More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_2067 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_2067  HAD family hydrolase  100 
 
 
230 aa  448  1e-125  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0859939  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0412  putative phosphatase  99.57 
 
 
230 aa  445  1.0000000000000001e-124  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2336  HAD family hydrolase  84.35 
 
 
231 aa  356  1.9999999999999998e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.509915  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2818  HAD-like hydrolase  55.31 
 
 
240 aa  228  7e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.564979 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2172  HAD family hydrolase  52.44 
 
 
230 aa  223  1e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3129  HAD family hydrolase  52.86 
 
 
235 aa  219  3.9999999999999997e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.27329 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0898  phosphatase  44.2 
 
 
246 aa  140  1.9999999999999998e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.214916  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0489  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  42.04 
 
 
240 aa  136  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.193377  normal  0.0160234 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0425  HAD family hydrolase  40.79 
 
 
233 aa  137  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.523755  normal  0.669052 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0533  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  42.6 
 
 
240 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.454785  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2676  HAD family hydrolase  38.72 
 
 
242 aa  129  3e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.80155 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0302  HAD superfamily hydrolase  40 
 
 
249 aa  122  6e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.795024  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0287  HAD superfamily hydrolase  40 
 
 
249 aa  122  6e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.727823  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0371  HAD family hydrolase  38.67 
 
 
242 aa  122  6e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2473  hydrolase  36.16 
 
 
278 aa  101  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0460809 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0302  HAD family hydrolase  27.27 
 
 
248 aa  94  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0353  haloacid dehalogenase/epoxide hydrolase family protein  26.96 
 
 
247 aa  92.8  4e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0398  haloacid dehalogenase/epoxide hydrolase family protein  28.14 
 
 
248 aa  92.8  4e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0370  haloacid dehalogenase/epoxide hydrolase family protein  27.47 
 
 
247 aa  89.4  4e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0304  HAD family hydrolase  29.06 
 
 
248 aa  88.6  7e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0296  haloacid dehalogenase-like hydrolase  26.09 
 
 
247 aa  88.6  8e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4950  haloacid dehalogenase/epoxide hydrolase family protein  27.78 
 
 
248 aa  86.7  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0309  haloacid dehalogenase/epoxide hydrolase family protein  25.65 
 
 
247 aa  85.1  8e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0324  haloacid dehalogenase/epoxide hydrolase family protein  25.65 
 
 
247 aa  85.1  8e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0292  haloacid dehalogenase-like hydrolase  25.65 
 
 
247 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2324  phosphoglycolate phosphatase  44.19 
 
 
223 aa  84.3  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.289687  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0356  haloacid dehalogenase/epoxide hydrolase family protein  25.65 
 
 
247 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13001  phosphatase  26.58 
 
 
253 aa  80.9  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.221513  normal  0.158564 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3378  2-deoxyglucose-6-phosphatase  29.11 
 
 
225 aa  78.6  0.00000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0592  HAD family hydrolase  26.54 
 
 
227 aa  77.8  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0578  HAD family hydrolase  26.54 
 
 
227 aa  77.8  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.297181  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3425  2-deoxyglucose-6-phosphatase  30.8 
 
 
223 aa  76.3  0.0000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000919178  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2797  hydrolase  25.64 
 
 
235 aa  75.1  0.0000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.392797  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0304  beta-phosphoglucomutase  35.96 
 
 
986 aa  75.1  0.0000000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.337026 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1623  phosphoglycolate phosphatase  31.9 
 
 
222 aa  72.8  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0437  2-deoxyglucose-6-phosphatase  25.54 
 
 
221 aa  72.4  0.000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000647119  hitchhiker  0.00000756317 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2697  phosphoglycolate phosphatase  32.67 
 
 
240 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14830  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  32.91 
 
 
219 aa  72  0.000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.187107 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0179  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.13 
 
 
218 aa  72  0.000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3772  2-deoxyglucose-6-phosphatase  30.1 
 
 
218 aa  72  0.000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19180  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.92 
 
 
218 aa  71.6  0.000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.143986  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2205  2-deoxyglucose-6-phosphatase  29.15 
 
 
221 aa  71.6  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.100097  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0284  2-deoxyglucose-6-phosphatase  28.08 
 
 
221 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00458991 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3289  AHBA synthesis associated protein  32.74 
 
 
264 aa  70.1  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1661  AHBA synthesis associated protein  31.67 
 
 
214 aa  69.7  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.49792 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2523  HAD family hydrolase  31.44 
 
 
219 aa  70.1  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000000119514  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0019  phosphatase  23.83 
 
 
208 aa  70.1  0.00000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.379676 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1912  2-deoxyglucose-6-phosphatase  28.25 
 
 
223 aa  69.3  0.00000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0120822  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0424  2-deoxyglucose-6-phosphatase  28.16 
 
