More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_1203 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_1203  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  100 
 
 
241 aa  472  1e-132  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.481265  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1566  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  55.74 
 
 
263 aa  235  4e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11020  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  54.96 
 
 
274 aa  226  2e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1687  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  53.19 
 
 
248 aa  214  8e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0106556 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2362  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  53.91 
 
 
276 aa  211  5.999999999999999e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2525  HAD family hydrolase  40.27 
 
 
245 aa  129  5.0000000000000004e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0221998  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2262  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  39.61 
 
 
248 aa  125  6e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000545934 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2828  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  37.2 
 
 
231 aa  114  1.0000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.688481 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2297  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  36.19 
 
 
268 aa  107  2e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4215  HAD family hydrolase  35.86 
 
 
226 aa  107  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.842339 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3180  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  35.8 
 
 
236 aa  106  3e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.177133  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09020  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  34.05 
 
 
234 aa  105  8e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.532277  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1679  HAD family hydrolase  32.47 
 
 
245 aa  103  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1951  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.58 
 
 
244 aa  103  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.305812  hitchhiker  0.0035955 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08650  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  37.89 
 
 
261 aa  102  7e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0557  haloacid dehalogenase-like hydrolase family protein  24.69 
 
 
235 aa  100  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.262309  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6008  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.76 
 
 
227 aa  99.4  5e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1476  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  33.33 
 
 
259 aa  94  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.644028  normal  0.407764 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3623  HAD superfamily hydrolase  25.33 
 
 
225 aa  91.7  9e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.95626  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0736  HAD superfamily hydrolase  26.25 
 
 
300 aa  86.3  5e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3930  hydrolase, HAD superfamily  25 
 
 
207 aa  82.8  0.000000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00240  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  23.47 
 
 
237 aa  81.6  0.000000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0751  HAD superfamily hydrolase  25.7 
 
 
300 aa  80.9  0.00000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2494  HAD superfamily hydrolase  23.71 
 
 
231 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000287122  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0203  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.67 
 
 
228 aa  76.6  0.0000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.423986  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3898  phosphoglycolate phosphatase  32.27 
 
 
221 aa  76.3  0.0000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.67393 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2747  HAD superfamily hydrolase  24.06 
 
 
230 aa  75.9  0.0000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00479401  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2534  HAD superfamily hydrolase  24.03 
 
 
231 aa  75.5  0.0000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0986265  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2581  phosphoglycolate phosphatase  33.82 
 
 
221 aa  74.7  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2458  HAD superfamily hydrolase  22.69 
 
 
231 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.536577  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2720  HAD superfamily hydrolase  26.57 
 
 
230 aa  73.2  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2564  2-haloalkanoic acid dehalogenase  27.97 
 
 
255 aa  72.8  0.000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00980265 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2782  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  24.58 
 
 
230 aa  72  0.000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.195747  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1784  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.2 
 
 
242 aa  71.6  0.00000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.899574  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0634  HAD family hydrolase  29.73 
 
 
239 aa  70.5  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.828667  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0649  HAD family hydrolase  29.73 
 
 
239 aa  70.5  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0262  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  35.29 
 
 
239 aa  69.7  0.00000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.381468 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1388  haloacid dehalogenase  27.38 
 
 
234 aa  70.1  0.00000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1190  hypothetical protein  28.5 
 
 
228 aa  69.3  0.00000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.619731  normal  0.0510932 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2426  HAD family hydrolase  21.85 
 
 
225 aa  69.3  0.00000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0509966  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2859  phosphoglycolate phosphatase  29.7 
 
 
256 aa  68.9  0.00000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.430899  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1705  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.98 
 
 
260 aa  68.9  0.00000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.495652  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0265  phosphoglycolate phosphatase  28.43 
 
 
227 aa  68.2  0.0000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2999  HAD family hydrolase  32.86 
 
 
259 aa  68.2  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.42477 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0509  HAD family hydrolase  26.76 
 
 
234 aa  67.4  0.0000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2564  HAD family hydrolase  30.66 
 
 
231 aa  66.6  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0054388 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0809  HAD family hydrolase  30.84 
 
 
218 aa  66.6  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3611  phosphoglycolate phosphatase  28.44 
 
 
262 aa  66.6  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2785  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.63 
 
 
235 aa  66.6  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0021  HAD family hydrolase  31.85 
 
 
233 aa  67  0.0000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.191967  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0285  nucleotidase  30.84 
 
 
229 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0440  phosphoglycolate phosphatase  31.05 
 
