121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0418 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_0418  HAD superfamily hydrolase  100 
 
 
230 aa  468  1.0000000000000001e-131  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0460  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  63.32 
 
 
230 aa  298  3e-80  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0506  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  64.91 
 
 
233 aa  296  1e-79  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.374858  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0497  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  58.15 
 
 
230 aa  278  6e-74  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1678  HAD superfamily hydrolase  55.7 
 
 
233 aa  267  8.999999999999999e-71  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0503  hydrolase  54.78 
 
 
230 aa  255  5e-67  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1987  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  55.9 
 
 
230 aa  253  1.0000000000000001e-66  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1353  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  38.01 
 
 
233 aa  153  2e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4195  hydrolase  36.61 
 
 
234 aa  130  2.0000000000000002e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.953926  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3764  hydrolase  36.32 
 
 
232 aa  119  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0254156  unclonable  0.0000121762 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2687  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  34.2 
 
 
228 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1000  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  38.25 
 
 
246 aa  108  8.000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0873  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  33.48 
 
 
227 aa  107  1e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2672  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  33.33 
 
 
232 aa  103  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.188866 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1120  hydrolase  36.97 
 
 
231 aa  98.6  8e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.546359  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0717  hydrolase  36.84 
 
 
234 aa  94.4  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.032007  hitchhiker  0.00793283 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8751  hypothetical protein  32.88 
 
 
229 aa  92.8  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3983  hydrolase  30.49 
 
 
230 aa  88.2  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.583874  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1439  putative phosphoglycolate phosphatase  28.51 
 
 
238 aa  87.8  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.608138  normal  0.0945263 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0787  haloacid dehalogenase domain-containing protein hydrolase  28.19 
 
 
246 aa  87  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0431  hydrolase  29.29 
 
 
284 aa  84.7  9e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0706  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  32.44 
 
 
231 aa  80.1  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.524016  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16273  predicted protein  28.81 
 
 
250 aa  80.1  0.00000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.948108 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0707  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  32.44 
 
 
231 aa  79.7  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.61417  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0672  haloacid dehalogenase-like hydrolase  32.58 
 
 
231 aa  78.2  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7316  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  26.91 
 
 
229 aa  75.1  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000529142  hitchhiker  0.000000108756 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5846  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  29 
 
 
229 aa  74.3  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0126424  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3192  hydrolase  29.91 
 
 
272 aa  72.8  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.063397  hitchhiker  0.00469081 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0948  haloacid dehalogenase-like hydrolase  33.19 
 
 
233 aa  72.8  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000642365  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2888  haloacid dehalogenase-like hydrolase  26.99 
 
 
239 aa  72.4  0.000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.061028  normal  0.661007 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2521  HAD family hydrolase  32.68 
 
 
233 aa  72  0.000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.343798 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1510  phosphoglycolate phosphatase  29.39 
 
 
249 aa  68.9  0.00000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117992  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4015  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  26.53 
 
 
249 aa  66.6  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0625  HAD family hydrolase  30.41 
 
 
221 aa  66.2  0.0000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1002  HAD superfamily hydrolase  30.63 
 
 
221 aa  65.1  0.0000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0968  HAD superfamily hydrolase  30.63 
 
 
221 aa  65.1  0.0000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04620  conserved hypothetical protein  27.2 
 
 
487 aa  63.2  0.000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.311368 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0218  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.34 
 
 
206 aa  62.4  0.000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30410  predicted phosphatase  29.95 
 
 
237 aa  62  0.000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.990761  normal  0.161888 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2768  HAD family hydrolase  25.94 
 
 
237 aa  62  0.000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.654297  normal  0.45248 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2262  hydrolase  27.83 
 
 
223 aa  60.5  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5572  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  29.33 
 
 
238 aa  59.3  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00524465  normal  0.993212 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2482  phosphatase  25.12 
 
 
245 aa  58.2  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1018  HAD family hydrolase  29.19 
 
 
221 aa  57.4  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.76802 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8965  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  27.01 
 
 
224 aa  57.4  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0545563  normal  0.651642 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0280  HAD family hydrolase  28.11 
 
 
233 aa  56.2  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0590  HAD family hydrolase  25.99 
 
 
219 aa  56.2  0.0000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0419315 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0323  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.7 
 
 
233 aa  55.5  0.0000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0341719 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0734  HAD family hydrolase  26.83 
 
 
241 aa  55.1  0.0000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.879574  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4762  HAD family hydrolase  26.97 
 
