More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_07760 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_07760  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  100 
 
 		 198 aa  389  1e-107  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3718  HAD family hydrolase  74.74 
 
 		 197 aa  268  5e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4915  HAD family hydrolase  74.35 
 
 		 197 aa  262  2e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000596857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4292  HAD family hydrolase  64.62 
 
 		 196 aa  256  1e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0659  HAD family hydrolase  71.28 
 
 		 196 aa  248  4e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0468832  normal  0.394115 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4773  HAD family hydrolase  70.37 
 
 		 197 aa  245  4e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.330372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12890  hypothetical protein  67.86 
 
 		 198 aa  242  3e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.753603  normal  0.341873 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4659  HAD-superfamily hydrolase  66.67 
 
 		 184 aa  238  4e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1167  hypothetical protein  67.35 
 
 		 198 aa  238  4e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4761  HAD superfamily hydrolase  68.21 
 
 		 196 aa  230  1e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0000261111  hitchhiker  0.00232434 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4635  HAD family hydrolase  68.21 
 
 		 196 aa  230  1e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.262111  hitchhiker  0.00233323 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3457  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  61.05 
 
 		 210 aa  216  2e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04278  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 1 and 3  63.24 
 
 		 185 aa  196  2.0000000000000003e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3148  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  53.12 
 
 		 199 aa  166  2e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.29989  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1113  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  53.12 
 
 		 204 aa  161  5.0000000000000005e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0694  HAD family hydrolase  48.65 
 
 		 214 aa  154  1e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2814  HAD family hydrolase  51.83 
 
 		 202 aa  154  1e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1559  HAD family hydrolase  47.98 
 
 		 204 aa  153  1e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.815546  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3448  HAD family hydrolase  51.85 
 
 		 209 aa  150  2e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0499  HAD superfamily hydrolase  37.56 
 
 		 204 aa  111  6e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0635  HAD family hydrolase  36.72 
 
 		 204 aa  105  4e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3760  HAD family hydrolase  37.08 
 
 		 204 aa  104  8e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0550  HAD family hydrolase  37.64 
 
 		 204 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0574  HAD family hydrolase  37.64 
 
 		 204 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0803877 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0580  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  37.64 
 
 		 204 aa  102  3e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3426  HAD family hydrolase  35.2 
 
 		 203 aa  92  5e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4039  HAD superfamily hydrolase  35.23 
 
 		 202 aa  90.5  1e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3600  HAD family hydrolase  36.78 
 
 		 206 aa  90.5  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0412  HAD family hydrolase  32.28 
 
 		 209 aa  90.5  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0526  HAD family hydrolase  34.64 
 
 		 210 aa  90.1  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3247  HAD family hydrolase  31.72 
 
 		 201 aa  90.1  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2257  HAD family hydrolase  34.57 
 
 		 207 aa  88.6  5e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.071447 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0371  HAD family hydrolase  34.1 
 
 		 205 aa  87  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0759  HAD family hydrolase  33.33 
 
 		 214 aa  86.3  3e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0523  hydrolase, HAD-family protein  30.65 
 
 		 203 aa  85.1  6e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0171673  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2703  HAD family hydrolase  29.88 
 
 		 197 aa  75.5  0.0000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.776642  normal  0.681898 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00424  putative hydrolase/phosphatase protein  28.49 
 
 		 172 aa  73.2  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.465946  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_5811  predicted protein  38.1 
 
 		 207 aa  71.6  0.000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.695872  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05409  phosphoglycolate phosphatase  29.45 
 
 		 204 aa  66.2  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001470  HAD-superfamily hydrolase  28.48 
 
 		 206 aa  65.1  0.0000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_87850  predicted protein  33.13 
 
 		 227 aa  65.1  0.0000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.762716  normal  0.0707375 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3854  phosphoglycolate phosphatase  31.01 
 
 		 252 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00525883  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0571  phosphoglycolate phosphatase  32.08 
 
 		 242 aa  63.2  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2878  phosphoglycolate phosphatase  29.73 
 
 		 226 aa  63.2  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3661  phosphoglycolate phosphatase  30.38 
 
 		 252 aa  62  0.000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.29844  normal  0.025681 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3581  phosphoglycolate phosphatase  30.38 
 
 		 252 aa  62  0.000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.284383  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0328  phosphoglycolate phosphatase  30.38 
 
 		 252 aa  62  0.000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.372389  normal  0.201922 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4689  phosphoglycolate phosphatase  30.38 
 
 		 252 aa  62  0.000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.663349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20950  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  34.24 
 
 		 216 aa  61.6  0.000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1697  HAD family hydrolase  28.38 
 