 
235 aa  66.6  0.0000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.433387 
 
 
-
 
NC_002936  DET0533  HAD family hydrolase  26.07 
 
 
234 aa  66.2  0.0000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.298334  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3811  haloacid dehalogenase, type II  30.2 
 
 
226 aa  66.6  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.277165  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0571  phosphoglycolate phosphatase  30.81 
 
 
242 aa  66.2  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0033  HAD family hydrolase  25.25 
 
 
221 aa  66.2  0.0000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2295  putative phosphoglycolate phosphatase  31.45 
 
 
234 aa  65.9  0.0000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.768888 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23210  phosphoglycolate phosphatase  30 
 
 
226 aa  65.9  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0343323  hitchhiker  0.00416895 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2972  HAD family hydrolase  29.49 
 
 
231 aa  65.5  0.0000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0648694 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3656  phosphoglycolate phosphatase  31.66 
 
 
234 aa  65.5  0.0000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.755729 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3955  haloacid dehalogenase, type II  35.04 
 
 
226 aa  65.5  0.0000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3868  haloacid dehalogenase, type II  35.04 
 
 
226 aa  65.5  0.0000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1070  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.37 
 
 
227 aa  65.5  0.0000000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0064  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.43 
 
 
250 aa  64.7  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47740  haloacid dehalogenase-like hydrolase protein  29.75 
 
 
233 aa  64.7  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.127906  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1147  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.3 
 
 
223 aa  64.7  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.29444  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2363  phosphoglycolate phosphatase  28.57 
 
 
227 aa  64.7  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.496506  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1773  HAD family hydrolase  29.44 
 
 
227 aa  64.7  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0332  hypothetical protein  21.15 
 
 
223 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0268  HAD superfamily hydrolase  28.69 
 
 
242 aa  64.3  0.000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.54938  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3651  phosphoglycolate phosphatase  28.64 
 
 
223 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1798  phosphoglycolate phosphatase  29.95 
 
 
221 aa  63.9  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0263592  unclonable  0.00000282508 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0264  hypothetical protein  26.4 
 
 
211 aa  63.9  0.000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.247484 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0464  phosphoglycolate phosphatase  29.29 
 
 
251 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.992467  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2787  phosphoglycolate phosphatase  31.46 
 
 
221 aa  63.9  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00496025  hitchhiker  0.0014162 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0704  haloacid dehalogenase-like hydrolase  25.35 
 
 
231 aa  63.9  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.463246  normal  0.864545 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2928  HAD family hydrolase  37.23 
 
 
230 aa  63.9  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.244628  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5502  HAD family hydrolase  28.4 
 
 
234 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.178539  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3622  2-phosphoglycolate phosphatase  28.78 
 
 
254 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15750  phosphoglycolate phosphatase  30.15 
 
 
223 aa  63.5  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4662  HAD family hydrolase  28.04 
 
 
244 aa  62.8  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00548431  decreased coverage  0.00277532 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0234  HAD family hydrolase  33.15 
 
 
225 aa  63.2  0.000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.961854 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0743  phosphoglycolate phosphatase  30.69 
 
 
225 aa  63.2  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02162  phosphoglycolate phosphatase  26.34 
 
 
225 aa  62.8  0.000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1957  phosphoglycolate phosphatase  29 
 
 
223 aa  62.8  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2746  HAD family hydrolase  28.97 
 
 
226 aa  62.8  0.000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.20923  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02868  hydrolase  35 
 
 
245 aa  62.4  0.000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0710  phosphoglycolate phosphatase  29.47 
 
 
218 aa  62.8  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.113573  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0446  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.82 
 
 
240 aa  62.8  0.000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4906  hypothetical protein  20.67 
 
 
223 aa  62.4  0.000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.792086  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4462  phosphoglycolate phosphatase  29.5 
 
 
250 aa  62  0.000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0440  phosphoglycolate phosphatase  28.22 
 
 
251 aa  62  0.000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.122838  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1179  HAD family hydrolase  24.3 
 
 
231 aa  61.2  0.00000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.269982  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3482  phosphoglycolate phosphatase  26.63 
 
 
226 aa  61.2  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.824519  normal  0.190106 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5456  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.8 
 
 
217 aa  61.6  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.474023  normal  0.179199 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5158  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.3 
 
 
222 aa  61.6  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0832547  normal  0.0266654 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2874  HAD family hydrolase  25.96 
 
 
231 aa  61.2  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.5302  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0779  nucleotidase  25.96 
 
 
228 aa  61.2  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.655006  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69720  putative hydrolase  33.87 
 
 
232 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.673064  normal  0.5613 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05480  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28 
 
 
221 aa  61.6  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.100764  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>