More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_0489 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0489  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  100 
 
 		 240 aa  481  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.193377  normal  0.0160234 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0533  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  92.5 
 
 		 240 aa  447  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.454785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0425  HAD family hydrolase  71.05 
 
 		 233 aa  328  6e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.523755  normal  0.669052 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0898  phosphatase  68.53 
 
 		 246 aa  317  1e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.214916  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2676  HAD family hydrolase  46.75 
 
 		 242 aa  191  7e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.80155 
 
 
-
 
NC_004310  BR0287  HAD superfamily hydrolase  35.37 
 
 		 249 aa  136  2e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.727823  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0302  HAD superfamily hydrolase  35.37 
 
 		 249 aa  136  2e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.795024  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3129  HAD family hydrolase  39.74 
 
 		 235 aa  135  5e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.27329 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0371  HAD family hydrolase  35.37 
 
 		 242 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0412  putative phosphatase  42.04 
 
 		 230 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2067  HAD family hydrolase  42.04 
 
 		 230 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0859939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2818  HAD-like hydrolase  37.12 
 
 		 240 aa  118  9.999999999999999e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.564979 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2336  HAD family hydrolase  39.83 
 
 		 231 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.509915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2473  hydrolase  33.62 
 
 		 278 aa  106  4e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0460809 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2172  HAD family hydrolase  35.71 
 
 		 230 aa  103  2e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4950  haloacid dehalogenase/epoxide hydrolase family protein  32.9 
 
 		 248 aa  102  8e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0398  haloacid dehalogenase/epoxide hydrolase family protein  32.46 
 
 		 248 aa  101  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0353  haloacid dehalogenase/epoxide hydrolase family protein  32.02 
 
 		 247 aa  97.8  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0304  HAD family hydrolase  32.76 
 
 		 248 aa  97.4  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0292  haloacid dehalogenase-like hydrolase  32.46 
 
 		 247 aa  97.4  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0309  haloacid dehalogenase/epoxide hydrolase family protein  32.46 
 
 		 247 aa  96.7  3e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0296  haloacid dehalogenase-like hydrolase  32.02 
 
 		 247 aa  96.7  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0324  haloacid dehalogenase/epoxide hydrolase family protein  32.46 
 
 		 247 aa  96.7  3e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0356  haloacid dehalogenase/epoxide hydrolase family protein  32.46 
 
 		 247 aa  96.3  4e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0370  haloacid dehalogenase/epoxide hydrolase family protein  32.9 
 
 		 247 aa  96.3  4e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0302  HAD family hydrolase  31.14 
 
 		 248 aa  96.3  4e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0199  HAD superfamily hydrolase  27.44 
 
 		 231 aa  85.1  9e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0578  HAD family hydrolase  26.15 
 
 		 227 aa  77.4  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.297181  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0592  HAD family hydrolase  26.15 
 
 		 227 aa  77.4  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4662  HAD family hydrolase  28.09 
 
 		 244 aa  70.9  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00548431  decreased coverage  0.00277532 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14830  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  28.31 
 
 		 219 aa  66.6  0.0000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.187107 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1504  HAD family hydrolase  27.97 
 
 		 249 aa  65.1  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000137172  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4131  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.64 
 
 		 245 aa  63.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000103032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1857  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.43 
 
 		 245 aa  63.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3479  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.64 
 
 		 249 aa  63.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.498075 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1831  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.43 
 
 		 245 aa  63.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0968  HAD superfamily hydrolase  28.87 
 
 		 221 aa  62.4  0.000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1002  HAD superfamily hydrolase  28.87 
 
 		 221 aa  62.4  0.000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13001  phosphatase  25.46 
 
 		 253 aa  62.8  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.221513  normal  0.158564 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3095  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.06 
 
 		 234 aa  62.4  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0156733  normal  0.965778 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0937  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.07 
 
 		 219 aa  60.5  0.00000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.171636 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3378  2-deoxyglucose-6-phosphatase  25.11 
 
 		 225 aa  60.1  0.00000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23210  phosphoglycolate phosphatase  26.77 
 
 		 226 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0343323  hitchhiker  0.00416895 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1760  HAD family hydrolase  36.13 
 
 		 260 aa  59.3  0.00000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.960773  normal  0.487326 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0356  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.77 
 
 		 233 aa  58.5  0.00000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1957  phosphoglycolate phosphatase  25.76 
 
 		 223 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2152  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  34.97 
 
 		 225 aa  57.4  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1267  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.71 
 
 		 221 aa  56.6  0.0000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.090781  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2285  phosphatases  37.5 
 
 		 221 aa  56.6  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.812545  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4110  HAD superfamily hydrolase  26.81 
 
