More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2473 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_2473  hydrolase  100 
 
 		 278 aa  545  1e-154  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0460809 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2818  HAD-like hydrolase  40.44 
 
 		 240 aa  132  7.999999999999999e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.564979 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0371  HAD family hydrolase  38.2 
 
 		 242 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0287  HAD superfamily hydrolase  37.77 
 
 		 249 aa  126  3e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.727823  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0302  HAD superfamily hydrolase  37.77 
 
 		 249 aa  126  3e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.795024  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3129  HAD family hydrolase  35.96 
 
 		 235 aa  122  9e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.27329 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2172  HAD family hydrolase  36.36 
 
 		 230 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0412  putative phosphatase  36.16 
 
 		 230 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2067  HAD family hydrolase  36.16 
 
 		 230 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0859939  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0533  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  33.62 
 
 		 240 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.454785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2676  HAD family hydrolase  36.8 
 
 		 242 aa  114  2.0000000000000002e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.80155 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0489  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  33.62 
 
 		 240 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.193377  normal  0.0160234 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0898  phosphatase  34.62 
 
 		 246 aa  109  5e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.214916  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0425  HAD family hydrolase  30.77 
 
 		 233 aa  104  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.523755  normal  0.669052 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2336  HAD family hydrolase  35.09 
 
 		 231 aa  102  6e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.509915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2797  hydrolase  25.1 
 
 		 235 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.392797  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0578  HAD family hydrolase  25.11 
 
 		 227 aa  70.1  0.00000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.297181  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0592  HAD family hydrolase  25.11 
 
 		 227 aa  70.1  0.00000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0302  HAD family hydrolase  26.29 
 
 		 248 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0304  HAD family hydrolase  28.57 
 
 		 248 aa  67  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0353  haloacid dehalogenase/epoxide hydrolase family protein  26.56 
 
 		 247 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0398  haloacid dehalogenase/epoxide hydrolase family protein  27.69 
 
 		 248 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2363  phosphoglycolate phosphatase  35.83 
 
 		 227 aa  63.2  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.496506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1780  HAD family hydrolase  38.84 
 
 		 225 aa  62.4  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.587654  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0309  haloacid dehalogenase/epoxide hydrolase family protein  25.94 
 
 		 247 aa  61.2  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0324  haloacid dehalogenase/epoxide hydrolase family protein  25.94 
 
 		 247 aa  61.2  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4950  haloacid dehalogenase/epoxide hydrolase family protein  26.5 
 
 		 248 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0356  haloacid dehalogenase/epoxide hydrolase family protein  25.94 
 
 		 247 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02162  phosphoglycolate phosphatase  26.5 
 
 		 225 aa  61.2  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1175  HAD family hydrolase  26.64 
 
 		 241 aa  61.6  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.542362  normal  0.617727 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0292  haloacid dehalogenase-like hydrolase  25.94 
 
 		 247 aa  60.5  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0370  haloacid dehalogenase/epoxide hydrolase family protein  26.18 
 
 		 247 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4360  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.85 
 
 		 223 aa  60.1  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2152  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  37.19 
 
 		 225 aa  60.1  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0634  HAD family hydrolase  22.76 
 
 		 239 aa  58.9  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.828667  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0649  HAD family hydrolase  22.76 
 
 		 239 aa  58.9  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0296  haloacid dehalogenase-like hydrolase  25.52 
 
 		 247 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2493  phosphoglycolate phosphatase  32.52 
 
 		 225 aa  58.2  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15750  phosphoglycolate phosphatase  29.54 
 
 		 223 aa  57.4  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03237  phosphoglycolate phosphatase  32.84 
 
 		 252 aa  57  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0328  phosphoglycolate phosphatase  32.84 
 
 		 252 aa  57  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3854  phosphoglycolate phosphatase  32.84 
 
 		 252 aa  57  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00525883  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3581  phosphoglycolate phosphatase  32.84 
 
 		 252 aa  57  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.284383  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0328  phosphoglycolate phosphatase  32.84 
 
 		 252 aa  57  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.372389  normal  0.201922 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3762  phosphoglycolate phosphatase  32.84 
 
 		 252 aa  57.4  0.0000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.40481  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4689  phosphoglycolate phosphatase  32.84 
 
 		 252 aa  57  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.663349  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03189  hypothetical protein  32.84 
 
 		 252 aa  57  0.0000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3661  phosphoglycolate phosphatase  32.84 
 
 		 252 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.29844  normal  0.025681 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0268  HAD superfamily hydrolase  23.65 
 
 		 242 aa  56.6  0.0000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.54938  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1198  phosphoglycolate phosphatase  32.47 
 
 		 223 aa  56.6  0.0000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.042458  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19180  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  21.3 
 
