More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1190 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_1190  hypothetical protein  100 
 
 
228 aa  470  1e-132  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.619731  normal  0.0510932 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0033  HAD family hydrolase  41.54 
 
 
221 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1175  HAD family hydrolase  38.16 
 
 
241 aa  159  4e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.542362  normal  0.617727 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2894  phosphoglycolate phosphatase  42.57 
 
 
243 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.225583 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0992  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  40.19 
 
 
235 aa  142  4e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0708331 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1535  HAD family hydrolase  40.98 
 
 
213 aa  139  3e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00037807  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2874  HAD family hydrolase  34.55 
 
 
231 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.5302  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0472  HAD family hydrolase  34.04 
 
 
261 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.523945  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0264  hypothetical protein  29.22 
 
 
211 aa  102  4e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.247484 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0482  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  37.7 
 
 
215 aa  94.7  1e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1773  HAD family hydrolase  32.65 
 
 
227 aa  81.3  0.00000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1151  HAD family hydrolase  31.58 
 
 
219 aa  80.5  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.205266  hitchhiker  0.00490249 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2697  phosphoglycolate phosphatase  31.47 
 
 
240 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1179  HAD family hydrolase  27.98 
 
 
231 aa  80.1  0.00000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.269982  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0250  HAD family hydrolase  29.7 
 
 
225 aa  79.7  0.00000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1573  phosphoglycolate phosphatase  28.78 
 
 
229 aa  79.3  0.00000000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14830  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  32.63 
 
 
219 aa  78.6  0.00000000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.187107 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1463  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.89 
 
 
228 aa  77  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0497866  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0525  HAD family hydrolase  31.77 
 
 
209 aa  76.6  0.0000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00124351  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0754  haloacid dehalogenase-like hydrolase  26.85 
 
 
223 aa  76.6  0.0000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.531988 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2251  phosphoglycolate phosphatase  29.44 
 
 
229 aa  75.9  0.0000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0265  phosphoglycolate phosphatase  29.41 
 
 
232 aa  75.9  0.0000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.210779  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2859  phosphoglycolate phosphatase  32.16 
 
 
256 aa  75.5  0.0000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.430899  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1529  putative 2-phosphoglycolate phosphatase  30.35 
 
 
234 aa  75.1  0.0000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1630  phosphoglycolate phosphatase  28.29 
 
 
224 aa  75.1  0.0000000000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3992  HAD family hydrolase  29.26 
 
 
220 aa  74.7  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000540909 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3495  phosphoglycolate phosphatase  29.08 
 
 
238 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0294223  hitchhiker  0.0000911523 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3752  HAD family hydrolase  38.17 
 
 
237 aa  73.6  0.000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0186  HAD family hydrolase  27.46 
 
 
225 aa  72.8  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2742  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  27.27 
 
 
300 aa  72.8  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0642685  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0431  3-amino-5-hydroxybenoic acid synthesis related  29.86 
 
 
263 aa  72.4  0.000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2908  phosphoglycolate phosphatase  31.71 
 
 
242 aa  72.4  0.000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0649  HAD family hydrolase  26.67 
 
 
239 aa  72  0.000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0203  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.69 
 
 
228 aa  72  0.000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.423986  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0634  HAD family hydrolase  26.67 
 
 
239 aa  72  0.000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.828667  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3482  phosphoglycolate phosphatase  28.72 
 
 
226 aa  71.6  0.000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.824519  normal  0.190106 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2648  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  27.27 
 
 
300 aa  71.2  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.364708  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10830  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  27.19 
 
 
296 aa  70.9  0.00000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0462  2-phosphoglycolate phosphatase  28.57 
 
 
238 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14061  hypothetical protein  24.64 
 
 
248 aa  70.9  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.180582  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0343  phosphoglycolate phosphatase  30.14 
 
 
233 aa  71.2  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0268  HAD superfamily hydrolase  35.42 
 
 
242 aa  70.5  0.00000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.54938  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3114  HAD family hydrolase  28 
 
 
216 aa  70.5  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1388  haloacid dehalogenase  27.01 
 
 
234 aa  70.9  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0371  HAD family hydrolase  28.79 
 
 
242 aa  70.9  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0464  phosphoglycolate phosphatase  31.03 
 
 
251 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.992467  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3555  phosphoglycolate phosphatase  29.95 
 
 
245 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.221388  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0287  HAD superfamily hydrolase  31.31 
 
 
249 aa  70.1  0.00000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.727823  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0302  HAD superfamily hydrolase  31.31 
 
 
249 aa  70.1  0.00000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.795024  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0760  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.77 
 
 
220 aa  70.1  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.133542 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3582  phosphoglycolate phosphatase  29.95 
 
