160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0497 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0497  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  100 
 
 
230 aa  473  1e-132  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0460  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  67.69 
 
 
230 aa  327  7e-89  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0503  hydrolase  62.01 
 
 
230 aa  295  6e-79  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0418  HAD superfamily hydrolase  58.15 
 
 
230 aa  278  6e-74  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0506  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  58.15 
 
 
233 aa  273  1.0000000000000001e-72  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.374858  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1678  HAD superfamily hydrolase  57.27 
 
 
233 aa  269  2e-71  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1987  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  53.71 
 
 
230 aa  251  6e-66  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1353  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  38.81 
 
 
233 aa  153  2e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4195  hydrolase  38.05 
 
 
234 aa  146  3e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.953926  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3764  hydrolase  34.48 
 
 
232 aa  118  6e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0254156  unclonable  0.0000121762 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2672  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  32.41 
 
 
232 aa  110  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.188866 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2687  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  33.04 
 
 
228 aa  107  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0873  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  32.89 
 
 
227 aa  107  2e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3983  hydrolase  33.78 
 
 
230 aa  106  3e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.583874  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1120  hydrolase  35.04 
 
 
231 aa  102  7e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.546359  normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16273  predicted protein  32.08 
 
 
250 aa  91.3  1e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.948108 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1000  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  32.26 
 
 
246 aa  88.2  9e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0431  hydrolase  33.77 
 
 
284 aa  87.8  1e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8751  hypothetical protein  30.63 
 
 
229 aa  85.9  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0706  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  28.89 
 
 
231 aa  82  0.000000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.524016  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0707  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  28.89 
 
 
231 aa  82  0.000000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.61417  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0717  hydrolase  30.84 
 
 
234 aa  80.9  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.032007  hitchhiker  0.00793283 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0787  haloacid dehalogenase domain-containing protein hydrolase  26.29 
 
 
246 aa  80.1  0.00000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0672  haloacid dehalogenase-like hydrolase  28.51 
 
 
231 aa  79.3  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7316  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  28.37 
 
 
229 aa  78.2  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000529142  hitchhiker  0.000000108756 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3192  hydrolase  26.55 
 
 
272 aa  73.9  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.063397  hitchhiker  0.00469081 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0948  haloacid dehalogenase-like hydrolase  29.44 
 
 
233 aa  74.3  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000642365  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2521  HAD family hydrolase  29.27 
 
 
233 aa  72.4  0.000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.343798 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5572  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  28.32 
 
 
238 aa  70.5  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00524465  normal  0.993212 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1439  putative phosphoglycolate phosphatase  24.57 
 
 
238 aa  69.7  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.608138  normal  0.0945263 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0590  HAD family hydrolase  30.14 
 
 
219 aa  68.2  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0419315 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5846  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  30 
 
 
229 aa  66.2  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0126424  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8965  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  27.48 
 
 
224 aa  66.2  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0545563  normal  0.651642 
 
 
-
 
NC_004310  BR1002  HAD superfamily hydrolase  27.59 
 
 
221 aa  64.3  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0968  HAD superfamily hydrolase  27.59 
 
 
221 aa  64.3  0.000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04620  conserved hypothetical protein  26.52 
 
 
487 aa  62.4  0.000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.311368 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30410  predicted phosphatase  30.92 
 
 
237 aa  62  0.000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.990761  normal  0.161888 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2482  phosphatase  23.89 
 
 
245 aa  57.8  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0734  HAD family hydrolase  25.87 
 
 
241 aa  57.8  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.879574  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2768  HAD family hydrolase  29.24 
 
 
237 aa  58.2  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.654297  normal  0.45248 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2888  haloacid dehalogenase-like hydrolase  25 
 
 
239 aa  57.8  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.061028  normal  0.661007 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2255  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.44 
 
 
209 aa  57.4  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00490459 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14830  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  29.93 
 
 
219 aa  57  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.187107 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4015  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  24.37 
 
 
249 aa  56.6  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5246  pyrophosphatase PpaX  23.98 
 
 
216 aa  55.8  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2262  hydrolase  25.96 
 
 
223 aa  55.5  0.0000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0178  HAD family hydrolase  26.13 
 
 
230 aa  55.1  0.0000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000756614  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1510  phosphoglycolate phosphatase  27.5 
 
 
249 aa  54.7  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117992  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2085  HAD family hydrolase  28.43 
 
 
223 aa  54.7  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0218  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.76 
 
 
206 aa  54.3  0.000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4954  pyrophosphatase PpaX  23.77 
 
