112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1987 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1987  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  100 
 
 		 230 aa  468  1.0000000000000001e-131  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0503  hydrolase  63.76 
 
 		 230 aa  290  1e-77  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0460  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  60.7 
 
 		 230 aa  281  4.0000000000000003e-75  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0506  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  58.77 
 
 		 233 aa  279  2e-74  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.374858  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1678  HAD superfamily hydrolase  57.89 
 
 		 233 aa  275  4e-73  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0418  HAD superfamily hydrolase  55.9 
 
 		 230 aa  253  1.0000000000000001e-66  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0497  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  53.71 
 
 		 230 aa  251  6e-66  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1353  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  38.84 
 
 		 233 aa  153  2e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2687  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  36.48 
 
 		 228 aa  133  1.9999999999999998e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4195  hydrolase  34.51 
 
 		 234 aa  123  3e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.953926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3764  hydrolase  34.91 
 
 		 232 aa  116  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0254156  unclonable  0.0000121762 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3983  hydrolase  36.94 
 
 		 230 aa  103  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.583874  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2672  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  32.56 
 
 		 232 aa  100  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.188866 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1120  hydrolase  35.34 
 
 		 231 aa  95.1  9e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.546359  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0873  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  30.45 
 
 		 227 aa  94  2e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0431  hydrolase  30.99 
 
 		 284 aa  92  7e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1439  putative phosphoglycolate phosphatase  27.83 
 
 		 238 aa  91.7  9e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.608138  normal  0.0945263 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1000  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  34.42 
 
 		 246 aa  90.5  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8751  hypothetical protein  31.08 
 
 		 229 aa  90.5  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0717  hydrolase  33.94 
 
 		 234 aa  89.7  3e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.032007  hitchhiker  0.00793283 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0787  haloacid dehalogenase domain-containing protein hydrolase  27.39 
 
 		 246 aa  87.8  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0706  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  31.08 
 
 		 231 aa  84  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.524016  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0707  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  31.08 
 
 		 231 aa  84  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.61417  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0672  haloacid dehalogenase-like hydrolase  31.82 
 
 		 231 aa  82.4  0.000000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16273  predicted protein  29.75 
 
 		 250 aa  80.5  0.00000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.948108 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4015  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  27.39 
 
 		 249 aa  80.1  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7316  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  28.57 
 
 		 229 aa  77.8  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000529142  hitchhiker  0.000000108756 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30410  predicted phosphatase  32.63 
 
 		 237 aa  77.8  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.990761  normal  0.161888 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0948  haloacid dehalogenase-like hydrolase  29.66 
 
 		 233 aa  76.6  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000642365  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2888  haloacid dehalogenase-like hydrolase  26.72 
 
 		 239 aa  73.6  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.061028  normal  0.661007 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3192  hydrolase  27.62 
 
 		 272 aa  72.4  0.000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.063397  hitchhiker  0.00469081 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8965  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  27.71 
 
 		 224 aa  70.9  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0545563  normal  0.651642 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5572  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  29.52 
 
 		 238 aa  69.7  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00524465  normal  0.993212 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04620  conserved hypothetical protein  27.6 
 
 		 487 aa  68.6  0.00000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.311368 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2768  HAD family hydrolase  33.33 
 
 		 237 aa  68.6  0.00000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.654297  normal  0.45248 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1510  phosphoglycolate phosphatase  29 
 
 		 249 aa  67.8  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117992  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4762  HAD family hydrolase  25.76 
 
 		 242 aa  67  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.698376  hitchhiker  0.00269567 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0625  HAD family hydrolase  32 
 
 		 221 aa  66.6  0.0000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5846  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  27.43 
 
 		 229 aa  66.2  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0126424  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2521  HAD family hydrolase  28.29 
 
 		 233 aa  65.1  0.0000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.343798 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1018  HAD family hydrolase  28.44 
 
 		 221 aa  64.7  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.76802 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1313  HAD family hydrolase  28.29 
 
 		 232 aa  60.8  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.95229 
 
 
-
 
NC_004310  BR1002  HAD superfamily hydrolase  28.3 
 
 		 221 aa  59.3  0.00000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0968  HAD superfamily hydrolase  28.3 
 
 		 221 aa  59.3  0.00000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1883  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.19 
 
 		 217 aa  59.3  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00501827  normal  0.0218555 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2273  HAD family hydrolase  27.04 
 
 		 219 aa  58.5  0.00000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.768763  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2482  phosphatase  21.83 
 
 		 245 aa  57.4  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0734  HAD family hydrolase  27.23 
 