 		 224 aa  60.8  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.264529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3762  phosphoglycolate phosphatase  29.75 
 
 		 252 aa  60.8  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.40481  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03237  phosphoglycolate phosphatase  30.38 
 
 		 252 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0328  phosphoglycolate phosphatase  30.38 
 
 		 252 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19180  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.78 
 
 		 218 aa  60.1  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.143986  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2880  phosphoglycolate phosphatase  33.9 
 
 		 246 aa  60.1  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.587243  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03189  hypothetical protein  30.38 
 
 		 252 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0371  HAD family hydrolase  43.69 
 
 		 242 aa  59.3  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2229  phosphoglycolate phosphatase  34.45 
 
 		 227 aa  59.3  0.00000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.40738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0743  phosphoglycolate phosphatase  31.58 
 
 		 225 aa  58.9  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0431  3-amino-5-hydroxybenoic acid synthesis related  31.34 
 
 		 263 aa  58.5  0.00000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1900  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.26 
 
 		 221 aa  58.5  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.65867  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0268  phosphoglycolate phosphatase  31.58 
 
 		 228 aa  58.9  0.00000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0557534  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3361  phosphoglycolate phosphatase  29.67 
 
 		 227 aa  58.5  0.00000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0268  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.36 
 
 		 192 aa  58.5  0.00000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.423006  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15750  phosphoglycolate phosphatase  28.21 
 
 		 223 aa  57.8  0.00000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1483  HAD family hydrolase  29.95 
 
 		 224 aa  57.8  0.00000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0762089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0220  phosphoglycolate phosphatase  28.12 
 
 		 231 aa  57.4  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0486776 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2034  HAD family hydrolase  29.51 
 
 		 216 aa  57.4  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.645104  normal  0.0672621 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2493  phosphoglycolate phosphatase  30.17 
 
 		 225 aa  57.8  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2274  phosphoglycolate phosphatase  31.09 
 
 		 216 aa  57.4  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3788  phosphoglycolate phosphatase  29.11 
 
 		 252 aa  57.4  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2496  phosphoglycolate phosphatase  29.21 
 
 		 221 aa  57  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1156  phosphoglycolate phosphatase  38.46 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.53294 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1661  AHBA synthesis associated protein  31.32 
 
 		 214 aa  56.2  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.49792 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1395  HAD family hydrolase  23.23 
 
 		 215 aa  55.8  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2834  HAD family hydrolase  28.02 
 
 		 224 aa  55.8  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.46316  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0783  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.66 
 
 		 222 aa  55.8  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3681  phosphoglycolate phosphatase  28.48 
 
 		 252 aa  55.8  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.123155  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2324  phosphoglycolate phosphatase  34.4 
 
 		 223 aa  55.8  0.0000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.289687  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0382  phosphoglycolate phosphatase  29.7 
 
 		 229 aa  55.8  0.0000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3807  HAD family hydrolase  28.99 
 
 		 224 aa  55.5  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.118188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0971  2-phosphoglycolate phosphatase  31.11 
 
 		 237 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.080581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0258  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.54 
 
 		 220 aa  55.1  0.0000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1710  HAD family hydrolase  30.05 
 
 		 230 aa  54.7  0.0000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.2318 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0937  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.53 
 
 		 219 aa  54.7  0.0000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.171636 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1296  phosphoglycolate phosphatase  35.07 
 
 		 233 aa  54.7  0.0000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0205291  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1323  HAD family hydrolase  28.04 
 
 		 218 aa  54.7  0.0000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00010916  normal  0.934661 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2363  phosphoglycolate phosphatase  29.55 
 
 		 227 aa  54.7  0.0000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.496506  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0546  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.1 
 
 		 319 aa  54.7  0.0000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02162  phosphoglycolate phosphatase  30.16 
 
 		 225 aa  54.7  0.0000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0287  HAD superfamily hydrolase  40.74 
 
 		 249 aa  54.7  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.727823  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0265  phosphoglycolate phosphatase  25 
 
 		 227 aa  54.3  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3122  HAD family hydrolase  29.28 
 
 		 214 aa  54.3  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1646  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  22.65 
 
 		 217 aa  54.3  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14830  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  28.97 
 
 		 219 aa  54.3  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.187107 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0302  HAD superfamily hydrolase  40.74 
 
 		 249 aa  54.7  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.795024  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3679  phosphoglycolate phosphatase  37.35 
 
 		 252 aa  53.9  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.966867  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3754  phosphoglycolate phosphatase  37.35 
 
 		 252 aa  53.9  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0179  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.27 
 
 		 233 aa  53.1  0.000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.31745 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3850  phosphoglycolate phosphatase  37.35 
 
 		 252 aa  53.9  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>