More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_3479 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_3479  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  100 
 
 		 249 aa  515  1.0000000000000001e-145  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.498075 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1857  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  70.69 
 
 		 245 aa  336  1.9999999999999998e-91  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1831  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  70.69 
 
 		 245 aa  336  1.9999999999999998e-91  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4110  HAD superfamily hydrolase  56.91 
 
 		 244 aa  291  5e-78  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.74944  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1504  HAD family hydrolase  57.89 
 
 		 249 aa  290  2e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000137172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4662  HAD family hydrolase  60.82 
 
 		 244 aa  277  1e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00548431  decreased coverage  0.00277532 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4131  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  49.39 
 
 		 245 aa  222  6e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000103032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0693  hypothetical protein  40.51 
 
 		 277 aa  152  7e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0116398  normal  0.589418 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0467  HAD family hydrolase  33.2 
 
 		 257 aa  131  9e-30  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1868  hypothetical protein  29.96 
 
 		 257 aa  123  3e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04011  HAD family hydrolase  27.52 
 
 		 262 aa  121  9e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.502053  normal  0.216164 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1688  HAD family hydrolase  27.13 
 
 		 262 aa  120  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22171  haloacid dehalogenase/epoxide hydrolase family protein  29.46 
 
 		 270 aa  105  6e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03461  phosphatase  29.12 
 
 		 258 aa  104  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13001  phosphatase  29.57 
 
 		 253 aa  81.3  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.221513  normal  0.158564 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0734  HAD family hydrolase  31.54 
 
 		 241 aa  73.6  0.000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.879574  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1002  HAD superfamily hydrolase  28.9 
 
 		 221 aa  73.2  0.000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0968  HAD superfamily hydrolase  28.9 
 
 		 221 aa  73.2  0.000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1313  HAD family hydrolase  29.68 
 
 		 232 aa  70.5  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.95229 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4762  HAD family hydrolase  28.67 
 
 		 242 aa  70.5  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.698376  hitchhiker  0.00269567 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0571  phosphoglycolate phosphatase  31.58 
 
 		 242 aa  68.9  0.00000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1987  HAD family hydrolase  28.57 
 
 		 215 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0143235  normal  0.0109237 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0425  HAD family hydrolase  26.34 
 
 		 233 aa  67.8  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.523755  normal  0.669052 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14840  HAD-superfamily hydrolase  27.01 
 
 		 220 aa  67  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.770171  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0323  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.05 
 
 		 233 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0341719 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0356  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.88 
 
 		 233 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0199  HAD superfamily hydrolase  24.58 
 
 		 231 aa  66.6  0.0000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0280  HAD family hydrolase  29.05 
 
 		 233 aa  67  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0592  HAD family hydrolase  23.56 
 
 		 227 aa  65.9  0.0000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0578  HAD family hydrolase  23.56 
 
 		 227 aa  65.9  0.0000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.297181  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2097  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.29 
 
 		 221 aa  65.5  0.0000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.284323  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1640  HAD family hydrolase  30.77 
 
 		 220 aa  65.5  0.0000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.284861 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2363  phosphoglycolate phosphatase  30.29 
 
 		 227 aa  65.5  0.0000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.496506  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2291  HAD family hydrolase  29.46 
 
 		 218 aa  64.7  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.265516  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2434  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  35.85 
 
 		 218 aa  63.9  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.282448  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3839  HAD-superfamily hydrolase  29.06 
 
 		 220 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0865807  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2658  haloacid dehalogenase-like hydrolase  36.22 
 
 		 236 aa  64.3  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4462  phosphoglycolate phosphatase  30.88 
 
 		 250 aa  63.9  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0489  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.64 
 
 		 240 aa  63.9  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.193377  normal  0.0160234 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0937  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  37.93 
 
 		 219 aa  63.5  0.000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.171636 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2565  HAD family hydrolase  25.74 
 
 		 244 aa  63.2  0.000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000244874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2100  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.55 
 
 		 215 aa  62.8  0.000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2403  HAD family hydrolase  27.43 
 
 		 248 aa  62.8  0.000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000854479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0302  HAD family hydrolase  22.94 
 
 		 248 aa  62.4  0.000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0625  HAD family hydrolase  34.33 
 
 		 221 aa  62.4  0.000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0533  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.05 
 
 		 240 aa  62.4  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.454785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0854  HAD family hydrolase  25.48 
 
 		 221 aa  62.4  0.000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.249022  decreased coverage  0.000200034 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1595  HAD family hydrolase  29.03 
 
 		 219 aa  61.2  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00389314  normal  0.0112895 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0743  phosphoglycolate phosphatase  28.7 
 
 		 225 aa  61.6  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0292  HAD family hydrolase  33.09 
 
 		 222 aa  62  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.402537  normal  0.982934 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3656  phosphoglycolate phosphatase  26.92 
 
