55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2411 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_2411  hydrolase  100 
 
 		 238 aa  485  1e-136  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.683271 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1515  hydrolase  35.09 
 
 		 242 aa  129  3e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.127689 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3671  haloacid dehalogenase-like hydrolase  29.44 
 
 		 231 aa  116  3e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2152  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  28.22 
 
 		 227 aa  90.1  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00286727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3439  HAD family hydrolase  30.41 
 
 		 233 aa  52.8  0.000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2149  HAD family hydrolase  29.84 
 
 		 224 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.376936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2776  HAD family hydrolase  29.13 
 
 		 240 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.223588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1937  HAD family hydrolase  29.6 
 
 		 234 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.67763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2790  HAD family hydrolase  29.13 
 
 		 240 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2746  HAD family hydrolase  29.13 
 
 		 240 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.906764  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5846  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  28.38 
 
 		 229 aa  50.1  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0126424  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2426  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.32 
 
 		 224 aa  50.4  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0132517 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1510  phosphoglycolate phosphatase  23.74 
 
 		 249 aa  49.3  0.00005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117992  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4417  HAD family hydrolase  27.98 
 
 		 232 aa  49.3  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.155896  normal  0.156136 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5294  HAD family hydrolase  28.86 
 
 		 224 aa  47.4  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.08015 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0787  haloacid dehalogenase domain-containing protein hydrolase  22.18 
 
 		 246 aa  47  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0513  HAD family hydrolase  30.69 
 
 		 225 aa  47  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4195  hydrolase  29.51 
 
 		 234 aa  46.2  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.953926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2109  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.26 
 
 		 224 aa  46.2  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.546495 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4249  HAD family hydrolase  28 
 
 		 224 aa  46.2  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2672  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  30.16 
 
 		 232 aa  45.8  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.188866 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1439  putative phosphoglycolate phosphatase  24.75 
 
 		 238 aa  45.8  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.608138  normal  0.0945263 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0416  phosphoglycolate phosphatase  27.4 
 
 		 272 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3310  HAD family hydrolase  31.82 
 
 		 232 aa  44.7  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0450  phosphoglycolate phosphatase  27.4 
 
 		 272 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.416285 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4275  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase family protein  28.22 
 
 		 224 aa  44.7  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0625662 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0937  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.58 
 
 		 219 aa  44.7  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.171636 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1080  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25.54 
 
 		 218 aa  44.7  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00830882  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5583  HAD family hydrolase  27.23 
 
 		 224 aa  45.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0431  3-amino-5-hydroxybenoic acid synthesis related  24.06 
 
 		 263 aa  44.7  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0418  HAD superfamily hydrolase  26.7 
 
 		 230 aa  45.1  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2193  phosphoglycolate phosphatase  25.73 
 
 		 225 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.83571  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0925  phosphoglycolate phosphatase  27.8 
 
 		 224 aa  43.9  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0181  HAD superfamily hydrolase  24.44 
 
 		 214 aa  44.3  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6309  HAD family hydrolase  27.72 
 
 		 224 aa  43.9  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.403057 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1098  HAD superfamily hydrolase  29 
 
 		 240 aa  44.3  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.379458  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2310  HAD family hydrolase  28.02 
 
 		 221 aa  44.3  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.523408  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3482  phosphoglycolate phosphatase  28.37 
 
 		 228 aa  44.3  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.875502  normal  0.981101 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6102  HAD family hydrolase  27.72 
 
 		 224 aa  43.5  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.524869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1317  HAD family hydrolase  27.72 
 
 		 224 aa  43.5  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.716581  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0838  phosphoglycolate phosphatase  27.36 
 
 		 228 aa  43.5  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.681144  normal  0.099255 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6512  HAD family hydrolase  27.72 
 
 		 224 aa  43.5  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0447  phosphoglycolate phosphatase  32 
 
 		 272 aa  43.1  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.558752 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1056  putative periplasmic protein  23.18 
 
 		 207 aa  42.7  0.004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0228325  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22130  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.66 
 
 		 229 aa  43.1  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27350  HAD-superfamily hydrolase  29.66 
 
 		 229 aa  43.1  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5280  HAD family hydrolase  24.76 
 
 		 228 aa  43.1  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.94241  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1387  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  26.92 
 
 		 269 aa  43.1  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0598116  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7037  HAD family hydrolase  27.72 
 
 		 224 aa  43.1  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.927677 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0027  HAD superfamily hydrolase  26.81 
 
 		 235 aa  42.4  0.006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0767  phosphoglycolate phosphatase  27.32 
 
 		 229 aa  42.4  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.54601  hitchhiker  0.00790762 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5624  HAD family hydrolase  28.86 
 
 		 228 aa  42.4  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.147818  normal  0.407625 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2206  HAD family hydrolase  23.98 
 
 		 227 aa  42  0.008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0834963  normal  0.088242 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0503  hydrolase  24.75 
 
 		 230 aa  42  0.008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4445  phosphoglycolate phosphatase  34.82 
 
 		 234 aa  42  0.008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0670358  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>