 		 218 aa  56.6  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.143986  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4445  phosphoglycolate phosphatase  32.4 
 
 		 234 aa  57  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0670358  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3850  phosphoglycolate phosphatase  31.3 
 
 		 252 aa  56.6  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3679  phosphoglycolate phosphatase  31.3 
 
 		 252 aa  56.2  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.966867  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3754  phosphoglycolate phosphatase  31.3 
 
 		 252 aa  56.6  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3681  phosphoglycolate phosphatase  31.3 
 
 		 252 aa  56.6  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.123155  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3193  phosphoglycolate phosphatase  28.74 
 
 		 250 aa  56.6  0.0000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2060  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.36 
 
 		 225 aa  56.6  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.750609  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0199  HAD superfamily hydrolase  23.38 
 
 		 231 aa  56.2  0.0000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1296  phosphoglycolate phosphatase  33.09 
 
 		 233 aa  55.8  0.0000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0205291  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3788  phosphoglycolate phosphatase  31.3 
 
 		 252 aa  55.8  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2290  HAD family hydrolase  34.48 
 
 		 223 aa  55.8  0.0000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.783453  normal  0.134252 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00378  phosphoglycolate phosphatase  32.39 
 
 		 250 aa  55.5  0.0000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.590108  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3991  HAD family hydrolase  33.9 
 
 		 223 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0589691  normal  0.286342 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10830  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  32.5 
 
 		 296 aa  55.5  0.000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1257  AHBA synthesis associated protein  27.24 
 
 		 228 aa  55.5  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0136935  hitchhiker  0.0000231922 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2324  phosphoglycolate phosphatase  33.62 
 
 		 223 aa  54.3  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.289687  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20950  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  28.87 
 
 		 216 aa  53.5  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1113  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.71 
 
 		 204 aa  53.5  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0976  HAD family hydrolase  25.81 
 
 		 225 aa  53.5  0.000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3482  phosphoglycolate phosphatase  27.6 
 
 		 228 aa  53.5  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.875502  normal  0.981101 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3148  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.71 
 
 		 199 aa  53.5  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.29989  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4472  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  33.05 
 
 		 223 aa  53.1  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1220  phosphoglycolate phosphatase  28.85 
 
 		 225 aa  52.8  0.000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0347  phosphoglycolate phosphatase  26.09 
 
 		 235 aa  52.8  0.000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1697  HAD family hydrolase  28.1 
 
 		 231 aa  52.8  0.000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0993915 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1267  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.73 
 
 		 221 aa  52.8  0.000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.090781  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2311  HAD superfamily (subfamily IA) hydrolase, TIGR01548  26.83 
 
 		 246 aa  52.8  0.000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1066  haloacid dehalogenase, IA family protein  28.88 
 
 		 224 aa  52.4  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4292  HAD family hydrolase  33.66 
 
 		 196 aa  52.4  0.000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2496  phosphoglycolate phosphatase  32.52 
 
 		 221 aa  52.4  0.000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2583  phosphoglycolate phosphatase  34.13 
 
 		 227 aa  51.6  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0268  phosphoglycolate phosphatase  35.05 
 
 		 228 aa  51.6  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0557534  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14830  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  34.43 
 
 		 219 aa  52  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.187107 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2193  phosphoglycolate phosphatase  30.51 
 
 		 225 aa  51.6  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.83571  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2878  phosphoglycolate phosphatase  31.67 
 
 		 226 aa  51.6  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0717  HAD-superfamily hydrolase  28.88 
 
 		 224 aa  51.2  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13001  phosphatase  23.56 
 
 		 253 aa  51.2  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.221513  normal  0.158564 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2370  phosphoglycolate phosphatase  32.5 
 
 		 227 aa  51.2  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2990  HAD-superfamily hydrolase  28.88 
 
 		 224 aa  51.2  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3611  phosphoglycolate phosphatase  28.74 
 
 		 262 aa  51.2  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0176  phosphoglycolate phosphatase  29.17 
 
 		 224 aa  51.2  0.00002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.790253  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1752  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.84 
 
 		 216 aa  50.8  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1609  HAD-superfamily hydrolase  28.88 
 
 		 224 aa  51.2  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1060  haloacid dehalogenase, IA family protein  28.88 
 
 		 224 aa  51.2  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2296  HAD-superfamily hydrolase  28.88 
 
 		 224 aa  51.2  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1190  hypothetical protein  25.86 
 
 		 228 aa  51.2  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.619731  normal  0.0510932 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2083  phosphoglycolate phosphatase  26.38 
 
 		 226 aa  51.2  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.609164  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0954  phosphoglycolate phosphatase  34.45 
 
 		 233 aa  50.4  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4258  phosphoglycolate phosphatase  28.89 
 
 		 235 aa  50.8  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0125483 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>