More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0898 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_0898  phosphatase  100 
 
 		 246 aa  493  9.999999999999999e-139  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.214916  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0489  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  68.53 
 
 		 240 aa  317  1e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.193377  normal  0.0160234 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0533  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  67.69 
 
 		 240 aa  314  6e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.454785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0425  HAD family hydrolase  65.79 
 
 		 233 aa  305  4.0000000000000004e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.523755  normal  0.669052 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2676  HAD family hydrolase  45.65 
 
 		 242 aa  188  5.999999999999999e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.80155 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0412  putative phosphatase  44.2 
 
 		 230 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2067  HAD family hydrolase  44.2 
 
 		 230 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0859939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3129  HAD family hydrolase  39.56 
 
 		 235 aa  132  3.9999999999999996e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.27329 
 
 
-
 
NC_004310  BR0287  HAD superfamily hydrolase  35.59 
 
 		 249 aa  132  5e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.727823  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0302  HAD superfamily hydrolase  35.59 
 
 		 249 aa  132  5e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.795024  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0371  HAD family hydrolase  34.89 
 
 		 242 aa  131  7.999999999999999e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2336  HAD family hydrolase  43.89 
 
 		 231 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.509915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2818  HAD-like hydrolase  39.38 
 
 		 240 aa  120  3e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.564979 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0398  haloacid dehalogenase/epoxide hydrolase family protein  31.03 
 
 		 248 aa  116  3e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0304  HAD family hydrolase  32.76 
 
 		 248 aa  116  3e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0353  haloacid dehalogenase/epoxide hydrolase family protein  30.57 
 
 		 247 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4950  haloacid dehalogenase/epoxide hydrolase family protein  30.6 
 
 		 248 aa  112  5e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0302  HAD family hydrolase  28.88 
 
 		 248 aa  109  3e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0296  haloacid dehalogenase-like hydrolase  30.57 
 
 		 247 aa  109  5e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0292  haloacid dehalogenase-like hydrolase  29.74 
 
 		 247 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0309  haloacid dehalogenase/epoxide hydrolase family protein  29.74 
 
 		 247 aa  108  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0324  haloacid dehalogenase/epoxide hydrolase family protein  29.74 
 
 		 247 aa  108  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0356  haloacid dehalogenase/epoxide hydrolase family protein  29.74 
 
 		 247 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0370  haloacid dehalogenase/epoxide hydrolase family protein  30.6 
 
 		 247 aa  107  3e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2172  HAD family hydrolase  34.65 
 
 		 230 aa  105  7e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2473  hydrolase  33.19 
 
 		 278 aa  99  6e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0460809 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0199  HAD superfamily hydrolase  25.53 
 
 		 231 aa  87  2e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0578  HAD family hydrolase  24.55 
 
 		 227 aa  73.6  0.000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.297181  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0592  HAD family hydrolase  24.55 
 
 		 227 aa  73.6  0.000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4662  HAD family hydrolase  29.58 
 
 		 244 aa  71.2  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00548431  decreased coverage  0.00277532 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13001  phosphatase  25.68 
 
 		 253 aa  69.7  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.221513  normal  0.158564 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4131  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.88 
 
 		 245 aa  63.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000103032  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4110  HAD superfamily hydrolase  27.5 
 
 		 244 aa  63.2  0.000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.74944  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1857  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.25 
 
 		 245 aa  63.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1831  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.25 
 
 		 245 aa  63.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2797  hydrolase  25.73 
 
 		 235 aa  63.2  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.392797  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1313  HAD family hydrolase  28.26 
 
 		 232 aa  61.2  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.95229 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1844  phosphoglycolate phosphatase  28.93 
 
 		 223 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0203973  normal  0.771348 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1504  HAD family hydrolase  28.94 
 
 		 249 aa  61.2  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000137172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22171  haloacid dehalogenase/epoxide hydrolase family protein  28.63 
 
 		 270 aa  60.8  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3479  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.27 
 
 		 249 aa  60.1  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.498075 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3095  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.43 
 
 		 234 aa  59.7  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0156733  normal  0.965778 
 
 
-
 
NC_004310  BR1002  HAD superfamily hydrolase  28.88 
 
 		 221 aa  58.9  0.00000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0384  HAD family hydrolase  32.68 
 
 		 222 aa  58.9  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000045535  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0968  HAD superfamily hydrolase  28.88 
 
 		 221 aa  58.9  0.00000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5246  pyrophosphatase PpaX  23.63 
 
 		 216 aa  58.5  0.00000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1377  phosphonoacetaldehyde hydrolase  24.3 
 
 		 264 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0693  hypothetical protein  30 
 
 		 277 aa  57.4  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0116398  normal  0.589418 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5953  phosphoglycolate phosphatase  25 
 
