More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_12890 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_12890  hypothetical protein  100 
 
 		 198 aa  393  1e-108  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.753603  normal  0.341873 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1167  hypothetical protein  96.97 
 
 		 198 aa  359  1e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4292  HAD family hydrolase  69.11 
 
 		 196 aa  272  3e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4773  HAD family hydrolase  75.66 
 
 		 197 aa  271  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.330372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0659  HAD family hydrolase  75.92 
 
 		 196 aa  265  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0468832  normal  0.394115 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4761  HAD superfamily hydrolase  76.44 
 
 		 196 aa  263  2e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0000261111  hitchhiker  0.00232434 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4635  HAD family hydrolase  76.44 
 
 		 196 aa  263  2e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.262111  hitchhiker  0.00233323 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07760  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  67.86 
 
 		 198 aa  255  3e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4915  HAD family hydrolase  71.81 
 
 		 197 aa  253  9e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000596857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3718  HAD family hydrolase  71.13 
 
 		 197 aa  253  9e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3457  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  67.53 
 
 		 210 aa  246  1e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4659  HAD-superfamily hydrolase  69.27 
 
 		 184 aa  246  2e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04278  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 1 and 3  61.41 
 
 		 185 aa  179  2e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0694  HAD family hydrolase  51.58 
 
 		 214 aa  176  2e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1559  HAD family hydrolase  53.55 
 
 		 204 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.815546  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2814  HAD family hydrolase  52.36 
 
 		 202 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3148  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  55.74 
 
 		 199 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.29989  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1113  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  55.98 
 
 		 204 aa  160  2e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3448  HAD family hydrolase  54.01 
 
 		 209 aa  149  3e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0499  HAD superfamily hydrolase  42.54 
 
 		 204 aa  125  3e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0550  HAD family hydrolase  38.97 
 
 		 204 aa  119  3e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0580  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  38.97 
 
 		 204 aa  119  3e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0574  HAD family hydrolase  38.97 
 
 		 204 aa  118  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0803877 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3760  HAD family hydrolase  37.95 
 
 		 204 aa  118  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0635  HAD family hydrolase  38.78 
 
 		 204 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4039  HAD superfamily hydrolase  37.56 
 
 		 202 aa  108  5e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3426  HAD family hydrolase  37.56 
 
 		 203 aa  107  1e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3600  HAD family hydrolase  37.56 
 
 		 206 aa  106  3e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0526  HAD family hydrolase  37.06 
 
 		 210 aa  105  5e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0759  HAD family hydrolase  33.14 
 
 		 214 aa  99.8  2e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3247  HAD family hydrolase  31.96 
 
 		 201 aa  96.3  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0523  hydrolase, HAD-family protein  34.16 
 
 		 203 aa  95.5  4e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0171673  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00424  putative hydrolase/phosphatase protein  32.75 
 
 		 172 aa  95.9  4e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.465946  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0371  HAD family hydrolase  34.12 
 
 		 205 aa  95.5  4e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2257  HAD family hydrolase  34.57 
 
 		 207 aa  92.8  3e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.071447 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0412  HAD family hydrolase  31.12 
 
 		 209 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001470  HAD-superfamily hydrolase  30.64 
 
 		 206 aa  83.6  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05409  phosphoglycolate phosphatase  31.49 
 
 		 204 aa  82  0.000000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_5811  predicted protein  37.93 
 
 		 207 aa  75.1  0.0000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.695872  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_87850  predicted protein  31.07 
 
 		 227 aa  74.3  0.000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.762716  normal  0.0707375 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2703  HAD family hydrolase  26.63 
 
 		 197 aa  73.2  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.776642  normal  0.681898 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0546  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.29 
 
 		 319 aa  68.9  0.00000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0268  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.21 
 
 		 192 aa  67  0.0000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.423006  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2324  phosphoglycolate phosphatase  37.1 
 
 		 223 aa  67  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.289687  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2878  phosphoglycolate phosphatase  29.73 
 
 		 226 aa  66.2  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0766  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.97 
 
 		 222 aa  65.5  0.0000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0179  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.89 
 
 		 233 aa  65.5  0.0000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.31745 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20950  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  32.57 
 
 		 216 aa  64.3  0.000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19180  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.7 
 
 		 218 aa  63.9  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.143986  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0783  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.44 
 
 		 222 aa  63.2  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0371  HAD family hydrolase  38.89 
 
 		 242 aa  62.4  0.000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1764  phosphoglycolate phosphatase  28.04 
 
 		 223 aa  62  0.000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2496  phosphoglycolate phosphatase  29.7 
 
