More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_2257 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_2257  HAD family hydrolase  100 
 
 		 207 aa  420  1e-117  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.071447 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0759  HAD family hydrolase  48.42 
 
 		 214 aa  174  6e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3247  HAD family hydrolase  44.85 
 
 		 201 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2703  HAD family hydrolase  42.49 
 
 		 197 aa  160  2e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.776642  normal  0.681898 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00424  putative hydrolase/phosphatase protein  48.77 
 
 		 172 aa  156  2e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.465946  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0412  HAD family hydrolase  46.67 
 
 		 209 aa  153  2e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0523  hydrolase, HAD-family protein  45.12 
 
 		 203 aa  144  1e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0171673  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001470  HAD-superfamily hydrolase  46.91 
 
 		 206 aa  139  1.9999999999999998e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0499  HAD superfamily hydrolase  43.12 
 
 		 204 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05409  phosphoglycolate phosphatase  41.33 
 
 		 204 aa  137  2e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3426  HAD family hydrolase  42.95 
 
 		 203 aa  121  6e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0526  HAD family hydrolase  42.95 
 
 		 210 aa  121  7e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3600  HAD family hydrolase  42.95 
 
 		 206 aa  121  7e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4039  HAD superfamily hydrolase  42.95 
 
 		 202 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0635  HAD family hydrolase  41.03 
 
 		 204 aa  119  3e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0550  HAD family hydrolase  39.74 
 
 		 204 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0574  HAD family hydrolase  39.74 
 
 		 204 aa  115  5e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0803877 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0371  HAD family hydrolase  39.63 
 
 		 205 aa  115  6e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0580  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  39.74 
 
 		 204 aa  114  6.9999999999999995e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3760  HAD family hydrolase  39.35 
 
 		 204 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_5811  predicted protein  36.56 
 
 		 207 aa  101  8e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.695872  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_87850  predicted protein  35.32 
 
 		 227 aa  97.8  9e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.762716  normal  0.0707375 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4292  HAD family hydrolase  31.48 
 
 		 196 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4659  HAD-superfamily hydrolase  32.7 
 
 		 184 aa  94  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07760  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.57 
 
 		 198 aa  94  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0694  HAD family hydrolase  34.94 
 
 		 214 aa  93.6  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4773  HAD family hydrolase  32.73 
 
 		 197 aa  91.7  6e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.330372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12890  hypothetical protein  34.57 
 
 		 198 aa  91.7  7e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.753603  normal  0.341873 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3718  HAD family hydrolase  36.42 
 
 		 197 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4915  HAD family hydrolase  34.57 
 
 		 197 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000596857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0659  HAD family hydrolase  31.93 
 
 		 196 aa  88.6  7e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0468832  normal  0.394115 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1167  hypothetical protein  33.95 
 
 		 198 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1559  HAD family hydrolase  33.73 
 
 		 204 aa  84.7  9e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.815546  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4761  HAD superfamily hydrolase  33.94 
 
 		 196 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0000261111  hitchhiker  0.00232434 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2814  HAD family hydrolase  33.33 
 
 		 202 aa  83.2  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4635  HAD family hydrolase  33.94 
 
 		 196 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.262111  hitchhiker  0.00233323 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3148  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.53 
 
 		 199 aa  79.7  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.29989  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1113  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.73 
 
 		 204 aa  77.8  0.00000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0546  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.16 
 
 		 319 aa  76.3  0.0000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3457  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.25 
 
 		 210 aa  76.3  0.0000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3448  HAD family hydrolase  35 
 
 		 209 aa  73.6  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1688  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 1  31.1 
 
 		 193 aa  72.8  0.000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.168366  normal  0.420144 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0268  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.81 
 
 		 192 aa  71.6  0.000000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.423006  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2259  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.13 
 
 		 191 aa  67  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.45426  normal  0.439301 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2118  HAD family hydrolase  30.74 
 
 		 235 aa  63.9  0.000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1646  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.14 
 
 		 217 aa  62.4  0.000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2190  HAD family hydrolase  28.84 
 
 		 234 aa  61.6  0.000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0937  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.86 
 
 		 219 aa  61.2  0.00000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.171636 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0190  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.58 
 
 		 178 aa  60.8  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.615275  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1715  HAD family hydrolase  29.05 
 
 		 195 aa  59.3  0.00000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.101498 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2310  HAD family hydrolase  31.11 
 
 		 221 aa  58.9  0.00000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.523408  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0131  HAD family hydrolase  27.85 
 
