More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR0287 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR0287  HAD superfamily hydrolase  100 
 
 
249 aa  498  1e-140  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.727823  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0302  HAD superfamily hydrolase  100 
 
 
249 aa  498  1e-140  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.795024  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0371  HAD family hydrolase  83.9 
 
 
242 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0425  HAD family hydrolase  36.05 
 
 
233 aa  148  9e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.523755  normal  0.669052 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0533  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  36.29 
 
 
240 aa  142  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.454785  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2818  HAD-like hydrolase  40.71 
 
 
240 aa  139  3.9999999999999997e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.564979 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2676  HAD family hydrolase  37.5 
 
 
242 aa  136  3.0000000000000003e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.80155 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0489  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  35.37 
 
 
240 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.193377  normal  0.0160234 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0898  phosphatase  35.59 
 
 
246 aa  132  5e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.214916  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3129  HAD family hydrolase  36.32 
 
 
235 aa  129  3e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.27329 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2336  HAD family hydrolase  38.67 
 
 
231 aa  122  6e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.509915  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2067  HAD family hydrolase  40 
 
 
230 aa  119  6e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0859939  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0412  putative phosphatase  40 
 
 
230 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2473  hydrolase  36.21 
 
 
278 aa  114  1.0000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0460809 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2172  HAD family hydrolase  36.09 
 
 
230 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0199  HAD superfamily hydrolase  29.91 
 
 
231 aa  108  1e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0592  HAD family hydrolase  30.84 
 
 
227 aa  107  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0578  HAD family hydrolase  30.84 
 
 
227 aa  107  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.297181  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0302  HAD family hydrolase  31.49 
 
 
248 aa  104  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0304  HAD family hydrolase  32.48 
 
 
248 aa  104  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4950  haloacid dehalogenase/epoxide hydrolase family protein  32.2 
 
 
248 aa  99.8  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0398  haloacid dehalogenase/epoxide hydrolase family protein  31.4 
 
 
248 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0353  haloacid dehalogenase/epoxide hydrolase family protein  32.47 
 
 
247 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0370  haloacid dehalogenase/epoxide hydrolase family protein  32.2 
 
 
247 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0292  haloacid dehalogenase-like hydrolase  31.17 
 
 
247 aa  91.7  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0309  haloacid dehalogenase/epoxide hydrolase family protein  31.17 
 
 
247 aa  90.9  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0324  haloacid dehalogenase/epoxide hydrolase family protein  31.17 
 
 
247 aa  90.9  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0356  haloacid dehalogenase/epoxide hydrolase family protein  31.17 
 
 
247 aa  90.5  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0296  haloacid dehalogenase-like hydrolase  29.63 
 
 
247 aa  89.7  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3854  phosphoglycolate phosphatase  30.71 
 
 
252 aa  90.1  3e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00525883  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03237  phosphoglycolate phosphatase  30.31 
 
 
252 aa  88.6  9e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0328  phosphoglycolate phosphatase  30.31 
 
 
252 aa  88.6  9e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03189  hypothetical protein  30.31 
 
 
252 aa  88.6  9e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3661  phosphoglycolate phosphatase  30.31 
 
 
252 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.29844  normal  0.025681 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3762  phosphoglycolate phosphatase  30.31 
 
 
252 aa  88.2  1e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.40481  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3581  phosphoglycolate phosphatase  30.43 
 
 
252 aa  87.8  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.284383  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0328  phosphoglycolate phosphatase  30.43 
 
 
252 aa  87.8  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.372389  normal  0.201922 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4689  phosphoglycolate phosphatase  30.43 
 
 
252 aa  87.8  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.663349  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2152  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.82 
 
 
225 aa  85.9  6e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2797  hydrolase  28.51 
 
 
235 aa  85.1  9e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.392797  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3681  phosphoglycolate phosphatase  30.08 
 
 
252 aa  82  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.123155  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3788  phosphoglycolate phosphatase  30.08 
 
 
252 aa  81.6  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3679  phosphoglycolate phosphatase  30.08 
 
 
252 aa  81.6  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.966867  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3850  phosphoglycolate phosphatase  30.08 
 
 
252 aa  81.6  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3754  phosphoglycolate phosphatase  30.08 
 
 
252 aa  81.6  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4954  pyrophosphatase PpaX  29.06 
 
 
215 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2984  pyrophosphatase PpaX  28.57 
 
 
215 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.417941  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2060  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.81 
 
 
225 aa  80.1  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.750609  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3168  pyrophosphatase PpaX  28.39 
 
 
222 aa  79.7  0.00000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1040  HAD family hydrolase  27.88 
 
 
226 aa  79.3  0.00000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000171478  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1780  HAD family hydrolase  28.95 
 
