More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3457 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_3457  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  100 
 
 		 210 aa  423  1e-118  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4292  HAD family hydrolase  66.14 
 
 		 196 aa  259  2e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4773  HAD family hydrolase  70.37 
 
 		 197 aa  254  9e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.330372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0659  HAD family hydrolase  69.47 
 
 		 196 aa  246  2e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0468832  normal  0.394115 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4915  HAD family hydrolase  68.45 
 
 		 197 aa  246  2e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000596857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1167  hypothetical protein  68.04 
 
 		 198 aa  246  2e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12890  hypothetical protein  67.53 
 
 		 198 aa  245  4e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.753603  normal  0.341873 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3718  HAD family hydrolase  67.02 
 
 		 197 aa  241  7.999999999999999e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4635  HAD family hydrolase  70 
 
 		 196 aa  239  2e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.262111  hitchhiker  0.00233323 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4761  HAD superfamily hydrolase  70 
 
 		 196 aa  239  2e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0000261111  hitchhiker  0.00232434 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4659  HAD-superfamily hydrolase  64.25 
 
 		 184 aa  236  2e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07760  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  61.05 
 
 		 198 aa  228  4e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04278  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 1 and 3  64.13 
 
 		 185 aa  211  9e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1559  HAD family hydrolase  48.11 
 
 		 204 aa  159  2e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.815546  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3148  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  53.41 
 
 		 199 aa  158  5e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.29989  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1113  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  53.41 
 
 		 204 aa  154  9e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0694  HAD family hydrolase  44.22 
 
 		 214 aa  151  7e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2814  HAD family hydrolase  49.14 
 
 		 202 aa  149  3e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3448  HAD family hydrolase  48.19 
 
 		 209 aa  135  4e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0574  HAD family hydrolase  40.41 
 
 		 204 aa  118  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0803877 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3760  HAD family hydrolase  39.79 
 
 		 204 aa  118  6e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0580  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  40.84 
 
 		 204 aa  118  7e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0550  HAD family hydrolase  40.84 
 
 		 204 aa  117  9e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0635  HAD family hydrolase  38.86 
 
 		 204 aa  116  3e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0499  HAD superfamily hydrolase  39.56 
 
 		 204 aa  113  3e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4039  HAD superfamily hydrolase  35.23 
 
 		 202 aa  104  1e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0526  HAD family hydrolase  32.65 
 
 		 210 aa  102  4e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0371  HAD family hydrolase  33.17 
 
 		 205 aa  102  5e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3600  HAD family hydrolase  32.65 
 
 		 206 aa  102  5e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3426  HAD family hydrolase  34.66 
 
 		 203 aa  101  8e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0759  HAD family hydrolase  29.02 
 
 		 214 aa  95.1  7e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3247  HAD family hydrolase  29.34 
 
 		 201 aa  86.7  3e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00424  putative hydrolase/phosphatase protein  30.18 
 
 		 172 aa  85.1  7e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.465946  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0412  HAD family hydrolase  28.57 
 
 		 209 aa  82.8  0.000000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05409  phosphoglycolate phosphatase  28.93 
 
 		 204 aa  82.4  0.000000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2257  HAD family hydrolase  30.25 
 
 		 207 aa  77  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.071447 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0523  hydrolase, HAD-family protein  28.57 
 
 		 203 aa  76.6  0.0000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0171673  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2703  HAD family hydrolase  26.32 
 
 		 197 aa  73.6  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.776642  normal  0.681898 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0268  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.08 
 
 		 192 aa  72.8  0.000000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.423006  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001470  HAD-superfamily hydrolase  26.4 
 
 		 206 aa  72  0.000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_87850  predicted protein  30.18 
 
 		 227 aa  70.5  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.762716  normal  0.0707375 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1688  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 1  31.95 
 
 		 193 aa  68.6  0.00000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.168366  normal  0.420144 
 
 
-
 
NC_004310  BR0287  HAD superfamily hydrolase  38.33 
 
 		 249 aa  67.4  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.727823  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0302  HAD superfamily hydrolase  38.33 
 
 		 249 aa  67.4  0.0000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.795024  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_5811  predicted protein  34.46 
 
 		 207 aa  66.2  0.0000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.695872  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2255  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.68 
 
 		 209 aa  64.7  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00490459 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0382  phosphoglycolate phosphatase  31.5 
 
 		 229 aa  63.9  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0525  HAD family hydrolase  26.21 
 
 		 209 aa  61.6  0.000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00124351  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1764  phosphoglycolate phosphatase  29.95 
 
 		 223 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0371  HAD family hydrolase  40.23 
 
 		 242 aa  59.7  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3950  phosphoglycolate phosphatase  29.44 
 
