104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2672 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_2672  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  100 
 
 
232 aa  461  1e-129  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.188866 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4195  hydrolase  39.45 
 
 
234 aa  132  3.9999999999999996e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.953926  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1353  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  34.19 
 
 
233 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0497  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  32.41 
 
 
230 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0460  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  33.79 
 
 
230 aa  108  8.000000000000001e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0418  HAD superfamily hydrolase  33.33 
 
 
230 aa  103  2e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0873  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  36.62 
 
 
227 aa  103  3e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1987  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  32.56 
 
 
230 aa  100  2e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0506  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  31.78 
 
 
233 aa  98.6  8e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.374858  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1678  HAD superfamily hydrolase  32.26 
 
 
233 aa  94.4  1e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0503  hydrolase  32.11 
 
 
230 aa  90.1  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0431  hydrolase  30.81 
 
 
284 aa  89.7  3e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5846  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  38.07 
 
 
229 aa  88.6  7e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0126424  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3983  hydrolase  32.29 
 
 
230 aa  87  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.583874  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1000  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  39.63 
 
 
246 aa  87  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7316  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  35.02 
 
 
229 aa  85.1  7e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000529142  hitchhiker  0.000000108756 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0706  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  36.24 
 
 
231 aa  84.3  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.524016  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0707  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  36.24 
 
 
231 aa  84  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.61417  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0672  haloacid dehalogenase-like hydrolase  35.84 
 
 
231 aa  81.6  0.000000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0717  hydrolase  38.18 
 
 
234 aa  80.9  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.032007  hitchhiker  0.00793283 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2687  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  33.33 
 
 
228 aa  80.9  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8751  hypothetical protein  34.82 
 
 
229 aa  79  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8965  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  32.58 
 
 
224 aa  78.2  0.00000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0545563  normal  0.651642 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3192  hydrolase  32.88 
 
 
272 aa  78.2  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.063397  hitchhiker  0.00469081 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3764  hydrolase  37.5 
 
 
232 aa  75.9  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0254156  unclonable  0.0000121762 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0787  haloacid dehalogenase domain-containing protein hydrolase  33.48 
 
 
246 aa  73.2  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30410  predicted phosphatase  33.62 
 
 
237 aa  72.4  0.000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.990761  normal  0.161888 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0948  haloacid dehalogenase-like hydrolase  35.22 
 
 
233 aa  72  0.000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000642365  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2888  haloacid dehalogenase-like hydrolase  37.41 
 
 
239 aa  70.9  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.061028  normal  0.661007 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2521  HAD family hydrolase  31.58 
 
 
233 aa  70.5  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.343798 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1120  hydrolase  35.87 
 
 
231 aa  68.6  0.00000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.546359  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0384  HAD family hydrolase  28.83 
 
 
222 aa  68.6  0.00000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000045535  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5572  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  29.73 
 
 
238 aa  67.4  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00524465  normal  0.993212 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04620  conserved hypothetical protein  26.32 
 
 
487 aa  66.2  0.0000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.311368 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16273  predicted protein  29.88 
 
 
250 aa  65.9  0.0000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.948108 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1515  hydrolase  27.78 
 
 
242 aa  61.2  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.127689 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2482  phosphatase  27.03 
 
 
245 aa  60.8  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1510  phosphoglycolate phosphatase  33.95 
 
 
249 aa  60.1  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117992  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4015  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  31.17 
 
 
249 aa  59.3  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1697  HAD family hydrolase  26.09 
 
 
231 aa  55.5  0.0000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0993915 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0431  3-amino-5-hydroxybenoic acid synthesis related  30.73 
 
 
263 aa  53.5  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3671  haloacid dehalogenase-like hydrolase  27.18 
 
 
231 aa  53.5  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0072  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.72 
 
 
230 aa  52.4  0.000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2613  phosphoglycolate phosphatase  29.09 
 
 
273 aa  50.4  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0917169  normal  0.0942866 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3798  phosphoglycolate phosphatase  26.72 
 
 
253 aa  50.8  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0419361 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3754  phosphoglycolate phosphatase  29.85 
 
 
252 aa  50.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3850  phosphoglycolate phosphatase  29.85 
 
 
252 aa  50.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3726  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  28.64 
 
 
255 aa  50.1  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.151121  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00083  phosphoglycolate phosphatase  30.56 
 
 
228 aa  50.1  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1661  AHBA synthesis associated protein  31.08 
 
 
214 aa  50.1  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.49792 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3679  phosphoglycolate phosphatase  29.85 
 
