148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1353 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1353  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  100 
 
 		 233 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0460  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  37.1 
 
 		 230 aa  155  5.0000000000000005e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0418  HAD superfamily hydrolase  38.01 
 
 		 230 aa  153  2e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1987  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  38.84 
 
 		 230 aa  153  2e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0497  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  38.81 
 
 		 230 aa  153  2e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1678  HAD superfamily hydrolase  37.56 
 
 		 233 aa  152  2.9999999999999998e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0506  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  35.37 
 
 		 233 aa  143  2e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.374858  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0503  hydrolase  36.28 
 
 		 230 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4195  hydrolase  38.94 
 
 		 234 aa  132  6.999999999999999e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.953926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3764  hydrolase  38.84 
 
 		 232 aa  117  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0254156  unclonable  0.0000121762 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2672  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  34.19 
 
 		 232 aa  117  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.188866 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0873  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  34.87 
 
 		 227 aa  115  6.9999999999999995e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2687  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  34.67 
 
 		 228 aa  112  6e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3983  hydrolase  36.8 
 
 		 230 aa  109  3e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.583874  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8751  hypothetical protein  36.16 
 
 		 229 aa  108  8.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3192  hydrolase  35.53 
 
 		 272 aa  102  6e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.063397  hitchhiker  0.00469081 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04620  conserved hypothetical protein  33.94 
 
 		 487 aa  100  1e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.311368 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16273  predicted protein  33.47 
 
 		 250 aa  100  2e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.948108 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0717  hydrolase  37.99 
 
 		 234 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.032007  hitchhiker  0.00793283 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1000  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  40 
 
 		 246 aa  99  5e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7316  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  33.49 
 
 		 229 aa  94.7  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000529142  hitchhiker  0.000000108756 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1120  hydrolase  38.84 
 
 		 231 aa  94.7  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.546359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30410  predicted phosphatase  38.07 
 
 		 237 aa  93.2  3e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.990761  normal  0.161888 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0948  haloacid dehalogenase-like hydrolase  33.76 
 
 		 233 aa  91.7  9e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000642365  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2888  haloacid dehalogenase-like hydrolase  34.38 
 
 		 239 aa  90.5  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.061028  normal  0.661007 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1510  phosphoglycolate phosphatase  35.62 
 
 		 249 aa  90.1  3e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117992  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8965  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  34.86 
 
 		 224 aa  88.6  8e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0545563  normal  0.651642 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5572  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  33.18 
 
 		 238 aa  82.4  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00524465  normal  0.993212 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0431  hydrolase  28.3 
 
 		 284 aa  82.4  0.000000000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0672  haloacid dehalogenase-like hydrolase  36.04 
 
 		 231 aa  82.4  0.000000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5846  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  34.91 
 
 		 229 aa  79.7  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0126424  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0707  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  33.63 
 
 		 231 aa  77  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.61417  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2521  HAD family hydrolase  31.73 
 
 		 233 aa  77  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.343798 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1439  putative phosphoglycolate phosphatase  29.6 
 
 		 238 aa  77  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.608138  normal  0.0945263 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0706  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  33.63 
 
 		 231 aa  77.4  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.524016  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0787  haloacid dehalogenase domain-containing protein hydrolase  28.77 
 
 		 246 aa  71.6  0.000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2482  phosphatase  27.93 
 
 		 245 aa  65.9  0.0000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0854  HAD family hydrolase  31.37 
 
 		 221 aa  63.2  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.249022  decreased coverage  0.000200034 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4038  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.34 
 
 		 230 aa  62.8  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4015  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  27.97 
 
 		 249 aa  61.2  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4075  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.84 
 
 		 230 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.280264  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2007  HAD family hydrolase  29.28 
 
 		 222 aa  60.5  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2449  HAD family hydrolase  26.55 
 
 		 217 aa  60.1  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0190416  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2152  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.05 
 
 		 225 aa  58.2  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0280  HAD family hydrolase  27.64 
 
 		 233 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1451  HAD superfamily hydrolase  28.22 
 
 		 241 aa  53.9  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0356  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.11 
 
 		 233 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0323  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.64 
 
 		 233 aa  53.5  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0341719 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1758  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.32 
 
 		 234 aa  53.5  0.000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0639278  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4762  HAD family hydrolase  27.66 
 
 		 242 aa  53.5  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.698376  hitchhiker  0.00269567 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0178  HAD family hydrolase  26.29 
 
 		 230 aa  52.8  0.000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000756614  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1780  HAD family hydrolase  34.45 
 