 
225 aa  79  0.00000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.587654  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10830  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  29.57 
 
 
296 aa  78.2  0.0000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0176  phosphoglycolate phosphatase  36.72 
 
 
224 aa  77.4  0.0000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.790253  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5246  pyrophosphatase PpaX  26.92 
 
 
216 aa  77  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1573  phosphoglycolate phosphatase  33.68 
 
 
229 aa  75.5  0.0000000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1630  phosphoglycolate phosphatase  33.68 
 
 
224 aa  75.5  0.0000000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0265  phosphoglycolate phosphatase  35.17 
 
 
232 aa  75.5  0.0000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.210779  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5322  pyrophosphatase PpaX  29.31 
 
 
216 aa  75.5  0.0000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5265  pyrophosphatase PpaX  26.5 
 
 
216 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4839  pyrophosphatase PpaX  26.5 
 
 
216 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4854  pyrophosphatase PpaX  26.5 
 
 
216 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0525  HAD family hydrolase  27.9 
 
 
209 aa  75.1  0.000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00124351  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0343  phosphoglycolate phosphatase  29.92 
 
 
233 aa  75.1  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1957  phosphoglycolate phosphatase  28.22 
 
 
223 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1874  HAD family hydrolase  30.47 
 
 
216 aa  73.2  0.000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.785736  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5280  pyrophosphatase PpaX  29 
 
 
216 aa  73.2  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5677  pyrophosphatase PpaX  29 
 
 
216 aa  73.2  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5010  pyrophosphatase PpaX  26.07 
 
 
216 aa  73.2  0.000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5390  pyrophosphatase PpaX  26.07 
 
 
216 aa  73.2  0.000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2363  phosphoglycolate phosphatase  36.29 
 
 
227 aa  72.4  0.000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.496506  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2481  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.52 
 
 
207 aa  72.4  0.000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23210  phosphoglycolate phosphatase  27.72 
 
 
226 aa  72  0.000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0343323  hitchhiker  0.00416895 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2370  phosphoglycolate phosphatase  31.78 
 
 
227 aa  72  0.000000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3798  phosphoglycolate phosphatase  29.83 
 
 
253 aa  72  0.000000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0419361 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3704  pyrophosphatase PpaX  28.02 
 
 
212 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0265  phosphoglycolate phosphatase  27.51 
 
 
227 aa  70.5  0.00000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1190  hypothetical protein  31.31 
 
 
228 aa  70.1  0.00000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.619731  normal  0.0510932 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0261  phosphoglycolate phosphatase  27.04 
 
 
226 aa  69.7  0.00000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0440  phosphoglycolate phosphatase  34.51 
 
 
235 aa  69.7  0.00000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.433387 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1844  phosphoglycolate phosphatase  32.84 
 
 
223 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0203973  normal  0.771348 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15750  phosphoglycolate phosphatase  31.03 
 
 
223 aa  69.7  0.00000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08650  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  45.05 
 
 
261 aa  69.7  0.00000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0269  haloacid dehalogenase, IA family protein  30.61 
 
 
217 aa  68.9  0.00000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2290  HAD family hydrolase  32.32 
 
 
223 aa  68.2  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.783453  normal  0.134252 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3611  phosphoglycolate phosphatase  27.57 
 
 
262 aa  68.2  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00378  phosphoglycolate phosphatase  32.08 
 
 
250 aa  68.6  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.590108  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0260  haloacid dehalogenase, IA family protein  30.61 
 
 
217 aa  68.2  0.0000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14830  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  27.73 
 
 
219 aa  68.2  0.0000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.187107 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1267  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  40.68 
 
 
221 aa  67.8  0.0000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.090781  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0118  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.25 
 
 
232 aa  67  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4761  HAD superfamily hydrolase  41.82 
 
 
196 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0000261111  hitchhiker  0.00232434 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0422  HAD family hydrolase  23.81 
 
 
217 aa  67.4  0.0000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3457  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  38.33 
 
 
210 aa  67.4  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0659  HAD family hydrolase  42.24 
 
 
196 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0468832  normal  0.394115 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0571  phosphoglycolate phosphatase  37.27 
 
 
242 aa  67.4  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4635  HAD family hydrolase  41.82 
 
 
196 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.262111  hitchhiker  0.00233323 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3898  phosphoglycolate phosphatase  38.89 
 
 
221 aa  67.8  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.67393 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4600  phosphoglycolate phosphatase  34 
 
 
232 aa  67  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.383007  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3737  haloacid dehalogenase-like hydrolase  28.79 
 
 
254 aa  66.6  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1661  AHBA synthesis associated protein  39.8 
 
 
214 aa  66.2  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.49792 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>