 
252 aa  50.1  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.966867  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3681  phosphoglycolate phosphatase  29.85 
 
 
252 aa  50.4  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.123155  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0218  HAD superfamily hydrolase  22.48 
 
 
215 aa  49.7  0.00004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3788  phosphoglycolate phosphatase  29.85 
 
 
252 aa  49.7  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0820  HAD family hydrolase  28.87 
 
 
219 aa  49.3  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.362734  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4032  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.46 
 
 
222 aa  49.3  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2152  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  34.09 
 
 
225 aa  48.9  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1439  putative phosphoglycolate phosphatase  30.88 
 
 
238 aa  48.1  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.608138  normal  0.0945263 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3193  phosphoglycolate phosphatase  26.7 
 
 
250 aa  47.4  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8278  virP  27.27 
 
 
207 aa  46.6  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2847  phosphoglycolate phosphatase  31.25 
 
 
227 aa  46.2  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.212796  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3246  phosphoglycolate phosphatase  31.25 
 
 
227 aa  46.2  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.181824  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2324  phosphoglycolate phosphatase  30 
 
 
223 aa  45.8  0.0006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.289687  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2251  phosphoglycolate phosphatase  32.43 
 
 
229 aa  45.8  0.0006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5583  HAD family hydrolase  26.58 
 
 
224 aa  45.8  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3203  hydrolase  31.36 
 
 
220 aa  45.8  0.0006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2411  hydrolase  30.16 
 
 
238 aa  45.8  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.683271 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1064  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase  28.33 
 
 
219 aa  45.1  0.0009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.259823  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6102  HAD family hydrolase  26.38 
 
 
224 aa  44.7  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.524869  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3168  pyrophosphatase PpaX  24.42 
 
 
222 aa  44.3  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1780  HAD family hydrolase  33.33 
 
 
225 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.587654  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0176  phosphoglycolate phosphatase  26.28 
 
 
224 aa  44.3  0.002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.790253  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4762  HAD family hydrolase  27.11 
 
 
242 aa  44.3  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.698376  hitchhiker  0.00269567 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0366  HAD family hydrolase  24.45 
 
 
212 aa  44.3  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000608265 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2887  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  27.62 
 
 
219 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3209  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  27.62 
 
 
219 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002270  phosphoglycolate phosphatase  27.78 
 
 
228 aa  44.3  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0218  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.69 
 
 
206 aa  43.9  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0567  phosphoglycolate phosphatase  25.91 
 
 
266 aa  43.5  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7037  HAD family hydrolase  25.96 
 
 
224 aa  43.5  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.927677 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3854  phosphoglycolate phosphatase  26.87 
 
 
252 aa  43.1  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00525883  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2060  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.06 
 
 
225 aa  43.5  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.750609  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2100  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.29 
 
 
215 aa  43.5  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1317  HAD family hydrolase  26.58 
 
 
224 aa  43.1  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.716581  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6512  HAD family hydrolase  26.58 
 
 
224 aa  43.1  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2768  HAD family hydrolase  28.96 
 
 
237 aa  42.7  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.654297  normal  0.45248 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14840  HAD-superfamily hydrolase  31.3 
 
 
220 aa  42.7  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.770171  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0179  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.55 
 
 
218 aa  42.7  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2110  phosphoglycolate phosphatase  24.35 
 
 
225 aa  42.7  0.005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.782136  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0268  phosphoglycolate phosphatase  29.69 
 
 
228 aa  42  0.007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0557534  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2112  HAD family hydrolase  27.83 
 
 
239 aa  42  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3581  phosphoglycolate phosphatase  26.12 
 
 
252 aa  42  0.008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.284383  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4258  phosphoglycolate phosphatase  24.4 
 
 
235 aa  42  0.008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0125483 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0328  phosphoglycolate phosphatase  26.12 
 
 
252 aa  42  0.008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.372389  normal  0.201922 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3661  phosphoglycolate phosphatase  26.12 
 
 
252 aa  42  0.008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.29844  normal  0.025681 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2920  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.49 
 
 
219 aa  42  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00300829  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4689  phosphoglycolate phosphatase  26.12 
 
 
252 aa  42  0.008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.663349  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03237  phosphoglycolate phosphatase  24.15 
 
 
252 aa  42  0.009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0328  phosphoglycolate phosphatase  24.15 
 
 
252 aa  42  0.009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3762  phosphoglycolate phosphatase  26.12 
 
 
252 aa  42  0.009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.40481  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>