More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2172 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2172  HAD family hydrolase  100 
 
 		 230 aa  462  1e-129  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2818  HAD-like hydrolase  55.51 
 
 		 240 aa  242  3.9999999999999997e-63  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.564979 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2067  HAD family hydrolase  52.44 
 
 		 230 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0859939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0412  putative phosphatase  52.44 
 
 		 230 aa  217  1e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2336  HAD family hydrolase  51.56 
 
 		 231 aa  202  4e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.509915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3129  HAD family hydrolase  44.89 
 
 		 235 aa  182  3e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.27329 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0371  HAD family hydrolase  38.46 
 
 		 242 aa  125  8.000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0302  HAD superfamily hydrolase  36.09 
 
 		 249 aa  114  1.0000000000000001e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.795024  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0287  HAD superfamily hydrolase  36.09 
 
 		 249 aa  114  1.0000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.727823  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0533  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  35.78 
 
 		 240 aa  107  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.454785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0425  HAD family hydrolase  34.08 
 
 		 233 aa  107  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.523755  normal  0.669052 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2676  HAD family hydrolase  35.66 
 
 		 242 aa  106  3e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.80155 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0898  phosphatase  34.65 
 
 		 246 aa  105  6e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.214916  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0489  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  35.71 
 
 		 240 aa  103  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.193377  normal  0.0160234 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2473  hydrolase  36.36 
 
 		 278 aa  97.4  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0460809 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0302  HAD family hydrolase  27.16 
 
 		 248 aa  92  7e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0353  haloacid dehalogenase/epoxide hydrolase family protein  27.27 
 
 		 247 aa  89.4  4e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0370  haloacid dehalogenase/epoxide hydrolase family protein  29.18 
 
 		 247 aa  89.4  5e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0464  phosphoglycolate phosphatase  32.52 
 
 		 251 aa  89  6e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.992467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0440  phosphoglycolate phosphatase  32.55 
 
 		 251 aa  88.6  8e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.122838  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0304  HAD family hydrolase  29.87 
 
 		 248 aa  87.4  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3495  phosphoglycolate phosphatase  33.8 
 
 		 238 aa  85.5  7e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0294223  hitchhiker  0.0000911523 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0398  haloacid dehalogenase/epoxide hydrolase family protein  27.35 
 
 		 248 aa  85.5  7e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3622  2-phosphoglycolate phosphatase  33.33 
 
 		 254 aa  85.1  9e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4950  haloacid dehalogenase/epoxide hydrolase family protein  28.63 
 
 		 248 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3574  phosphoglycolate phosphatase  33.81 
 
 		 242 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.952116  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2697  phosphoglycolate phosphatase  30.19 
 
 		 240 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3555  phosphoglycolate phosphatase  33.81 
 
 		 245 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.221388  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3582  phosphoglycolate phosphatase  33.81 
 
 		 245 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0643  phosphoglycolate phosphatase  33.33 
 
 		 242 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0534  phosphoglycolate phosphatase  33.33 
 
 		 242 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0250125  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0939  phosphoglycolate phosphatase  33.33 
 
 		 242 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1909  phosphoglycolate phosphatase  33.33 
 
 		 242 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0462  2-phosphoglycolate phosphatase  33.82 
 
 		 238 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2908  phosphoglycolate phosphatase  33.81 
 
 		 242 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0535  phosphoglycolate phosphatase  33.33 
 
 		 254 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0507  phosphoglycolate phosphatase  33.33 
 
 		 254 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.263743  normal  0.890695 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2324  phosphoglycolate phosphatase  34.7 
 
 		 223 aa  81.3  0.00000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.289687  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2570  phosphoglycolate phosphatase  33.33 
 
 		 254 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0578  HAD family hydrolase  26.79 
 
 		 227 aa  80.9  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.297181  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0592  HAD family hydrolase  26.79 
 
 		 227 aa  80.9  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2363  phosphoglycolate phosphatase  35.71 
 
 		 227 aa  80.1  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.496506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2859  phosphoglycolate phosphatase  32.37 
 
 		 256 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.430899  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0309  haloacid dehalogenase/epoxide hydrolase family protein  26.52 
 
 		 247 aa  79.3  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0296  haloacid dehalogenase-like hydrolase  27.63 
 
 		 247 aa  79.7  0.00000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0324  haloacid dehalogenase/epoxide hydrolase family protein  26.52 
 
 		 247 aa  79.3  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0292  haloacid dehalogenase-like hydrolase  27.39 
 
 		 247 aa  79  0.00000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0356  haloacid dehalogenase/epoxide hydrolase family protein  27.39 
 
 		 247 aa  79  0.00000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1780  HAD family hydrolase  45.61 
 
 		 225 aa  78.6  0.00000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.587654  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2232  pyrophosphatase PpaX  38.46 
 
 		 214 aa  77  0.0000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1944  pyrophosphatase PpaX  38.46 
 
