99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1899 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_1899  pyrimidine 5'-nucleotidase  100 
 
 		 249 aa  504  9.999999999999999e-143  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.226115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0631  pyrimidine 5'-nucleotidase  59.73 
 
 		 233 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0074  pyrimidine 5-nucleotidase  60.81 
 
 		 233 aa  282  4.0000000000000003e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0135144 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0812  pyrimidine 5-nucleotidase  61.01 
 
 		 235 aa  278  5e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.935066  normal  0.61408 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0678  pyrimidine 5-nucleotidase  59.46 
 
 		 236 aa  278  7e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7331  HAD-superfamily hydrolase  59.56 
 
 		 231 aa  275  5e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.178908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3699  pyrimidine 5-nucleotidase  57.89 
 
 		 237 aa  270  2e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3070  pyrimidine 5-nucleotidase  59.65 
 
 		 238 aa  267  1e-70  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.560308 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2296  pyrimidine 5'-nucleotidase  53.59 
 
 		 243 aa  234  9e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.491142  normal  0.310547 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2620  pyrimidine 5'-nucleotidase  52.14 
 
 		 248 aa  226  2e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0626666 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2341  pyrimidine 5'-nucleotidase  52.14 
 
 		 248 aa  226  2e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0867  pyrimidine 5'-nucleotidase  51.85 
 
 		 243 aa  226  3e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.652613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0294  pyrimidine 5'-nucleotidase  47.56 
 
 		 248 aa  224  1e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1385  pyrimidine 5'-nucleotidase  52.46 
 
 		 243 aa  224  1e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0603953  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0955  pyrimidine 5'-nucleotidase  50.66 
 
 		 249 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.559689  normal  0.38574 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1204  pyrimidine 5'-nucleotidase  52.19 
 
 		 240 aa  218  5e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00476471 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0071  pyrimidine 5'-nucleotidase  48.89 
 
 		 237 aa  216  2.9999999999999998e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0142063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0967  HAD superfamily hydrolase  49.55 
 
 		 234 aa  215  5.9999999999999996e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0382  pyrimidine 5'-nucleotidase  48.87 
 
 		 232 aa  214  9.999999999999999e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0582701  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1026  HAD superfamily hydrolase  49.11 
 
 		 234 aa  212  3.9999999999999995e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3343  pyrimidine 5-nucleotidase  49.79 
 
 		 238 aa  210  2e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0082  pyrimidine 5'-nucleotidase  47.06 
 
 		 235 aa  210  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.723897  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3331  pyrimidine 5'-nucleotidase  49.34 
 
 		 268 aa  208  6e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.142582 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0065  pyrimidine 5'-nucleotidase  47.35 
 
 		 237 aa  207  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.284923  decreased coverage  0.00705345 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0449  hydrolase  46.03 
 
 		 250 aa  204  9e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1357  pyrimidine 5'-nucleotidase  48.88 
 
 		 234 aa  201  9e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.593204  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2390  putative pyrimidine 5'-nucleotidase  46.4 
 
 		 215 aa  183  3e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.664306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1243  pyrimidine 5-nucleotidase  44.65 
 
 		 213 aa  181  7e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.882257  normal  0.476279 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2912  pyrimidine 5'-nucleotidase  48.65 
 
 		 280 aa  181  1e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3943  pyrimidine 5'-nucleotidase  43.53 
 
 		 228 aa  169  3e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2297  pyrimidine 5-nucleotidase  43.44 
 
 		 214 aa  167  1e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1836  pyrimidine 5-nucleotidase  42.04 
 
 		 229 aa  166  2.9999999999999998e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00207221  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0657  pyrimidine 5'-nucleotidase  44.54 
 
 		 215 aa  165  5.9999999999999996e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.114356 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0455  pyrimidine 5'-nucleotidase  41.92 
 
 		 240 aa  162  5.0000000000000005e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.50243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0520  pyrimidine 5'-nucleotidase  43.58 
 
 		 215 aa  159  3e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1870  hydrolase  43.58 
 
 		 215 aa  159  3e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.777911  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4559  pyrimidine 5'-nucleotidase  44.55 
 
 		 222 aa  159  4e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2827  pyrimidine 5-nucleotidase  42.58 
 
 		 237 aa  157  2e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.112564  normal  0.0242793 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3072  HAD family hydrolase  40.11 
 
 		 220 aa  135  5e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000791447  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0010  pyrimidine 5'-nucleotidase  39.46 
 
 		 221 aa  120  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.32249  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2923  pyrimidine 5'-nucleotidase  34.82 
 
 		 220 aa  120  3e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0724502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1534  pyrimidine 5'-nucleotidase  38.67 
 
 		 216 aa  118  7.999999999999999e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.78669  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0032  hypothetical protein  39.46 
 
 		 287 aa  118  7.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3395  pyrimidine 5'-nucleotidase  38.07 
 
 		 281 aa  116  3e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3718  pyrimidine 5'-nucleotidase  38.65 
 
 		 285 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0628  HAD family pyrimidine 5-nucleotidase  34.25 
 
 		 212 aa  109  4.0000000000000004e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.821924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0141  pyrimidine 5-nucleotidase  38.37 
 
