46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2482 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2482  phosphatase  100 
 
 		 245 aa  496  1e-139  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3726  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  60.5 
 
 		 255 aa  270  1e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.151121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1439  putative phosphoglycolate phosphatase  53.22 
 
 		 238 aa  228  5e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.608138  normal  0.0945263 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0787  haloacid dehalogenase domain-containing protein hydrolase  51.71 
 
 		 246 aa  227  1e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4015  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  52.97 
 
 		 249 aa  227  1e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2888  haloacid dehalogenase-like hydrolase  41.33 
 
 		 239 aa  159  4e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.061028  normal  0.661007 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8751  hypothetical protein  37.04 
 
 		 229 aa  143  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0948  haloacid dehalogenase-like hydrolase  37.66 
 
 		 233 aa  137  1e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000642365  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3192  hydrolase  36.4 
 
 		 272 aa  137  2e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.063397  hitchhiker  0.00469081 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8965  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  38.57 
 
 		 224 aa  132  6e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0545563  normal  0.651642 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1510  phosphoglycolate phosphatase  40.85 
 
 		 249 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117992  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7316  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  38.81 
 
 		 229 aa  128  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000529142  hitchhiker  0.000000108756 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5846  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  38.29 
 
 		 229 aa  126  3e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0126424  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5572  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  37.79 
 
 		 238 aa  125  8.000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00524465  normal  0.993212 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30410  predicted phosphatase  36.48 
 
 		 237 aa  124  1e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.990761  normal  0.161888 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3764  hydrolase  30.17 
 
 		 232 aa  75.5  0.0000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0254156  unclonable  0.0000121762 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2687  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  28.14 
 
 		 228 aa  74.7  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3983  hydrolase  28.82 
 
 		 230 aa  71.2  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.583874  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1353  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  28 
 
 		 233 aa  66.2  0.0000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0707  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  27.16 
 
 		 231 aa  64.3  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.61417  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1120  hydrolase  27.54 
 
 		 231 aa  63.5  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.546359  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04620  conserved hypothetical protein  27.15 
 
 		 487 aa  63.2  0.000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.311368 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0706  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  26.72 
 
 		 231 aa  63.2  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.524016  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0873  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  25.1 
 
 		 227 aa  62.8  0.000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0497  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  23.93 
 
 		 230 aa  61.2  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2672  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  27.35 
 
 		 232 aa  60.8  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.188866 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4195  hydrolase  27.31 
 
 		 234 aa  60.1  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.953926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0717  hydrolase  28.82 
 
 		 234 aa  59.7  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.032007  hitchhiker  0.00793283 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0418  HAD superfamily hydrolase  24.26 
 
 		 230 aa  59.7  0.00000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1987  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  21.43 
 
 		 230 aa  58.9  0.00000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0672  haloacid dehalogenase-like hydrolase  26.55 
 
 		 231 aa  58.2  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0817  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  35.21 
 
 		 206 aa  51.2  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0503  hydrolase  20.51 
 
 		 230 aa  51.2  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0506  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  22.64 
 
 		 233 aa  50.1  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.374858  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7122  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.5 
 
 		 219 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0460  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  21.03 
 
 		 230 aa  48.1  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0479  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  32.28 
 
 		 218 aa  48.5  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6369  HAD family hydrolase  26.73 
 
 		 219 aa  47  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.23133  normal  0.167912 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2083  phosphoglycolate phosphatase  27.92 
 
 		 226 aa  46.2  0.0004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.609164  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3933  hydrolase  30.77 
 
 		 472 aa  46.2  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.158663  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1678  HAD superfamily hydrolase  20.61 
 
 		 233 aa  45.4  0.0007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3959  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.64 
 
 		 229 aa  44.7  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2582  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 1  26.47 
 
 		 224 aa  43.1  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0909618 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0292  HAD family hydrolase  24.88 
 
 		 222 aa  42  0.008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.402537  normal  0.982934 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0174  HAD family hydrolase  24.2 
 
 		 215 aa  42  0.009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4417  HAD family hydrolase  27.43 
 
 		 232 aa  42  0.01  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.155896  normal  0.156136 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>