More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_3718 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_3718  HAD family hydrolase  100 
 
 		 197 aa  391  1e-108  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07760  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  74.74 
 
 		 198 aa  286  2e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4292  HAD family hydrolase  70 
 
 		 196 aa  278  4e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4773  HAD family hydrolase  72.92 
 
 		 197 aa  259  2e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.330372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4915  HAD family hydrolase  73.68 
 
 		 197 aa  258  4e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000596857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1167  hypothetical protein  71.65 
 
 		 198 aa  254  6e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12890  hypothetical protein  71.13 
 
 		 198 aa  254  6e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.753603  normal  0.341873 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4659  HAD-superfamily hydrolase  69.02 
 
 		 184 aa  252  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0659  HAD family hydrolase  70.77 
 
 		 196 aa  247  7e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0468832  normal  0.394115 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3457  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  67.02 
 
 		 210 aa  243  1.9999999999999999e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4761  HAD superfamily hydrolase  72.11 
 
 		 196 aa  236  1e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0000261111  hitchhiker  0.00232434 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4635  HAD family hydrolase  72.11 
 
 		 196 aa  236  1e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.262111  hitchhiker  0.00233323 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04278  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 1 and 3  64.09 
 
 		 185 aa  192  2e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1559  HAD family hydrolase  48.44 
 
 		 204 aa  161  5.0000000000000005e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.815546  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3148  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  52.11 
 
 		 199 aa  161  5.0000000000000005e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.29989  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2814  HAD family hydrolase  50.27 
 
 		 202 aa  160  1e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1113  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  52.04 
 
 		 204 aa  158  4e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0694  HAD family hydrolase  46.49 
 
 		 214 aa  155  5.0000000000000005e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3448  HAD family hydrolase  51.04 
 
 		 209 aa  144  7.0000000000000006e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0499  HAD superfamily hydrolase  41.42 
 
 		 204 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0635  HAD family hydrolase  37.5 
 
 		 204 aa  111  7.000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0574  HAD family hydrolase  35.42 
 
 		 204 aa  108  6e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0803877 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0580  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  35.42 
 
 		 204 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3760  HAD family hydrolase  36.57 
 
 		 204 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0550  HAD family hydrolase  35.42 
 
 		 204 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4039  HAD superfamily hydrolase  39.89 
 
 		 202 aa  105  4e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0526  HAD family hydrolase  39.41 
 
 		 210 aa  102  3e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3600  HAD family hydrolase  39.41 
 
 		 206 aa  102  3e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3426  HAD family hydrolase  39.41 
 
 		 203 aa  102  4e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3247  HAD family hydrolase  31.29 
 
 		 201 aa  97.4  1e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0523  hydrolase, HAD-family protein  33.54 
 
 		 203 aa  95.9  4e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0171673  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2257  HAD family hydrolase  36.42 
 
 		 207 aa  95.5  5e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.071447 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0759  HAD family hydrolase  31.29 
 
 		 214 aa  90.1  2e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0371  HAD family hydrolase  35.33 
 
 		 205 aa  87.8  8e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00424  putative hydrolase/phosphatase protein  30.25 
 
 		 172 aa  82.4  0.000000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.465946  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_87850  predicted protein  34.71 
 
 		 227 aa  79.7  0.00000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.762716  normal  0.0707375 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0412  HAD family hydrolase  28.99 
 
 		 209 aa  78.6  0.00000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2703  HAD family hydrolase  27.01 
 
 		 197 aa  77.8  0.0000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.776642  normal  0.681898 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001470  HAD-superfamily hydrolase  30.41 
 
 		 206 aa  75.1  0.0000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05409  phosphoglycolate phosphatase  31.71 
 
 		 204 aa  74.7  0.0000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_5811  predicted protein  36.42 
 
 		 207 aa  72.8  0.000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.695872  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20950  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  34.01 
 
 		 216 aa  72.8  0.000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2324  phosphoglycolate phosphatase  32.64 
 
 		 223 aa  67  0.0000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.289687  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0382  phosphoglycolate phosphatase  36.63 
 
 		 229 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0371  HAD family hydrolase  41.38 
 
 		 242 aa  66.2  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19180  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.73 
 
 		 218 aa  66.6  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.143986  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0287  HAD superfamily hydrolase  40.54 
 
 		 249 aa  65.1  0.0000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.727823  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1688  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 1  32.54 
 
 		 193 aa  65.1  0.0000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.168366  normal  0.420144 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0302  HAD superfamily hydrolase  40.54 
 
 		 249 aa  65.1  0.0000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.795024  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3361  phosphoglycolate phosphatase  30.57 
 
 		 227 aa  64.7  0.0000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0347  phosphoglycolate phosphatase  30.09 
 