 		 257 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0174691 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23210  phosphoglycolate phosphatase  27.41 
 
 		 226 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0343323  hitchhiker  0.00416895 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0939  phosphoglycolate phosphatase  28.92 
 
 		 242 aa  57  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1909  phosphoglycolate phosphatase  28.92 
 
 		 242 aa  57  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0534  phosphoglycolate phosphatase  28.92 
 
 		 242 aa  57  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0250125  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0643  phosphoglycolate phosphatase  28.92 
 
 		 242 aa  57  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3555  phosphoglycolate phosphatase  28.64 
 
 		 245 aa  57  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.221388  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3582  phosphoglycolate phosphatase  28.64 
 
 		 245 aa  57  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5322  pyrophosphatase PpaX  23.93 
 
 		 216 aa  56.2  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5265  pyrophosphatase PpaX  23.21 
 
 		 216 aa  56.2  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4839  pyrophosphatase PpaX  23.21 
 
 		 216 aa  56.2  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4854  pyrophosphatase PpaX  23.21 
 
 		 216 aa  56.2  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3574  phosphoglycolate phosphatase  28.92 
 
 		 242 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.952116  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0006  phosphoglycolate phosphatase  28.05 
 
 		 226 aa  56.2  0.0000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.537352  normal  0.527818 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2463  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  33.33 
 
 		 217 aa  56.2  0.0000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.35707  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2859  phosphoglycolate phosphatase  28.28 
 
 		 256 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.430899  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7122  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  33.87 
 
 		 219 aa  55.8  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4954  pyrophosphatase PpaX  22.13 
 
 		 215 aa  55.5  0.0000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2984  pyrophosphatase PpaX  24.15 
 
 		 215 aa  55.5  0.0000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.417941  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15750  phosphoglycolate phosphatase  28.06 
 
 		 223 aa  55.1  0.0000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5010  pyrophosphatase PpaX  21.61 
 
 		 216 aa  54.7  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5390  pyrophosphatase PpaX  21.61 
 
 		 216 aa  54.7  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3421  phosphonoacetaldehyde hydrolase  26.82 
 
 		 274 aa  55.1  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3378  2-deoxyglucose-6-phosphatase  23.73 
 
 		 225 aa  54.7  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1217  phosphonoacetaldehyde hydrolase  25.35 
 
 		 264 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0490  phosphoglycolate phosphatase  28.57 
 
 		 224 aa  53.9  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155705  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3168  pyrophosphatase PpaX  24.89 
 
 		 222 aa  53.9  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12262  hypothetical protein  28.27 
 
 		 291 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5677  pyrophosphatase PpaX  22.36 
 
 		 216 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3704  pyrophosphatase PpaX  20.76 
 
 		 212 aa  53.9  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1741  phosphoglycolate phosphatase  27.41 
 
 		 223 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3651  phosphoglycolate phosphatase  27.72 
 
 		 223 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2060  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.31 
 
 		 225 aa  53.5  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.750609  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1371  phosphoglycolate phosphatase  27.14 
 
 		 223 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2908  phosphoglycolate phosphatase  26.9 
 
 		 242 aa  53.5  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1957  phosphoglycolate phosphatase  26.4 
 
 		 223 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5280  pyrophosphatase PpaX  22.36 
 
 		 216 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2290  HAD family hydrolase  28.05 
 
 		 223 aa  53.1  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.783453  normal  0.134252 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14830  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  30.95 
 
 		 219 aa  53.1  0.000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.187107 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0925  phosphoglycolate phosphatase  27.67 
 
 		 224 aa  52.8  0.000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3967  phosphonoacetaldehyde hydrolase  23.96 
 
 		 264 aa  52.8  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0595  HAD family hydrolase  23.93 
 
 		 215 aa  52.8  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0609  HAD family hydrolase  23.93 
 
 		 215 aa  52.8  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1907  HAD superfamily hydrolase  31.09 
 
 		 224 aa  52.4  0.000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000027861 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3547  phosphoglycolate phosphatase  29.17 
 
 		 238 aa  52.4  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4445  phosphoglycolate phosphatase  27.87 
 
 		 234 aa  52.4  0.000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0670358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1483  HAD family hydrolase  31.09 
 
 		 224 aa  52.4  0.000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0762089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2889  HAD family hydrolase  25.53 
 
 		 228 aa  52.4  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.119829  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1215  phosphonoacetaldehyde hydrolase  24.88 
 
 		 264 aa  52.4  0.000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4164  HAD family hydrolase  30.25 
 
 		 193 aa  52.4  0.000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0540485  normal  0.889807 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1340  phosphonoacetaldehyde hydrolase  24.88 
 
 		 264 aa  52.4  0.000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0462  2-phosphoglycolate phosphatase  27.23 
 
 		 238 aa  52.4  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>