 
215 aa  53.9  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4839  pyrophosphatase PpaX  23.53 
 
 
216 aa  53.1  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4854  pyrophosphatase PpaX  23.53 
 
 
216 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2336  HAD family hydrolase  29.91 
 
 
231 aa  52.8  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.509915  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5010  pyrophosphatase PpaX  23.53 
 
 
216 aa  52.4  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0412  putative phosphatase  30.94 
 
 
230 aa  52.8  0.000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5390  pyrophosphatase PpaX  23.53 
 
 
216 aa  52.4  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2067  HAD family hydrolase  30.94 
 
 
230 aa  52.8  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0859939  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5677  pyrophosphatase PpaX  23.32 
 
 
216 aa  52.4  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0316  phosphoglycolate phosphatase  25.86 
 
 
226 aa  52.4  0.000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.547041 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0625  HAD family hydrolase  27.49 
 
 
221 aa  52  0.000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5265  pyrophosphatase PpaX  23.08 
 
 
216 aa  51.6  0.000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5322  pyrophosphatase PpaX  23.79 
 
 
216 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2887  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  27.15 
 
 
219 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0391  HAD family hydrolase  28.18 
 
 
229 aa  51.6  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4762  HAD family hydrolase  24.67 
 
 
242 aa  51.2  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.698376  hitchhiker  0.00269567 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5280  pyrophosphatase PpaX  23.58 
 
 
216 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0854  HAD family hydrolase  27.65 
 
 
221 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.249022  decreased coverage  0.000200034 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3209  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  27.15 
 
 
219 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2240  HAD family hydrolase  27.03 
 
 
214 aa  50.8  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.279618  normal  0.937061 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2201  phosphoglycolate phosphatase  24.32 
 
 
226 aa  50.1  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0343  phosphoglycolate phosphatase  22.87 
 
 
233 aa  50.1  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3679  phosphoglycolate phosphatase  26.72 
 
 
252 aa  50.1  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.966867  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2832  HAD superfamily hydrolase  23.77 
 
 
211 aa  49.7  0.00004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3671  haloacid dehalogenase-like hydrolase  24.34 
 
 
231 aa  49.3  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3878  phosphoglycolate phosphatase  22.37 
 
 
234 aa  49.3  0.00005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1323  HAD family hydrolase  26.48 
 
 
218 aa  49.3  0.00005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00010916  normal  0.934661 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0280  HAD family hydrolase  26.29 
 
 
233 aa  49.3  0.00005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0868  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  24.78 
 
 
227 aa  49.3  0.00005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000353752  normal  0.072442 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0705  HAD family hydrolase  46.94 
 
 
214 aa  48.9  0.00006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.399525  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5280  HAD family hydrolase  27.18 
 
 
228 aa  48.9  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.94241  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0072  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.81 
 
 
230 aa  49.3  0.00006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1089  phosphoglycolate phosphatase  26.39 
 
 
227 aa  48.9  0.00007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.396739  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3704  pyrophosphatase PpaX  25.11 
 
 
212 aa  48.5  0.00008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2878  phosphoglycolate phosphatase  25.44 
 
 
226 aa  47.8  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0323  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.23 
 
 
233 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0341719 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3850  phosphoglycolate phosphatase  26.72 
 
 
252 aa  48.1  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3754  phosphoglycolate phosphatase  26.72 
 
 
252 aa  48.1  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02162  phosphoglycolate phosphatase  35.29 
 
 
225 aa  47.8  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1410  phosphoglycolate phosphatase  34.48 
 
 
225 aa  47.8  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3681  phosphoglycolate phosphatase  26.72 
 
 
252 aa  47.8  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.123155  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4055  phosphoglycolate phosphatase  22.94 
 
 
234 aa  47.8  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0278697  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2228  HAD family hydrolase  24.34 
 
 
212 aa  47  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.375493  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3788  phosphoglycolate phosphatase  26.29 
 
 
252 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0431  3-amino-5-hydroxybenoic acid synthesis related  27.23 
 
 
263 aa  47  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1874  HAD family hydrolase  29.63 
 
 
216 aa  47  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.785736  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4689  phosphoglycolate phosphatase  24.46 
 
 
252 aa  47  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.663349  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3798  phosphoglycolate phosphatase  29.79 
 
 
253 aa  47  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0419361 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0328  phosphoglycolate phosphatase  24.46 
 
 
252 aa  47  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.372389  normal  0.201922 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3661  phosphoglycolate phosphatase  24.46 
 
 
252 aa  47  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.29844  normal  0.025681 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>