 		 234 aa  61.6  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.755729 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2205  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  34.65 
 
 		 228 aa  61.2  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.322675  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2473  HAD family hydrolase  27.31 
 
 		 248 aa  60.8  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000591891  hitchhiker  0.00615598 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25590  putative hydrolase  30 
 
 		 230 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.080664  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0898  phosphatase  27.27 
 
 		 246 aa  60.1  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.214916  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0659  HAD family hydrolase  35.05 
 
 		 196 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0468832  normal  0.394115 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1323  HAD family hydrolase  28.83 
 
 		 218 aa  60.1  0.00000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00010916  normal  0.934661 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1068  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.59 
 
 		 219 aa  60.1  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00420484  normal  0.997021 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0581  putative phosphoglycolate phosphatase protein  27.49 
 
 		 233 aa  59.7  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1018  HAD family hydrolase  29.09 
 
 		 221 aa  59.7  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.76802 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2711  HAD family hydrolase  29.6 
 
 		 230 aa  59.7  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3611  phosphoglycolate phosphatase  30.66 
 
 		 262 aa  59.7  0.00000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2878  phosphoglycolate phosphatase  29.71 
 
 		 226 aa  59.7  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3103  HAD family hydrolase  26.84 
 
 		 562 aa  59.7  0.00000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2172  HAD family hydrolase  24.89 
 
 		 230 aa  59.3  0.00000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4164  HAD family hydrolase  30.77 
 
 		 193 aa  58.9  0.00000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0540485  normal  0.889807 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3898  phosphoglycolate phosphatase  25.21 
 
 		 221 aa  59.3  0.00000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.67393 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4950  haloacid dehalogenase/epoxide hydrolase family protein  25.23 
 
 		 248 aa  58.9  0.00000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2240  HAD family hydrolase  26.85 
 
 		 214 aa  58.9  0.00000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.279618  normal  0.937061 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2290  HAD family hydrolase  25.18 
 
 		 223 aa  58.9  0.00000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.783453  normal  0.134252 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1722  HAD family hydrolase  26.89 
 
 		 228 aa  58.9  0.00000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2502  HAD family hydrolase  29.6 
 
 		 200 aa  58.9  0.00000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.396303  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0590  HAD family hydrolase  34.38 
 
 		 219 aa  58.9  0.00000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0419315 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1621  HAD family hydrolase  31.82 
 
 		 231 aa  58.5  0.00000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0638141  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10830  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  25.23 
 
 		 296 aa  58.2  0.0000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2112  HAD family hydrolase  30.2 
 
 		 239 aa  58.2  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0820  HAD family hydrolase  30.41 
 
 		 219 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.362734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7122  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.9 
 
 		 219 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1907  HAD superfamily hydrolase  28.85 
 
 		 224 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000027861 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20950  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  30.89 
 
 		 216 aa  57.8  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3807  HAD family hydrolase  28.85 
 
 		 224 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.118188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3129  HAD family hydrolase  29.41 
 
 		 235 aa  57.8  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.27329 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2697  phosphoglycolate phosphatase  28.95 
 
 		 240 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1355  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.69 
 
 		 228 aa  57.4  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.873579  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2085  HAD family hydrolase  26.92 
 
 		 223 aa  57.4  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2632  HAD family hydrolase  28.23 
 
 		 216 aa  57.8  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.861911  hitchhiker  0.000131082 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3996  phosphoglycolate phosphatase  28 
 
 		 225 aa  56.6  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12643  Predicted phosphatase  24.07 
 
 		 216 aa  57  0.0000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.128583  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3854  phosphoglycolate phosphatase  22.67 
 
 		 252 aa  57  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00525883  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3950  phosphoglycolate phosphatase  26.87 
 
 		 223 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00428214  normal  0.0156244 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1483  HAD family hydrolase  28.85 
 
 		 224 aa  57  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0762089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4106  phosphoglycolate phosphatase  28 
 
 		 225 aa  56.6  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0658  haloacid dehalogenase-like hydrolase  26.29 
 
 		 222 aa  56.2  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.40238 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1517  HAD family hydrolase  29.41 
 
 		 272 aa  56.6  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00550293  decreased coverage  0.0000688846 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2206  HAD family hydrolase  23.91 
 
 		 227 aa  56.6  0.0000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0834963  normal  0.088242 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3114  HAD family hydrolase  28.37 
 
 		 216 aa  56.2  0.0000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3581  phosphoglycolate phosphatase  22.67 
 
 		 252 aa  56.2  0.0000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.284383  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2262  hydrolase  25.24 
 
 		 223 aa  55.8  0.0000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2797  hydrolase  24.26 
 
 		 235 aa  56.2  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.392797  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3661  phosphoglycolate phosphatase  22.67 
 
 		 252 aa  56.2  0.0000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.29844  normal  0.025681 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>