More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_11020 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_11020  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  100 
 
 
274 aa  540  1e-153  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1566  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  54.2 
 
 
263 aa  244  9e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1687  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  54.27 
 
 
248 aa  239  4e-62  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0106556 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1203  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  54.96 
 
 
241 aa  233  4.0000000000000004e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.481265  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2362  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  50.81 
 
 
276 aa  224  1e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2525  HAD family hydrolase  37.45 
 
 
245 aa  127  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0221998  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2262  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  35.55 
 
 
248 aa  115  6e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000545934 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2828  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  34.88 
 
 
231 aa  109  4.0000000000000004e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.688481 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4215  HAD family hydrolase  37.91 
 
 
226 aa  104  2e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.842339 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08650  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  36.87 
 
 
261 aa  102  6e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2297  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  35.62 
 
 
268 aa  102  8e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1679  HAD family hydrolase  29.61 
 
 
245 aa  100  3e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1951  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.65 
 
 
244 aa  99.8  5e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.305812  hitchhiker  0.0035955 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0557  haloacid dehalogenase-like hydrolase family protein  26.32 
 
 
235 aa  92.8  6e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.262309  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3623  HAD superfamily hydrolase  25.12 
 
 
225 aa  91.7  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.95626  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3180  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  34.65 
 
 
236 aa  89.7  5e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.177133  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1476  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.84 
 
 
259 aa  87.8  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.644028  normal  0.407764 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09020  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  31.82 
 
 
234 aa  84.7  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.532277  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3930  hydrolase, HAD superfamily  24.14 
 
 
207 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6008  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.31 
 
 
227 aa  77  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00240  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  23.5 
 
 
237 aa  76.6  0.0000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0736  HAD superfamily hydrolase  24.66 
 
 
300 aa  76.3  0.0000000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0262  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.26 
 
 
239 aa  75.5  0.0000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.381468 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3972  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  33.02 
 
 
220 aa  68.6  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0446  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.58 
 
 
240 aa  67.8  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0751  HAD superfamily hydrolase  23.58 
 
 
300 aa  67  0.0000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1476  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.94 
 
 
254 aa  67  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02868  hydrolase  32.57 
 
 
245 aa  67  0.0000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0363  phosphoglycolate phosphatase  30.15 
 
 
261 aa  66.2  0.0000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2725  HAD-superfamily hydrolase  30.68 
 
 
224 aa  65.9  0.0000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.305002  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2999  HAD family hydrolase  42 
 
 
259 aa  65.9  0.0000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.42477 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2493  hydrolase  32.1 
 
 
235 aa  65.1  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.668245 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0352  phosphoglycolate phosphatase  29.8 
 
 
241 aa  64.7  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0570615  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3992  HAD family hydrolase  27.36 
 
 
220 aa  63.5  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000540909 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3898  phosphoglycolate phosphatase  29.65 
 
 
221 aa  62.8  0.000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.67393 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2295  putative phosphoglycolate phosphatase  33 
 
 
234 aa  62.4  0.000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.768888 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2051  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  41.84 
 
 
230 aa  62  0.000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0164056  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0571  phosphoglycolate phosphatase  42.71 
 
 
242 aa  61.6  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2494  HAD superfamily hydrolase  24.04 
 
 
231 aa  60.8  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000287122  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0809  HAD family hydrolase  30.77 
 
 
218 aa  60.8  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0440  phosphoglycolate phosphatase  40.35 
 
 
235 aa  61.2  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.433387 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1653  HAD family hydrolase  40.82 
 
 
230 aa  60.5  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.144199  normal  0.146413 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1798  phosphoglycolate phosphatase  31.28 
 
 
221 aa  60.1  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0263592  unclonable  0.00000282508 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3116  HAD family hydrolase  28.9 
 
 
249 aa  59.7  0.00000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.553412  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1504  HAD family hydrolase  37.38 
 
 
249 aa  59.3  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000137172  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0332  hypothetical protein  24.15 
 
 
223 aa  59.7  0.00000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2747  HAD superfamily hydrolase  22.71 
 
 
230 aa  58.9  0.00000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00479401  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1784  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  20.64 
 
 
242 aa  58.9  0.00000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.899574  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1773  HAD family hydrolase  25.82 
 
 
227 aa  58.9  0.00000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03237  phosphoglycolate phosphatase  29.61 
 
 
252 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3581  phosphoglycolate phosphatase  29.61 
 
 
252 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.284383  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0328  phosphoglycolate phosphatase  29.61 
 