 
222 aa  69.3  0.00000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2363  phosphoglycolate phosphatase  36 
 
 
227 aa  69.3  0.00000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.496506  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0199  HAD superfamily hydrolase  26.94 
 
 
231 aa  68.6  0.00000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1562  putative hydrolase  33.94 
 
 
218 aa  68.6  0.00000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.320439  normal  0.240105 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0571  phosphoglycolate phosphatase  38.79 
 
 
242 aa  68.6  0.00000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0432  2-deoxyglucose-6-phosphatase  31.07 
 
 
218 aa  68.6  0.00000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000498152  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00378  phosphoglycolate phosphatase  41.35 
 
 
250 aa  68.6  0.00000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.590108  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4954  pyrophosphatase PpaX  26.01 
 
 
215 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1944  pyrophosphatase PpaX  23.86 
 
 
214 aa  68.2  0.0000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0464  phosphoglycolate phosphatase  43.62 
 
 
251 aa  67  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.992467  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0431  3-amino-5-hydroxybenoic acid synthesis related  31.82 
 
 
263 aa  67  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2446  phosphoglycolate phosphatase  34.17 
 
 
225 aa  67.4  0.0000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0381  2-deoxyglucose-6-phosphatase  30.69 
 
 
221 aa  67  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0071153  normal  0.324571 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2790  HAD family hydrolase  25.66 
 
 
223 aa  67  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0431  2-deoxyglucose-6-phosphatase  30 
 
 
217 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2124  phosphoglycolate phosphatase  34.17 
 
 
230 aa  66.6  0.0000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.305125  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000391  2-deoxyglucose-6-phosphate hydrolase YniC  25.49 
 
 
218 aa  66.2  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0106831  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0265  phosphoglycolate phosphatase  32.48 
 
 
227 aa  67  0.0000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2469  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.41 
 
 
224 aa  66.6  0.0000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.618161  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2097  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  24.79 
 
 
221 aa  66.6  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.284323  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2232  pyrophosphatase PpaX  23.86 
 
 
214 aa  67  0.0000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3593  2-deoxyglucose-6-phosphatase  30.58 
 
 
218 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000011766  normal  0.672534 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0440  phosphoglycolate phosphatase  43.62 
 
 
251 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.122838  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0743  phosphoglycolate phosphatase  42.55 
 
 
225 aa  66.2  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1780  HAD family hydrolase  43.36 
 
 
225 aa  66.2  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.587654  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2641  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.84 
 
 
222 aa  66.2  0.0000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3288  HAD family hydrolase  30.84 
 
 
222 aa  66.2  0.0000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2859  phosphoglycolate phosphatase  43.62 
 
 
256 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.430899  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2370  phosphoglycolate phosphatase  27.11 
 
 
227 aa  65.9  0.0000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3031  2-phosphoglycolate phosphatase  40.35 
 
 
256 aa  65.9  0.0000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3410  2-deoxyglucose-6-phosphatase  30.48 
 
 
217 aa  65.9  0.0000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0110715  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0057  phosphoglycolate phosphatase  32.5 
 
 
232 aa  65.9  0.0000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.049028  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1187  phosphoglycolate phosphatase  28.64 
 
 
218 aa  65.9  0.0000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00990405  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0925  phosphoglycolate phosphatase  28.86 
 
 
224 aa  65.1  0.0000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0820  HAD family hydrolase  29.91 
 
 
219 aa  65.5  0.0000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.362734  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2583  phosphoglycolate phosphatase  37.78 
 
 
227 aa  64.3  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0260  haloacid dehalogenase, IA family protein  25.55 
 
 
217 aa  64.7  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2152  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  42.48 
 
 
225 aa  64.3  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0328  phosphoglycolate phosphatase  36.36 
 
 
252 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2060  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  43.36 
 
 
225 aa  63.9  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.750609  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2920  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.46 
 
 
219 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00300829  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3495  phosphoglycolate phosphatase  28.57 
 
 
238 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0294223  hitchhiker  0.0000911523 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5246  pyrophosphatase PpaX  24.49 
 
 
216 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5953  phosphoglycolate phosphatase  36.89 
 
 
257 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0174691 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3622  2-phosphoglycolate phosphatase  41.49 
 
 
254 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3762  phosphoglycolate phosphatase  36.36 
 
 
252 aa  64.3  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.40481  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2908  phosphoglycolate phosphatase  41.49 
 
 
242 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03189  hypothetical protein  36.36 
 
 
252 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4689  phosphoglycolate phosphatase  36.36 
 
 
252 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.663349  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0328  phosphoglycolate phosphatase  36.36 
 
 
252 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.372389  normal  0.201922 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3661  phosphoglycolate phosphatase  36.36 
 
 
252 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.29844  normal  0.025681 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3581  phosphoglycolate phosphatase  36.36 
 
 
252 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.284383  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>