More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2501 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_2501  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  100 
 
 		 217 aa  420  1e-117  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.077596  normal  0.373224 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2575  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  56.28 
 
 		 197 aa  184  7e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0707  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  55.8 
 
 		 190 aa  183  2.0000000000000003e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2083  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  52.81 
 
 		 178 aa  154  9e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.946947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0190  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  45.65 
 
 		 178 aa  142  3e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.615275  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2080  phosphoglycolate phosphatase  31.44 
 
 		 237 aa  69.3  0.00000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.307061  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1907  HAD superfamily hydrolase  24.34 
 
 		 211 aa  63.2  0.000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2703  HAD family hydrolase  24.43 
 
 		 197 aa  62.8  0.000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.776642  normal  0.681898 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1089  phosphoglycolate phosphatase  33.33 
 
 		 227 aa  62  0.000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.396739  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2784  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.54 
 
 		 208 aa  62  0.000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2760  putative phosphoglycolate phosphatase  31.55 
 
 		 221 aa  61.6  0.000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0219607 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3547  phosphoglycolate phosphatase  36.13 
 
 		 238 aa  61.2  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00424  putative hydrolase/phosphatase protein  25.14 
 
 		 172 aa  60.8  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.465946  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1458  phosphoglycolate phosphatase  31.22 
 
 		 231 aa  61.2  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.677189  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1296  phosphoglycolate phosphatase  32 
 
 		 233 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0205291  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0954  phosphoglycolate phosphatase  32.49 
 
 		 233 aa  59.3  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0937  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.27 
 
 		 219 aa  58.9  0.00000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.171636 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2083  phosphoglycolate phosphatase  30.81 
 
 		 226 aa  58.5  0.00000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.609164  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0490  phosphoglycolate phosphatase  29.19 
 
 		 224 aa  58.5  0.00000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155705  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0925  phosphoglycolate phosphatase  30.81 
 
 		 224 aa  57.8  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5521  HAD family hydrolase  47.06 
 
 		 236 aa  57  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.743773 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1684  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.42 
 
 		 220 aa  57.4  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000256212  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1573  hydrolase  29.95 
 
 		 231 aa  57  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282427 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3605  HAD family hydrolase  47.06 
 
 		 236 aa  57  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4762  HAD family hydrolase  47.06 
 
 		 236 aa  57  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.201991 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3208  hydrolase  28.34 
 
 		 227 aa  56.6  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1500  phosphoglycolate phosphatase  30.93 
 
 		 224 aa  56.2  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0783789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0893  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1 family protein  27.66 
 
 		 209 aa  56.6  0.0000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.041002  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0937  HAD family hydrolase  30.57 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1823  phosphoglycolate phosphatase  30.93 
 
 		 224 aa  56.2  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2252  phosphoglycolate phosphatase  35.94 
 
 		 233 aa  56.6  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.191906  normal  0.672709 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2481  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.5 
 
 		 207 aa  56.6  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11020  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  29.25 
 
 		 274 aa  56.6  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0440  phosphoglycolate phosphatase  30.67 
 
 		 251 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.122838  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1789  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.63 
 
 		 222 aa  55.8  0.0000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.160371  normal  0.0157208 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0464  phosphoglycolate phosphatase  30.45 
 
 		 251 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.992467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0261  HAD family hydrolase  52.83 
 
 		 217 aa  55.1  0.0000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000130583  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2697  phosphoglycolate phosphatase  29.7 
 
 		 240 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5953  phosphoglycolate phosphatase  30.93 
 
 		 257 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0174691 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0456  phosphoglycolate phosphatase  43.21 
 
 		 170 aa  55.1  0.0000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0719928 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0073  HAD family hydrolase  29.67 
 
 		 234 aa  54.7  0.0000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.772732 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2701  phosphoglycolate phosphatase  31.35 
 
 		 230 aa  55.1  0.0000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.364651  normal  0.0856305 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2859  phosphoglycolate phosphatase  29.67 
 
 		 256 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.430899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0729  HAD family hydrolase  29.19 
 
 		 225 aa  54.7  0.0000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2097  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.42 
 
 		 221 aa  54.7  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.284323  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0534  phosphoglycolate phosphatase  32.16 
 
 		 242 aa  53.9  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0250125  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3574  phosphoglycolate phosphatase  32.16 
 
 		 242 aa  53.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.952116  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3582  phosphoglycolate phosphatase  32.16 
 
 		 245 aa  53.9  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3622  2-phosphoglycolate phosphatase  31.37 
 
 		 254 aa  53.5  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4786  phosphoglycolate phosphatase  53.06 
 
 		 272 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.602175 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2461  phosphoglycolate phosphatase  28.27 
 
 		 225 aa  53.5  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.768725 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0643  phosphoglycolate phosphatase  32.16 
 