 		 214 aa  77.4  0.0000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15750  phosphoglycolate phosphatase  30.37 
 
 		 223 aa  76.6  0.0000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5953  phosphoglycolate phosphatase  38.17 
 
 		 257 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0174691 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2446  phosphoglycolate phosphatase  30.7 
 
 		 225 aa  75.9  0.0000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02162  phosphoglycolate phosphatase  32.52 
 
 		 225 aa  75.5  0.0000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2124  phosphoglycolate phosphatase  37.5 
 
 		 230 aa  75.5  0.0000000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.305125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2493  phosphoglycolate phosphatase  35.83 
 
 		 225 aa  75.1  0.0000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1741  phosphoglycolate phosphatase  31.08 
 
 		 223 aa  75.1  0.0000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0199  HAD superfamily hydrolase  26.78 
 
 		 231 aa  74.7  0.000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1957  phosphoglycolate phosphatase  29.11 
 
 		 223 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3651  phosphoglycolate phosphatase  30.8 
 
 		 223 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1371  phosphoglycolate phosphatase  30.33 
 
 		 223 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0265  phosphoglycolate phosphatase  32.2 
 
 		 227 aa  73.6  0.000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2060  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  47.25 
 
 		 225 aa  73.2  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.750609  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2152  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  42.11 
 
 		 225 aa  72.8  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0057  phosphoglycolate phosphatase  31.97 
 
 		 232 aa  73.2  0.000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.049028  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1623  phosphoglycolate phosphatase  32.18 
 
 		 222 aa  72.8  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1764  phosphoglycolate phosphatase  29.72 
 
 		 223 aa  72.8  0.000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23210  phosphoglycolate phosphatase  28.64 
 
 		 226 aa  72.8  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0343323  hitchhiker  0.00416895 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0525  HAD family hydrolase  26.99 
 
 		 209 aa  72  0.000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00124351  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0743  phosphoglycolate phosphatase  43.62 
 
 		 225 aa  72  0.000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0581  putative phosphoglycolate phosphatase protein  31.43 
 
 		 233 aa  71.6  0.000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1355  phosphoglycolate phosphatase  30.19 
 
 		 223 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2229  phosphoglycolate phosphatase  35.4 
 
 		 227 aa  71.2  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.40738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3950  phosphoglycolate phosphatase  29.25 
 
 		 223 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00428214  normal  0.0156244 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3547  phosphoglycolate phosphatase  38.24 
 
 		 238 aa  70.1  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2083  phosphoglycolate phosphatase  31.03 
 
 		 226 aa  70.1  0.00000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.609164  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3898  phosphoglycolate phosphatase  38.61 
 
 		 221 aa  69.7  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.67393 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2878  phosphoglycolate phosphatase  34.96 
 
 		 226 aa  69.3  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13001  phosphatase  25.78 
 
 		 253 aa  69.7  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.221513  normal  0.158564 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3482  phosphoglycolate phosphatase  40 
 
 		 226 aa  69.3  0.00000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.824519  normal  0.190106 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3611  phosphoglycolate phosphatase  39.6 
 
 		 262 aa  68.9  0.00000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0072  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  40.68 
 
 		 230 aa  68.2  0.00000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03237  phosphoglycolate phosphatase  36.75 
 
 		 252 aa  67.8  0.0000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0328  phosphoglycolate phosphatase  36.75 
 
 		 252 aa  67.8  0.0000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0571  phosphoglycolate phosphatase  40.4 
 
 		 242 aa  68.2  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4689  phosphoglycolate phosphatase  36.75 
 
 		 252 aa  67.8  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.663349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3854  phosphoglycolate phosphatase  36.75 
 
 		 252 aa  67.8  0.0000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00525883  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0347  phosphoglycolate phosphatase  31.16 
 
 		 235 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03189  hypothetical protein  36.75 
 
 		 252 aa  67.8  0.0000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3581  phosphoglycolate phosphatase  36.75 
 
 		 252 aa  67.8  0.0000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.284383  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1950  HAD family hydrolase  30.57 
 
 		 228 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0253028  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3762  phosphoglycolate phosphatase  36.75 
 
 		 252 aa  67.8  0.0000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.40481  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0328  phosphoglycolate phosphatase  36.75 
 
 		 252 aa  67.8  0.0000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.372389  normal  0.201922 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3661  phosphoglycolate phosphatase  36.75 
 
 		 252 aa  67.8  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.29844  normal  0.025681 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3679  phosphoglycolate phosphatase  38.24 
 
 		 252 aa  67  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.966867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2290  HAD family hydrolase  27.6 
 
 		 223 aa  67.4  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.783453  normal  0.134252 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3681  phosphoglycolate phosphatase  38.24 
 
 		 252 aa  67  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.123155  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3754  phosphoglycolate phosphatase  38.24 
 
 		 252 aa  67  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4662  HAD family hydrolase  27.35 
 
 		 244 aa  67.8  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00548431  decreased coverage  0.00277532 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>