231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2814 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2814  HAD family hydrolase  100 
 
 		 202 aa  402  1e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0694  HAD family hydrolase  66.5 
 
 		 214 aa  266  1e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3148  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  59.9 
 
 		 199 aa  213  9.999999999999999e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.29989  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1559  HAD family hydrolase  56.19 
 
 		 204 aa  211  5.999999999999999e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.815546  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1113  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  59.38 
 
 		 204 aa  209  3e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3448  HAD family hydrolase  58.85 
 
 		 209 aa  194  1e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4292  HAD family hydrolase  52.63 
 
 		 196 aa  188  4e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4915  HAD family hydrolase  55.05 
 
 		 197 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000596857  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4659  HAD-superfamily hydrolase  52.43 
 
 		 184 aa  171  9e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07760  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  51.83 
 
 		 198 aa  167  1e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12890  hypothetical protein  52.36 
 
 		 198 aa  163  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.753603  normal  0.341873 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1167  hypothetical protein  52.91 
 
 		 198 aa  162  3e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4773  HAD family hydrolase  51.05 
 
 		 197 aa  159  3e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.330372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3718  HAD family hydrolase  50.79 
 
 		 197 aa  158  4e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0659  HAD family hydrolase  51.58 
 
 		 196 aa  154  9e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0468832  normal  0.394115 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3457  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  49.43 
 
 		 210 aa  150  8e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4761  HAD superfamily hydrolase  51.58 
 
 		 196 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0000261111  hitchhiker  0.00232434 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4635  HAD family hydrolase  51.58 
 
 		 196 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.262111  hitchhiker  0.00233323 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04278  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 1 and 3  46.11 
 
 		 185 aa  122  3e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0635  HAD family hydrolase  40.76 
 
 		 204 aa  112  3e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0580  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  40.13 
 
 		 204 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0550  HAD family hydrolase  40.13 
 
 		 204 aa  108  5e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0574  HAD family hydrolase  40.13 
 
 		 204 aa  108  5e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0803877 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3760  HAD family hydrolase  39.49 
 
 		 204 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0499  HAD superfamily hydrolase  35.48 
 
 		 204 aa  101  8e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4039  HAD superfamily hydrolase  39.49 
 
 		 202 aa  100  1e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3426  HAD family hydrolase  39.49 
 
 		 203 aa  100  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0526  HAD family hydrolase  39.49 
 
 		 210 aa  100  2e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3600  HAD family hydrolase  39.49 
 
 		 206 aa  99.8  3e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0523  hydrolase, HAD-family protein  31.55 
 
 		 203 aa  99  4e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0171673  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0371  HAD family hydrolase  35.62 
 
 		 205 aa  93.6  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3247  HAD family hydrolase  30.16 
 
 		 201 aa  92.8  3e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0759  HAD family hydrolase  29 
 
 		 214 aa  86.7  2e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0412  HAD family hydrolase  33.97 
 
 		 209 aa  86.7  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2257  HAD family hydrolase  33.33 
 
 		 207 aa  85.1  7e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.071447 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05409  phosphoglycolate phosphatase  31.75 
 
 		 204 aa  84  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001470  HAD-superfamily hydrolase  29.35 
 
 		 206 aa  82.4  0.000000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00424  putative hydrolase/phosphatase protein  32.1 
 
 		 172 aa  80.1  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.465946  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2703  HAD family hydrolase  25.79 
 
 		 197 aa  73.9  0.000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.776642  normal  0.681898 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_5811  predicted protein  34.44 
 
 		 207 aa  73.2  0.000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.695872  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_87850  predicted protein  32.37 
 
 		 227 aa  73.2  0.000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.762716  normal  0.0707375 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0546  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.32 
 
 		 319 aa  69.7  0.00000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0525  HAD family hydrolase  33.88 
 
 		 209 aa  63.5  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00124351  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15750  phosphoglycolate phosphatase  31.72 
 
 		 223 aa  63.5  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0268  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28 
 
 		 192 aa  63.2  0.000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.423006  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01945  HAD superfamily hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G13290)  31.09 
 
 		 228 aa  62.4  0.000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0940209 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2190  HAD family hydrolase  31.92 
 
 		 234 aa  62.4  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3122  HAD family hydrolase  30.22 
 
 		 214 aa  61.6  0.000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1245  phosphoglycolate phosphatase  33.7 
 
 		 209 aa  59.7  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1177  phosphoglycolate phosphatase  34.07 
 
 		 209 aa  58.9  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1117  phosphoglycolate phosphatase  33.15 
 
 		 209 aa  58.2  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.31485  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2449  HAD family hydrolase  29.83 
 