 		 225 aa  52.4  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.587654  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2060  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.45 
 
 		 225 aa  52.4  0.000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.750609  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1002  HAD superfamily hydrolase  26.7 
 
 		 221 aa  52.4  0.000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0968  HAD superfamily hydrolase  26.7 
 
 		 221 aa  52.4  0.000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2908  phosphoglycolate phosphatase  27.36 
 
 		 242 aa  52  0.000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3168  pyrophosphatase PpaX  26.73 
 
 		 222 aa  51.2  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1697  HAD family hydrolase  25 
 
 		 231 aa  51.2  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0993915 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2262  hydrolase  26.85 
 
 		 223 aa  51.2  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4525  phosphatase  23.53 
 
 		 208 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14830  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  24.24 
 
 		 219 aa  50.4  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.187107 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2757  phosphoglycolate phosphatase  28.24 
 
 		 243 aa  50.1  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.411374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3656  phosphoglycolate phosphatase  27.31 
 
 		 234 aa  50.1  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.755729 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0927  HAD family hydrolase  24.54 
 
 		 210 aa  50.4  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0156  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.91 
 
 		 216 aa  50.4  0.00003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0743  phosphoglycolate phosphatase  27.18 
 
 		 225 aa  49.3  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2100  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.23 
 
 		 215 aa  48.9  0.00006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0525  HAD family hydrolase  26.48 
 
 		 209 aa  48.9  0.00007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00124351  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2255  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.61 
 
 		 209 aa  48.9  0.00007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00490459 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0481  HAD family hydrolase  27.95 
 
 		 231 aa  48.9  0.00008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.158536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1313  HAD family hydrolase  26.64 
 
 		 232 aa  48.9  0.00008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.95229 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0595  HAD family hydrolase  25.23 
 
 		 215 aa  48.5  0.00009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0609  HAD family hydrolase  25.23 
 
 		 215 aa  48.5  0.00009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3084  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.3 
 
 		 218 aa  47.8  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2112  HAD family hydrolase  28.91 
 
 		 239 aa  47.8  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6369  HAD family hydrolase  26.32 
 
 		 219 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.23133  normal  0.167912 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3022  phosphoglycolate phosphatase  26.22 
 
 		 241 aa  47  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.116956  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0012  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.43 
 
 		 212 aa  47.8  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0912057  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2034  HAD family hydrolase  26.05 
 
 		 216 aa  47  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.645104  normal  0.0672621 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3122  phosphoglycolate phosphatase  28.04 
 
 		 248 aa  47.4  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.571446  normal  0.270174 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0694  HAD family hydrolase  31.75 
 
 		 214 aa  47  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2984  pyrophosphatase PpaX  25.66 
 
 		 215 aa  46.6  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.417941  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2311  HAD superfamily (subfamily IA) hydrolase, TIGR01548  27.36 
 
 		 246 aa  46.2  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1284  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.86 
 
 		 227 aa  46.2  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.153215  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1778  HAD family hydrolase  29.17 
 
 		 222 aa  46.6  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0979226  decreased coverage  0.0000822361 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14840  HAD-superfamily hydrolase  29.28 
 
 		 220 aa  46.6  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.770171  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3528  HAD family hydrolase  25.27 
 
 		 222 aa  46.2  0.0004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.894258  hitchhiker  0.00350401 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3726  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  24.79 
 
 		 255 aa  46.2  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.151121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1985  phosphoglycolate phosphatase  26.18 
 
 		 223 aa  45.8  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.554471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5677  pyrophosphatase PpaX  22.71 
 
 		 216 aa  45.8  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2602  HAD family hydrolase  29.32 
 
 		 227 aa  45.8  0.0006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.852152 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5246  pyrophosphatase PpaX  22.27 
 
 		 216 aa  45.4  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5280  pyrophosphatase PpaX  23.14 
 
 		 216 aa  45.4  0.0008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3420  HAD family hydrolase  26.42 
 
 		 242 aa  45.1  0.0009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.964625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1944  pyrophosphatase PpaX  22.43 
 
 		 214 aa  45.1  0.0009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3209  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  23.5 
 
 		 219 aa  45.1  0.0009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2742  HAD family hydrolase  28.51 
 
 		 218 aa  45.1  0.0009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2887  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  23.5 
 
 		 219 aa  45.1  0.0009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0431  3-amino-5-hydroxybenoic acid synthesis related  26.54 
 
 		 263 aa  45.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0625  HAD family hydrolase  28.79 
 
 		 221 aa  45.1  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>