720  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  23.85 
 
 
222 aa  48.9  0.00006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.739414  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1824  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1 family protein  26.02 
 
 
213 aa  48.9  0.00007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0490965  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0504  phosphatase-like protein  28.64 
 
 
324 aa  48.5  0.00008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3186  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  33.33 
 
 
231 aa  48.5  0.00008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.234606  normal  0.0137169 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1697  HAD family hydrolase  25.94 
 
 
231 aa  48.5  0.00008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0993915 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2003  phosphoglycolate phosphatase  23.26 
 
 
221 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.196564  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0710  phosphoglycolate phosphatase  30.53 
 
 
218 aa  47.8  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.113573  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2152  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.24 
 
 
225 aa  48.1  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1092  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.29 
 
 
212 aa  47.8  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0735  phosphoglycolate phosphatase  29.08 
 
 
237 aa  47.8  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.442963  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6102  HAD family hydrolase  28.32 
 
 
224 aa  48.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.524869  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0218  HAD superfamily hydrolase  23.56 
 
 
215 aa  47.4  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0787  haloacid dehalogenase domain-containing protein hydrolase  29.46 
 
 
246 aa  47.4  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2064  HAD superfamily hydrolase  23.9 
 
 
221 aa  47.4  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2220  HAD superfamily hydrolase  23.9 
 
 
221 aa  47.4  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0053  hydrolase  28.64 
 
 
229 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.205751 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2535  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  23.94 
 
 
220 aa  47  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2248  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  24.14 
 
 
221 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.2381099999999995e-27 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5624  HAD family hydrolase  29.95 
 
 
228 aa  46.6  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.147818  normal  0.407625 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1453  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  29.38 
 
 
228 aa  46.6  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.781565 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2060  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.99 
 
 
225 aa  46.6  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.750609  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3998  phosphoglycolate phosphatase  30.88 
 
 
226 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.739792  normal  0.543367 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2097  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.03 
 
 
221 aa  45.8  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.284323  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1780  HAD family hydrolase  28.02 
 
 
225 aa  45.8  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.587654  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0734  HAD family hydrolase  30.14 
 
 
241 aa  45.8  0.0006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.879574  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2438  HAD family hydrolase  27.19 
 
 
219 aa  45.8  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.625372  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5583  HAD family hydrolase  27.88 
 
 
224 aa  45.4  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0609  HAD family hydrolase  22.38 
 
 
215 aa  45.4  0.0007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>