184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2676 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2676  HAD family hydrolase  100 
 
 		 242 aa  474  1e-133  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.80155 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0425  HAD family hydrolase  46.26 
 
 		 233 aa  199  1.9999999999999998e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.523755  normal  0.669052 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0533  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  47.19 
 
 		 240 aa  193  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.454785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0489  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  46.75 
 
 		 240 aa  191  7e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.193377  normal  0.0160234 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0898  phosphatase  45.65 
 
 		 246 aa  188  5e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.214916  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3129  HAD family hydrolase  41.48 
 
 		 235 aa  147  1.0000000000000001e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.27329 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0371  HAD family hydrolase  37.72 
 
 		 242 aa  137  1e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0287  HAD superfamily hydrolase  37.5 
 
 		 249 aa  136  3.0000000000000003e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.727823  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0302  HAD superfamily hydrolase  37.5 
 
 		 249 aa  136  3.0000000000000003e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.795024  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2818  HAD-like hydrolase  37.33 
 
 		 240 aa  125  7e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.564979 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0412  putative phosphatase  38.72 
 
 		 230 aa  124  1e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2067  HAD family hydrolase  38.72 
 
 		 230 aa  122  5e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0859939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2336  HAD family hydrolase  37.07 
 
 		 231 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.509915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0398  haloacid dehalogenase/epoxide hydrolase family protein  33.33 
 
 		 248 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2172  HAD family hydrolase  35.66 
 
 		 230 aa  106  3e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2473  hydrolase  37.17 
 
 		 278 aa  106  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0460809 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0353  haloacid dehalogenase/epoxide hydrolase family protein  33.33 
 
 		 247 aa  103  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0296  haloacid dehalogenase-like hydrolase  32.78 
 
 		 247 aa  103  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0302  HAD family hydrolase  28.81 
 
 		 248 aa  102  5e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0304  HAD family hydrolase  33.61 
 
 		 248 aa  102  6e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0292  haloacid dehalogenase-like hydrolase  32.07 
 
 		 247 aa  100  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0309  haloacid dehalogenase/epoxide hydrolase family protein  32.07 
 
 		 247 aa  100  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0324  haloacid dehalogenase/epoxide hydrolase family protein  32.07 
 
 		 247 aa  100  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0356  haloacid dehalogenase/epoxide hydrolase family protein  32.07 
 
 		 247 aa  100  3e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4950  haloacid dehalogenase/epoxide hydrolase family protein  31.95 
 
 		 248 aa  97.8  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0370  haloacid dehalogenase/epoxide hydrolase family protein  30.51 
 
 		 247 aa  95.9  5e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2797  hydrolase  23.43 
 
 		 235 aa  72.4  0.000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.392797  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13001  phosphatase  25.21 
 
 		 253 aa  71.6  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.221513  normal  0.158564 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4662  HAD family hydrolase  36.04 
 
 		 244 aa  66.2  0.0000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00548431  decreased coverage  0.00277532 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0199  HAD superfamily hydrolase  21.85 
 
 		 231 aa  63.5  0.000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14830  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  32.76 
 
 		 219 aa  62.4  0.000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.187107 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1504  HAD family hydrolase  28.69 
 
 		 249 aa  61.2  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000137172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22171  haloacid dehalogenase/epoxide hydrolase family protein  28.05 
 
 		 270 aa  60.1  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0578  HAD family hydrolase  23.71 
 
 		 227 aa  58.9  0.00000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.297181  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0592  HAD family hydrolase  23.71 
 
 		 227 aa  58.9  0.00000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0971  2-phosphoglycolate phosphatase  31.33 
 
 		 237 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.080581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0735  phosphoglycolate phosphatase  29.54 
 
 		 237 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.442963  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0027  HAD-superfamily hydrolase  43.21 
 
 		 238 aa  55.5  0.0000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0625  HAD family hydrolase  30.26 
 
 		 221 aa  55.5  0.0000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1900  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.58 
 
 		 221 aa  55.5  0.0000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.65867  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3012  phosphoglycolate phosphatase  30.64 
 
 		 237 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0258131  normal  0.0275568 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1868  hypothetical protein  27.82 
 
 		 257 aa  55.5  0.0000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03461  phosphatase  24.51 
 
 		 258 aa  54.7  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1752  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.93 
 
 		 216 aa  55.1  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0678  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  40.23 
 
 		 264 aa  53.9  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1313  HAD family hydrolase  27.82 
 
 		 232 aa  53.9  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.95229 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1532  D,D-heptose 1,7-bisphosphate phosphatase  38.96 
 
 		 184 aa  52.8  0.000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.219369  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3095  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.77 
 
 		 234 aa  53.1  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0156733  normal  0.965778 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1040  HAD family hydrolase  25.19 
 