 		 242 aa  53.9  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3555  phosphoglycolate phosphatase  32.16 
 
 		 245 aa  53.9  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.221388  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0939  phosphoglycolate phosphatase  32.16 
 
 		 242 aa  53.9  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2060  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.65 
 
 		 225 aa  53.9  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.750609  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1909  phosphoglycolate phosphatase  32.16 
 
 		 242 aa  53.9  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2570  phosphoglycolate phosphatase  31.86 
 
 		 254 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0743  phosphoglycolate phosphatase  28.8 
 
 		 225 aa  53.9  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0019  phosphatase  25.41 
 
 		 208 aa  53.5  0.000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.379676 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0535  phosphoglycolate phosphatase  31.86 
 
 		 254 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4023  phosphoglycolate phosphatase  28.87 
 
 		 227 aa  53.5  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3754  phosphoglycolate phosphatase  52 
 
 		 252 aa  53.1  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3850  phosphoglycolate phosphatase  52 
 
 		 252 aa  53.1  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1371  phosphoglycolate phosphatase  28.23 
 
 		 223 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3681  phosphoglycolate phosphatase  52 
 
 		 252 aa  53.1  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.123155  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0447  phosphoglycolate phosphatase  51.02 
 
 		 272 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.558752 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3788  phosphoglycolate phosphatase  52 
 
 		 252 aa  53.1  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3679  phosphoglycolate phosphatase  52 
 
 		 252 aa  53.1  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.966867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2015  HAD family hydrolase  49.09 
 
 		 237 aa  53.1  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.260233  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1899  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.49 
 
 		 212 aa  53.1  0.000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000244384  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03237  phosphoglycolate phosphatase  50 
 
 		 252 aa  52.8  0.000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0328  phosphoglycolate phosphatase  50 
 
 		 252 aa  52.8  0.000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0752  phosphoglycolate phosphatase  53.06 
 
 		 272 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1399  phosphoglycolate phosphatase  28.27 
 
 		 225 aa  52.8  0.000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3495  phosphoglycolate phosphatase  27.64 
 
 		 238 aa  52.8  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0294223  hitchhiker  0.0000911523 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3581  phosphoglycolate phosphatase  50 
 
 		 252 aa  52.8  0.000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.284383  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3661  phosphoglycolate phosphatase  50 
 
 		 252 aa  52.8  0.000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.29844  normal  0.025681 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0893  fructose-1-phosphatase  29.19 
 
 		 188 aa  52.8  0.000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000160736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3762  phosphoglycolate phosphatase  50 
 
 		 252 aa  52.8  0.000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.40481  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03189  hypothetical protein  50 
 
 		 252 aa  52.8  0.000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3371  fructose-1-phosphatase  29.19 
 
 		 188 aa  52.8  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000166362  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0328  phosphoglycolate phosphatase  50 
 
 		 252 aa  52.8  0.000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.372389  normal  0.201922 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4689  phosphoglycolate phosphatase  50 
 
 		 252 aa  52.8  0.000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.663349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07930  phosphoglycolate phosphatase  53.06 
 
 		 272 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282972 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3236  fructose-1-phosphatase  29.19 
 
 		 188 aa  52.8  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000293158  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0391  phosphoglycolate phosphatase  25 
 
 		 216 aa  52.8  0.000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1237  HAD family hydrolase  28.57 
 
 		 229 aa  52.8  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1166  HAD family hydrolase  49.09 
 
 		 229 aa  52.4  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.779812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2878  phosphoglycolate phosphatase  45.76 
 
 		 226 aa  52.4  0.000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2257  HAD family hydrolase  26.55 
 
 		 207 aa  52.4  0.000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.071447 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2296  phosphoglycolate phosphatase  35.29 
 
 		 233 aa  52.4  0.000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.75758  normal  0.0287022 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3854  phosphoglycolate phosphatase  50 
 
 		 252 aa  52  0.000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00525883  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3998  phosphoglycolate phosphatase  51.02 
 
 		 226 aa  52  0.000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.739792  normal  0.543367 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3031  2-phosphoglycolate phosphatase  42.31 
 
 		 256 aa  52.4  0.000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3737  haloacid dehalogenase-like hydrolase  29.32 
 
 		 254 aa  52  0.000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1514  phosphoglycolate phosphatase  32.26 
 
 		 243 aa  52  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00414525  decreased coverage  0.0000736152 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1764  phosphoglycolate phosphatase  29.95 
 
 		 223 aa  52  0.000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0118  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  33.03 
 
 		 232 aa  52  0.000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0462  2-phosphoglycolate phosphatase  27.27 
 
 		 238 aa  52  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2233  phosphoglycolate phosphatase  32.8 
 
 		 238 aa  51.6  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.25252  normal  0.513173 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>