 		 221 aa  62  0.000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1355  phosphoglycolate phosphatase  28.04 
 
 		 223 aa  62  0.000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3950  phosphoglycolate phosphatase  28.04 
 
 		 223 aa  62  0.000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00428214  normal  0.0156244 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2255  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.41 
 
 		 209 aa  61.2  0.000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00490459 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1697  HAD family hydrolase  30.22 
 
 		 224 aa  60.8  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.264529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3361  phosphoglycolate phosphatase  31.89 
 
 		 227 aa  60.8  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15750  phosphoglycolate phosphatase  28.57 
 
 		 223 aa  60.1  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1371  phosphoglycolate phosphatase  28.04 
 
 		 223 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0525  HAD family hydrolase  26.63 
 
 		 209 aa  59.7  0.00000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00124351  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1783  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.07 
 
 		 222 aa  59.3  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0382  phosphoglycolate phosphatase  24.75 
 
 		 229 aa  58.5  0.00000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0937  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.13 
 
 		 219 aa  58.2  0.00000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.171636 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2449  HAD family hydrolase  25.41 
 
 		 217 aa  57.8  0.00000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0190416  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2880  phosphoglycolate phosphatase  29.8 
 
 		 246 aa  57.8  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.587243  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0287  HAD superfamily hydrolase  37.3 
 
 		 249 aa  57.4  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.727823  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2363  phosphoglycolate phosphatase  28.1 
 
 		 227 aa  57.4  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.496506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0302  HAD superfamily hydrolase  37.3 
 
 		 249 aa  57.4  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.795024  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0571  phosphoglycolate phosphatase  37.86 
 
 		 242 aa  57.8  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0347  phosphoglycolate phosphatase  24.54 
 
 		 235 aa  56.2  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2790  HAD family hydrolase  25.13 
 
 		 223 aa  55.8  0.0000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4527  phosphoglycolate phosphatase  25.27 
 
 		 216 aa  55.5  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0743  phosphoglycolate phosphatase  30.73 
 
 		 225 aa  55.5  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1646  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.56 
 
 		 217 aa  55.5  0.0000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0220  phosphoglycolate phosphatase  24.62 
 
 		 231 aa  55.1  0.0000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0486776 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1117  phosphoglycolate phosphatase  31.69 
 
 		 209 aa  55.1  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.31485  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1798  phosphoglycolate phosphatase  31.09 
 
 		 221 aa  54.7  0.0000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0263592  unclonable  0.00000282508 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0268  phosphoglycolate phosphatase  29.2 
 
 		 228 aa  55.1  0.0000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0557534  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1688  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 1  28.99 
 
 		 193 aa  54.7  0.0000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.168366  normal  0.420144 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0945  putative 2-phosphoglycolate phosphatase  28.04 
 
 		 226 aa  54.7  0.0000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1944  pyrophosphatase PpaX  22.56 
 
 		 214 aa  54.7  0.0000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3998  phosphoglycolate phosphatase  36.19 
 
 		 226 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.739792  normal  0.543367 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3084  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.32 
 
 		 218 aa  53.9  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1395  HAD family hydrolase  22.28 
 
 		 215 aa  53.9  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1900  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.97 
 
 		 221 aa  54.3  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.65867  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0983  P-Ser-HPr phosphatase  25.42 
 
 		 215 aa  53.9  0.000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0416  phosphoglycolate phosphatase  28 
 
 		 272 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1388  putative phosphatase  31.13 
 
 		 218 aa  53.5  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00329661  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0450  phosphoglycolate phosphatase  28 
 
 		 272 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.416285 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2151  flagellar biosynthesis chaperone FliJ-like protein  27.78 
 
 		 228 aa  53.1  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3012  phosphoglycolate phosphatase  33.88 
 
 		 237 aa  53.5  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0258131  normal  0.0275568 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1245  phosphoglycolate phosphatase  31.69 
 
 		 209 aa  53.1  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0507  phosphoglycolate phosphatase  27.32 
 
 		 254 aa  52.8  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.263743  normal  0.890695 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2570  phosphoglycolate phosphatase  27.32 
 
 		 254 aa  52.8  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2232  pyrophosphatase PpaX  21.88 
 
 		 214 aa  53.1  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0535  phosphoglycolate phosphatase  27.32 
 
 		 254 aa  52.8  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2370  phosphoglycolate phosphatase  31.16 
 
 		 227 aa  52.4  0.000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4462  phosphoglycolate phosphatase  35.92 
 
 		 250 aa  52.4  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2152  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  37.93 
 
 		 225 aa  52.4  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>