 		 226 aa  52.4  0.000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000171478  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1002  HAD superfamily hydrolase  32.74 
 
 		 221 aa  51.6  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3611  phosphoglycolate phosphatase  33.65 
 
 		 262 aa  52  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0292  HAD family hydrolase  30.34 
 
 		 222 aa  51.6  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.402537  normal  0.982934 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0968  HAD superfamily hydrolase  32.74 
 
 		 221 aa  51.6  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2583  phosphoglycolate phosphatase  32.28 
 
 		 227 aa  50.8  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0534  phosphoglycolate phosphatase  30.7 
 
 		 242 aa  51.2  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0250125  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3574  phosphoglycolate phosphatase  30.7 
 
 		 242 aa  50.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.952116  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4462  phosphoglycolate phosphatase  30.07 
 
 		 250 aa  50.8  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0643  phosphoglycolate phosphatase  30.7 
 
 		 242 aa  51.2  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0939  phosphoglycolate phosphatase  30.7 
 
 		 242 aa  51.2  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3555  phosphoglycolate phosphatase  30.7 
 
 		 245 aa  50.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.221388  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3582  phosphoglycolate phosphatase  30.7 
 
 		 245 aa  50.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1909  phosphoglycolate phosphatase  30.7 
 
 		 242 aa  51.2  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3479  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  34.52 
 
 		 249 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.498075 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1857  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.03 
 
 		 245 aa  50.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1267  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.64 
 
 		 221 aa  50.1  0.00003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.090781  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0467  HAD family hydrolase  26.64 
 
 		 257 aa  50.1  0.00003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3402  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  34.41 
 
 		 244 aa  50.4  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0865244 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0071  phosphatase-like protein  39.51 
 
 		 246 aa  50.1  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1844  phosphoglycolate phosphatase  25.52 
 
 		 223 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0203973  normal  0.771348 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1831  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.03 
 
 		 245 aa  50.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4110  HAD superfamily hydrolase  27.73 
 
 		 244 aa  50.1  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.74944  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2582  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 1  30.33 
 
 		 224 aa  49.7  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0909618 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2290  HAD family hydrolase  28.76 
 
 		 223 aa  49.3  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.783453  normal  0.134252 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0571  phosphoglycolate phosphatase  30 
 
 		 242 aa  49.3  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2132  HAD family hydrolase  27.36 
 
 		 220 aa  48.9  0.00006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1874  HAD family hydrolase  25.63 
 
 		 216 aa  49.3  0.00006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.785736  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4773  HAD family hydrolase  38.2 
 
 		 197 aa  49.3  0.00006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.330372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5624  HAD family hydrolase  37.7 
 
 		 228 aa  49.3  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.147818  normal  0.407625 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0384  HAD family hydrolase  30.4 
 
 		 222 aa  48.9  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000045535  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1151  HAD family hydrolase  30.77 
 
 		 219 aa  48.9  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.205266  hitchhiker  0.00490249 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1947  HAD family hydrolase  26.04 
 
 		 239 aa  48.5  0.00009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0127606 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0590  HAD family hydrolase  27.91 
 
 		 219 aa  48.5  0.00009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0419315 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2414  phosphoglycolate phosphatase, putative  26.94 
 
 		 229 aa  48.5  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0937  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.44 
 
 		 219 aa  48.1  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.171636 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2406  HAD family hydrolase  25.91 
 
 		 223 aa  48.5  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0211635  unclonable  0.0000117739 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2056  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.91 
 
 		 223 aa  48.5  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0324232  unclonable  0.00000000000163854 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0659  HAD family hydrolase  38.2 
 
 		 196 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0468832  normal  0.394115 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1705  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.22 
 
 		 260 aa  47.8  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.495652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2289  HAD family hydrolase  25.91 
 
 		 223 aa  48.5  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000247556  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00378  phosphoglycolate phosphatase  28.76 
 
 		 250 aa  47.4  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.590108  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2463  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  34.52 
 
 		 217 aa  47.4  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.35707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0868  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.83 
 
 		 227 aa  47.8  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000353752  normal  0.072442 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4525  phosphatase  26.55 
 
 		 208 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2493  phosphoglycolate phosphatase  28.69 
 
 		 225 aa  47.4  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0714  hydrolase  46.34 
 
 		 255 aa  47.8  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2152  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  34.51 
 
 		 225 aa  47.4  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0261  HAD family hydrolase  25.56 
 
 		 217 aa  47.8  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000130583  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2060  HAD family hydrolase  25.91 
 
 		 223 aa  47.8  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00381556  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4131  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.93 
 
 		 245 aa  47  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000103032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0558  phosphoglycolate phosphatase  30.51 
 
 		 237 aa  47  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>