More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0937 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_0937  HAD family hydrolase  100 
 
 		 206 aa  426  1e-118  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2069  HAD family hydrolase  77.11 
 
 		 212 aa  324  6e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.827654  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2849  hydrolase  67.33 
 
 		 206 aa  285  5e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2451  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  61.69 
 
 		 212 aa  258  4e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1766  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  60.7 
 
 		 206 aa  253  1.0000000000000001e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00317051 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2933  HAD family hydrolase  57.71 
 
 		 210 aa  245  3e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.954117  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2784  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  56.5 
 
 		 208 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2242  phosphatases  39.3 
 
 		 256 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0404  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  41.87 
 
 		 224 aa  139  3.9999999999999997e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1666  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  37.57 
 
 		 236 aa  133  1.9999999999999998e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.695428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0604  hydrolase  39.71 
 
 		 238 aa  131  6.999999999999999e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1876  phosphatases  40.59 
 
 		 221 aa  130  9e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000282708  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1697  HAD family hydrolase  38.35 
 
 		 224 aa  125  3e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.264529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2173  HAD family hydrolase  40 
 
 		 232 aa  120  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0277554  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0021  hydrolase  36.82 
 
 		 218 aa  120  9.999999999999999e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.993674  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0148  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  36.76 
 
 		 247 aa  119  4.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0660196 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1900  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.75 
 
 		 221 aa  103  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.65867  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5953  phosphoglycolate phosphatase  39.2 
 
 		 257 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0174691 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3854  phosphoglycolate phosphatase  46.74 
 
 		 252 aa  78.6  0.00000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00525883  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3788  phosphoglycolate phosphatase  33.15 
 
 		 252 aa  78.2  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03237  phosphoglycolate phosphatase  45.65 
 
 		 252 aa  77.4  0.0000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0328  phosphoglycolate phosphatase  45.65 
 
 		 252 aa  77.4  0.0000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3762  phosphoglycolate phosphatase  45.65 
 
 		 252 aa  77.4  0.0000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.40481  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03189  hypothetical protein  45.65 
 
 		 252 aa  77.4  0.0000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3661  phosphoglycolate phosphatase  45.65 
 
 		 252 aa  77.4  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.29844  normal  0.025681 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0328  phosphoglycolate phosphatase  45.65 
 
 		 252 aa  77.4  0.0000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.372389  normal  0.201922 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3581  phosphoglycolate phosphatase  45.65 
 
 		 252 aa  77.4  0.0000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.284383  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4689  phosphoglycolate phosphatase  45.65 
 
 		 252 aa  77.4  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.663349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3681  phosphoglycolate phosphatase  32.6 
 
 		 252 aa  75.5  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.123155  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3850  phosphoglycolate phosphatase  32.6 
 
 		 252 aa  75.5  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3754  phosphoglycolate phosphatase  32.6 
 
 		 252 aa  75.5  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3679  phosphoglycolate phosphatase  42.16 
 
 		 252 aa  74.7  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.966867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3798  phosphoglycolate phosphatase  34.36 
 
 		 253 aa  74.3  0.000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0419361 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3737  haloacid dehalogenase-like hydrolase  28.97 
 
 		 254 aa  73.6  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0520  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.3 
 
 		 217 aa  72.4  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1661  AHBA synthesis associated protein  31.98 
 
 		 214 aa  72.4  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.49792 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3998  phosphoglycolate phosphatase  32.98 
 
 		 226 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.739792  normal  0.543367 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3246  phosphoglycolate phosphatase  28.36 
 
 		 227 aa  71.2  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.181824  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2847  phosphoglycolate phosphatase  28.36 
 
 		 227 aa  71.2  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.212796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1092  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.87 
 
 		 212 aa  69.3  0.00000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0431  3-amino-5-hydroxybenoic acid synthesis related  32.14 
 
 		 263 aa  68.9  0.00000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2290  HAD family hydrolase  28.22 
 
 		 223 aa  68.2  0.00000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.783453  normal  0.134252 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2878  phosphoglycolate phosphatase  30.53 
 
 		 226 aa  67.4  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0447  phosphoglycolate phosphatase  32.12 
 
 		 272 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.558752 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0343  phosphoglycolate phosphatase  39.29 
 
 		 233 aa  66.6  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1355  phosphoglycolate phosphatase  30 
 
 		 223 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0265  phosphoglycolate phosphatase  29.61 
 
 		 232 aa  67  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.210779  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3122  HAD family hydrolase  29.57 
 
 		 214 aa  67.4  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3473  HAD family hydrolase  30.3 
 
 		 243 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2591  HAD family hydrolase  34.51 
 
 		 220 aa  67  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000123522  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0019  phosphatase  25.53 
 
 		 208 aa  66.6  0.0000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.379676 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1764  phosphoglycolate phosphatase  28.95 
 