 		 235 aa  63.5  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3854  phosphoglycolate phosphatase  32.28 
 
 		 252 aa  63.2  0.000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00525883  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0525  HAD family hydrolase  28.49 
 
 		 209 aa  63.2  0.000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00124351  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0179  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.8 
 
 		 233 aa  62  0.000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.31745 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0546  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.47 
 
 		 319 aa  61.2  0.000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0268  phosphoglycolate phosphatase  31.52 
 
 		 228 aa  61.2  0.000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0557534  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4689  phosphoglycolate phosphatase  31.65 
 
 		 252 aa  61.2  0.000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.663349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3581  phosphoglycolate phosphatase  31.65 
 
 		 252 aa  61.2  0.000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.284383  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0328  phosphoglycolate phosphatase  31.65 
 
 		 252 aa  61.2  0.000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.372389  normal  0.201922 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2255  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25.84 
 
 		 209 aa  60.8  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00490459 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0595  HAD family hydrolase  29.19 
 
 		 215 aa  60.8  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0609  HAD family hydrolase  29.19 
 
 		 215 aa  60.8  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3661  phosphoglycolate phosphatase  31.65 
 
 		 252 aa  61.2  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.29844  normal  0.025681 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0971  2-phosphoglycolate phosphatase  31.13 
 
 		 237 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.080581  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0783  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.86 
 
 		 222 aa  60.5  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0220  phosphoglycolate phosphatase  30.6 
 
 		 231 aa  60.5  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0486776 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03237  phosphoglycolate phosphatase  31.65 
 
 		 252 aa  59.3  0.00000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0328  phosphoglycolate phosphatase  31.65 
 
 		 252 aa  59.3  0.00000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03189  hypothetical protein  31.65 
 
 		 252 aa  59.3  0.00000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3762  phosphoglycolate phosphatase  31.01 
 
 		 252 aa  59.7  0.00000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.40481  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2363  phosphoglycolate phosphatase  29.02 
 
 		 227 aa  59.7  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.496506  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0897  hydrolase protein  35.66 
 
 		 229 aa  58.9  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00554563  normal  0.72661 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0996  phosphoglycolate phosphatase  31.03 
 
 		 237 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.137981  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2370  phosphoglycolate phosphatase  32.61 
 
 		 227 aa  58.9  0.00000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1697  HAD family hydrolase  27.75 
 
 		 224 aa  58.5  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.264529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4258  phosphoglycolate phosphatase  31.19 
 
 		 235 aa  58.2  0.00000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0125483 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3012  phosphoglycolate phosphatase  29.58 
 
 		 237 aa  58.2  0.00000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0258131  normal  0.0275568 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1323  HAD family hydrolase  37.5 
 
 		 218 aa  57.8  0.00000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00010916  normal  0.934661 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0258  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.81 
 
 		 220 aa  56.6  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4076  phosphoglycolate phosphatase  35.87 
 
 		 225 aa  56.6  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3996  phosphoglycolate phosphatase  35.87 
 
 		 225 aa  56.6  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2229  phosphoglycolate phosphatase  30.87 
 
 		 227 aa  56.6  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.40738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1773  HAD family hydrolase  35.43 
 
 		 227 aa  56.6  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4150  2-phosphoglycolate phosphatase  30.46 
 
 		 238 aa  57  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4194  phosphoglycolate phosphatase  35.87 
 
 		 225 aa  57  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4106  phosphoglycolate phosphatase  35.87 
 
 		 225 aa  56.6  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0268  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.86 
 
 		 192 aa  56.6  0.0000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.423006  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0558  phosphoglycolate phosphatase  30.46 
 
 		 237 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1037  phosphoglycolate phosphatase  30.46 
 
 		 237 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0917  phosphoglycolate phosphatase  30.06 
 
 		 238 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0326596 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0293  phosphoglycolate phosphatase  35.87 
 
 		 227 aa  56.2  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0913  phosphoglycolate phosphatase  30.06 
 
 		 238 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2274  phosphoglycolate phosphatase  28.72 
 
 		 216 aa  55.8  0.0000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2034  HAD family hydrolase  28.35 
 
 		 216 aa  55.5  0.0000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.645104  normal  0.0672621 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2463  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  34.78 
 
 		 217 aa  55.5  0.0000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.35707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2834  HAD family hydrolase  28.04 
 
 		 224 aa  55.5  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.46316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2878  phosphoglycolate phosphatase  28.87 
 
 		 226 aa  55.1  0.0000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1646  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  24.32 
 
 		 217 aa  55.1  0.0000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4055  phosphoglycolate phosphatase  25.81 
 
 		 234 aa  55.1  0.0000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0278697  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0904  HAD family hydrolase  26.67 
 
 		 197 aa  53.9  0.000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>