86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0787 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_0787  haloacid dehalogenase domain-containing protein hydrolase  100 
 
 
246 aa  491  9.999999999999999e-139  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1439  putative phosphoglycolate phosphatase  72.03 
 
 
238 aa  341  8e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.608138  normal  0.0945263 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4015  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  57.02 
 
 
249 aa  256  2e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2482  phosphatase  52.21 
 
 
245 aa  222  4e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3726  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  47.88 
 
 
255 aa  197  1.0000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.151121  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8751  hypothetical protein  44.19 
 
 
229 aa  186  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2888  haloacid dehalogenase-like hydrolase  45.09 
 
 
239 aa  180  2e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.061028  normal  0.661007 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7316  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  42.08 
 
 
229 aa  163  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000529142  hitchhiker  0.000000108756 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0948  haloacid dehalogenase-like hydrolase  39.73 
 
 
233 aa  151  1e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000642365  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1510  phosphoglycolate phosphatase  42.93 
 
 
249 aa  143  2e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117992  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3192  hydrolase  39.48 
 
 
272 aa  144  2e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.063397  hitchhiker  0.00469081 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5846  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  39.29 
 
 
229 aa  140  3e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0126424  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8965  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  38.36 
 
 
224 aa  133  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0545563  normal  0.651642 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30410  predicted phosphatase  38.89 
 
 
237 aa  132  6e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.990761  normal  0.161888 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5572  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  37.56 
 
 
238 aa  125  4.0000000000000003e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00524465  normal  0.993212 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2687  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  32.75 
 
 
228 aa  111  9e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3764  hydrolase  34.36 
 
 
232 aa  98.6  9e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0254156  unclonable  0.0000121762 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3983  hydrolase  29.6 
 
 
230 aa  88.6  8e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.583874  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1987  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  27.39 
 
 
230 aa  87.8  1e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4195  hydrolase  29.74 
 
 
234 aa  87  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.953926  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0418  HAD superfamily hydrolase  28.19 
 
 
230 aa  87  2e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0503  hydrolase  27.39 
 
 
230 aa  86.7  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1120  hydrolase  33.04 
 
 
231 aa  84  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.546359  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0460  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  26.96 
 
 
230 aa  83.6  0.000000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0497  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  26.29 
 
 
230 aa  80.1  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0706  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  31.58 
 
 
231 aa  75.5  0.0000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.524016  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0707  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  32.02 
 
 
231 aa  74.3  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.61417  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2672  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  33.48 
 
 
232 aa  73.2  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.188866 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1678  HAD superfamily hydrolase  27.95 
 
 
233 aa  72.8  0.000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1353  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  28.77 
 
 
233 aa  71.6  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1000  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  30.29 
 
 
246 aa  69.7  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0672  haloacid dehalogenase-like hydrolase  30.97 
 
 
231 aa  69.7  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04620  conserved hypothetical protein  23.61 
 
 
487 aa  67.8  0.0000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.311368 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0873  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  27.04 
 
 
227 aa  68.6  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0506  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  25.45 
 
 
233 aa  65.9  0.0000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.374858  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0012  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.57 
 
 
212 aa  65.1  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0912057  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0479  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  36.77 
 
 
218 aa  63.9  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0717  hydrolase  30.22 
 
 
234 aa  62.8  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.032007  hitchhiker  0.00793283 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0174  HAD family hydrolase  28.63 
 
 
215 aa  58.5  0.00000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4626  HAD family hydrolase  28.17 
 
 
213 aa  55.5  0.0000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.317625  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2521  HAD family hydrolase  27.18 
 
 
233 aa  55.1  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.343798 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0431  hydrolase  25.68 
 
 
284 aa  55.1  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0569  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  27.98 
 
 
213 aa  54.3  0.000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.895889  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16273  predicted protein  24.37 
 
 
250 aa  52.8  0.000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.948108 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3516  phosphoglycolate phosphatase  30.41 
 
 
229 aa  52.4  0.000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4762  HAD family hydrolase  29.49 
 
 
242 aa  51.6  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.698376  hitchhiker  0.00269567 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0450  phosphoglycolate phosphatase  27 
 
 
272 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.416285 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0734  HAD family hydrolase  23.75 
 
 
241 aa  48.9  0.00006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.879574  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0416  phosphoglycolate phosphatase  27 
 
 
272 aa  48.9  0.00007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0147  ExsB family protein  46.55 
 
 
486 aa  48.5  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00645126 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2310  HAD family hydrolase  29.52 
 
 
221 aa  48.1  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.523408  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0447  phosphoglycolate phosphatase  26.58 
 
 
272 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.558752 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1212  hypothetical protein  25.52 
 
 
219 aa  48.5  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0173059  normal  0.0170431 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34060  predicted phosphatase  29.46 
 
 
228 aa  47.4  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07930  phosphoglycolate phosphatase  28.1 
 
 
272 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00282972 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0914  hypothetical protein  23.5 
 
 
216 aa  47.4  0.0002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0817  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  34.13 
 
 
206 aa  46.6  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1483  phosphoglycolate phosphatase  26.18 
 
 
231 aa  47  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.539513 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2411  hydrolase  22.18 
 
 
238 aa  47  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.683271 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3959  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.24 
 
 
229 aa  46.6  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0752  phosphoglycolate phosphatase  27.39 
 
 
272 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3933  hydrolase  33.33 
 
 
472 aa  46.6  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.158663  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1177  phosphoglycolate phosphatase  37.36 
 
 
209 aa  45.4  0.0008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1514  phosphoglycolate phosphatase  27.07 
 
 
243 aa  45.4  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00414525  decreased coverage  0.0000736152 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4428  haloacid dehalogenase-like hydrolase  42.62 
 
 
213 aa  45.4  0.0008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.283335 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0927  HAD family hydrolase  25.45 
 
 
210 aa  45.1  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0567  phosphoglycolate phosphatase  25.23 
 
 
266 aa  45.4  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2768  HAD family hydrolase  26.87 
 
 
237 aa  45.1  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.654297  normal  0.45248 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2336  HAD family hydrolase  41.38 
 
 
231 aa  44.7  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.509915  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2262  hydrolase  24.29 
 
 
223 aa  44.7  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1245  phosphoglycolate phosphatase  37.36 
 
 
209 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4610  phosphoglycolate phosphatase  26.07 
 
 
272 aa  43.9  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5119  phosphoglycolate phosphatase  24.31 
 
 
272 aa  43.9  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10830  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  28.02 
 
 
296 aa  44.3  0.002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2370  phosphoglycolate phosphatase  25.55 
 
 
227 aa  43.9  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1058  phosphoglycolate phosphatase  26.82 
 
 
227 aa  43.9  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.234796  normal  0.363243 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4417  HAD family hydrolase  26.4 
 
 
232 aa  43.5  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.155896  normal  0.156136 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1117  phosphoglycolate phosphatase  37.36 
 
 
209 aa  43.5  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.31485  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2251  phosphoglycolate phosphatase  25.68 
 
 
229 aa  43.9  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1462  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  43.75 
 
 
330 aa  43.9  0.003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32916  predicted protein  28.57 
 
 
252 aa  43.1  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4786  phosphoglycolate phosphatase  24.12 
 
 
272 aa  42.7  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.602175 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4032  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.18 
 
 
222 aa  42.7  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2832  HAD superfamily hydrolase  24.39 
 
 
211 aa  42.4  0.007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1937  HAD family hydrolase  28.24 
 
 
234 aa  42.4  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.67763  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2083  phosphoglycolate phosphatase  31.78 
 
 
226 aa  42  0.009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.609164  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>