More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3448 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_3448  HAD family hydrolase  100 
 
 		 209 aa  414  9.999999999999999e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0694  HAD family hydrolase  58.33 
 
 		 214 aa  216  2e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1559  HAD family hydrolase  57.98 
 
 		 204 aa  204  6e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.815546  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2814  HAD family hydrolase  58.16 
 
 		 202 aa  204  8e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3148  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  57.87 
 
 		 199 aa  197  9e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.29989  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1113  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  56.85 
 
 		 204 aa  193  1e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4292  HAD family hydrolase  51.12 
 
 		 196 aa  169  2e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4773  HAD family hydrolase  54.97 
 
 		 197 aa  169  3e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.330372  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07760  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  51.3 
 
 		 198 aa  164  6.9999999999999995e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4659  HAD-superfamily hydrolase  52.91 
 
 		 184 aa  159  3e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0659  HAD family hydrolase  56.74 
 
 		 196 aa  158  5e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0468832  normal  0.394115 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1167  hypothetical protein  54.59 
 
 		 198 aa  158  6e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12890  hypothetical protein  54.01 
 
 		 198 aa  157  1e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.753603  normal  0.341873 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4761  HAD superfamily hydrolase  54.17 
 
 		 196 aa  153  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0000261111  hitchhiker  0.00232434 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4635  HAD family hydrolase  54.17 
 
 		 196 aa  153  2e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.262111  hitchhiker  0.00233323 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3718  HAD family hydrolase  51.04 
 
 		 197 aa  153  2e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4915  HAD family hydrolase  53.48 
 
 		 197 aa  152  4e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000596857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3457  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  48.21 
 
 		 210 aa  144  1e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04278  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 1 and 3  47.51 
 
 		 185 aa  110  1.0000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0499  HAD superfamily hydrolase  37.97 
 
 		 204 aa  105  3e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0580  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  41.77 
 
 		 204 aa  104  1e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0574  HAD family hydrolase  42.14 
 
 		 204 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0803877 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0550  HAD family hydrolase  42.14 
 
 		 204 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3760  HAD family hydrolase  41.51 
 
 		 204 aa  102  6e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0523  hydrolase, HAD-family protein  32.99 
 
 		 203 aa  101  9e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0171673  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0635  HAD family hydrolase  39.87 
 
 		 204 aa  99.4  4e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3426  HAD family hydrolase  34.65 
 
 		 203 aa  95.9  4e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4039  HAD superfamily hydrolase  35.98 
 
 		 202 aa  93.6  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0526  HAD family hydrolase  35.45 
 
 		 210 aa  93.6  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3600  HAD family hydrolase  35.57 
 
 		 206 aa  93.6  2e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0371  HAD family hydrolase  37.65 
 
 		 205 aa  93.2  3e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0759  HAD family hydrolase  29.65 
 
 		 214 aa  85.1  7e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05409  phosphoglycolate phosphatase  29.44 
 
 		 204 aa  82.8  0.000000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0412  HAD family hydrolase  32.34 
 
 		 209 aa  78.2  0.00000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3247  HAD family hydrolase  28.04 
 
 		 201 aa  77  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2257  HAD family hydrolase  35 
 
 		 207 aa  75.9  0.0000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.071447 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2703  HAD family hydrolase  28.5 
 
 		 197 aa  75.9  0.0000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.776642  normal  0.681898 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001470  HAD-superfamily hydrolase  29.03 
 
 		 206 aa  75.5  0.0000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00424  putative hydrolase/phosphatase protein  31.01 
 
 		 172 aa  73.6  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.465946  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0268  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.95 
 
 		 192 aa  71.6  0.000000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.423006  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3122  HAD family hydrolase  30.05 
 
 		 214 aa  65.1  0.0000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2449  HAD family hydrolase  27.62 
 
 		 217 aa  64.3  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0190416  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_5811  predicted protein  35.67 
 
 		 207 aa  64.3  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.695872  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0525  HAD family hydrolase  30.51 
 
 		 209 aa  61.6  0.000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00124351  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1900  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.48 
 
 		 221 aa  60.5  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.65867  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_87850  predicted protein  30.46 
 
 		 227 aa  60.8  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.762716  normal  0.0707375 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0431  3-amino-5-hydroxybenoic acid synthesis related  29.89 
 
 		 263 aa  59.7  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1783  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.59 
 
 		 222 aa  59.3  0.00000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2152  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  34.27 
 
 		 225 aa  59.3  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2632  HAD family hydrolase  28.4 
 
 		 216 aa  58.9  0.00000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.861911  hitchhiker  0.000131082 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0658  haloacid dehalogenase-like hydrolase  40 
 