 		 334 aa  108  9.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0804995 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2986  pyrimidine 5'-nucleotidase  36.07 
 
 		 217 aa  107  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0234941  hitchhiker  0.000703738 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0181  HAD family pyrimidine 5-nucleotidase  36.46 
 
 		 322 aa  106  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2256  pyrimidine 5-nucleotidase  34.24 
 
 		 241 aa  104  1e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0948171  hitchhiker  0.0000228381 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0063  pyrimidine 5'-nucleotidase  38.71 
 
 		 252 aa  104  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.264362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0541  pyrimidine 5'-nucleotidase  36.76 
 
 		 233 aa  100  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0337  pyrimidine 5'-nucleotidase  36.76 
 
 		 267 aa  96.7  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2483  pyrimidine 5-nucleotidase  36.76 
 
 		 263 aa  96.3  4e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0380059  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3097  pyrimidine 5'-nucleotidase  36.76 
 
 		 263 aa  96.3  4e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.143226  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3113  pyrimidine 5'-nucleotidase  36.22 
 
 		 263 aa  96.3  5e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.735685 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2059  pyrimidine 5'-nucleotidase  27.73 
 
 		 214 aa  95.5  7e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.288048  normal  0.220082 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3093  pyrimidine 5'-nucleotidase  36.76 
 
 		 263 aa  93.6  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.274131 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0500  hypothetical protein  34.43 
 
 		 243 aa  93.6  3e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.354982 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6448  HAD family hydrolase  36.22 
 
 		 263 aa  93.6  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.895915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0159  HAD-superfamily hydrolase  36.22 
 
 		 267 aa  91.3  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3144  pyrimidine 5'-nucleotidase  37.3 
 
 		 263 aa  87.4  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4386  HAD family hydrolase  35.11 
 
 		 267 aa  87  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2909  HAD-superfamily hydrolase  43.65 
 
 		 267 aa  86.7  3e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.378471  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2180  HAD-superfamily hydrolase  43.65 
 
 		 267 aa  86.7  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0184  HAD-superfamily hydrolase  43.65 
 
 		 267 aa  86.7  3e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.610769  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3006  pyrimidine 5'-nucleotidase  37.3 
 
 		 263 aa  87  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.632034 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0194  HAD-superfamily hydrolase  43.65 
 
 		 267 aa  86.7  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3439  HAD-superfamily hydrolase  43.65 
 
 		 267 aa  86.7  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3248  HAD-superfamily hydrolase  43.65 
 
 		 267 aa  86.7  3e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.800899  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_7521  predicted protein  32.04 
 
 		 212 aa  86.7  3e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0283312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_18726  predicted protein  31.05 
 
 		 273 aa  64.3  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.245332 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15835  predicted protein  32.26 
 
 		 190 aa  61.6  0.00000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0367369  normal  0.333156 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_9879  predicted protein  27.62 
 
 		 188 aa  59.7  0.00000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.753142  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_84214  suppressor of deletion of TFIIS  25 
 
 		 287 aa  53.5  0.000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.538947  normal  0.0127046 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3457  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.85 
 
 		 210 aa  51.6  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0659  HAD family hydrolase  26.6 
 
 		 196 aa  48.9  0.00009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0468832  normal  0.394115 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2195  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.96 
 
 		 224 aa  48.1  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3083  HAD family hydrolase  24.5 
 
 		 363 aa  46.6  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0267  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.43 
 
 		 220 aa  44.7  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.583067  normal  0.103324 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6064  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.67 
 
 		 215 aa  44.7  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.219512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1559  HAD family hydrolase  24.24 
 
 		 204 aa  43.9  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.815546  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4773  HAD family hydrolase  29.59 
 
 		 197 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.330372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7216  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase  38.75 
 
 		 223 aa  44.3  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2416  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  33.33 
 
 		 266 aa  43.9  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42723  predicted protein  22.61 
 
 		 202 aa  43.1  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0877  phosphoglycolate phosphatase  29.47 
 
 		 227 aa  43.1  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.336164  normal  0.0645651 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4524  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.77 
 
 		 203 aa  42.7  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.655556  normal  0.0295033 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3918  beta-phosphoglucomutase  34.41 
 
 		 208 aa  42.4  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0371171 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0477  HAD superfamily hydrolase  25.12 
 
 		 212 aa  42.7  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.992519  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07760  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.43 
 
 		 198 aa  42.7  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2461  phosphoglycolate phosphatase  25.96 
 
 		 225 aa  42.7  0.006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.768725 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3792  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.67 
 
 		 229 aa  42.4  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4259  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.14 
 
 		 203 aa  42.4  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2077  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.63 
 
 		 231 aa  42.4  0.007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0155497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0304  beta-phosphoglucomutase  34.78 
 
 		 986 aa  42.4  0.007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.337026 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1399  phosphoglycolate phosphatase  25.96 
 
 		 225 aa  42  0.008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1550  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25.71 
 
 		 249 aa  42  0.009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.204001 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0493  HAD family hydrolase  35.53 
 
 		 230 aa  42  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0405108  hitchhiker  0.00191213 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>