 		 217 aa  58.2  0.00000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0190416  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2118  HAD family hydrolase  27.27 
 
 		 235 aa  57.8  0.0000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1780  HAD family hydrolase  32.96 
 
 		 225 aa  57.4  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.587654  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2324  phosphoglycolate phosphatase  35.37 
 
 		 223 aa  57.4  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.289687  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0371  HAD family hydrolase  33.33 
 
 		 242 aa  56.6  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2463  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  36.84 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.35707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2060  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.4 
 
 		 225 aa  54.7  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.750609  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23210  phosphoglycolate phosphatase  27.96 
 
 		 226 aa  54.7  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0343323  hitchhiker  0.00416895 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2083  phosphoglycolate phosphatase  31.72 
 
 		 226 aa  54.3  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.609164  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1715  HAD family hydrolase  31.84 
 
 		 195 aa  54.3  0.000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.101498 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2152  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.4 
 
 		 225 aa  53.1  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1508  phosphoglycolate phosphatase  30.93 
 
 		 228 aa  53.5  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.313556  normal  0.0200123 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1957  phosphoglycolate phosphatase  27.98 
 
 		 223 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3289  AHBA synthesis associated protein  30.64 
 
 		 264 aa  53.1  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3679  phosphoglycolate phosphatase  32.29 
 
 		 252 aa  53.1  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.966867  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3754  phosphoglycolate phosphatase  32.29 
 
 		 252 aa  53.1  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3681  phosphoglycolate phosphatase  32.29 
 
 		 252 aa  53.1  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.123155  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3850  phosphoglycolate phosphatase  32.29 
 
 		 252 aa  53.1  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0122  haloacid dehalogenase-like hydrolase  25.79 
 
 		 236 aa  52  0.000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.817509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0131  HAD family hydrolase  26.11 
 
 		 236 aa  52  0.000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3788  phosphoglycolate phosphatase  32.29 
 
 		 252 aa  52.4  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1688  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 1  30.57 
 
 		 193 aa  52.4  0.000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.168366  normal  0.420144 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0085  HAD family hydrolase  27.94 
 
 		 241 aa  52.4  0.000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.658322  hitchhiker  0.00000571122 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0174  HAD family hydrolase  34.69 
 
 		 215 aa  52  0.000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1887  HAD family hydrolase  31.32 
 
 		 196 aa  51.6  0.000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14830  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  30.97 
 
 		 219 aa  51.6  0.000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.187107 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2583  phosphoglycolate phosphatase  29.73 
 
 		 227 aa  51.6  0.000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0160  HAD family hydrolase  28.57 
 
 		 224 aa  50.8  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.300128  normal  0.21286 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0072  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.57 
 
 		 230 aa  51.2  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2878  phosphoglycolate phosphatase  28.14 
 
 		 226 aa  51.2  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0293  phosphoglycolate phosphatase  26.42 
 
 		 227 aa  50.4  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0258  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.8 
 
 		 220 aa  50.1  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0347  phosphoglycolate phosphatase  23.83 
 
 		 235 aa  49.7  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1741  phosphoglycolate phosphatase  28.49 
 
 		 223 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0328  phosphoglycolate phosphatase  29.17 
 
 		 252 aa  49.3  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.372389  normal  0.201922 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0937  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  24.16 
 
 		 219 aa  49.7  0.00003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.171636 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3762  phosphoglycolate phosphatase  29.17 
 
 		 252 aa  49.7  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.40481  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1198  phosphoglycolate phosphatase  34.11 
 
 		 223 aa  49.7  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.042458  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2501  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.9 
 
 		 217 aa  49.7  0.00003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.077596  normal  0.373224 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3581  phosphoglycolate phosphatase  29.17 
 
 		 252 aa  49.3  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.284383  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3691  phosphoglycolate phosphatase  27.46 
 
 		 227 aa  49.7  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2363  phosphoglycolate phosphatase  26.91 
 
 		 227 aa  49.7  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.496506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2496  phosphoglycolate phosphatase  27.27 
 
 		 221 aa  49.7  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4689  phosphoglycolate phosphatase  29.17 
 
 		 252 aa  49.3  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.663349  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03237  phosphoglycolate phosphatase  29.17 
 
 		 252 aa  49.3  0.00004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1463  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.06 
 
 		 228 aa  48.9  0.00004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0497866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3854  phosphoglycolate phosphatase  29.17 
 
 		 252 aa  49.3  0.00004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00525883  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3661  phosphoglycolate phosphatase  29.17 
 
 		 252 aa  49.3  0.00004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.29844  normal  0.025681 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0876  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.3 
 
 		 215 aa  48.9  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>