 		 222 aa  58.5  0.00000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.40238 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2473  HAD family hydrolase  29.76 
 
 		 248 aa  58.2  0.00000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000591891  hitchhiker  0.00615598 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1688  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 1  33.54 
 
 		 193 aa  57.4  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.168366  normal  0.420144 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2716  HAD family hydrolase  29.6 
 
 		 218 aa  57  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000772309  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0971  2-phosphoglycolate phosphatase  31.32 
 
 		 237 aa  57  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.080581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0983  P-Ser-HPr phosphatase  26.97 
 
 		 215 aa  57  0.0000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1697  HAD family hydrolase  29.79 
 
 		 224 aa  56.2  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.264529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2255  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.59 
 
 		 209 aa  56.6  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00490459 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2190  HAD family hydrolase  32.24 
 
 		 234 aa  56.6  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0384  HAD family hydrolase  32.65 
 
 		 222 aa  56.2  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000045535  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0735  phosphoglycolate phosphatase  30.73 
 
 		 237 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.442963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2060  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.58 
 
 		 225 aa  55.8  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.750609  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14830  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  27.27 
 
 		 219 aa  55.8  0.0000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.187107 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2192  phosphoglycolate phosphatase  28.89 
 
 		 217 aa  55.5  0.0000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1710  HAD family hydrolase  29.35 
 
 		 230 aa  55.8  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.2318 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0323  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  34.34 
 
 		 233 aa  55.5  0.0000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0341719 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0280  HAD family hydrolase  34.34 
 
 		 233 aa  55.5  0.0000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0590  HAD family hydrolase  29.79 
 
 		 219 aa  55.1  0.0000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0419315 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1780  HAD family hydrolase  33.15 
 
 		 225 aa  55.1  0.0000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.587654  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2173  HAD family hydrolase  26.6 
 
 		 232 aa  54.7  0.0000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0277554  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0937  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.95 
 
 		 219 aa  54.3  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.171636 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1899  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.95 
 
 		 212 aa  54.3  0.000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000244384  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0292  HAD family hydrolase  28.93 
 
 		 222 aa  54.3  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.402537  normal  0.982934 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0558  phosphoglycolate phosphatase  31.43 
 
 		 237 aa  54.3  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3012  phosphoglycolate phosphatase  30.17 
 
 		 237 aa  53.9  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0258131  normal  0.0275568 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1037  phosphoglycolate phosphatase  31.43 
 
 		 237 aa  54.3  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2818  HAD-like hydrolase  39.36 
 
 		 240 aa  53.5  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.564979 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0438  phosphoglycolate phosphatase  31.28 
 
 		 241 aa  53.9  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0957  phosphoglycolate phosphatase  31.28 
 
 		 241 aa  53.9  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.753227  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3004  phosphoglycolate phosphatase  31.28 
 
 		 241 aa  53.9  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2583  phosphoglycolate phosphatase  31.28 
 
 		 241 aa  53.9  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0190  phosphoglycolate phosphatase  31.28 
 
 		 241 aa  53.9  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1629  phosphoglycolate phosphatase  32.4 
 
 		 241 aa  53.5  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1987  HAD family hydrolase  28.65 
 
 		 215 aa  53.5  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0143235  normal  0.0109237 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2502  HAD family hydrolase  31.25 
 
 		 200 aa  53.9  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.396303  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2955  phosphoglycolate phosphatase  31.28 
 
 		 241 aa  53.9  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3168  pyrophosphatase PpaX  35.56 
 
 		 222 aa  53.9  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3288  HAD family hydrolase  33.62 
 
 		 222 aa  53.9  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2893  phosphoglycolate phosphatase  31.28 
 
 		 241 aa  53.9  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6369  HAD family hydrolase  26.92 
 
 		 219 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.23133  normal  0.167912 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2641  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  33.62 
 
 		 222 aa  53.9  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0356  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.57 
 
 		 233 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2267  phosphoglycolate phosphatase  29.65 
 
 		 238 aa  53.5  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.428353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2037  HAD family hydrolase  34.32 
 
 		 225 aa  53.1  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00546936 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0766  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.45 
 
 		 222 aa  52.8  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2403  HAD family hydrolase  29.76 
 
 		 248 aa  52.4  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000854479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0996  phosphoglycolate phosphatase  30.06 
 
 		 237 aa  52.4  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.137981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4954  pyrophosphatase PpaX  31.36 
 
 		 215 aa  52.4  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0546  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28 
 
 		 319 aa  52.4  0.000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2240  HAD family hydrolase  29 
 
 		 214 aa  52  0.000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.279618  normal  0.937061 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>