 		 244 aa  55.8  0.0000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.74944  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1844  phosphoglycolate phosphatase  27.23 
 
 		 223 aa  55.8  0.0000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0203973  normal  0.771348 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0323  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.58 
 
 		 233 aa  55.5  0.0000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0341719 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0280  HAD family hydrolase  32.58 
 
 		 233 aa  55.5  0.0000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1780  HAD family hydrolase  36.52 
 
 		 225 aa  55.5  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.587654  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2290  HAD family hydrolase  29.28 
 
 		 223 aa  55.1  0.0000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.783453  normal  0.134252 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1323  HAD family hydrolase  26.32 
 
 		 218 aa  55.1  0.0000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00010916  normal  0.934661 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0467  HAD family hydrolase  28.11 
 
 		 257 aa  55.1  0.000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0625  HAD family hydrolase  29.36 
 
 		 221 aa  54.7  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2060  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.65 
 
 		 225 aa  54.3  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.750609  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1313  HAD family hydrolase  31.9 
 
 		 232 aa  53.9  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.95229 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0057  phosphoglycolate phosphatase  25.89 
 
 		 232 aa  54.3  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.049028  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5246  pyrophosphatase PpaX  27.87 
 
 		 216 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19180  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.44 
 
 		 218 aa  53.5  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.143986  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15750  phosphoglycolate phosphatase  25.13 
 
 		 223 aa  53.5  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0693  hypothetical protein  28.36 
 
 		 277 aa  53.5  0.000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0116398  normal  0.589418 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2097  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  22.94 
 
 		 221 aa  53.1  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.284323  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2797  hydrolase  25 
 
 		 235 aa  53.1  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.392797  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4954  pyrophosphatase PpaX  27.73 
 
 		 215 aa  52.8  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2085  HAD family hydrolase  26.47 
 
 		 223 aa  52.8  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1868  hypothetical protein  26.5 
 
 		 257 aa  52.8  0.000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0027  HAD-superfamily hydrolase  30.95 
 
 		 238 aa  52.8  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0976  HAD family hydrolase  25.21 
 
 		 225 aa  52.4  0.000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2834  HAD family hydrolase  27.19 
 
 		 224 aa  52  0.000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.46316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5280  pyrophosphatase PpaX  27.05 
 
 		 216 aa  52  0.000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5322  pyrophosphatase PpaX  27.05 
 
 		 216 aa  52  0.000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3704  pyrophosphatase PpaX  26.89 
 
 		 212 aa  52  0.000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4839  pyrophosphatase PpaX  27.05 
 
 		 216 aa  52  0.000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4854  pyrophosphatase PpaX  27.05 
 
 		 216 aa  52  0.000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5265  pyrophosphatase PpaX  27.05 
 
 		 216 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1114  HAD family hydrolase  27.36 
 
 		 218 aa  51.2  0.00001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.35546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0178  HAD family hydrolase  31.15 
 
 		 230 aa  51.2  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000756614  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2479  phosphoglycolate phosphatase  28.33 
 
 		 228 aa  51.6  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0669626  normal  0.547058 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0590  HAD family hydrolase  30.51 
 
 		 219 aa  51.2  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0419315 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4032  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  21.86 
 
 		 222 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1900  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.4 
 
 		 221 aa  50.8  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.65867  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0384  HAD family hydrolase  33.01 
 
 		 222 aa  50.8  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000045535  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0072  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.94 
 
 		 230 aa  50.4  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2473  HAD family hydrolase  25.11 
 
 		 248 aa  50.8  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000591891  hitchhiker  0.00615598 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2037  HAD family hydrolase  33.04 
 
 		 225 aa  50.4  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00546936 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5010  pyrophosphatase PpaX  26.23 
 
 		 216 aa  50.1  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5390  pyrophosphatase PpaX  26.23 
 
 		 216 aa  50.1  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22171  haloacid dehalogenase/epoxide hydrolase family protein  26.02 
 
 		 270 aa  50.4  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5677  pyrophosphatase PpaX  26.45 
 
 		 216 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0398  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.17 
 
 		 226 aa  50.4  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2274  phosphoglycolate phosphatase  24.74 
 
 		 216 aa  49.7  0.00004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1743  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  23.47 
 
 		 227 aa  49.7  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.293469  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1944  pyrophosphatase PpaX  25.26 
 
 		 214 aa  49.7  0.00004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2463  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  33.33 
 
 		 217 aa  49.7  0.00004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.35707  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2291  HAD family hydrolase  36.36 
 
 		 218 aa  49.3  0.00005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.265516  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2232  pyrophosphatase PpaX  25.26 
 
 		 214 aa  49.3  0.00005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>