 		 236 aa  58.5  0.00000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0160  HAD family hydrolase  31.43 
 
 		 224 aa  58.2  0.00000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.300128  normal  0.21286 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4663  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.89 
 
 		 215 aa  58.2  0.00000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.828051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04278  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 1 and 3  29.56 
 
 		 185 aa  57.4  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0935  HAD family hydrolase  29.79 
 
 		 235 aa  57.4  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.941543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4708  putative haloacid dehalogenase  28.26 
 
 		 233 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.301624  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1857  phosphoglycolate phosphatase  30.17 
 
 		 219 aa  56.6  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53790  putative haloacid dehalogenase  28.26 
 
 		 233 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0417823  normal  0.160959 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0461  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.57 
 
 		 217 aa  56.2  0.0000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1917  phosphatase  26.47 
 
 		 198 aa  55.8  0.0000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0976  HAD family hydrolase  28.85 
 
 		 225 aa  55.8  0.0000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1710  HAD family hydrolase  27.67 
 
 		 230 aa  55.5  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.2318 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0897  hydrolase protein  26.98 
 
 		 229 aa  55.1  0.0000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00554563  normal  0.72661 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0735  phosphoglycolate phosphatase  30.27 
 
 		 237 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.442963  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00150  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  28.8 
 
 		 218 aa  55.1  0.0000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2834  HAD family hydrolase  26.84 
 
 		 224 aa  54.7  0.0000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.46316  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1348  phosphoglycolate phosphatase  27.89 
 
 		 233 aa  54.7  0.0000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2449  HAD family hydrolase  27.84 
 
 		 217 aa  54.7  0.0000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0190416  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0525  HAD family hydrolase  26.34 
 
 		 209 aa  54.7  0.0000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00124351  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4258  phosphoglycolate phosphatase  29.28 
 
 		 235 aa  53.9  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0125483 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3022  phosphoglycolate phosphatase  27.09 
 
 		 241 aa  54.3  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.116956  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19180  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.11 
 
 		 218 aa  54.3  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.143986  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3208  hydrolase  24.66 
 
 		 227 aa  54.3  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4610  phosphoglycolate phosphatase  27.83 
 
 		 272 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2496  phosphoglycolate phosphatase  30.73 
 
 		 221 aa  53.5  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4503  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.22 
 
 		 224 aa  53.9  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3346  HAD family hydrolase  26.02 
 
 		 221 aa  53.5  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.363754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5119  phosphoglycolate phosphatase  28.57 
 
 		 272 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0467  HAD family hydrolase  31.45 
 
 		 257 aa  53.9  0.000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0767  phosphoglycolate phosphatase  27.75 
 
 		 229 aa  53.5  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.54601  hitchhiker  0.00790762 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1395  HAD family hydrolase  25.37 
 
 		 215 aa  53.1  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0822  HAD family hydrolase  32.22 
 
 		 224 aa  53.1  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.923988 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1684  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.5 
 
 		 220 aa  52.8  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000256212  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0416  phosphoglycolate phosphatase  27.43 
 
 		 272 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4275  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase family protein  30.52 
 
 		 224 aa  52.4  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0625662 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0450  phosphoglycolate phosphatase  27.43 
 
 		 272 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.416285 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0122  haloacid dehalogenase-like hydrolase  25.57 
 
 		 236 aa  52.4  0.000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.817509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2818  HAD-like hydrolase  33.33 
 
 		 240 aa  52.4  0.000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.564979 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2829  phosphoglycolate phosphatase  27.62 
 
 		 221 aa  52.4  0.000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0461088  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3310  HAD family hydrolase  29.81 
 
 		 232 aa  52  0.000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2501  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.09 
 
 		 217 aa  52  0.000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.077596  normal  0.373224 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4954  pyrophosphatase PpaX  27.53 
 
 		 215 aa  52  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1237  HAD family hydrolase  29.15 
 
 		 229 aa  52  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1947  HAD family hydrolase  30.9 
 
 		 239 aa  52  0.000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0127606 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2083  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.71 
 
 		 178 aa  51.6  0.000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.946947  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2658  haloacid dehalogenase-like hydrolase  26.26 
 
 		 236 aa  51.6  0.000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2289  HAD family hydrolase  28.02 
 
 		 223 aa  51.2  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000247556  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2097  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  24.88 
 
 		 221 aa  50.8  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.284323  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4249  HAD family hydrolase  30.29 
 
 		 224 aa  50.8  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>