 
252 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0328  phosphoglycolate phosphatase  29.61 
 
 
252 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.372389  normal  0.201922 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4689  phosphoglycolate phosphatase  29.61 
 
 
252 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.663349  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3681  phosphoglycolate phosphatase  29.61 
 
 
252 aa  58.5  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.123155  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1783  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  21.51 
 
 
222 aa  58.2  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3788  phosphoglycolate phosphatase  29.61 
 
 
252 aa  58.5  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2564  2-haloalkanoic acid dehalogenase  31.76 
 
 
255 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00980265 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03189  hypothetical protein  29.61 
 
 
252 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2564  HAD family hydrolase  40 
 
 
231 aa  58.5  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0054388 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3850  phosphoglycolate phosphatase  29.61 
 
 
252 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3762  phosphoglycolate phosphatase  29.61 
 
 
252 aa  57.4  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.40481  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2501  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.46 
 
 
217 aa  57.8  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.077596  normal  0.373224 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0253  HAD family hydrolase  21.95 
 
 
234 aa  57.8  0.0000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.334079  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2426  HAD family hydrolase  22.73 
 
 
225 aa  57.4  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0509966  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3754  phosphoglycolate phosphatase  29.61 
 
 
252 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1151  HAD family hydrolase  24.8 
 
 
219 aa  57.4  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.205266  hitchhiker  0.00490249 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2534  HAD superfamily hydrolase  26.09 
 
 
231 aa  57  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0986265  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2229  phosphoglycolate phosphatase  33.64 
 
 
227 aa  57  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.40738  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2720  HAD superfamily hydrolase  26.09 
 
 
230 aa  57  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3854  phosphoglycolate phosphatase  29.61 
 
 
252 aa  57  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00525883  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0649  HAD family hydrolase  27.73 
 
 
239 aa  57  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0634  HAD family hydrolase  27.73 
 
 
239 aa  57  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.828667  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0720  HAD family hydrolase  37.39 
 
 
292 aa  56.6  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.070073 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3661  phosphoglycolate phosphatase  29.13 
 
 
252 aa  56.6  0.0000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.29844  normal  0.025681 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0779  nucleotidase  24.64 
 
 
228 aa  56.6  0.0000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.655006  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2894  phosphoglycolate phosphatase  28.18 
 
 
243 aa  56.2  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.225583 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2787  phosphoglycolate phosphatase  29.69 
 
 
221 aa  56.6  0.0000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00496025  hitchhiker  0.0014162 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0021  HAD family hydrolase  32.14 
 
 
233 aa  56.2  0.0000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.191967  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4069  HAD family hydrolase  22.22 
 
 
231 aa  55.8  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.256512  normal  0.511576 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2738  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  30.95 
 
 
230 aa  55.8  0.0000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2252  phosphoglycolate phosphatase  30.48 
 
 
233 aa  55.5  0.0000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.191906  normal  0.672709 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1705  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.75 
 
 
260 aa  55.8  0.0000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.495652  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4906  hypothetical protein  22.17 
 
 
223 aa  55.5  0.0000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.792086  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3022  phosphoglycolate phosphatase  28.51 
 
 
241 aa  55.5  0.0000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.116956  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3567  HAD family hydrolase  30.05 
 
 
240 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.210535  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3679  phosphoglycolate phosphatase  29.95 
 
 
252 aa  54.7  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.966867  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2701  phosphoglycolate phosphatase  36.69 
 
 
230 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.364651  normal  0.0856305 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0743  phosphoglycolate phosphatase  40.45 
 
 
225 aa  55.1  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47740  haloacid dehalogenase-like hydrolase protein  29.49 
 
 
233 aa  55.1  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.127906  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4880  nucleotidase  27.07 
 
 
225 aa  54.3  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00926428  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4973  nucleotidase  27.07 
 
 
225 aa  54.3  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.100904  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4812  nucleotidase  27.07 
 
 
225 aa  54.3  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.622374  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4539  HAD superfamily hydrolase  22.82 
 
 
224 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4915  nucleotidase  27.07 
 
 
225 aa  54.3  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.366204  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0533  nucleotidase  28.71 
 
 
225 aa  54.7  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.330887  normal  0.0227178 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4967  nucleotidase  27.07 
 
 
225 aa  54.3  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.081412  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2571  phosphoglycolate phosphatase  28.88 
 
 
233 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0542226 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23210  phosphoglycolate phosphatase  27.57 
 
 
226 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0343323  hitchhiker  0.00416895 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0046  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.17 
 
 
216 aa  53.9  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>