 		 223 aa  65.9  0.0000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0095  HAD family hydrolase  24.86 
 
 		 212 aa  65.9  0.0000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1518  HAD family hydrolase  29.36 
 
 		 226 aa  65.9  0.0000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0020263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07930  phosphoglycolate phosphatase  31.69 
 
 		 272 aa  65.5  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282972 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1543  HAD family hydrolase  28.36 
 
 		 218 aa  65.5  0.0000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.290377 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0416  phosphoglycolate phosphatase  27.36 
 
 		 272 aa  65.1  0.0000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0450  phosphoglycolate phosphatase  27.36 
 
 		 272 aa  65.1  0.0000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.416285 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3950  phosphoglycolate phosphatase  28.95 
 
 		 223 aa  65.1  0.0000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00428214  normal  0.0156244 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0525  HAD family hydrolase  27.09 
 
 		 209 aa  65.1  0.0000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00124351  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4786  phosphoglycolate phosphatase  38.61 
 
 		 272 aa  65.1  0.0000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.602175 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0508  HAD family hydrolase  34.96 
 
 		 205 aa  64.7  0.0000000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.13325  normal  0.112078 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1650  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1 family protein  23.08 
 
 		 213 aa  64.7  0.000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0752  phosphoglycolate phosphatase  31.15 
 
 		 272 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1824  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1 family protein  23.63 
 
 		 213 aa  64.3  0.000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0490965  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0473  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.12 
 
 		 211 aa  64.3  0.000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000148872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0460  phosphoglycolate phosphatase  29.76 
 
 		 229 aa  64.3  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0934432  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2583  phosphoglycolate phosphatase  28.96 
 
 		 227 aa  63.9  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15750  phosphoglycolate phosphatase  26.84 
 
 		 223 aa  63.5  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4839  AHBA synthesis associated protein  32.97 
 
 		 237 aa  63.5  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.098143  normal  0.0397379 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2112  HAD family hydrolase  27.37 
 
 		 239 aa  63.5  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1371  phosphoglycolate phosphatase  28.95 
 
 		 223 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0261  HAD family hydrolase  27.69 
 
 		 217 aa  62.8  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000130583  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0391  phosphoglycolate phosphatase  23.5 
 
 		 216 aa  63.2  0.000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0457  phosphoglycolate phosphatase  29.63 
 
 		 227 aa  62.4  0.000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1089  phosphoglycolate phosphatase  30.89 
 
 		 227 aa  62.8  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.396739  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0673  HAD family hydrolase  24.19 
 
 		 211 aa  62  0.000000006  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1730  phosphoglycolate phosphatase  29.63 
 
 		 238 aa  62  0.000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0384  HAD family hydrolase  27.27 
 
 		 222 aa  61.6  0.000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000045535  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3482  phosphoglycolate phosphatase  27.92 
 
 		 226 aa  62  0.000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.824519  normal  0.190106 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2370  phosphoglycolate phosphatase  40 
 
 		 227 aa  61.6  0.000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2363  phosphoglycolate phosphatase  28.5 
 
 		 227 aa  61.6  0.000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.496506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3073  HAD family hydrolase  28.92 
 
 		 223 aa  61.2  0.000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00582956  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1470  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1 family protein  21.98 
 
 		 213 aa  60.8  0.00000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000674726  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4525  phosphatase  24.87 
 
 		 208 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2229  phosphoglycolate phosphatase  28.42 
 
 		 227 aa  60.8  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.40738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00430  beta-phosphoglucomutase  25.68 
 
 		 216 aa  60.8  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2324  phosphoglycolate phosphatase  28.57 
 
 		 223 aa  60.8  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.289687  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2232  pyrophosphatase PpaX  25.95 
 
 		 214 aa  60.8  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1483  HAD family hydrolase  27.98 
 
 		 224 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0762089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43120  phosphoglycolate phosphatase, PGPase  28.21 
 
 		 291 aa  60.1  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.691617  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0139  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25.37 
 
 		 220 aa  60.5  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000437323  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5119  phosphoglycolate phosphatase  31.02 
 
 		 272 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4954  pyrophosphatase PpaX  24.24 
 
 		 215 aa  60.5  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4600  phosphoglycolate phosphatase  34.51 
 
 		 232 aa  60.5  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.383007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1944  pyrophosphatase PpaX  25.41 
 
 		 214 aa  60.1  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1980  HAD family hydrolase  27.84 
 
 		 202 aa  60.1  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000561924  normal  0.0500569 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1994  HAD family hydrolase  27.84 
 
 		 202 aa  60.5  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000168215  unclonable  0.0000194697 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0937  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.84 
 
 		 219 aa  60.1  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.171636 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2067  HAD family hydrolase  27.84 
 
 		 202 aa  60.1  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000117425  hitchhiker  0.0000127527 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>