 
242 aa  55.1  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.698376  hitchhiker  0.00269567 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2085  HAD family hydrolase  31.12 
 
 
223 aa  54.3  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1313  HAD family hydrolase  26.43 
 
 
232 aa  53.5  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.95229 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4038  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  22.71 
 
 
230 aa  52.8  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0316  phosphoglycolate phosphatase  27.66 
 
 
226 aa  52.4  0.000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.547041 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4075  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  22.22 
 
 
230 aa  52  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.280264  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0356  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.17 
 
 
233 aa  52  0.000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2152  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  23.5 
 
 
227 aa  51.2  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00286727  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2240  HAD family hydrolase  25.33 
 
 
214 aa  51.6  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.279618  normal  0.937061 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0791  HAD family hydrolase  28.82 
 
 
220 aa  50.8  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.226537  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07930  phosphoglycolate phosphatase  24.89 
 
 
272 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00282972 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0072  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  24.55 
 
 
230 aa  50.1  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0752  phosphoglycolate phosphatase  24.89 
 
 
272 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6369  HAD family hydrolase  29.32 
 
 
219 aa  49.3  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.23133  normal  0.167912 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2818  HAD-like hydrolase  25.78 
 
 
240 aa  48.9  0.00007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.564979 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7122  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.68 
 
 
219 aa  48.9  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1380  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  23.81 
 
 
223 aa  48.5  0.00008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2641  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.37 
 
 
222 aa  48.5  0.00009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3288  HAD family hydrolase  25.37 
 
 
222 aa  48.5  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0854  HAD family hydrolase  27.73 
 
 
221 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.249022  decreased coverage  0.000200034 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1175  HAD family hydrolase  25.69 
 
 
222 aa  47  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.341694  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5246  pyrophosphatase PpaX  24.36 
 
 
216 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14830  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  21.12 
 
 
219 aa  47.4  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.187107 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0658  haloacid dehalogenase-like hydrolase  23.89 
 
 
222 aa  46.6  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.40238 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2449  HAD family hydrolase  24.56 
 
 
217 aa  47  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0190416  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1883  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.51 
 
 
217 aa  46.6  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00501827  normal  0.0218555 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0416  phosphoglycolate phosphatase  23.74 
 
 
272 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2438  HAD family hydrolase  25.78 
 
 
219 aa  46.2  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.625372  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1752  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.86 
 
 
216 aa  46.2  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0868  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  23.91 
 
 
227 aa  46.6  0.0004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000353752  normal  0.072442 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2085  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.92 
 
 
217 aa  46.2  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0330594  normal  0.304125 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2007  HAD family hydrolase  26.03 
 
 
222 aa  45.8  0.0006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2336  HAD family hydrolase  30.93 
 
 
231 aa  45.8  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.509915  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0567  phosphoglycolate phosphatase  25.12 
 
 
266 aa  45.4  0.0008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0174  HAD family hydrolase  24.88 
 
 
215 aa  45.4  0.0008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1192  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.89 
 
 
232 aa  44.3  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.998223  normal  0.137923 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3671  haloacid dehalogenase-like hydrolase  25.13 
 
 
231 aa  44.7  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4055  phosphoglycolate phosphatase  24.02 
 
 
234 aa  45.1  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0278697  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1458  phosphoglycolate phosphatase  25.22 
 
 
231 aa  44.7  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.677189  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4786  HAD family hydrolase  26.07 
 
 
225 aa  44.7  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.480444 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1212  hypothetical protein  26.19 
 
 
219 aa  44.7  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0173059  normal  0.0170431 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2411  hydrolase  26.7 
 
 
238 aa  45.1  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.683271 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4839  pyrophosphatase PpaX  23.93 
 
 
216 aa  44.3  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4854  pyrophosphatase PpaX  23.93 
 
 
216 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2228  HAD family hydrolase  24 
 
 
212 aa  43.9  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.375493  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3658  HAD family hydrolase  24.55 
 
 
219 aa  44.3  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0450  phosphoglycolate phosphatase  23.29 
 
 
272 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.416285 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2797  hydrolase  22.32 
 
 
235 aa  44.3  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.392797  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0447  phosphoglycolate phosphatase  23.74 
 
 
272 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.558752 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0160  HAD family hydrolase  25.54 
 
 
224 aa  43.9  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.300128  normal  0.21286 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1089  phosphoglycolate phosphatase  25.24 
 
 
227 aa  43.5  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.396739  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>