 
245 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0507  phosphoglycolate phosphatase  30.81 
 
 
254 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.263743  normal  0.890695 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2570  phosphoglycolate phosphatase  30.81 
 
 
254 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0909  phosphoglycolate phosphatase  29.33 
 
 
222 aa  69.7  0.00000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0440  phosphoglycolate phosphatase  30.81 
 
 
251 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.122838  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0535  phosphoglycolate phosphatase  30.81 
 
 
254 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0122  haloacid dehalogenase-like hydrolase  29.91 
 
 
236 aa  69.3  0.00000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.817509  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0589  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.34 
 
 
224 aa  68.9  0.00000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1716  HAD family hydrolase  26.94 
 
 
225 aa  69.3  0.00000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.204588  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0710  phosphoglycolate phosphatase  31.44 
 
 
218 aa  69.3  0.00000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.113573  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0746  HAD family hydrolase  26.94 
 
 
225 aa  69.3  0.00000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0639  HAD family hydrolase  32.07 
 
 
239 aa  69.3  0.00000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0512419 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4445  phosphoglycolate phosphatase  32.02 
 
 
234 aa  68.9  0.00000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0670358  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2581  phosphoglycolate phosphatase  33.33 
 
 
221 aa  68.9  0.00000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2493  phosphoglycolate phosphatase  28.69 
 
 
225 aa  68.9  0.00000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0704  haloacid dehalogenase-like hydrolase  35.87 
 
 
231 aa  68.9  0.00000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.463246  normal  0.864545 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00378  phosphoglycolate phosphatase  27.36 
 
 
250 aa  68.6  0.00000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.590108  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1508  phosphoglycolate phosphatase  29.81 
 
 
228 aa  68.6  0.00000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.313556  normal  0.0200123 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2739  phosphoglycolate phosphatase  28.88 
 
 
231 aa  68.2  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0534  phosphoglycolate phosphatase  31.1 
 
 
242 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0250125  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28840  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  33.33 
 
 
583 aa  67.8  0.0000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.107829  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3574  phosphoglycolate phosphatase  31.1 
 
 
242 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.952116  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4055  phosphoglycolate phosphatase  28.02 
 
 
234 aa  68.2  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0278697  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0643  phosphoglycolate phosphatase  31.1 
 
 
242 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0131  HAD family hydrolase  30.51 
 
 
236 aa  68.2  0.0000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0939  phosphoglycolate phosphatase  31.1 
 
 
242 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1909  phosphoglycolate phosphatase  31.1 
 
 
242 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001976  2-haloalkanoic acid dehalogenase  28.79 
 
 
241 aa  67.8  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000579937  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1092  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.87 
 
 
212 aa  67.4  0.0000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0064  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.43 
 
 
250 aa  67.4  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2083  phosphoglycolate phosphatase  29.44 
 
 
226 aa  67  0.0000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.609164  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3012  phosphoglycolate phosphatase  35.07 
 
 
237 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0258131  normal  0.0275568 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5119  phosphoglycolate phosphatase  27.78 
 
 
272 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3622  2-phosphoglycolate phosphatase  30.3 
 
 
254 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0971  2-phosphoglycolate phosphatase  39.42 
 
 
237 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.080581  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1203  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.5 
 
 
241 aa  67  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.481265  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1483  phosphoglycolate phosphatase  29.69 
 
 
231 aa  67  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.539513 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1218  haloacid dehalogenase-like hydrolase  26.84 
 
 
312 aa  66.2  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00165186  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2324  phosphoglycolate phosphatase  29.41 
 
 
223 aa  66.6  0.0000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.289687  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2227  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA  34.51 
 
 
208 aa  66.6  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.672436  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1882  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  34.51 
 
 
248 aa  66.6  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0746136  normal  0.527503 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1783  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.6 
 
 
222 aa  67  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5953  phosphoglycolate phosphatase  27.44 
 
 
257 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0174691 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1399  phosphoglycolate phosphatase  37.04 
 
 
225 aa  66.2  0.0000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2461  phosphoglycolate phosphatase  36.3 
 
 
225 aa  66.2  0.0000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.768725 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2007  HAD family hydrolase  32.54 
 
 
222 aa  65.9  0.0000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1476  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.22 
 
 
254 aa  65.9  0.0000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0021  HAD family hydrolase  31.47 
 
 
233 aa  65.9  0.0000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.191967  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0897  hydrolase protein  32.64 
 
 
229 aa  65.9  0.0000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00554563  normal  0.72661 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3854  phosphoglycolate phosphatase  27.62 
 
 
252 aa  65.5  0.0000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00525883  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>