More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1688 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_1688  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 1  100 
 
 		 193 aa  382  1e-105  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.168366  normal  0.420144 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2259  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  48.66 
 
 		 191 aa  158  4e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.45426  normal  0.439301 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0499  HAD superfamily hydrolase  34.59 
 
 		 204 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05409  phosphoglycolate phosphatase  32.34 
 
 		 204 aa  82.8  0.000000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3247  HAD family hydrolase  27.87 
 
 		 201 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0523  hydrolase, HAD-family protein  30.32 
 
 		 203 aa  80.1  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0171673  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0759  HAD family hydrolase  30.27 
 
 		 214 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001470  HAD-superfamily hydrolase  33.13 
 
 		 206 aa  79  0.00000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00424  putative hydrolase/phosphatase protein  31.1 
 
 		 172 aa  74.7  0.0000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.465946  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2257  HAD family hydrolase  31.1 
 
 		 207 aa  74.3  0.0000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.071447 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2703  HAD family hydrolase  25.27 
 
 		 197 aa  74.3  0.000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.776642  normal  0.681898 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0550  HAD family hydrolase  29.74 
 
 		 204 aa  72.4  0.000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0574  HAD family hydrolase  29.74 
 
 		 204 aa  72.4  0.000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0803877 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3457  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.95 
 
 		 210 aa  72  0.000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0580  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.74 
 
 		 204 aa  72  0.000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1144  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.11 
 
 		 217 aa  71.6  0.000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3760  HAD family hydrolase  29.74 
 
 		 204 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4292  HAD family hydrolase  31.95 
 
 		 196 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0268  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.52 
 
 		 192 aa  69.3  0.00000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.423006  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0635  HAD family hydrolase  32.7 
 
 		 204 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4773  HAD family hydrolase  30.68 
 
 		 197 aa  67.8  0.00000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.330372  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4659  HAD-superfamily hydrolase  33.13 
 
 		 184 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2251  phosphoglycolate phosphatase  27.98 
 
 		 229 aa  65.9  0.0000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4039  HAD superfamily hydrolase  30.1 
 
 		 202 aa  64.7  0.0000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3718  HAD family hydrolase  32.54 
 
 		 197 aa  64.7  0.0000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0412  HAD family hydrolase  28.57 
 
 		 209 aa  64.3  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4618  HAD family hydrolase  26.84 
 
 		 224 aa  63.2  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0659  HAD family hydrolase  29.55 
 
 		 196 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0468832  normal  0.394115 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1874  HAD family hydrolase  37.23 
 
 		 216 aa  62.4  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.785736  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0526  HAD family hydrolase  31.25 
 
 		 210 aa  62.4  0.000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0457  phosphoglycolate phosphatase  30.56 
 
 		 227 aa  62  0.000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3426  HAD family hydrolase  31.25 
 
 		 203 aa  62  0.000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2481  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.7 
 
 		 207 aa  62  0.000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3600  HAD family hydrolase  31.25 
 
 		 206 aa  62  0.000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1730  phosphoglycolate phosphatase  30.56 
 
 		 238 aa  62  0.000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4761  HAD superfamily hydrolase  30.68 
 
 		 196 aa  61.2  0.000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0000261111  hitchhiker  0.00232434 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4635  HAD family hydrolase  30.68 
 
 		 196 aa  61.2  0.000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.262111  hitchhiker  0.00233323 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0371  HAD family hydrolase  29.35 
 
 		 205 aa  60.5  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2784  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.74 
 
 		 208 aa  60.5  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4539  HAD superfamily hydrolase  26.63 
 
 		 224 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02338  putative phosphoglycolate phosphatase, contains a phosphatase-like domain  28.18 
 
 		 234 aa  60.5  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0463297  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2760  putative phosphoglycolate phosphatase  32.43 
 
 		 221 aa  60.5  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0219607 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4940  L-2-haloalkanoic acid dehalogenase  26.13 
 
 		 224 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0265  phosphoglycolate phosphatase  31.85 
 
 		 227 aa  59.7  0.00000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0705  HAD family hydrolase  30.07 
 
 		 214 aa  60.5  0.00000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.399525  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1857  phosphoglycolate phosphatase  30.52 
 
 		 219 aa  60.5  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0131  HAD family hydrolase  27.92 
 
 		 236 aa  60.5  0.00000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2370  phosphoglycolate phosphatase  36.36 
 
 		 227 aa  59.7  0.00000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0122  haloacid dehalogenase-like hydrolase  26.9 
 
 		 236 aa  58.9  0.00000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.817509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4926  hypothetical protein  25.79 
 