 		 241 aa  57.4  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.879574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2311  HAD superfamily (subfamily IA) hydrolase, TIGR01548  25.24 
 
 		 246 aa  57  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0280  HAD family hydrolase  26.9 
 
 		 233 aa  57  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3726  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  24.26 
 
 		 255 aa  55.8  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.151121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0323  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.47 
 
 		 233 aa  55.5  0.0000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0341719 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0284  HAD family hydrolase  27.73 
 
 		 234 aa  55.1  0.000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.251372 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0258  phosphoglycolate phosphatase  28.77 
 
 		 235 aa  54.3  0.000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.691366  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0431  3-amino-5-hydroxybenoic acid synthesis related  27.16 
 
 		 263 aa  54.3  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2085  HAD family hydrolase  30.65 
 
 		 223 aa  53.9  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0218  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.91 
 
 		 206 aa  53.9  0.000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2262  hydrolase  27.14 
 
 		 223 aa  54.3  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2085  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.56 
 
 		 217 aa  53.1  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0330594  normal  0.304125 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0854  HAD family hydrolase  27.27 
 
 		 221 aa  52  0.000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.249022  decreased coverage  0.000200034 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3671  haloacid dehalogenase-like hydrolase  25.13 
 
 		 231 aa  51.2  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0356  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.38 
 
 		 233 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10830  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  27.18 
 
 		 296 aa  50.8  0.00002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0391  HAD family hydrolase  32.65 
 
 		 229 aa  50.1  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1192  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.55 
 
 		 232 aa  49.7  0.00004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.998223  normal  0.137923 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14830  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  23.93 
 
 		 219 aa  49.3  0.00004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.187107 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0398  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  33.33 
 
 		 226 aa  49.3  0.00005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1661  AHBA synthesis associated protein  26.17 
 
 		 214 aa  48.9  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.49792 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6369  HAD family hydrolase  31.36 
 
 		 219 aa  48.9  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.23133  normal  0.167912 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2438  HAD family hydrolase  25.69 
 
 		 219 aa  48.1  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.625372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0384  HAD family hydrolase  25.79 
 
 		 222 aa  48.1  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000045535  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2797  hydrolase  23.42 
 
 		 235 aa  47.8  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.392797  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7122  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.51 
 
 		 219 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2152  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  25.67 
 
 		 227 aa  48.1  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00286727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2110  phosphoglycolate phosphatase  23.45 
 
 		 225 aa  48.5  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.782136  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0292  HAD family hydrolase  26.98 
 
 		 222 aa  47.4  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.402537  normal  0.982934 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0590  HAD family hydrolase  25.59 
 
 		 219 aa  47.4  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0419315 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2449  HAD family hydrolase  27.78 
 
 		 217 aa  46.6  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0190416  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0868  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  23.01 
 
 		 227 aa  47  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000353752  normal  0.072442 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0791  HAD family hydrolase  27.88 
 
 		 220 aa  46.2  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.226537  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0482  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.33 
 
 		 213 aa  46.2  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3656  phosphoglycolate phosphatase  30.83 
 
 		 234 aa  46.2  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.755729 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0481  HAD family hydrolase  28.04 
 
 		 231 aa  46.6  0.0004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.158536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2201  phosphoglycolate phosphatase  23.42 
 
 		 226 aa  45.1  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4954  pyrophosphatase PpaX  22.42 
 
 		 215 aa  44.7  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1483  HAD family hydrolase  26.09 
 
 		 224 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0762089  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2984  pyrophosphatase PpaX  24.44 
 
 		 215 aa  44.7  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.417941  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0287  HAD superfamily hydrolase  30 
 
 		 249 aa  44.3  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.727823  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0178  HAD family hydrolase  23.93 
 
 		 230 aa  43.9  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000756614  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2007  HAD family hydrolase  27.14 
 
 		 222 aa  44.3  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0302  HAD superfamily hydrolase  30 
 
 		 249 aa  44.3  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.795024  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3807  HAD family hydrolase  25.57 
 
 		 224 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.118188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0316  phosphoglycolate phosphatase  24.03 
 
 		 226 aa  43.9  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.547041 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1515  hydrolase  23.9 
 
 		 242 aa  43.9  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.127689 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5246  pyrophosphatase PpaX  23.32 
 
 		 216 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3168  pyrophosphatase PpaX  25.23 
 
 		 222 aa  44.3  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2336  HAD family hydrolase  27.97 
 
 		 231 aa  43.1  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.509915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1821  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  28.35 
 
 		 238 aa  42.7  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000701178 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4038  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.69 
 
 		 230 aa  42.7  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1463  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.63 
 
 		 228 aa  42.7  0.005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0497866  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>