 		 223 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00428214  normal  0.0156244 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1355  phosphoglycolate phosphatase  29.44 
 
 		 223 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3361  phosphoglycolate phosphatase  27.19 
 
 		 227 aa  58.9  0.00000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0609  HAD family hydrolase  25.87 
 
 		 215 aa  58.2  0.00000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0595  HAD family hydrolase  25.87 
 
 		 215 aa  58.2  0.00000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0220  phosphoglycolate phosphatase  27.23 
 
 		 231 aa  57.8  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0486776 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19180  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.15 
 
 		 218 aa  58.2  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.143986  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1371  phosphoglycolate phosphatase  29.44 
 
 		 223 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0537  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.37 
 
 		 260 aa  57  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0705  HAD family hydrolase  37.5 
 
 		 214 aa  57  0.0000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.399525  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2446  phosphoglycolate phosphatase  28.14 
 
 		 225 aa  57.4  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2172  HAD family hydrolase  41.07 
 
 		 230 aa  57.4  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0983  P-Ser-HPr phosphatase  28.57 
 
 		 215 aa  57  0.0000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1741  phosphoglycolate phosphatase  28.43 
 
 		 223 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1697  HAD family hydrolase  27.68 
 
 		 224 aa  56.6  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.264529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0954  phosphoglycolate phosphatase  30.53 
 
 		 233 aa  56.2  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2496  phosphoglycolate phosphatase  30.22 
 
 		 221 aa  55.8  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2701  phosphoglycolate phosphatase  33.09 
 
 		 230 aa  56.2  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.364651  normal  0.0856305 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23210  phosphoglycolate phosphatase  26.63 
 
 		 226 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0343323  hitchhiker  0.00416895 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0412  putative phosphatase  41.49 
 
 		 230 aa  55.5  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0292  HAD family hydrolase  29.61 
 
 		 222 aa  55.8  0.0000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.402537  normal  0.982934 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2067  HAD family hydrolase  41.49 
 
 		 230 aa  55.5  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0859939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2324  phosphoglycolate phosphatase  30.53 
 
 		 223 aa  55.5  0.0000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.289687  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4527  phosphoglycolate phosphatase  26.2 
 
 		 216 aa  55.1  0.0000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0245  phosphoglycolate phosphatase  27.62 
 
 		 232 aa  55.1  0.0000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5677  pyrophosphatase PpaX  25.23 
 
 		 216 aa  54.7  0.0000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4194  phosphoglycolate phosphatase  29.36 
 
 		 225 aa  54.7  0.0000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4076  phosphoglycolate phosphatase  26.06 
 
 		 225 aa  55.1  0.0000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1957  phosphoglycolate phosphatase  26.13 
 
 		 223 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1296  phosphoglycolate phosphatase  31.4 
 
 		 233 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0205291  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4106  phosphoglycolate phosphatase  27.87 
 
 		 225 aa  54.3  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15750  phosphoglycolate phosphatase  27.52 
 
 		 223 aa  54.7  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3651  phosphoglycolate phosphatase  27.92 
 
 		 223 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0533  nucleotidase  28.65 
 
 		 225 aa  54.3  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.330887  normal  0.0227178 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5280  pyrophosphatase PpaX  25.23 
 
 		 216 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0546  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.66 
 
 		 319 aa  54.7  0.000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3996  phosphoglycolate phosphatase  27.87 
 
 		 225 aa  54.3  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3699  phosphoglycolate phosphatase  27.97 
 
 		 226 aa  53.9  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1899  pyrimidine 5'-nucleotidase  28.71 
 
 		 249 aa  53.5  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.226115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1295  HAD-superfamily hydrolase  38.38 
 
 		 224 aa  53.9  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.647127  normal  0.296731 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2112  HAD family hydrolase  25.91 
 
 		 239 aa  53.9  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0766  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.34 
 
 		 222 aa  53.5  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0179  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.66 
 
 		 233 aa  53.9  0.000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.31745 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1715  HAD family hydrolase  30.99 
 
 		 195 aa  53.9  0.000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.101498 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0293  phosphoglycolate phosphatase  27.97 
 
 		 227 aa  53.1  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5010  pyrophosphatase PpaX  29.13 
 
 		 216 aa  53.1  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5390  pyrophosphatase PpaX  29.13 
 
 		 216 aa  53.1  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2637  HAD family hydrolase  28.34 
 
 		 286 aa  53.1  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.403398  normal  0.292856 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0268  phosphoglycolate phosphatase  29.2 
 
 		 228 aa  52.8  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0557534  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0783  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.96 
 
 		 222 aa  53.1  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>