 		 224 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4905  hypothetical protein  24.54 
 
 		 224 aa  58.9  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0332  hypothetical protein  23.56 
 
 		 223 aa  58.9  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4520  haloacid dehalogenase-like hydrolase  26.32 
 
 		 224 aa  58.5  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2229  phosphoglycolate phosphatase  37.72 
 
 		 227 aa  58.5  0.00000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.40738  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07760  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.19 
 
 		 198 aa  58.5  0.00000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0937  HAD family hydrolase  35.19 
 
 		 206 aa  58.5  0.00000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0343  phosphoglycolate phosphatase  31.06 
 
 		 233 aa  58.5  0.00000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0945  putative 2-phosphoglycolate phosphatase  32.26 
 
 		 226 aa  58.2  0.00000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2451  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.03 
 
 		 212 aa  58.2  0.00000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1985  phosphoglycolate phosphatase  32.46 
 
 		 223 aa  58.2  0.00000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.554471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1515  HAD family hydrolase  38.68 
 
 		 229 aa  57.8  0.00000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000770474 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2496  phosphoglycolate phosphatase  29.94 
 
 		 221 aa  57.8  0.00000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2069  HAD family hydrolase  37.38 
 
 		 212 aa  57.8  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.827654  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14060  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  31.68 
 
 		 217 aa  57.8  0.0000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2829  phosphoglycolate phosphatase  25.46 
 
 		 221 aa  57.8  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0461088  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4906  hypothetical protein  26.84 
 
 		 223 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.792086  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2493  phosphoglycolate phosphatase  30.07 
 
 		 225 aa  57  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2461  phosphoglycolate phosphatase  29.05 
 
 		 225 aa  56.6  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.768725 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3218  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  24.88 
 
 		 234 aa  57  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2878  phosphoglycolate phosphatase  31.58 
 
 		 226 aa  56.2  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0021  hydrolase  30.46 
 
 		 218 aa  56.2  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.993674  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2849  hydrolase  30.6 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1167  hypothetical protein  29.59 
 
 		 198 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2097  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.77 
 
 		 221 aa  56.2  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.284323  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1399  phosphoglycolate phosphatase  28.49 
 
 		 225 aa  56.2  0.0000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1973  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  35.4 
 
 		 224 aa  56.2  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2110  phosphoglycolate phosphatase  30.08 
 
 		 225 aa  56.2  0.0000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.782136  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1559  HAD family hydrolase  31.85 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.815546  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2933  HAD family hydrolase  26.34 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.954117  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3022  phosphoglycolate phosphatase  40.57 
 
 		 241 aa  55.1  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.116956  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4462  phosphoglycolate phosphatase  33.33 
 
 		 250 aa  55.1  0.0000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3854  phosphoglycolate phosphatase  31.06 
 
 		 252 aa  55.1  0.0000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00525883  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3482  phosphoglycolate phosphatase  27.72 
 
 		 226 aa  54.7  0.0000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.824519  normal  0.190106 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0937  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.49 
 
 		 219 aa  54.7  0.0000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.171636 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2363  phosphoglycolate phosphatase  30.53 
 
 		 227 aa  54.7  0.0000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.496506  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0404  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  38.1 
 
 		 224 aa  54.7  0.0000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4716  phosphoglycolate phosphatase  26.82 
 
 		 221 aa  54.7  0.0000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.92014 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0925  phosphoglycolate phosphatase  33.94 
 
 		 224 aa  54.3  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3762  phosphoglycolate phosphatase  30.3 
 
 		 252 aa  53.9  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.40481  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1789  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  38.61 
 
 		 222 aa  54.3  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.160371  normal  0.0157208 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1766  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.54 
 
 		 206 aa  53.9  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00317051 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0328  phosphoglycolate phosphatase  30.3 
 
 		 252 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22171  haloacid dehalogenase/epoxide hydrolase family protein  31.86 
 
 		 270 aa  53.5  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4689  phosphoglycolate phosphatase  30.3 
 
 		 252 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.663349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2255  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.64 
 
 		 209 aa  53.5  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00490459 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3581  phosphoglycolate phosphatase  30.3 
 
 		 252 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.284383  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23210  phosphoglycolate phosphatase  27.93 
 
 		 226 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0343323  hitchhiker  0.00416895 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3661  phosphoglycolate phosphatase  30.3 
 
 		 252 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.29844  normal  0.025681 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2235  phosphoglycolate phosphatase 2  26.86 
 
 		 223 aa  53.5  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0682937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1015  hydrolase  44 
 
 		 203 aa  53.1  0.000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.772817  hitchhiker  0.000000000927289 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>